KEGG   ENZYME: 3.1.21.2Help
Entry
EC 3.1.21.2                 Enzyme                                 

Name
deoxyribonuclease IV;
deoxyribonuclease IV (phage-T4-induced) (misleading);
endodeoxyribonuclease IV (phage T4-induced) (misleading);
E. coli endonuclease IV;
endodeoxyribonuclease (misleading);
redoxyendonuclease;
deoxriboendonuclease (misleading);
endonuclease II;
endonuclease IV;
DNA-adenine-transferase;
nfo (gene name)
Class
Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
BRITE hierarchy
Reaction(IUBMB)
Endonucleolytic cleavage of ssDNA at apurinic/apyrimidinic sites to 5'-phosphooligonucleotide end-products
Comment
The enzyme is an apurinic/apyrimidinic (AP) site endonuclease that primes DNA repair synthesis at AP sites. It specifically cleaves the DNA backbone at AP sites and also removes 3' DNA-blocking groups such as 3' phosphates, 3' phosphoglycolates, and 3' alpha,beta-unsaturated aldehydes that arise from oxidative base damage and the activity of combined glycosylase/lyase enzymes. It is also the only known repair enzyme that is able to cleave the DNA backbone 5' of the oxidative lesion alpha-deoxyadenosine. The enzyme has a strong preference for single-stranded DNA.
History
EC 3.1.21.2 created 1972 as EC 3.1.4.30, transferred 1978 to EC 3.1.21.2, modified 2014
Orthology
K01151  
deoxyribonuclease IV
Genes
ECU: 
EIN: 
EHE: 
NCE: 
ECO: 
b2159(nfo)
ECJ: 
ECD: 
EBW: 
ECOK: 
ECE: 
Z3416(nfo)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c2694(nfo)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ELL: 
ELC: 
ELD: 
ELP: 
EBL: 
EBE: 
ELF: 
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
STY: 
STY2438(nfo)
STT: 
t0652(nfo)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM2203(nfo)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA0648(nfo)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SEC: 
SC2219(nfo)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG2240(nfo)
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SEN2196(nfo)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_22940(SBOV22741)
SENE: 
SES: 
SBG: 
SBZ: 
SBV: 
YPE: 
YPO1306(nfo)
YPK: 
y2879(nfo)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_1286(nfo)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPT: 
YPD: 
YPX: 
YPH: 
YPS: 
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
YEN: 
YE1455(nfo)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YSI: 
SFL: 
SF2244(nfo)
SFX: 
S2373(nfo)
SFV: 
SFE: 
SFN: 
SFS: 
SSN: 
SSJ: 
SBO: 
SBC: 
SDY: 
SDZ: 
ECA: 
ECA2726(nfo)
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
EPY: 
EPR: 
EAM: 
EAY: 
EBI: 
ERJ: 
PLU: 
plu2857(nfo)
PAY: 
BUC: 
BU137(nfo)
BAP: 
BAU: 
BAW: 
BAJC: 
BUA: 
BUP: 
BAK: 
BUH: 
BAPF: 
BAPG: 
BAPU: 
BAPW: 
BAS: 
BUsg130(nfo)
BAB: 
bbp128(nfo)
BCC: 
BCc_087(nfo)
BAJ: 
SOD: 
PES: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
EEC: 
ENL: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
KPN: 
KPU: 
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPO: 
KPR: 
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
CKO: 
CRO: 
CFD: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SSZ: 
SCc_623(nfo)
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SERR: 
SFO: 
SERF: 
SERS: 
PMR: 
PMI0838(nfo)
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETD: 
ETE: 
ETC: 
SECT: 
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
XBO: 
XNE: 
PAM: 
PLF: 
PAJ: 
PAQ: 
PVA: 
PAO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
PSX: 
EBT: 
MMK: 
ROR: 
CNT: 
PGE: 
EBF: 
PSTS: 
HDU: 
HD1062(nfo)
HAP: 
HPAZ: 
HPAS: 
HPAK: 
MHT: 
MHQ: 
MHX: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
APL: 
APJ: 
APA: 
ASI: 
ASS: 
GAN: 
BTO: 
BTRE: 
BTRH: 
BTRA: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VFI: 
VF_2114(nfo)
VFM: 
VSA: 
PPR: 
SLO: 
SSE: 
SPL: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
PSY: 
FBL: 
AEH: 
HHA: 
HCS: 
AHA: 
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
ASA: 
AVR: 
AMED: 
TAU: 
GAP: 
BCI: 
BCIB: 
WSU: 
TDN: 
SUA: 
SKU: 
SULR: 
CFF: 
CFV: 
CAMP: 
CCV: 
CHA: 
CAJ: 
ABU: 
ABT: 
ABL: 
ANT: 
ARC: 
SDL: 
SBA: 
SMUL: 
NSA: 
NIS: 
SUN: 
NAM: 
GSU: 
GSU0529(nfo)
GSK: 
GME: 
GUR: 
GLO: 
GBM: 
GEO: 
GEM: 
GEB: 
PCA: 
PPD: 
DVU: 
DVU1224(nfo)
DVL: 
DVM: 
DVG: 
DDE: 
DDN: 
DMA: 
DSA: 
DAS: 
DAF: 
DHY: 
DPI: 
DBA: 
DRT: 
BMX: 
DPS: 
DAK: 
DPR: 
DSF: 
DOL: 
DAT: 
DTO: 
ADE: 
ACP: 
AFW: 
ANK: 
CCX: 
SUR: 
SCL: 
sce8011(nfo)
SCU: 
DAO: 
SFU: 
DBR: 
HMR: 
DAV: 
DPB: 
BJA: 
RPC: 
MGM: 
BSU: 
BSU25130(yqfS)
BSR: 
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSS: 
BST: 
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSUB: 
BSX: 
BSP: 
BLI: 
BL03699(nfo)
BLD: 
BLH: 
BAO: 
BAMF_2411(nvfo)
BAY: 
BAQ: 
BYA: 
BAMP: 
BAML: 
BAMA: 
BAMN: 
BAMB: 
BAMT: 
BAZ: 
BQL: 
LL3_02708(nvfO)
BXH: 
BQY: 
MUS_2808(yqfS)
BAMI: 
BAMC: 
BAMF: 
BAE: 
BHA: 
BAN: 
BA_4508(nfo)
BAR: 
BAT: 
BAH: 
BAI: 
BAX: 
BANT: 
BANR: 
BANS: 
BAL: 
BCE: 
BCA: 
BCZ: 
BCR: 
BCB: 
BCU: 
BCG: 
BCQ: 
BCX: 
BNC: 
BCF: 
BCER: 
BCY: 
BTK: 
BTL: 
BTB: 
BTT: 
BTC: 
BTF: 
BTM: 
BTG: 
BTI: 
BTN: 
BTHT: 
BTHU: 
BWE: 
BTY: 
BMYC: 
BCL: 
BPU: 
BPUM: 
BPF: 
BMQ: 
BMD: 
BMH: 
BCO: 
BCK: 
BAG: 
BJS: 
BACI: 
BIF: 
BLE: 
BMET: 
OIH: 
OB1938(nfo)
GKA: 
GTN: 
GTH: 
GTE: 
GWC: 
GYC: 
GYA: 
GCT: 
GMC: 
GGH: 
GJF: 
GST: 
AFL: 
AXL: 
LSP: 
LGY: 
HHD: 
TAP: 
VIR: 
BSE: 
SAU: 
SAV: 
SAW: 
SAH: 
SAJ: 
SAM: 
SAS: 
SAR: 
SAC: 
SAX: 
SAA: 
SAO: 
SAE: 
SAD: 
SUU: 
SUV: 
SUH: 
SUE: 
SUJ: 
SUK: 
SUC: 
SUT: 
SUQ: 
SUZ: 
SUD: 
SUX: 
SUW: 
SUG: 
SUF: 
SAUA: 
SAUE: 
SAUN: 
SAUS: 
SAUU: 
SAUZ: 
SAB: 
SUY: 
SAUB: 
SAUM: 
SAUC: 
SAUR: 
SAUI: 
SAUT: 
SAUJ: 
SAUK: 
SAUQ: 
SAUV: 
SAUW: 
SAUX: 
SAUY: 
SEP: 
SER: 
SEPP: 
SHA: 
SSP: 
SCA: 
SLG: 
SLN: 
SSD: 
SDT: 
SWA: 
SPAS: 
SXY: 
SXL: 
MCL: 
LMO: 
LMF: 
LMH: 
LMC: 
LMN: 
LMY: 
LMT: 
LMG: 
LMS: 
LMJ: 
LMQ: 
LML: 
LMP: 
LMW: 
LMX: 
LMZ: 
LMON: 
LMOC: 
LMOS: 
LMOO: 
LMOY: 
LMOT: 
LMOA: 
LMOL: 
LMOG: 
LMOE: 
LMOB: 
LMOJ: 
LMOZ: 
LMOD: 
LMOW: 
LMOX: 
LMOQ: 
LMR: 
LIN: 
LWE: 
lwe1465(nfo)
LSG: 
LIV: 
LIW: 
ESI: 
EAT: 
EAN: 
EXM: 
BBE: 
PJD: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPM_1238(nfo1) PPM_2685(nfo3)
PPOL: 
PPQ: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PLV: 
PSAB: 
PDU: 
TCO: 
AAC: 
AAD: 
BTS: 
SIV: 
LPL: 
lp_1976(nfo)
LPJ: 
LPT: 
LPS: 
LPR: 
LPZ: 
LSA: 
LSA0868(nfo)
LBR: 
LBK: 
LCA: 
LCB: 
LCZ: 
LCS: 
LCE: 
LCW: 
LCL: 
LRH: 
LRG: 
LRL: 
LRA: 
LRO: 
LRC: 
LBH: 
LBN: 
LRM: 
LSN: 
LPI: 
LPQ: 
PPE: 
PPEN: 
PCE: 
EFA: 
EF1736(nfo)
EFL: 
EFI: 
EFD: 
EFS: 
EFN: 
EFC: 
EFAU: 
EFU: 
EFM: 
EFT: 
EHR: 
ENE: 
ECAS: 
EMU: 
MPS: 
MPX: 
THL: 
CRN: 
CML: 
CAW: 
CAC: 
CAE: 
CAY: 
CPE: 
CPF: 
CPR: 
CTC: 
CTET: 
CNO: 
CBO: 
CBA: 
CBH: 
CBY: 
CBL: 
CBK: 
CBB: 
CBI: 
CBN: 
CBT: 
CBF: 
CBM: 
CBJ: 
CBE: 
CKL: 
CKR: 
CCE: 
CLJ: 
CCB: 
CLS: 
CLB: 
CSR: 
CPAS: 
CSB: 
CAH: 
CLT: 
AOE: 
ASF: 
ASM: 
ASO: 
ASB: 
CTX: 
CCL: 
ESR: 
ESU: 
CSS: 
CSD: 
EHA: 
RBR: 
RUM: 
RUS: 
BFI: 
CLE: 
RHO: 
RIX: 
RIM: 
CCT: 
ROB: 
RTO: 
CPY: 
CSH: 
CSO: 
CAD: 
CDF: 
CDC: 
CDL: 
CDG: 
STH: 
SLP: 
DSY: 
DHD: 
DDH: 
DDL: 
DRM: 
DAE: 
DCA: 
DKU: 
DRU: 
DGI: 
PTH: 
DAU: 
TJR: 
SGY: 
DOR: 
DAI: 
DMI: 
DED: 
DEC: 
DRS: 
HMO: 
FMA: 
EEL: 
ERE: 
ERT: 
ERA: 
ELM: 
EAC: 
AWO: 
OVA: 
TMR: 
SAY: 
TPY_1693(nfo) TPY_2499(nfo)
SAP: 
BPRM: 
BPRS: 
BPRL: 
TTE: 
TTE1276(Nfo)
TEX: 
THX: 
TPD: 
TIT: 
TMT: 
TBO: 
TWI: 
CHY: 
MTA: 
ADG: 
TPZ: 
CSC: 
ATE: 
COB: 
CHD: 
COW: 
CKI: 
CKN: 
CLC: 
TOC: 
TTM: 
TTO: 
TXY: 
TSH: 
CPO: 
TNR: 
MAS: 
NTH: 
HOR: 
HAS: 
HPK: 
AAR: 
HHL: 
VPR: 
SSG: 
SRI: 
MED: 
PUF: 
AFN: 
AIN: 
ERH: 
ERS: 
MGE: 
MGU: 
MGC: 
MGQ: 
MGX: 
MPN: 
MPN328(nfo)
MPM: 
MPJ: 
MPB: 
MPU: 
MPE: 
MGA: 
MGH: 
MGF: 
MGN: 
MGS: 
MGT: 
MGV: 
MGW: 
MGAC: 
MGAN: 
MGNC: 
MGZ: 
MMY: 
MMYM: 
MML: 
MMO: 
MHY: 
mhp065(nfo)
MHJ: 
MHP: 
MHN: 
MHYL: 
MHYO: 
MSY: 
MCP: 
MAA: 
MAL: 
MAT: 
MCO: 
MHO: 
MCD: 
MHR: 
MHH: 
MHM: 
MHS: 
MHV: 
MFR: 
MFM: 
MFP: 
MBV: 
MBH: 
MBI: 
MBQ: 
MLC: 
MLH: 
MHA: 
MHF: 
MSS: 
MSK: 
Msui07790(apn1)
MPF: 
MPUT: 
MHE: 
MWE: 
MHL: 
MCY: 
MCYN_0778(MCYN0778)
MHB: 
MPV: 
MOV: 
MBC: 
MCR: 
UUR: 
UU306(nfo)
UPA: 
UUE: 
HCR: 
POY: 
PAM_454(nfo)
AYW: 
PML: 
PAL: 
NZS: 
SLY_0233(nfo) SLY_0234(nfo)
PSOL: 
ACL: 
ABRA: 
APAL: 
MFL: 
MFW: 
SCR: 
SSYR: 
SDI: 
STAI: 
SAPI: 
SMIR: 
SCQ: 
SSAB: 
MBJ: 
MTU: 
Rv0670(end)
MTV: 
MTC: 
MRA: 
MTF: 
MTB: 
MTK: 
MTI: 
MTE: 
MTUR: 
MTL: 
MTO: 
MTD: 
MTN: 
MTJ: 
MTUB: 
MTUC: 
MTUE: 
MTX: 
MTUH: 
MTUL: 
MTUT: 
MTUU: 
MTQ: 
MBO: 
Mb0689(end)
MBB: 
MBT: 
MBM: 
MBK: 
MAF: 
MCE: 
MCQ: 
MCV: 
MCX: 
MCZ: 
MLE: 
MLB: 
MPA: 
MAP4132(end)
MAO: 
MAV: 
MIT: 
MIR: 
MIA: 
MID: 
MYO: 
MSM: 
MSG: 
MSA: 
MUL: 
MVA: 
MGI: 
MSP: 
MMC: 
MKM: 
MJL: 
MJD: 
MMI: 
MRH: 
MMM: 
MCB: 
MLI: 
MKN: 
MNE: 
ASD: 
NFA: 
NCY: 
NBR: 
NNO: 
RHA: 
ROP: 
ROA: 
REQ: 
RPY: 
GBR: 
GPO: 
GOR: 
TPR: 
SCO: 
SCO2111(SC6E10.05)
SMA: 
SGR: 
SCB: 
SSX: 
SVL: 
SCT: 
SCY: 
SFA: 
SBH: 
SHY: 
SHO: 
SVE: 
SDV: 
SALB: 
STRP: 
SFI: 
SCI: 
SRC: 
SALU: 
SLV: 
KSK: 
BCV: 
XCE: 
IVA: 
CFL: 
CFI: 
CGA: 
ICA: 
PAC: 
PAK: 
PAV: 
PAX: 
PAZ: 
PAW: 
PAD: 
PCN: 
PACC: 
PACH: 
PFR: 
PPC: 
PBO: 
PRA: 
MPH: 
NCA: 
KFL: 
TFU: 
NDA: 
NAL: 
TCU: 
SRO: 
ACE: 
NML: 
GOB: 
BSD: 
MMAR: 
SEN: 
SVI: 
TBI: 
AMD: 
AMN: 
AMM: 
AMZ: 
AOI: 
AJA: 
AMQ: 
PDX: 
AMI: 
SESP: 
KAL: 
STP: 
SAQ: 
MAU: 
MIL: 
VMA: 
AMS: 
ASE: 
ACTN: 
AFS: 
CAI: 
SNA: 
BLO: 
BLJ: 
BLN: 
BLON: 
BLF: 
BLL: 
BLB: 
BLM: 
BLK: 
BLG: 
BBI: 
BBP: 
BBF: 
BBV: 
BBRU: 
BBRE: 
BBRV: 
BBRJ: 
BBRC: 
BBRN: 
BBRS: 
RXY: 
RRD: 
CWO: 
AFO: 
CCU: 
SHI: 
APV: 
ELE: 
EYY: 
CGO: 
GPA: 
AEQ: 
CTR: 
CT_625(nfo)
CTD: 
CTF: 
CTRD: 
CTRO: 
CTRT: 
CTA: 
CTY: 
CRA: 
CTRQ: 
CTRX: 
CTRZ: 
CTRP: 
CTLJ: 
CTLX: 
CTLL: 
CTB: 
CTL0889(nfo)
CTRR: 
CTLF: 
CTLI: 
CTL: 
CTRU: 
CTRL: 
CTRV: 
CTRM: 
CTLA: 
CTLM: 
CTLS: 
CTLZ: 
CTLC: 
CTLN: 
CTLB: 
CTLQ: 
CTO: 
CTRN: 
CTJ: 
CTZ: 
CTG: 
CTK: 
CSW: 
CES: 
CTRB: 
CTRE: 
CTRS: 
CTEC: 
CFS: 
CFW: 
CTFW: 
CTRF: 
CTCH: 
CTN: 
CTQ: 
CTV: 
CTW: 
CTRG: 
CTRI: 
CTRA: 
CTRH: 
CTRJ: 
CTRK: 
CTJT: 
CTCF: 
CTFS: 
CTHF: 
CTCJ: 
CTHJ: 
CTMJ: 
CTTJ: 
CTJS: 
CTRC: 
CTRW: 
CTRY: 
CTCT: 
CMU: 
TC_0914(nfo)
CMN: 
CPN: 
CPn0732(nfo)
CPA: 
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:4895219]
  Authors
Friedberg EC, Goldthwait DA.
  Title
Endonuclease II of E. coli. I. Isolation and purification.
  Journal
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 62 (1969) 934-40.
Reference
2  [PMID:4981786]
  Authors
Friedberg EC, Hadi SM, Goldthwait DA.
  Title
Endonuclease II of Escherichia coli. II. Enzyme properties and studies on the degradation of alkylated and native deoxyribonucleic acid.
  Journal
J. Biol. Chem. 244 (1969) 5879-89.
Reference
3  [PMID:4944066]
  Authors
Hadi SM, Goldthwait DA.
  Title
Endonuclease II of Escherichia coli. Degradation of partially depurinated deoxyribonucleic acid.
  Journal
Biochemistry. 10 (1971) 4986-93.
Reference
4  [PMID:2430946]
  Authors
Cunningham RP, Saporito SM, Spitzer SG, Weiss B
  Title
Endonuclease IV (nfo) mutant of Escherichia coli.
  Journal
J. Bacteriol. 168 (1986) 1120-7.
Reference
5  [PMID:7516707]
  Authors
Ide H, Tedzuka K, Shimzu H, Kimura Y, Purmal AA, Wallace SS, Kow YW
  Title
Alpha-deoxyadenosine, a major anoxic radiolysis product of adenine in DNA, is a substrate for Escherichia coli endonuclease IV.
  Journal
Biochemistry. 33 (1994) 7842-7.
Reference
6  [PMID:10458614]
  Authors
Hosfield DJ, Guan Y, Haas BJ, Cunningham RP, Tainer JA
  Title
Structure of the DNA repair enzyme endonuclease IV and its DNA complex: double-nucleotide flipping at abasic sites and three-metal-ion catalysis.
  Journal
Cell. 98 (1999) 397-408.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
63363-78-0

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