KEGG   ENZYME: 3.1.11.1Help
Entry
EC 3.1.11.1                 Enzyme                                 

Name
exodeoxyribonuclease I;
Escherichia coli exonuclease I;
E. coli exonuclease I;
exonuclease I
Class
Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
BRITE hierarchy
Reaction(IUBMB)
Exonucleolytic cleavage in the 3'- to 5'-direction to yield nucleoside 5'-phosphates
Comment
Preference for single-stranded DNA. The Escherichia coli enzyme hydrolyses glucosylated DNA.
History
EC 3.1.11.1 created 1972 as EC 3.1.4.25, transferred 1978 to EC 3.1.11.1
Orthology
K01141  
exodeoxyribonuclease I
K20777  
exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2
Genes
HSA: 
55218(EXD2)
PTR: 
452996(EXD2)
PPS: 
100981128(EXD2)
GGO: 
101141719(EXD2)
PON: 
100454609(EXD2)
NLE: 
100598564(EXD2)
MCC: 
712296(EXD2)
MCF: 
102132077(EXD2)
CSAB: 
103229241(EXD2)
RRO: 
104659636(EXD2)
CJC: 
100408563(EXD2)
SBQ: 
101042550(EXD2)
MMU: 
97827(Exd2)
RNO: 
362759(Exd2)
CGE: 
100765115(Exd2)
NGI: 
103744214(Exd2)
HGL: 
101710627(Exd2)
OCU: 
100348519(EXD2)
TUP: 
102502137(EXD2)
CFA: 
490750(EXD2)
AML: 
100469494(EXD2)
UMR: 
103671636(EXD2)
FCA: 
101098798(EXD2)
PTG: 
102956146(EXD2)
BTA: 
539532(EXD2)
BOM: 
102264899(EXD2)
PHD: 
102335806(EXD2)
CHX: 
102175029(EXD2)
OAS: 
101117589(EXD2)
SSC: 
100155300(EXD2)
CFR: 
102514478(EXD2)
BACU: 
103011846(EXD2)
LVE: 
103087906(EXD2)
ECB: 
100053111(EXD2)
MYB: 
102262743(EXD2)
MYD: 
102762340(EXD2)
PALE: 
102888910(EXD2)
LAV: 
100661708(EXD2)
MDO: 
100028590(EXD2)
SHR: 
100925474(EXD2)
OAA: 
100074346(EXD2)
GGA: 
423264(EXD2)
MGP: 
100549672(EXD2)
CJO: 
107314902(EXD2)
APLA: 
101795979(EXD2)
TGU: 
100222893(EXD2)
GFR: 
102042773(EXD2)
FAB: 
101813352(EXD2)
PHI: 
102100000(EXD2)
CCW: 
104683675(EXD2)
FPG: 
101912429(EXD2)
FCH: 
102049018(EXD2)
CLV: 
102087628(EXD2)
AAM: 
ASN: 
102380497(EXD2)
AMJ: 
102569788(EXD2)
PSS: 
102463492(EXD2)
CMY: 
102931960(EXD2)
ACS: 
100553135(exd2)
PBI: 
103053120(EXD2)
GJA: 
107112202(EXD2)
XLA: 
100158397(exd2-b) 398805(exd2.L)
XTR: 
549208(exd2)
DRE: 
334455(exd2)
TRU: 
101079715(exd2)
TNG: 
MZE: 
101486647(exd2)
OLA: 
101175217(exd2)
XMA: 
102219587(exd2)
SASA: 
LCM: 
102361044(EXD2)
CMK: 
103178441(exd2)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
SKO: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
Dsimw501_GD20659(Dsim_GD20659)
DWI: 
DYA: 
Dyak_GE24622(dyak_GLEANR_8300)
DGR: 
DMO: 
DVI: 
MDE: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
BIM: 
BTER: 
SOC: 
AEC: 
HST: 
CFO: 
NVI: 
100120121(Exdl2)
BMOR: 
DPL: 
API: 
PHU: 
DPX: 
ISC: 
TSP: 
HRO: 
LGI: 
CRG: 
OBI: 
NVE: 
ADF: 
HMG: 
AQU: 
BNA: 
CIT: 
EGR: 
ADU: 
FVE: 
JCU: 
SLY: 
SPEN: 
SIND: 
NNU: 
BDI: 
SITA: 
EGU: 
MUS: 
CRE: 
VCN: 
CSL: 
CVR: 
APRO: 
SHS: 
HIR: 
FME: 
MLR: 
DDI: 
DDB_G0278079(exdl2A)
DPP: 
DFA: 
PTM: 
SMIN: 
v1.2.014490.t1(symbB.v1.2.014490.t1) v1.2.032608.t1(symbB.v1.2.032608.t1)
EHX: 
GTT: 
NGR: 
ECO: 
b2011(sbcB)
ECJ: 
JW1993(sbcB)
ECD: 
EBW: 
BWG_1801(sbcB)
ECOK: 
ECE: 
Z3173(sbcB)
ECS: 
ECs2813(sbcB)
ECF: 
ETW: 
ECSP_2762(sbcB)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c2539(sbcB)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_2328(sbcB)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
O3O_16260(sbcB)
ESM: 
O3M_09325(sbcB)
ESL: 
O3K_09360(sbcB)
ECL: 
EBR: 
ECB_01914(sbcB)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m2170(sbcB)
ELL: 
WFL_10630(sbcB)
ELC: 
i14_2340(sbcB)
ELD: 
i02_2340(sbcB)
ELP: 
EBL: 
ECD_01914(sbcB)
EBE: 
B21_01900(sbcB)
ELF: 
LF82_2088(sbcB)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
ECOS: 
EFE: 
EFER_2094(sbcB)
EAL: 
STY: 
STY2276(sbcB)
STT: 
t0807(sbcB)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM2067(sbcB)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SENR: 
SEND: 
SENI: 
SEEN: 
SPT: 
SPA0804(sbcB)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_1646(sbcB)
SEC: 
SCH_2077(sbcB)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG2097(sbcB)
SEL: 
SPUL_0831(sbcB)
SEGA: 
SET: 
SEN2066(sbcB)
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
SENE: 
IA1_10315(sbcB)
SENC: 
SES: 
SBG: 
SBG_1894(sbcB)
SBZ: 
SBV: 
SFL: 
SF2070(sbcB)
SFX: 
S2193(sbcB)
SFV: 
SFV_2070(sbcB)
SFE: 
SFxv_2306(sbcB)
SFN: 
SFS: 
SFT: 
SSN: 
SSON_2081(sbcB)
SSJ: 
SBO: 
SBO_0835(sbcB)
SBC: 
SDY: 
SDY_2231(sbcB)
SDZ: 
SHQ: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ECLA: 
ECLC: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
ENR: 
ENX: 
ENF: 
ESA: 
CSK: 
ES15_1443(sbcB)
CSZ: 
CSI: 
CSJ: 
CCON: 
CDM: 
CMJ: 
CUI: 
CMW: 
CTU: 
CTU_27100(sbcB)
KPN: 
KPN_02469(sbcB)
KPU: 
KP1_3673(sbcB)
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPV: 
KPW: 
KPY: 
KPG: 
KPC: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPK_1718(sbcB)
KPO: 
KPR: 
KPR_1633(sbcB)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KPB: 
KPNE: 
KPNU: 
KVA: 
KVD: 
KVQ: 
KOX: 
KOX_24900(sbcB)
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOC: 
KOM: 
KMI: 
KLE: 
KQU: 
EAE: 
EAE_23340(sbcB)
EAR: 
CKO: 
CRO: 
ROD_21501(sbcB)
CFD: 
CAMA: 
CIF: 
BFL: 
Bfl461(sbcB)
BPN: 
BPEN_476(sbcB)
BVA: 
BVAF_462(sbcB)
BCHR: 
BEN: 
BED: 
HDE: 
HDEF_1920(sbcB)
SECT: 
SEHC: 
EBT: 
ROR: 
RON: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
CED: 
PGE: 
KSA: 
KOR: 
KIN: 
ICP: 
ICMP_355(sbcB)
LAX: 
LAZ: 
CMIK: 
EBF: 
PSTS: 
YPE: 
YPO1558(sbcB)
YPK: 
y2610(sbcB)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_1446(sbcB)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPZ3_1422(sbcB)
YPT: 
YPD: 
YPD4_1388(sbcB)
YPX: 
YPD8_1559(sbcB)
YPH: 
YPC_2591(sbcB)
YPW: 
YPJ: 
YPV: 
YPL: 
YPS: 
YPTB1569(sbcB)
YPO: 
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
DJ40_643(sbcB)
YPU: 
YPR: 
YPC: 
YPF: 
YEN: 
YE2758(sbcB)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YEW: 
CH47_2109(sbcB)
YET: 
YEF: 
YEE: 
YSI: 
YAL: 
YFR: 
AW19_691(sbcB)
YIN: 
YKR: 
YRO: 
YRU: 
YRB: 
YAK: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SSZ: 
SCc_488(sbcB)
SMAF: 
SMW: 
SMAR: 
SM39_2775(sbcB)
SMAC: 
SLQ: 
SERR: 
SERF: 
SERS: 
SFW: 
SRZ: 
SFO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
Q7S_07640(sbcB)
ECA: 
ECA2565(sbcB)
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PCV: 
PWA: 
PPAR: 
PEC: 
PWS: 
SGL: 
SOD: 
Sant_1487(sbcB)
PES: 
DDA: 
DDD: 
DZE: 
DDC: 
DZC: 
DSO: 
ETA: 
ETA_13610(sbcB)
EPY: 
EpC_14230(sbcB)
EPR: 
EAM: 
EAMY_2217(sbcB)
EAY: 
EAM_2136(sbcB)
EBI: 
EbC_28930(sbcB)
ERJ: 
EGE: 
BUC: 
BU555(sbcB)
BAJC: 
CWS_02860(sbcB)
BUA: 
CWO_02915(sbcB)
BUP: 
CWQ_02955(sbcB)
BAK: 
BAKON_563(sbcB)
BAPF: 
BAPG: 
BAPU: 
BAPW: 
BAS: 
BUsg_537(sbcB)
BAB: 
bbp_503(sbcB)
BCC: 
BCc_364(sbcB)
PAM: 
PANA_2454(sbcB)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_1751(sbcB)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_1937(sbcB)
PAO: 
KLN: 
PANT: 
PANP: 
PAGG: 
PLU: 
plu2847(sbcB)
PAY: 
PAU_01691(sbcB)
PTT: 
PMR: 
PMI0848(sbcB)
PMIB: 
PVL: 
XBO: 
XBJ1_2870(sbcB)
XBV: 
XBW1_2502(sbcB)
XNE: 
XNC1_2754(sbcB)
XNM: 
XNC2_2652(sbcB)
XDO: 
XDD1_2514(sbcB)
XPO: 
XPG1_1304(sbcB)
PSI: 
S70_01735(sbcB)
PSX: 
DR96_3511(sbcB)
MMK: 
ASY: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_1166(sbcB)
ETD: 
ETE: 
ETEE_3116(sbcB)
ETC: 
EDW: 
EDL: 
EHO: 
HAV: 
OPO: 
PFQ: 
PSHI: 
HIN: 
HI1377(sbcB)
HIT: 
NTHI1780(sbcB)
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HIA: 
HIH: 
HIW: 
HIC: 
HIX: 
HDU: 
HD_1412(sbcB)
HAP: 
HAPS_0025(sbcB)
HPAZ: 
HPAS: 
HPAK: 
HPR: 
HSO: 
HS_0872(sbcB)
HSM: 
PMU: 
PM0611(sbcB)
PMV: 
PUL: 
PMP: 
Pmu_06780(sbcB)
PMUL: 
MSU: 
MS1081(sbcB)
MHT: 
MHQ: 
MHAT: 
MHX: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MHAQ: 
MHAY: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
APL: 
APL_0673(sbcB)
APJ: 
APJL_0668(sbcB)
APA: 
APP7_0713(sbcB)
ASU: 
ASI: 
ASS: 
AEU: 
AAP: 
AAZ: 
AAT: 
AAO: 
AAN: 
AAH: 
AACN: 
GAN: 
BTO: 
BTRE: 
BTRH: 
BTRA: 
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XFL: 
XFS: 
XCC: 
XCC1551(sbcB)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XCV1640(sbcB)
XAC: 
XAC1599(sbcB)
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAX: 
XACM_1570(sbcB)
XAO: 
XOO: 
XOO2430(sbcB)
XOM: 
XOO2307(XOO2307)
XOP: 
XOY: 
XOR: 
XOZ: 
XAL: 
XSA: 
XTN: 
SML: 
Smlt3162(sbcB)
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SMD_2739(sbcB)
SACZ: 
STEK: 
SRH: 
PSU: 
PSUW: 
PSD: 
DSC_08460(sbcB)
LAB: 
LAQ: 
LCP: 
LGU: 
LEZ: 
GLE_2680(sbcB)
FAU: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
DTX: 
DKO: 
VCH: 
VC1234(sbcB)
VCF: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
O3Y_05745(sbcB)
VCL: 
VCQ: 
VCS: 
VCX: 
VCZ: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VP1301(sbcB)
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VEX: 
VHR: 
VSP: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VAU: 
VCY: 
VCT: 
VTU: 
VFL: 
VMI: 
VFI: 
VF_1482(sbcB)
VFM: 
VSA: 
AWD: 
PPR: 
PBPRA1693(SBCB)
PGB: 
GHO: 
PAE: 
PA4316(sbcB)
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PAEB: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
PMY: 
PMK: 
PRE: 
PPSE: 
BN5_1147(sbcB)
PALC: 
PPU: 
PP_1365(sbcB)
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
T1E_0219(sbcB)
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_09120(sbcB)
PPUD: 
PFV: 
PMON: 
PMOT: 
PMOS: 
PPJ: 
POR: 
PST: 
PSB: 
Psyr_4020(sbcB)
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PFL_4788(sbcB)
PPRC: 
PPRO: 
PPC_4796(sbcB)
PFO: 
PFS: 
PFLU_4940(sbcB)
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PFW: 
PFB: 
PFF: 
PPZ: 
PMAN: 
PTV: 
PEN: 
PSEEN1150(sbcB)
PSA: 
PST_1160(sbcB)
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
PBM: 
PBA: 
PBC: 
PPUU: 
PDR: 
PSV: 
PSK: 
PKC: 
PKB_4690(sbcB)
PCH: 
PCZ: 
PCP: 
PFZ: 
PALK: 
PRH: 
PSW: 
PPV: 
PSES: 
PSCI_2938(sbcB)
PSEM: 
PSEC: 
PPSY: 
PSOS: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
ACX: 
PBB: 
SON: 
SO_2790(sbcB)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
SVI_2537(sbcB)
ILO: 
IL1370(sbcB)
ILI: 
CPS: 
CPS_2014(sbcB)
COM: 
COZ: 
PHA: 
PSHAa1255(sbcB)
PAT: 
PSM: 
PSM_A1759(sbcB)
PSEO: 
PIA: 
PPHE: 
PBW: 
PRR: 
PTN: 
MAQ: 
MHC: 
MARHY2525(sbcB)
MAD: 
MBS: 
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:71298]
  Authors
Blakesley RW, Dodgson JB, Nes IF, Wells RD.
  Title
Duplex regions in "single-stranded" phiX174 DNA are cleaved by a restriction endonuclease from Haemophilus aegyptius.
  Journal
J. Biol. Chem. 252 (1977) 7300-6.
Reference
2
  Authors
Kelley, R.B., Atkinson, M.R., Huberman, J.A. and Kornberg, A.
  Title
Excision of thymine dimers and other mismatched sequences by DNA polymerases of Escherichia coli.
  Journal
Nature 224 (1969) 495-501.
Reference
3  [PMID:14235546]
  Authors
LEHMAN IR, NUSSBAUM AL.
  Title
THE DEOXYRIBONUCLEASES OF ESCHERICHIA COLI. V. ON THE SPECIFICITY OF EXONUCLEASE I (PHOSPHODIESTERASE).
  Journal
J. Biol. Chem. 239 (1964) 2628-36.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
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CAS: 
9037-46-1

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