KEGG   ENZYME: 3.1.4.52Help
Entry
EC 3.1.4.52                 Enzyme                                 

Name
cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase;
cyclic bis(3->5')diguanylate phosphodiesterase;
c-di-GMP-specific phosphodiesterase;
c-di-GMP phosphodiesterase;
phosphodiesterase (misleading);
phosphodiesterase A1;
PDEA1;
VieA
Class
Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Phosphoric-diester hydrolases
BRITE hierarchy
Sysname
cyclic bis(3->5')diguanylate 3-guanylylhydrolase
Reaction(IUBMB)
cyclic di-3',5'-guanylate + H2O = 5'-phosphoguanylyl(3'->5')guanosine [RN:R08991]
Reaction(KEGG)
Substrate
cyclic di-3',5'-guanylate [CPD:C16463];
H2O [CPD:C00001]
Product
5'-phosphoguanylyl(3'->5')guanosine [CPD:C18076]
Comment
Requires Mg2+ or Mn2+ for activity and is inhibited by Ca2+ and Zn2+. Contains a heme unit. This enzyme linearizes cyclic di-3,5-guanylate, the product of EC 2.7.7.65, diguanylate cyclase and an allosteric activator of EC 2.4.1.12, cellulose synthase (UDP-forming), rendering it inactive [1]. It is the balance between these two enzymes that determines the cellular level of c-di-GMP [1].
History
EC 3.1.4.52 created 2008
Orthology
K07181  
c-di-GMP phosphodiesterase
K13243  
c-di-GMP-specific phosphodiesterase
K13244  
c-di-GMP-specific phosphodiesterase
K13245  
c-di-GMP-specific phosphodiesterase
K13246  
c-di-GMP phosphodiesterase
K14051  
cyclic di-GMP phosphodiesterase Gmr
K20962  
c-di-GMP phosphodiesterase
K20963  
c-di-GMP phosphodiesterase
K20964  
c-di-GMP phosphodiesterase
K20965  
c-di-GMP phosphodiesterase
K20966  
c-di-GMP phosphodiesterase
K21024  
c-di-GMP phosphodiesterase
Genes
ECO: 
b0315(yahA) b1285(gmr) b1489(dosP)
ECJ: 
JW0307(yahA) JW1278(gmr) JW1484(dos)
ECD: 
EBW: 
BWG_1117(gmr) BWG_1310(dos)
ECOK: 
ECE: 
Z0403(yahA) Z2516(yciR)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_0371(yahA) ECSP_1806(gmr)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_00271(yahA) ECB_01262(yciR) ECB_01447(dos)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m0390(yahA) ECW_m1380(gmr) ECW_m1617(dos)
ELL: 
WFL_01915(yahA) WFL_06725(gmr) WFL_07915(dosP)
ELC: 
ELD: 
ELP: 
EBL: 
ECD_00271(yahA) ECD_01262(yciR) ECD_01447(dos)
EBE: 
B21_00274(yahA) B21_01273(gmr) B21_01459(dos)
ELF: 
LF82_0512(dos) LF82_0904(gmr) LF82_2511(yahA)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
ECOS: 
EFE: 
EFER_1580(dos) EFER_1668(gmr) EFER_2670(yahA)
EAL: 
STY: 
STT: 
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM1703(yciR)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SENR: 
SEND: 
SENI: 
SEEN: 
SPT: 
SPA1174(yciR)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_2029(yciR)
SEC: 
SCH_1697(yciR)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG1410(yciR)
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SEN1329(yciR)
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
SENE: 
SENC: 
SES: 
SBG: 
SBZ: 
SBV: 
SFV: 
SFE: 
SFN: 
SFS: 
SFT: 
NCTC1_01363(gmr_1) NCTC1_01364(gmr_2) NCTC1_01365(gmr_3) NCTC1_01884(dosP)
SSN: 
SSJ: 
SBO: 
SBC: 
SDZ: 
SHQ: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ECLA: 
ECLC: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
ENR: 
ENX: 
ENF: 
ESA: 
CSK: 
CSZ: 
CSI: 
CSJ: 
CCON: 
CDM: 
CMJ: 
CUI: 
CMW: 
CTU: 
KMI: 
KLE: 
CKO: 
CRO: 
CFD: 
CAMA: 
CIF: 
EBT: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
KSA: 
KOR: 
KIN: 
LAX: 
LAZ: 
PSTS: 
YEN: 
YEP: 
YEY: 
YEW: 
YET: 
YEF: 
YEE: 
YAL: 
YFR: 
YIN: 
YKR: 
YRO: 
YRU: 
YRB: 
YAK: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMW: 
SMAR: 
SMAC: 
SLQ: 
SERF: 
SERS: 
SFO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
EBI: 
EGE: 
PAM: 
PANA_2043(yciR)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_1367(yciR)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_1481(yciR)
PAO: 
KLN: 
PANT: 
PANP: 
PAGG: 
OPO: 
PSHI: 
FAU: 
VCH: 
VCF: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VCQ: 
VCS: 
VCX: 
VCZ: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VEX: 
VHR: 
VSP: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VAU: 
VCY: 
VCT: 
VTU: 
VFL: 
VMI: 
VFI: 
VFM: 
VSA: 
AWD: 
PPR: 
PBPRA0139(VP1147) PBPRA0620(VV2690)
PGB: 
GHO: 
PAE: 
PA4367(bifA)
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PAEB: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
PMY: 
PMK: 
PRE: 
PPSE: 
PALC: 
PPU: 
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_08860(bifA)
PPUD: 
PFV: 
PMON: 
PMOT: 
PMOS: 
PPJ: 
POR: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PPRC: 
PPRO: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PFW: 
PFB: 
PFF: 
PPZ: 
PMAN: 
PTV: 
PEN: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
PBM: 
PBA: 
PBC: 
PPUU: 
PDR: 
PSV: 
PSK: 
PKC: 
PCH: 
PCZ: 
PCP: 
PFZ: 
PALK: 
PRH: 
PSW: 
PPV: 
PSES: 
PSEM: 
PSEC: 
PPSY: 
PSOS: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
ACX: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
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SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SSE: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
PRR: 
MAQ: 
MHC: 
MAD: 
MARI: 
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GAG: 
MVS: 
LOK: 
TVI: 
HCH: 
HCO: 
LOKO_02376(cph2_15)
MME: 
AHY: 
GPB: 
BVI: 
BVE: 
BUR: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCEN: 
BCEW: 
BCEO: 
I35_4474(rpfR)
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMK: 
BMUL: 
BCT: 
BCED: 
BDL: 
BPYR: 
BCON: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BUK: 
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BXE: 
BXB: 
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SME: 
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SMQ: 
SMX: 
SMI: 
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SMD: 
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SFD: 
SIX: 
EAD: 
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BJP: 
CCR: 
CCS: 
CAK: 
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PZU: 
RRF: 
AWO: 
ERL: 
BSD: 
SYND: 
SLR: 
BLQ: 
L21SP5_00638(pdhS_1)
LOKI: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:11297407]
  Authors
Chang AL, Tuckerman JR, Gonzalez G, Mayer R, Weinhouse H, Volman G, Amikam D, Benziman M, Gilles-Gonzalez MA.
  Title
Phosphodiesterase A1, a regulator of cellulose synthesis in Acetobacter xylinum, is a heme-based sensor.
  Journal
Biochemistry. 40 (2001) 3420-6.
Reference
2  [PMID:15994307]
  Authors
Christen M, Christen B, Folcher M, Schauerte A, Jenal U.
  Title
Identification and characterization of a cyclic di-GMP-specific phosphodiesterase and its allosteric control by GTP.
  Journal
J. Biol. Chem. 280 (2005) 30829-37.
  Sequence
[ccr:CC_3396]
Reference
3  [PMID:15995192]
  Authors
Schmidt AJ, Ryjenkov DA, Gomelsky M.
  Title
The ubiquitous protein domain EAL is a cyclic diguanylate-specific phosphodiesterase: enzymatically active and inactive EAL domains.
  Journal
J. Bacteriol. 187 (2005) 4774-81.
  Sequence
[eco:b1489 b0315]
Reference
4  [PMID:16081414]
  Authors
Tamayo R, Tischler AD, Camilli A.
  Title
The EAL domain protein VieA is a cyclic diguanylate phosphodiesterase.
  Journal
J. Biol. Chem. 280 (2005) 33324-30.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
338732-46-0

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