KEGG   ENZYME: 3.6.4.13Help
Entry
EC 3.6.4.13                 Enzyme                                 

Name
RNA helicase;
CSFV NS3 helicase;
DBP2;
DbpA;
DDX17;
DDX25;
DDX3;
DDX3X;
DDX3Y;
DDX4;
DDX5;
DEAD-box protein DED1;
DEAD-box RNA helicase;
DEAH-box protein 2;
DEAH-box RNA helicase;
DED1;
Dex(H/D) RNA helicase;
EhDEAD1;
EhDEAD1 RNA helicase;
eIF4A helicase;
KOKV helicase;
Mtr4p;
nonstructural protein 3 helicase;
NPH-II;
RHA;
RNA helicase A;
RNA helicase DDX3;
RNA helicase Hera;
RNA-dependent ATPase;
TGBp1 NTPase/helicase domain;
VRH1;
GRTH/DDX25
Class
Hydrolases;
Acting on acid anhydrides;
Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
BRITE hierarchy
Sysname
ATP phosphohydrolase (RNA helix unwinding)
Reaction(IUBMB)
ATP + H2O = ADP + phosphate [RN:R00086]
Reaction(KEGG)
Substrate
ATP [CPD:C00002];
H2O [CPD:C00001]
Product
ADP [CPD:C00008];
phosphate [CPD:C00009]
Comment
RNA helicases utilize the energy from ATP hydrolysis to unwind RNA. Some of them unwind RNA with a 3' to 5' polarity [3], other show 5' to 3' polarity [8]. Some helicases unwind DNA as well as RNA [7,8]. May be identical with EC 3.6.4.12 (DNA helicase).
History
EC 3.6.4.13 created 2009
Orthology
K03578  
ATP-dependent helicase HrpA
K03579  
ATP-dependent helicase HrpB
K03732  
ATP-dependent RNA helicase RhlB
K05591  
ATP-independent RNA helicase DbpA
K05592  
ATP-dependent RNA helicase DeaD
K11273  
chromosome transmission fidelity protein 1
K11594  
ATP-dependent RNA helicase DDX3X
K11701  
helicase required for RNAi-mediated heterochromatin assembly 1
K11927  
ATP-dependent RNA helicase RhlE
K12598  
ATP-dependent RNA helicase DOB1
K12614  
ATP-dependent RNA helicase DDX6/DHH1
K12647  
interferon-induced helicase C domain-containing protein 1
K12811  
ATP-dependent RNA helicase DDX46/PRP5
K12812  
ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
K12813  
pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
K12814  
pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase-like protein PRP2
K12815  
pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX38/PRP16
K12818  
ATP-dependent RNA helicase DHX8/PRP22
K12820  
pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15/PRP43
K12823  
ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
K12835  
ATP-dependent RNA helicase DDX42
K12854  
pre-mRNA-splicing helicase BRR2
K12858  
ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
K13025  
ATP-dependent RNA helicase
K13116  
ATP-dependent RNA helicase DDX41
K13117  
ATP-dependent RNA helicase DDX35
K13131  
ATP-dependent RNA helicase DDX20
K13177  
ATP-dependent RNA helicase DDX1
K13178  
ATP-dependent RNA helicase DDX17
K13179  
ATP-dependent RNA helicase DDX18/HAS1
K13181  
ATP-dependent RNA helicase DDX27
K13182  
ATP-dependent RNA helicase DDX39
K13183  
ATP-dependent RNA helicase DDX50
K13184  
ATP-dependent RNA helicase A
K13185  
ATP-dependent RNA helicase DHX30
K13982  
probable ATP-dependent RNA helicase DDX4
K13983  
putative helicase MOV10L1
K14442  
ATP-dependent RNA helicase DHX36
K14776  
ATP-dependent RNA helicase DDX10/DBP4
K14777  
ATP-dependent RNA helicase DDX47/RRP3
K14778  
ATP-dependent RNA helicase DDX49/DBP8
K14779  
ATP-dependent RNA helicase DDX52/ROK1
K14780  
ATP-dependent RNA helicase DHX37/DHR1
K14781  
ATP-dependent RNA helicase DHR2
K14805  
ATP-dependent RNA helicase DDX24/MAK5
K14806  
ATP-dependent RNA helicase DDX31/DBP7
K14807  
ATP-dependent RNA helicase DDX51/DBP6
K14808  
ATP-dependent RNA helicase DDX54/DBP10
K14809  
ATP-dependent RNA helicase DDX55/SPB4
K14810  
ATP-dependent RNA helicase DDX56/DBP9
K14811  
ATP-dependent RNA helicase DBP3
K16911  
ATP-dependent RNA helicase DDX21
K17043  
ATP-dependent RNA helicase DDX43
K17265  
Ras GTPase-activating protein-binding protein 1
K17642  
ATP-dependent RNA helicase DDX3Y
K17675  
ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1/SUV3
K17678  
ATP-dependent RNA helicase MRH4, mitochondrial
K17679  
ATP-dependent RNA helicase MSS116, mitochondrial
K17820  
ATP-dependent RNA helicase DHX33
K18408  
ATP-dependent RNA helicase TDRD9
K18409  
ATP-dependent RNA helicase TDRD12
K18422  
helicase MOV-10
K18432  
RNA helicase armi
Genes
HSA: 
10146(G3BP1) 101929327 10212(DDX39A) 10521(DDX17) 11056(DDX52) 11218(DDX20) 11269(DDX19B) 11325(DDX42) 122402(TDRD9) 1653(DDX1) 1654(DDX3X) 1655(DDX5) 1656(DDX6) 1659(DHX8) 1660(DHX9) 1662(DDX10) 1663(DDX11) 1665(DHX15) 170506(DHX36) 22907(DHX30) 23020(SNRNP200) 23517(SKIV2L2) 29118(DDX25) 317781(DDX51) 4343(MOV10) 51202(DDX47) 51428(DDX41) 54456(MOV10L1) 54514(DDX4) 54555(DDX49) 54606(DDX56) 55308(DDX19A) 55510(DDX43) 55661(DDX27) 56919(DHX33) 57062(DDX24) 57647(DHX37) 57696(DDX55) 60625(DHX35) 64135(IFIH1) 64794(DDX31) 6832(SUPV3L1) 79009(DDX50) 79039(DDX54) 7919(DDX39B) 8449(DHX16) 8653(DDX3Y) 8886(DDX18) 90957(DHX57) 91646(TDRD12) 9188(DDX21) 9416(DDX23) 9775(EIF4A3) 9785(DHX38) 9879(DDX46)
PTR: 
100616507(DDX19A) 449508(DDX3Y) 450181(DDX17) 450499(DDX50) 450500(DDX21) 451534(DDX10) 451594(DDX6) 451649(DDX25) 451868(DDX23) 452379(DDX51) 452413 453129(DDX24) 453195(TDRD9) 454213(DDX19B) 454237(DHX38) 454607(DDX52) 454941(EIF4A3) 455267(DDX5) 455783(DDX39A) 455866(DDX49) 455925(TDRD12) 457099(MOV10) 457107(DDX20) 457568(DHX9) 458249(DHX35) 458320(DDX27) 459042(DDX1) 459169(DHX57) 459413(SNRNP200) 459566(DDX18) 459692(IFIH1) 460791(DHX36) 461011(DHX30) 461142(DHX15) 461867(DDX4) 461870(SKIV2L2) 462070(DDX46) 462310(DDX41) 462546(DHX16) 462821(DDX43) 463180(DDX39B) 464816(DDX31) 465298(DDX47) 465368(DDX11) 466095(SUPV3L1) 468453(DHX33) 471711(G3BP1) 738094(MOV10L1) 738366(DDX56) 738909(DDX42) 739545(DDX54) 740465(DHX8) 742589 742915(DDX3X) 745267(DDX55) 745343
PPS: 
100967598(DDX41) 100967975(DDX42) 100969288(SUPV3L1) 100970251(DHX16) 100970420(DDX3X) 100972135(DDX51) 100972170(DDX6) 100973226(DDX39A) 100973357(DHX36) 100973521(DHX57) 100974169(DHX33) 100974687(DDX31) 100974955(MOV10L1) 100974963(DDX55) 100975243(SNRNP200) 100975496(DDX1) 100976703(DDX56) 100976930(DDX17) 100977429(DDX46) 100978005(DDX39B) 100978190 100978225(DDX5) 100978418(DHX9) 100979042(DDX25) 100979543(DDX43) 100980209(DHX8) 100980939(DDX10) 100981492(DDX20) 100981509 100981559(IFIH1) 100983262 100983308(DDX52) 100983481(DDX27) 100983602 100984051(MOV10) 100984562(DHX37) 100984626(DDX19B) 100986047(DDX47) 100986439(DHX30) 100986507(SKIV2L2) 100987784(DDX24) 100987865(G3BP1) 100989198(DDX4) 100990054(DDX18) 100990059 100990790(DHX15) 100990848(DDX53) 100991680(DDX23) 100992185(DDX54) 100992357(DHX35) 100992649 100992985(TDRD12) 100993642(TDRD9) 100993786(DHX38) 100995295(DDX49) 100995398(DDX21) 100995966(DDX50)
GGO: 
101124409(DDX10) 101124642(DDX20) 101125245(DDX21) 101125584 101125860(DHX9) 101126754(DDX41) 101127004(DHX16) 101127629 101127882(DDX17) 101128064 101128333(DDX19B) 101128435 101128877(MOV10) 101129222(DDX50) 101129818(MOV10L1) 101130028(DHX35) 101130078(DDX6) 101130305(SUPV3L1) 101130463(DDX54) 101130489(DDX52) 101130741(DDX19A) 101134914(DDX5) 101135084(DDX3X) 101136169(DDX31) 101136376(DDX39A) 101136465 101136789(DHX57) 101137293(DDX25) 101137314(DHX30) 101138032(DDX11) 101138116(DDX53) 101140016 101140846(DDX55) 101141623(EIF4A3) 101141726(DHX15) 101142401(DDX56) 101142588(IFIH1) 101143445(DDX24) 101143661(DDX1) 101144570 101144828(G3BP1) 101145224(DDX27) 101145418(DHX38) 101145803(DDX43) 101147472(DDX39B) 101147654(DDX18) 101147897(DDX23) 101148379(DDX47) 101149254(DDX4) 101150411(DDX51) 101151498(SNRNP200) 101151519(TDRD9) 101152149(SKIV2L2) 101152744(DDX42) 101152748(DHX8) 101153344(DHX33) 101154153(DHX37)
PON: 
100147741(SNRNP200) 100171569(DDX3Y) 100171919(DDX24) 100172205(DHX30) 100172249(DDX23) 100172442(DHX35) 100172451(SUPV3L1) 100172476(G3BP1) 100173254(DDX18) 100173349(DDX42) 100173700(DHX38) 100173968(DHX8) 100173977(DDX5) 100174133(DDX1) 100174435(DHX15) 100174561(DDX39B) 100174587(DDX56) 100174753(DDX19A) 100190811(DDX6) 100432327(DDX20) 100433943(DHX37) 100434457(TDRD9) 100435128(MOV10L1) 100435388(DDX46) 100435607(TDRD12) 100435678(DDX21) 100436047(DDX50) 100436285 100437479(DDX39A) 100437507(DDX41) 100438692(DHX33) 100438807(IFIH1) 100438835(DDX27) 100439030(DDX25) 100441544(DHX16) 100445366(DDX54) 100446823(DDX3X) 100447175(SKIV2L2) 100447966(DDX31) 100448472(DDX11) 100448519(DDX49) 100448614 100448888(DDX17) 100449608(DDX4) 100449914(DHX9) 100450882(DDX47) 100451887(DDX51) 100453862(DDX55) 100454386(DDX52) 100455355(DDX19B) 100456222(DHX36) 100456359(DDX43) 100458347(MOV10) 100459107(EIF4A3) 100459836(DHX57)
NLE: 
100579235(DHX38) 100579375(DDX17) 100579600(DDX4) 100581804(DDX19B) 100581989(DHX37) 100582662(G3BP1) 100582969(DDX43) 100583027(DDX24) 100583087(DHX35) 100583305(DDX39B) 100584114(TDRD9) 100584227(DDX52) 100584327(DDX51) 100584471(EIF4A3) 100585400(DDX3X) 100585793(DDX31) 100586736(DDX42) 100587338(DHX36) 100587460(DHX30) 100588301(DDX23) 100588883(DDX54) 100588937(DHX57) 100589618(DDX47) 100589759(DDX6) 100589799(DHX15) 100590330(DDX1) 100591321(DDX56) 100591544(DHX8) 100592969(DDX53) 100593420(DDX41) 100596082(DDX11) 100596256(SUPV3L1) 100596672(DHX16) 100597387(DDX55) 100597651(IFIH1) 100598637(DDX21) 100599159(DDX10) 100599189(DDX50) 100600183(DDX25) 100600464(SNRNP200) 100601964 100601987(DDX27) 100602289(DDX46) 100602790(DDX18) 100602898(TDRD12) 100602972(DDX20) 100603290(DDX5) 100604380(DDX49) 100604992(MOV10) 100605379(DDX39A) 100605661(DHX9) 100605756(DDX19A) 100605886(SKIV2L2) 100606842(DHX33)
MCC: 
100270694(DDX3Y) 574266(DDX17) 677694(DDX5) 697304(DDX47) 697673(DHX35) 698327(DDX1) 698980(DDX56) 700253(DDX24) 700742(DDX41) 701441(DDX6) 701635(TDRD9) 702024(IFIH1) 702953(TDRD12) 703852(DDX27) 704731(DDX20) 705184(SNRNP200) 705910(MOV10) 706419 706709(DHX37) 706891(DDX3X) 706943(DDX4) 708112(DHX36) 708185(DDX23) 708293 709173(DHX38) 709576(DDX19B) 709884(DDX55) 710113 711026(DDX46) 711178 711977(DHX33) 712081(SUPV3L1) 712141(EIF4A3) 712432(DDX21) 712511(DDX50) 712763(DDX54) 713228(DHX8) 713523(DHX57) 713836(DHX16) 713884(G3BP1) 713920(DDX25) 714492(DDX52) 714800 715233(DDX39B) 715453(DHX9) 715849(DDX43) 715852(DHX15) 717040 717964(DDX42) 718822(DDX39A) 720303(DDX49) 720612
MCF: 
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CJC: 
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CGE: 
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HGL: 
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TUP: 
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CFA: 
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AML: 
UMR: 
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FCA: 
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CFR: 
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BACU: 
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LVE: 
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ECB: 
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MYD: 
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PALE: 
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MDO: 
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SHR: 
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CLV: 
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ASN: 
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AMJ: 
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PSS: 
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CMY: 
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ACS: 
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XTR: 
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DRE: 
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TRU: 
MZE: 
OLA: 
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P12B_c0135(hrpB) P12B_c1751(dbpA) P12B_c3280(deaD) P12B_c3908(rhlB)
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STM14_0223(hrpB) STM14_1985(hrpA) STM14_2001(dbpA) STM14_3962(deaD) STM14_4712(rhlB) STM14_951(rhlE)
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STMUK_0191(hrpB) STMUK_0825(rhlE) STMUK_1610(hrpA) STMUK_1624(dbpA) STMUK_3264(deaD) STMUK_3901(rhlB)
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SC0189(hrpB) SC0817(rhlE) SC1636(hrpA) SC1650(dbpA) SC3221(deaD) SC3820(rhlB)
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SG0193(hrpB) SG0799(rhlE) SG1462(dbpA) SG1478(hrpA) SG3171(deaD) SG3528(rhlB)
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SPUL_0205(hrpB) SPUL_1457(hrpA) SPUL_1473(dbpA) SPUL_2156(rhlE) SPUL_3289(deaD) SPUL_3511(rhlB)
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YP_0291(hrpB) YP_0595(deaD) YP_0973(srmB1) YP_1617(dbpA) YP_2109(hrpA) YP_3176(rhlB)
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YPG: 
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YPD8_1423(hrpA) YPD8_1981(dbpA) YPD8_2976(hrpB) YPD8_3066(deaD) YPD8_3415(rhlB)
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EPYR_00191(rhlB) EPYR_00380(deaD) EPYR_00897(hrpB) EPYR_01855(dbpA) EPYR_01865(hrpA) EPYR_02578(rhlE)
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Sant_0286(rhlB) Sant_1915(hrpA) Sant_2721(rhlE) Sant_3302(hrpB) Sant_3447(deaD)
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ES15_1876(hrpA) ES15_2642(rhlE) ES15_3180(hrpB) ES15_3508(deaD) ES15_3702(rhlB)
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CTU_02170(rhlB) CTU_04160(deaD) CTU_07790(hrpB) CTU_13960(rhlE) CTU_22640(hrpA)
KPN: 
KPN_00148(hrpB) KPN_00830(rhlE) KPN_01374(dbpA) KPN_01484(hrpA) KPN_03570(deaD) KPN_04281(rhlB)
KPU: 
KP1_0143(rhlB) KP1_0976(hrpB) KP1_1785(rhlE) KP1_2450(dbpA) KP1_2487(hrpA) KP1_4878(deaD)
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPK_0553(deaD) KPK_2984(hrpA) KPK_3032(dbpA) KPK_3740 KPK_4588(hrpB) KPK_5398(rhlB)
KPO: 
KPR: 
KPR_0235(rhlB) KPR_1078(hrpB) KPR_2859(hrpA) KPR_2894(dbpA) KPR_3758(rhlE) KPR_4765(deaD)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
CKO: 
CRO: 
ROD_01521(hrpB) ROD_08031(rhlE) ROD_16271(hrpA) ROD_16591(dbpA) ROD_39671(rhlB) ROD_46701(deaD)
CFD: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SOD_c01140(rhlB) SOD_c03710(deaD) SOD_c12000(rhlE) SOD_c24490(hrpA) SOD_c26470(dbpA) SOD_c39350(hrpB)
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SSZ: 
SCc_049(deaD)
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SERR: 
SFO: 
SERF: 
SERS: 
PMR: 
PMI0110(dbpA) PMI0203(hrpB) PMI0620(rhlE) PMI1192(hrpA) PMI3312(rhlB) PMI3424(deaD)
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_0098(rhlB) ETAE_0411(deaD) ETAE_0694(hrpB) ETAE_1370(dbpA) ETAE_1767(hrpA) ETAE_2327(rhlE)
ETD: 
ETE: 
ETEE_0349(rhlE) ETEE_1858(rhlB) ETEE_2171(deaD) ETEE_2460(hrpB) ETEE_3341(dbpA)
ETC: 
BFL: 
Bfl109(deaD)
BPN: 
BPEN_113(deaD)
BVA: 
BVAF_110(deaD)
BCHR: 
HDE: 
HDEF_0090(rhlB) HDEF_0103(hrpA) HDEF_0292(rhlE) HDEF_0325(deaD)
SECT: 
SEHC: 
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
XBO: 
XBJ1_0374(deaD) XBJ1_0969(rhlE) XBJ1_2368(hrpA) XBJ1_3665(hrpB) XBJ1_4184(rhlB)
XNE: 
XNC1_0380(rhlB) XNC1_0511(deaD) XNC1_0893(hrpB) XNC1_1460(rhlE) XNC1_2211(hrpA)
PAM: 
PANA_0144(rhlB) PANA_0463(deaD) PANA_0773(hrpB) PANA_0918(dbpA) PANA_1232(rhlE) PANA_2006(hrpA)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_0121(hrpB) PAJ_0250(dbpA) PAJ_0553(rhlE) PAJ_1333(hrpA) PAJ_3304(rhlB) PAJ_3611(deaD)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_0186(hrpB) Pvag_0294(dbpA) Pvag_0609(rhlE) Pvag_1433(hrpA) Pvag_3380(rhlB) Pvag_3685(deaD)
PAO: 
KLN: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
MEN: 
MEO: 
MPC_147(deaD)
PSI: 
PSX: 
DR96_130(hrpB) DR96_2261(rhlE) DR96_2897(dbpA) DR96_3003(hrpA) DR96_732(deaD) DR96_855
EBT: 
MMK: 
ROR: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
CED: 
PGE: 
EBF: 
PSTS: 
HIN: 
HI0231(deaD) HI0892(rhlB) HI1070(hrpa)
HIT: 
NTHI0337(deaD) NTHI1057(rhlB) NTHI1231(hrpA)
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
R2846_0369(deaD) R2846_1267(hrpA) R2846_1424(rhlB)
HIZ: 
R2866_0351(deaD) R2866_1329(hrpA) R2866_1490(rhlB)
HIK: 
HDU: 
HD1590(deaD)
HAP: 
HAPS_0375(rhlB) HAPS_0474(deaD) HAPS_1650(hrpA)
HPAZ: 
HPAS: 
HPAK: 
HPR: 
HSO: 
HS_0174(rhlB) HS_0704(deaD) HS_0992(hrpA)
HSM: 
PMU: 
PM0769(hrpA) PM1112(deaD) PM1921(rhlB)
PMV: 
PUL: 
PMP: 
Pmu_00420(deaD) Pmu_08470(hrpA) Pmu_14120(rhlB)
PMUL: 
MSU: 
MS0495(srmB) MS1437(hrpA) MS1836(srmB)
MHT: 
MHQ: 
MHX: 
MHH_c14300(hrpA) MHH_c19640(deaD) MHH_c24030(rhlB)
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
APL: 
APL_0365(hrpA) APL_0560(rhlB) APL_0575(deaD)
APJ: 
APJL_0383(hrpA) APJL_0568(deaD)
APA: 
ASU: 
ASI: 
ASS: 
AAP: 
AAT: 
AAO: 
AAN: 
AAH: 
GAN: 
BTO: 
BTRE: 
BTRH: 
BTRA: 
XFA: 
XFT: 
PD0157(rhlE) PD0205(deaD) PD0505(hrpB) PD0619(hrpA) PD2053(rhlB)
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XFL: 
XFS: 
XCC: 
XCC0275(hrpB) XCC0590(rhlE) XCC2282(dbpA) XCC2642(deaD) XCC2945(hrpA) XCC3776
XCB: 
XCA: 
XCP: