KEGG   ENZYME: 3.1.4.52Help
Entry
EC 3.1.4.52                 Enzyme                                 

Name
cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase;
cyclic bis(3->5')diguanylate phosphodiesterase;
c-di-GMP-specific phosphodiesterase;
c-di-GMP phosphodiesterase;
phosphodiesterase (misleading);
phosphodiesterase A1;
PDEA1;
VieA
Class
Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Phosphoric-diester hydrolases
BRITE hierarchy
Sysname
cyclic bis(3->5')diguanylate 3-guanylylhydrolase
Reaction(IUBMB)
cyclic di-3',5'-guanylate + H2O = 5'-phosphoguanylyl(3'->5')guanosine [RN:R08991]
Reaction(KEGG)
Substrate
cyclic di-3',5'-guanylate [CPD:C16463];
H2O [CPD:C00001]
Product
5'-phosphoguanylyl(3'->5')guanosine [CPD:C18076]
Comment
Requires Mg2+ or Mn2+ for activity and is inhibited by Ca2+ and Zn2+. Contains a heme unit. This enzyme linearizes cyclic di-3,5-guanylate, the product of EC 2.7.7.65, diguanylate cyclase and an allosteric activator of EC 2.4.1.12, cellulose synthase (UDP-forming), rendering it inactive [1]. It is the balance between these two enzymes that determines the cellular level of c-di-GMP [1].
History
EC 3.1.4.52 created 2008
Orthology
K13243  
c-di-GMP-specific phosphodiesterase
K13244  
c-di-GMP-specific phosphodiesterase
K13245  
c-di-GMP-specific phosphodiesterase
K13246  
c-di-GMP phosphodiesterase
K14051  
cyclic di-GMP phosphodiesterase Gmr
Genes
ECO: 
b0315(yahA) b1285(gmr) b1489(dosP)
ECJ: 
Y75_p0305(yahA) Y75_p1260(gmr) Y75_p1465(dos)
ECD: 
EBW: 
BWG_1117(gmr) BWG_1310(dos)
ECOK: 
ECE: 
Z0403(yahA) Z2221m Z2516(yciR)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_0371(yahA) ECSP_1806(gmr)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_00271(yahA) ECB_01262(yciR) ECB_01447(dos)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m0390(yahA) ECW_m1380(gmr) ECW_m1617(dos)
ELL: 
WFL_01915(yahA) WFL_06725(gmr) WFL_07915(dosP)
ELC: 
ELD: 
ELP: 
EBL: 
ECD_00271(yahA) ECD_01262(yciR) ECD_01447(dos)
EBE: 
B21_00274(yahA) B21_01273(gmr) B21_01459(dos)
ELF: 
LF82_0512(dos) LF82_0904(gmr) LF82_2511(yahA)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
EFER_1580(dos) EFER_1668(gmr) EFER_2670(yahA)
STY: 
STT: 
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM1703(yciR)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA1174(yciR)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_2029(yciR)
SEC: 
SC1697(yciR)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG1410(yciR)
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SEN1329(yciR)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_17540(SBOV17201)
SENE: 
SBG: 
SBZ: 
SBV: 
YEN: 
YEP: 
YEY: 
SFV: 
SFE: 
SFN: 
SFS: 
SSN: 
SSJ: 
SBO: 
SBC: 
SDZ: 
EBI: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLA: 
ECLC: 
ECLG: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CKO: 
CRO: 
CFD: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMW: 
SLQ: 
SFO: 
SERF: 
SERS: 
PAM: 
PANA_2043(yciR)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_1367(yciR)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_1481(yciR)
PAO: 
KLN: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
EBT: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
PSTS: 
FAU: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VAN: 
MAD: 
GAG: 
BVI: 
BUR: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCEN: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BMK: 
BCT: 
BCED: 
BXE: 
BXB: 
BPH: 
BPY: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BUK: 
BPX: 
BPT: 
AXY: 
AXO: 
AXN: 
AXS: 
CCR: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
PZU: 
BSD: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:11297407]
  Authors
Chang AL, Tuckerman JR, Gonzalez G, Mayer R, Weinhouse H, Volman G, Amikam D, Benziman M, Gilles-Gonzalez MA.
  Title
Phosphodiesterase A1, a regulator of cellulose synthesis in Acetobacter xylinum, is a heme-based sensor.
  Journal
Biochemistry. 40 (2001) 3420-6.
  Sequence
[up:P19449]
Reference
2  [PMID:15994307]
  Authors
Christen M, Christen B, Folcher M, Schauerte A, Jenal U.
  Title
Identification and characterization of a cyclic di-GMP-specific phosphodiesterase and its allosteric control by GTP.
  Journal
J. Biol. Chem. 280 (2005) 30829-37.
  Sequence
[ccr:CC_3396]
Reference
3  [PMID:15995192]
  Authors
Schmidt AJ, Ryjenkov DA, Gomelsky M.
  Title
The ubiquitous protein domain EAL is a cyclic diguanylate-specific phosphodiesterase: enzymatically active and inactive EAL domains.
  Journal
J. Bacteriol. 187 (2005) 4774-81.
  Sequence
[eco:b1489 b0315]
Reference
4  [PMID:16081414]
  Authors
Tamayo R, Tischler AD, Camilli A.
  Title
The EAL domain protein VieA is a cyclic diguanylate phosphodiesterase.
  Journal
J. Biol. Chem. 280 (2005) 33324-30.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
338732-46-0

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