KEGG   ENZYME: 6.1.1.13Help
Entry
EC 6.1.1.13                 Enzyme                                 
Name
D-alanine---poly(phosphoribitol) ligase;
D-alanyl-poly(phosphoribitol) synthetase;
D-alanine: membrane acceptor ligase;
D-alanine-D-alanyl carrier protein ligase;
D-alanine-membrane acceptor ligase;
D-alanine-activating enzyme
Class
Ligases;
Forming carbon-oxygen bonds;
Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
BRITE hierarchy
Sysname
D-alanine:poly(phosphoribitol) ligase (AMP-forming)
Reaction(IUBMB)
ATP + D-alanine + poly(ribitol phosphate) = AMP + diphosphate + O-D-alanyl-poly(ribitol phosphate) [RN:R02718]
Reaction(KEGG)
Substrate
ATP [CPD:C00002];
D-alanine [CPD:C00133];
poly(ribitol phosphate) [CPD:C00653]
Product
AMP [CPD:C00020];
diphosphate [CPD:C00013];
O-D-alanyl-poly(ribitol phosphate) [CPD:C04260]
Comment
A thioester bond is formed transiently between D-alanine and the sulfhydryl group of the 4'-phosphopantetheine prosthetic group of D-alanyl carrier protein during the activation of the alanine. Involved in the synthesis of teichoic acids.
Pathway
D-Alanine metabolism
Orthology
K03367  
D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1
K14188  
D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2
Genes
ECA: 
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
PLU: 
plu4381(dltC) plu4384(dltA)
ENO: 
ESC: 
SRR: 
SRS: 
SRA: 
SerAS13_4296
DDA: 
Dd703_0940 Dd703_0941
DDC: 
Dd586_3220 Dd586_3221
DDD: 
Dda3937_03193 Dda3937_03194 Dda3937_03211
DZE: 
Dd1591_0952 Dd1591_0953
RAH: 
Rahaq_4685 Rahaq_4686
RAA: 
Q7S_09665 Q7S_23946 Q7S_23951
BPE: 
BP2987(dltA) BP2991
BPC: 
BPTD_2955(dltA) BPTD_2959
BPER: 
BN118_2840(dltA) BN118_2844
BPA: 
BPP3907(dltA) BPP3911
BPAR: 
BN117_3981(dltA) BN117_3985
BBR: 
BB4380(dltA) BB4384
BBM: 
BN115_4056(dltA) BN115_4060
BBH: 
BN112_4038 BN112_4042(dltA)
BAV: 
BAV2987(dltA) BAV2991
AXY: 
AXYL_00630(acpP1) AXYL_00634(dltA)
AAA: 
Acav_2508 Acav_2509
DAC: 
Daci_2937 Daci_2938
DEL: 
DelCs14_3806
ABU: 
Abu_1280(dltA) Abu_1284(dltC)
ABT: 
ABED_1195 ABED_1199
PGA: 
PGA1_c13760(dltA1) PGA1_c13780(dltA2)
PGL: 
PGA2_c13660(dltA1) PGA2_c13680(dltA2)
BSU: 
BSU38500(dltA) BSU38520(dltC)
BSR: 
I33_4006(dltA) I33_4008(dltC)
BSL: 
A7A1_2075 A7A1_2077
BSH: 
BSU6051_38500(dltA) BSU6051_38520(dltC)
BSY: 
I653_18900 I653_18910
BSS: 
BSUW23_19090(dltA) BSUW23_19100(dltC)
BST: 
GYO_4251(dltA) GYO_4253(dltC)
BSO: 
BSNT_05891(dltA) BSNT_05893(dltC)
BSN: 
BSn5_10270 BSn5_10280
BSQ: 
B657_38500(dltA) B657_38520(dltC)
BSUB: 
BEST7613_7002(dltA) BEST7613_7004(dltC)
BSX: 
C663_3763(dltA) C663_3765(dltC)
BLI: 
BL03932(dltC) BL03934(dltA)
BLD: 
BLi04080(dltA) BLi04082(dltC)
BAO: 
BAMF_3682(dltA) BAMF_3684(dltC)
BAY: 
RBAM_035710(dltA) RBAM_035730(dltC)
BAQ: 
BACAU_3592(dltA) BACAU_3594(dltC)
BYA: 
BANAU_3753(dltA) BANAU_3755(dltC)
BAMP: 
B938_18290 B938_18300
BAML: 
BAM5036_3491(dltA) BAM5036_3493(dltC)
BAZ: 
BAMTA208_19480(dltA) BAMTA208_19490(dltC)
BQL: 
LL3_03999(dltA) LL3_04001(dltC)
BXH: 
BAXH7_03994(dltA) BAXH7_03996(dltC)
BQY: 
MUS_4244(dltA) MUS_4246(dltC)
BAMI: 
KSO_001235 KSO_001245
BAE: 
BATR1942_17210 BATR1942_17220
BAN: 
BA_1387(dltC) BA_1389(dltA)
BAR: 
GBAA_1387(dltC) GBAA_1389(dltA)
BAT: 
BAS1285 BAS1287
BAH: 
BAMEG_3204(dltA) BAMEG_3206(dltC)
BAI: 
BAA_1456(dltC) BAA_1458(dltA)
BAX: 
H9401_1302 H9401_1304
BAL: 
BACI_c14070(dltC) BACI_c14090(dltA)
BCE: 
BC1370 BC1372
BCA: 
BCE_1485(dltC) BCE_1487(dltA)
BCZ: 
BCZK1259(dltC) BCZK1261(dltA) pE33L466_0443(dltC)
BCR: 
BCAH187_A1528(dltC) BCAH187_A1530(dltA)
BCB: 
BCB4264_A1422(dltC) BCB4264_A1424(dltA)
BCU: 
BCAH820_1459(dltC) BCAH820_1461(dltA)
BCG: 
BCG9842_B3920(dltA) BCG9842_B3922(dltC)
BCQ: 
BCQ_1443(dltC) BCQ_1445(dltA)
BCX: 
BCA_1424(dltC) BCA_1426(dltA)
BNC: 
BCN_1345 BCN_1347
BCF: 
bcf_06935 bcf_06945
BCER: 
BCK_01525 BCK_01535
BCY: 
Bcer98_1090 Bcer98_1092
BTK: 
BT9727_1257(dltC) BT9727_1259(dltA)
BTL: 
BALH_1229 BALH_1231(dltA)
BTB: 
BMB171_C1212(dltC) BMB171_C1214(dltA)
BTT: 
HD73_1600 HD73_1603
BTC: 
CT43_CH1299(dltC) CT43_CH1301(dltA)
BTF: 
YBT020_07490 YBT020_07500 YBT020_28639 YBT020_29361
BTM: 
MC28_0606 MC28_0608 MC28_F256(dltC)
BTG: 
BTB_c14120(dltC) BTB_c14140(dltA)
BTI: 
BTG_13885 BTG_13895
BTN: 
BTF1_04550 BTF1_04560
BTHT: 
H175_ch1316 H175_ch1318
BWE: 
BcerKBAB4_1292 BcerKBAB4_1294
BPU: 
BPUM_2477(dltC) BPUM_2479(dltA)
BJS: 
MY9_3962 MY9_3964
SAU: 
SA0793(dltA) SA0795(dltC)
SAV: 
SAV0932(dltA) SAV0934(dltC)
SAW: 
SAHV_0927(dltA) SAHV_0929(dltC)
SAH: 
SaurJH1_0951 SaurJH1_0953
SAJ: 
SaurJH9_0932 SaurJH9_0934
SAM: 
MW0814(dltA) MW0816(dltC)
SAS: 
SAS0802 SAS0804
SAR: 
SAR0894(dltA) SAR0896(dltC)
SAC: 
SACOL0935(dltA) SACOL0937(dltC)
SAX: 
USA300HOU_0893(dltA) USA300HOU_0895(dltC)
SAA: 
SAUSA300_0835(dltA) SAUSA300_0837(dltC)
SAO: 
SAOUHSC_00869 SAOUHSC_00871
SAE: 
NWMN_0803(dltA) NWMN_0805(dltC)
SAD: 
SAAV_0893(dltA) SAAV_0895(dltC)
SUU: 
M013TW_0851 M013TW_0853
SUV: 
SAVC_03835 SAVC_03845
SUH: 
SAMSHR1132_07840 SAMSHR1132_07860
SUE: 
SAOV_0878 SAOV_0880
SUJ: 
SAA6159_00791(dltA) SAA6159_00793(dltC)
SUK: 
SAA6008_00883(dltA) SAA6008_00885(dltC)
SUC: 
ECTR2_788(dltA) ECTR2_790(dltC)
SUT: 
SAT0131_00962 SAT0131_00964
SUQ: 
HMPREF0772_12313(dltC) HMPREF0772_12315(dltA)
SUZ: 
MS7_0887(dltA) MS7_0889(dltC)
SUD: 
ST398NM01_0915 ST398NM01_0917
SUX: 
SAEMRSA15_07620(dltA) SAEMRSA15_07640(dltC)
SUW: 
SATW20_09320(dltA) SATW20_09340(dltC)
SUG: 
SAPIG0915(dltA) SAPIG0917(dltC)
SUF: 
SARLGA251_08500(dltA) SARLGA251_08520(dltC)
SAB: 
SAB0798(dltA) SAB0800(dltC)
SUY: 
SA2981_0887(dltA) SA2981_0889(dltC)
SAUB: 
C248_0931(dltA) C248_0933(dltC)
SAUM: 
BN843_8370 BN843_8390
SEP: 
SE0624 SE0626
SER: 
SERP0518(dltA) SERP0520(dltC)
SHA: 
SH2019(dltC) SH2021(dltA)
SSP: 
SSP1841 SSP1843
SCA: 
Sca_0534(dltA) Sca_0536(dltC)
SLG: 
SLGD_01939 SLGD_01941
SLN: 
SLUG_19310(dltC) SLUG_19330(dltA)
SSD: 
SPSINT_0722 SPSINT_0724
SDT: 
SPSE_1809(dltA) SPSE_1811(dltC)
SWA: 
A284_09070 A284_09080
LMO: 
lmo0972(dltC) lmo0974(dltA)
LMF: 
LMOf2365_0992(dltC) LMOf2365_0994(dltA)
LMH: 
LMHCC_1649(dltA) LMHCC_1651(dltC)
LMC: 
Lm4b_00992(dltC) Lm4b_00994(dltA)
LMN: 
LM5578_1053(dltC) LM5578_1055(dltA)
LMY: 
LM5923_1007(dltC) LM5923_1009(dltA)
LMT: 
LMRG_02071 LMRG_02073
LMG: 
LMKG_01951 LMKG_01953
LMS: 
LMLG_2708 LMLG_2710
LMJ: 
LMOG_00753 LMOG_00755
LMQ: 
LMM7_1008(dltC) LMM7_1010(dltA)
LML: 
lmo4a_0987(dltC) lmo4a_0989(dltA)
LMP: 
MUO_05130 MUO_05140
LMW: 
LMOSLCC2755_0973(dltC) LMOSLCC2755_0975(dltA)
LMX: 
LMOSLCC2372_0985(dltC) LMOSLCC2372_0987(dltA)
LMZ: 
LMOSLCC2482_1018(dltC) LMOSLCC2482_1020(dltA)
LMON: 
LMOSLCC2376_0943(dltC) LMOSLCC2376_0945(dltA)
LMOC: 
LMOSLCC5850_0976(dltC) LMOSLCC5850_0978
LMOS: 
LMOSLCC7179_0952(dltC) LMOSLCC7179_0954(dltA)
LMOO: 
LMOSLCC2378_0989(dltC) LMOSLCC2378_0991(dltA)
LMOY: 
LMOSLCC2479_0984(dltC) LMOSLCC2479_0986(dltA)
LMOT: 
LMOSLCC2540_0971(dltC) LMOSLCC2540_0973(dltA)
LMOA: 
LMOATCC19117_0993(dltC) LMOATCC19117_0995(dltA)
LMOL: 
LMOL312_0972(dltC) LMOL312_0974(dltA)
LMOG: 
BN389_10020(dltC) BN389_10040(dltA)
LMOE: 
BN418_1178 BN418_1181
LMOB: 
BN419_1179 BN419_1182
LIN: 
lin0971(dltC) lin0973(dltA)
LWE: 
lwe0954(dltC) lwe0956(dltA)
LSG: 
lse_0874(dltC) lse_0876(dltA)
LIV: 
LIV_0919(dltC) LIV_0921(dltA)
LSP: 
Bsph_0472 Bsph_0474
MCL: 
MCCL_0560(dltA)
LLA: 
L90005(dltC) L91510(dltA)
LLK: 
LLKF_1324(dltC) LLKF_1326(dltA)
LLT: 
CVCAS_1225(dltC) CVCAS_1227(dltA)
LLS: 
lilo_1197(dltC) lilo_1199(dltA)
LLC: 
LACR_1372 LACR_1374
LLM: 
llmg_1219(dltA) llmg_1221(dltC)
LLR: 
llh_6940 llh_6950
LLN: 
LLNZ_06280 LLNZ_06290
LLI: 
uc509_1264(dltC) uc509_1266(dltA)
LGR: 
LCGT_0955 LCGT_0957
LGV: 
LCGL_1081 LCGL_1083
SPY: 
SPy_1310(dltC) SPy_1312(dltA)
SPZ: 
M5005_Spy_1071 M5005_Spy_1073(dltA)
SPYM: 
M1GAS476_1130(ditC) M1GAS476_1132(dltA)
SPM: 
spyM18_1322 spyM18_1324(dltA)
SPG: 
SpyM3_0992(dltC) SpyM3_0994(dltA)
SPS: 
SPs0864 SPs0866
SPH: 
MGAS10270_Spy1127 MGAS10270_Spy1129(dltA)
SPI: 
MGAS10750_Spy1164 MGAS10750_Spy1166(dltA)
SPJ: 
MGAS2096_Spy1070 MGAS2096_Spy1073(dltA)
SPK: 
MGAS9429_Spy1113 MGAS9429_Spy1115(dltA)
SPF: 
SpyM50792(dltA) SpyM50794(dltC)
SPA: 
M6_Spy1041 M6_Spy1043
SPB: 
M28_Spy1052 M28_Spy1054(dltA)
STG: 
MGAS15252_1009(dltC) MGAS15252_1011(dltA)
SOZ: 
Spy49_1035c(dltC) Spy49_1037c(dltA)
STZ: 
SPYALAB49_001062(dltC) SPYALAB49_001064(dltA)
STX: 
MGAS1882_1005(dltC) MGAS1882_1007(dltA)
SPYA: 
A20_1105c(dltC) A20_1107c(dltA)
SPN: 
SP_2174 SP_2176
SPD: 
SPD_2003(dltC) SPD_2005(dltA)
SPR: 
spr1980(dltC) spr1982(dltA)
SPW: 
SPCG_2142(dltC) SPCG_2144(dltA)
SPX: 
SPG_2116(dltC) SPG_2118(dltA)
SNE: 
SPN23F_22070(dltC) SPN23F_22090(dltA)
SPV: 
SPH_2370(dltC) SPH_2372(dltA)
SNM: 
SP70585_2301(dltC) SP70585_2304(dltA)
SJJ: 
SPJ_2202(dltC) SPJ_2204(dltA)
SPP: 
SPP_2226(dltC) SPP_2228(dltA)
SNT: 
SPT_2189(dltC) SPT_2191(dltA)
SNC: 
HMPREF0837_10178(dltC) HMPREF0837_10180(dltA)
SNB: 
SP670_2319(dltC) SP670_2321(dltA)
SNP: 
SPAP_2225 SPAP_2227
SNI: 
INV104_18780(dltC) INV104_18800(dltA)
SNV: 
SPNINV200_19850(dltC) SPNINV200_19870(dltA)
SNX: 
SPNOXC_19190(dltC) SPNOXC_19210(dltA)
SND: 
MYY_2094 MYY_2096
SNU: 
SPNA45_02027 SPNA45_02029(dltA)
SPNG: 
HMPREF1038_02184(dltC) HMPREF1038_02186(dltA)
SPNE: 
SPN034156_09990(dltC) SPN034156_10010(dltA)
SPNU: 
SPN034183_19220(dltC) SPN034183_19240(dltA)
SPNM: 
SPN994038_19110(dltC) SPN994038_19130(dltA)
SPNO: 
SPN994039_19120(dltC) SPN994039_19140(dltA)
SAG: 
SAG1788(dltC) SAG1790(dltA)
SAN: 
gbs1831 gbs1833
SAK: 
SAK_1810(dltC) SAK_1812(dltA)
SGC: 
A964_1709(dltC) A964_1711(dltA)
SAGS: 
SaSA20_1497(dltC) SaSA20_1499(dltA)
SMU: 
SMU_1689(dltC) SMU_1691(dltA)
SMC: 
SmuNN2025_0428(dltA) SmuNN2025_0430(dltC)
SMJ: 
SMULJ23_0444(dltA) SMULJ23_0446(dltC)
SMUT: 
SMUGS5_07630 SMUGS5_07640
STC: 
str0761(dltA) str0763(dltC)
STL: 
stu0761(dltA) stu0763(dltC)
STE: 
STER_0802 STER_0804
STN: 
STND_0749 STND_0751
STU: 
STH8232_0955(dltA) STH8232_0957(dltC)
STW: 
Y1U_C0727 Y1U_C0729
SSA: 
SSA_2332(dltC) SSA_2334(dltA)
SSU: 
SSU05_0638 SSU05_0640
SSV: 
SSU98_0638 SSU98_0640
SSB: 
SSUBM407_1226(dltC) SSUBM407_1228(dltA)
SSI: 
SSU0596(dltA) SSU0598(dltC)
SSS: 
SSUSC84_0569(dltA) SSUSC84_0571(dltC)
SST: 
SSUST3_0798 SSUST3_0800
SSF: 
SSUA7_0594 SSUA7_0596
SSK: 
SSUD12_1230 SSUD12_1232
SSQ: 
SSUD9_0807 SSUD9_0809
SSW: 
SSGZ1_0629 SSGZ1_0631
SUI: 
SSUJS14_0729 SSUJS14_0731
SUO: 
SSU12_0595 SSU12_0597
SRP: 
SSUST1_1169 SSUST1_1171
SUP: 
YYK_02820 YYK_02830
SSUS: 
NJAUSS_0700 NJAUSS_0702
SGO: 
SGO_0054(dltA) SGO_0056(dltC)
SEQ: 
SZO_06940 SZO_06960
SEZ: 
Sez_1269(dltC) Sez_1271(dltA)
SEZO: 
SeseC_01638(dltC) SeseC_01640(dltA)
SEU: 
SEQ_1451 SEQ_1453
SUB: 
SUB1147(dltC) SUB1149(dltA)
SDS: 
SDEG_1307(dltC) SDEG_1309(dltA)
SDG: 
SDE12394_06860 SDE12394_06870
SDA: 
GGS_1190(dltA)
SDC: 
SDSE_1290(dltC) SDSE_1292(dltA)
SGA: 
GALLO_2053(dltC) GALLO_2055(dltA)
SGG: 
SGGBAA2069_c20130(dltC) SGGBAA2069_c20150(dltA)
SGT: 
SGGB_2036(dltC) SGGB_2038(dltA)
SMB: 
smi_2029(dltC) smi_2031(dltA)
SOR: 
SOR_1912(dltC) SOR_1914(dltA)
STK: 
STP_1002 STP_1004
STB: 
SGPB_1860(dltC) SGPB_1862(dltA)
SCP: 
HMPREF0833_11429(dltC) HMPREF0833_11431(dltA)
SCF: 
Spaf_2063(dltC) Spaf_2065(dltC2)
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SALIVB_0845(dltA) SALIVB_0847(dltC)
STF: 
Ssal_00926(dltA) Ssal_00928(dltC)
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STD: 
SPPN_11110 SPPN_11120
SMN: 
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SIF: 
Sinf_1754(dltC) Sinf_1756(dltA)
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lp_1406(dltC2) lp_2017(dltC1) lp_2019(dltA)
LPJ: 
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zj316_1453(dltC2) zj316_1979(dltC1) zj316_1981(dltA)
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LPST_C1127(dltC2) LPST_C1611(dltC1) LPST_C1613(dltA)
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LJ1782 LJ1784
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LJP_1719c LJP_1721c
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LSL_0890 LSL_0892
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LSEI_0794 LSEI_0796
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LGG_00777(dltA) LGG_00779(dltC)
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Elen_1791 Elen_1793
OLS: 
Olsu_1215 Olsu_1217
GPA: 
GPA_05210
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:13795638]
  Authors
BADDILEY J, NEUHAUS FC.
  Title
The enzymic activation of D-alanine.
  Journal
Biochem. J. 75 (1960) 579-87.
  Organism
Lactobacillus casei [GN:lca], Bacillus subtilis [GN:bsu], Lactobacillus arabinosus, Staphylococcus aureus
Reference
2  [PMID:4399593]
  Authors
Reusch VM Jr, Neuhaus FC.
  Title
D-Alanine: membrane acceptor ligase from Lactobacillus casei.
  Journal
J. Biol. Chem. 246 (1971) 6136-43.
  Organism
Lactobacillus casei [GN:lca]
Reference
3  [PMID:7797557]
  Authors
Perego M, Glaser P, Minutello A, Strauch MA, Leopold K, Fischer W.
  Title
Incorporation of D-alanine into lipoteichoic acid and wall teichoic acid in Bacillus subtilis. Identification of genes and regulation.
  Journal
J. Biol. Chem. 270 (1995) 15598-606.
  Organism
Bacillus subtilis [GN:bsu]
  Sequence
Reference
4  [PMID:8300523]
  Authors
Heaton MP, Neuhaus FC.
  Title
Role of the D-alanyl carrier protein in the biosynthesis of D-alanyl-lipoteichoic acid.
  Journal
J. Bacteriol. 176 (1994) 681-90.
  Organism
Lactobacillus casei [GN:lca]
Reference
5  [PMID:8682792]
  Authors
Debabov DV, Heaton MP, Zhang Q, Stewart KD, Lambalot RH, Neuhaus FC.
  Title
The D-Alanyl carrier protein in Lactobacillus casei: cloning, sequencing, and expression of dltC.
  Journal
J. Bacteriol. 178 (1996) 3869-76.
  Organism
Lactobacillus casei [GN:lca]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9023-65-8
DBGET integrated database retrieval system