KEGG   ENZYME: 1.14.11.33Help
Entry
EC 1.14.11.33               Enzyme                                 

Name
DNA oxidative demethylase;
alkylated DNA repair protein;
alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase ABH1;
alkB (gene name)
Class
Oxidoreductases;
Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen;
With 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom of oxygen into each donor
BRITE hierarchy
Sysname
methyl DNA-base, 2-oxoglutarate:oxygen oxidoreductase (formaldehyde-forming)
Reaction(IUBMB)
DNA-base-CH3 + 2-oxoglutarate + O2 = DNA-base + formaldehyde + succinate + CO2
Substrate
DNA-base-CH3;
2-oxoglutarate [CPD:C00026];
O2 [CPD:C00007]
Product
DNA-base;
formaldehyde [CPD:C00067];
succinate [CPD:C00042];
CO2 [CPD:C00011]
Comment
Contains iron; activity is slightly stimulated by ascorbate. Catalyses oxidative demethylation of the DNA base lesions N1-methyladenine, N3-methylcytosine, N1-methylguanine, and N3-methylthymine. It works better on single-stranded DNA (ssDNA) and is capable of repairing damaged bases in RNA.
History
EC 1.14.11.33 created 2011
Orthology
K03919  
alkylated DNA repair protein (DNA oxidative demethylase)
Genes
ECO: 
b2212(alkB)
ECJ: 
Y75_p2173(alkB)
ECD: 
EBW: 
BWG_1986(alkB)
ECOK: 
ECE: 
Z3470(alkB)
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ECF: 
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ECSP_3091(alkB)
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EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c2753(alkB)
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ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
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ECT: 
EOC: 
CE10_2586(alkB)
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ECZ: 
ELO: 
ELN: 
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ESE: 
ESO: 
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ESL: 
ECL: 
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ECB_02139(alkB)
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EKF: 
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EUN: 
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ECW_m2413(alkB)
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WFL_11810(alkB)
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i14_2553(alkB)
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i02_2553(alkB)
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ECD_02139(alkB)
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B21_02098(alkB)
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LF82_0067(alkB)
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EFE: 
EFER_0948(alkB)
STY: 
STY2490(alkB)
STT: 
t0600(alkB)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM2264(alkB)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
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SETU: 
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SPA0600(alkB)
SEK: 
SPQ: 
SEC: 
SC2268(alkB)
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SHB: 
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SEE: 
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SG2292(alkB)
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SEN2247(alkB)
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BN855_23450(SBOV23211)
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SES: 
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SBG_2062(alkB)
SBZ: 
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YE3631(aidD)
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SFL: 
SF2296(alkB)
SFX: 
S2426(alkB)
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SFV_2287(alkB)
SFE: 
SFxv_2531(alkB)
SSN: 
SSON_2270(alkB)
SSJ: 
SBO: 
SBO_2095(alkB)
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SDY: 
SDY_0864(alkB)
SDZ: 
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ECA0909(alkB)
PATR: 
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
ETA_12340(alkB)
EPY: 
EpC_12930(alkB)
EPR: 
EAM: 
EAMY_2335(alkB)
EAY: 
EAM_2256(alkB)
EBI: 
EbC_30270(alkB)
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SOD: 
Sant_2277(alkB)
ENT: 
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ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
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EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
ES15_1228(alkB)
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CTU_28690(alkB)
KPN: 
KPN_02633(alkB)
KPU: 
KP1_3866(alkB)
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPK_1519(alkB)
KPO: 
KPR: 
KPR_2080(alkB)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
CKO: 
CRO: 
ROD_23451(alkB)
CFD: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
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SERR: 
SFO: 
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DDC: 
DDD: 
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PAM: 
PANA_2599(alkB)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_1891(alkB)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_2068(alkB)
PAO: 
RAH: 
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RAA: 
PSI: 
EBT: 
MMK: 
ROR: 
EBF: 
PSTS: 
FAU: 
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PPU: 
PP_3400(alkB)
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PPG: 
PPW: 
PPT: 
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PPI: 
PPX: 
T1E_5192(alkB)
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_27870(alkB)
PPUU: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PFL: 
PFL_3408(alkB)
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PPZ: 
PEN: 
PSEEN2825(alkB)
PBA: 
PBC: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
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PCH: 
PALK: 
ILO: 
IL1249(alkB)
ILI: 
MAQ: 
MHC: 
MARHY1189(alkB)
MAD: 
MEJ: 
MEC: 
CVI: 
CV_3196(alkB)
PSE: 
RSO: 
RSc2568(alkB)
RSC: 
RSL: 
RSN: 
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RSE: 
F504_2515(alkB)
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
REU: 
REH: 
H16_B2376(alkB)
CNC: 
RME: 
Rmet_3769(alkB1) Rmet_5268(alkB2)
CTI: 
BUR: 
PPK: 
PPNO: 
PRB: 
BPE: 
BP0340(alkB)
BPC: 
BPTD_0335(alkB)
BPER: 
BPA: 
BPP4192(alkB)
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BBR: 
BB4662(alkB)
BBM: 
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BPT: 
Bpet2932(alkB)
BAV: 
BAV3121(aidD)
BHO: 
AXY: 
AXO: 
AXN: 
AKA: 
AMIM: 
CDN: 
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POL: 
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AAV: 
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DIA: 
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DAC: 
DEL: 
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CTT: 
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ADN: 
ADK: 
MPT: 
HAR: 
HEAR1490(alkB)
MMS: 
mma_1844(alkB)
JAG: 
GJA_3662(alkB)
HSE: 
CFU: 
CFU_3243(alkB)
AZO: 
azo2293(alkB)
AZA: 
AZKH_4352(alkB)
DSU: 
MFA: 
MMB: 
MEH: 
MEI: 
MEP: 
MPQ_2229(alkB)
MXA: 
MXAN_5937(alkB)
MFU: 
HOH: 
MLO: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
MES: 
PLA: 
SME: 
SMc02566(alkB)
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
SMEG: 
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SMD: 
RHI: 
SFH: 
SFD: 
EAD: 
ARA: 
Arad_0050(alkB)
RET: 
REC: 
REL: 
RLE: 
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RLG: 
RLB: 
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RTR: 
RHL: 
NGL: 
NGG: 
BME: 
BMI: 
BMZ: 
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BMW: 
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BAB2_0704(alkB)
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BMS: 
BRA0533(alkB)
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BOV: 
BOV_A0463(alkB)
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BSK: 
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BMR: 
BMI_II527(alkB)
BPP: 
BPI_II516(alkB)
BCET: 
BCEE: 
OAN: 
BJA: 
blr2963(alkB)
BJU: 
BRA: 
BRADO2590(alkB)
BBT: 
BBta_2936(alkB)
BRS: 
S23_50480(alkB)
AOL: 
RPA: 
RPA1722(alkB)
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RPC: 
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XAU: 
AZC: 
SNO: 
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MET: 
MNO: 
BID: 
MSL: 
MSC: 
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CCS: 
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JAN: 
RDE: 
RD1_0377(alkB)
RLI: 
PDE: 
PAMI: 
DSH: 
Dshi_3572(alkB2)
PSF: 
PGA: 
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PTP: 
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HNE_1522(alkB)
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SWI: 
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GDI: 
GDI_0819(alkB)
GDJ: 
GXY: 
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APT: 
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APF: 
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APK: 
RCE: 
RC1_2852(alkB)
TMO: 
TMO_1894(alkB)
PBR: 
PGV: 
CGL: 
NCgl0141(Cgl0144)
CGB: 
CGU: 
WA5_0141(AlkB)
CGT: 
CGS: 
CGG: 
CGM: 
cgp_0181(alkB)
CEF: 
CDI: 
CDP: 
CDH: 
CDT: 
CDE: 
CDR: 
CDA: 
CDZ: 
CDB: 
CDS: 
CDD: 
CDW: 
CDV: 
CUR: 
CUA: 
CPU: 
CPL: 
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CPP: 
CPK: 
CPQ: 
CPX: 
CPZ: 
COR: 
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Cp31_0098(alkB)
COD: 
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CUL: 
CUC: 
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CVA: 
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RER: 
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REQ: 
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TPR: 
SRT: 
SCO: 
SCO1040(SCG20A.20c)
SMA: 
SGR: 
SCB: 
SSX: 
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SCT: 
SCY: 
SFA: 
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SDV: 
SALB: 
STRP: 
F750_5536(alkB)
SFI: 
SCI: 
SRC: 
SALU: 
SLV: 
KSK: 
KSE_58580(alkB)
AAU: 
AAI: 
ARR: 
KRH: 
JDE: 
KSE: 
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NDA: 
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SRO: 
SEN: 
AMD: 
AMED_8390(alkB)
AMN: 
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AMES_8260(alkB)
AMZ: 
B737_8261(alkB)
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AORI_7165(alkB)
AJA: 
KAL: 
SNA: 
PCU: 
pc0286(alkB)
ABA: 
GMA: 
TSA: 
SUS: 
ANB: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:12226668]
  Authors
Falnes PO, Johansen RF, Seeberg E
  Title
AlkB-mediated oxidative demethylation reverses DNA damage in Escherichia coli.
  Journal
Nature. 419 (2002) 178-82.
  Sequence
[up:P05050] [eco:b2212]
Reference
2  [PMID:19852088]
  Authors
Yi C, Yang CG, He C
  Title
A non-heme iron-mediated chemical demethylation in DNA and RNA.
  Journal
Acc. Chem. Res. 42 (2009) 519-29.
Reference
3  [PMID:21068844]
  Authors
Yi C, Jia G, Hou G, Dai Q, Zhang W, Zheng G, Jian X, Yang CG, Cui Q, He C
  Title
Iron-catalysed oxidation intermediates captured in a DNA repair dioxygenase.
  Journal
Nature. 468 (2010) 330-3.
  Sequence
[up:P05050] [eco:b2212]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 

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