KEGG   ENZYME: 6.5.1.3Help
Entry
EC 6.5.1.3                  Enzyme                                 
Name
RNA ligase (ATP);
polyribonucleotide synthase (ATP);
RNA ligase;
polyribonucleotide ligase;
ribonucleic ligase
Class
Ligases;
Forming phosphoric-ester bonds;
Ligases that form phosphoric-ester bonds (only sub-subclass identified to date)
BRITE hierarchy
Sysname
poly(ribonucleotide):poly(ribonucleotide) ligase (AMP-forming)
Reaction(IUBMB)
ATP + (ribonucleotide)n + (ribonucleotide)m = AMP + diphosphate + (ribonucleotide)n+m [RN:R07640]
Reaction(KEGG)
R07640;
(other) R00436
Show
Substrate
ATP [CPD:C00002];
(ribonucleotide)n [CPD:C00046];
(ribonucleotide)m [CPD:C00046]
Product
AMP [CPD:C00020];
diphosphate [CPD:C00013];
(ribonucleotide)n+m [CPD:C00046]
Comment
Converts linear RNA to a circular form by transfer of the 5'-phosphate to the 3'-hydroxy terminus.
Orthology
K01973  
RNA-editing ligase
K14415  
tRNA-splicing ligase RtcB
K14679  
tRNA ligase
K14680  
RNA ligase
Genes
HSA: 
51493(C22orf28)
PTR: 
458782(C22H22orf28)
PPS: 
GGO: 
101144723(C22H22orf28)
PON: 
100439200(C22H22orf28)
MCC: 
717258(C10H22orf28)
MMU: 
28088(D10Wsu52e)
RNO: 
CFA: 
AML: 
FCA: 
101090197(CB4H22orf28)
BTA: 
525106(C5H22orf28)
SSC: 
733658
ECB: 
100054153
MDO: 
100016063
SHR: 
100928215(C5H22orf28)
OAA: 
100077731
GGA: 
418064(C1H22orf28)
MGP: 
100539950
TGU: 
100227339(C1AH22orf28)
ACS: 
100554682
XLA: 
779280(c22orf28)
XTR: 
595066(c22orf28)
DRE: 
406376
TRU: 
101070621
OLA: 
101164466
BFO: 
BRAFLDRAFT_216547
CIN: 
100176177
SPU: 
588300
DME: 
Dmel_CG9987
DPO: 
Dpse_GA22169
DAN: 
Dana_GF14042
DER: 
Dere_GG21180
DPE: 
Dper_GL21208
DSE: 
Dsec_GM17346
DSI: 
Dsim_GD24205
DWI: 
Dwil_GK23837
DYA: 
Dyak_GE13253
DGR: 
Dgri_GH13449
DMO: 
Dmoj_GI14026
DVI: 
Dvir_GJ18257
AGA: 
AgaP_AGAP008147
AAG: 
AaeL_AAEL003336
CQU: 
CpipJ_CPIJ004874 CpipJ_CPIJ019543
AME: 
409653
NVI: 
100123449(NV11757)
TCA: 
658169
API: 
100160137
PHU: 
Phum_PHUM545510
ISC: 
IscW_ISCW024552
CEL: 
CELE_F16A11.2(F16A11.2)
CBR: 
CBG22190
BMY: 
Bm1_49220
TSP: 
Tsp_12314
SMM: 
Smp_074870 Smp_162600
NVE: 
NEMVE_v1g198406 NEMVE_v1g9434
HMG: 
100200632
TAD: 
TRIADDRAFT_18395
AQU: 
100635515
CRE: 
CHLREDRAFT_139581
VCN: 
VOLCADRAFT_63305
OLU: 
OSTLU_25152
OTA: 
Ot10g01930
CME: 
CME059C
SCE: 
YJL087C(TRL1)
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AGOS_AFR099C
ERC: 
Ecym_6337
KLA: 
KLLA0F14399g
LTH: 
KLTH0H09548g
PPA: 
PAS_chr3_0622
VPO: 
Kpol_463p3
ZRO: 
ZYRO0G15070g
CGR: 
CAGL0M03091g
NCS: 
NCAS_0A09580(NCAS0A09580)
NDI: 
NDAI_0G05550(NDAI0G05550)
TPF: 
TPHA_0I00970(TPHA0I00970)
TBL: 
TBLA_0C02880(TBLA0C02880)
TDL: 
TDEL_0D01480(TDEL0D01480)
KAF: 
KAFR_0A01500(KAFR0A01500)
DHA: 
DEHA2D03498g
PIC: 
PICST_89535
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LELG_05515
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CaO19.13864(TRL1) CaO19.6511(TRL1) CaO19_6511(CaJ7_0238)
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CD36_71880
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CORT_0H01290
YLI: 
YALI0D14916g YALI0E06171g
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CLUG_02324 CLUG_02325
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NCU04410
SMP: 
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PODANSg7455
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THITE_2114865
MTM: 
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ANI: 
AN1296.2
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AFUA_1G09690
AOR: 
AOR_1_1536194(AO090012000873)
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ANI_1_218074(An08g01480)
AFV: 
AFLA_021220
ACT: 
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PCS: 
Pc16g06530
CIM: 
CIMG_10259
CPW: 
CPC735_013460
PBL: 
PAAG_02801
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UREG_03473
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TRV_07625
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HCAG_01469
PNO: 
SNOG_15109
PTE: 
PTT_06606
ZTR: 
MYCGRDRAFT_67486
TML: 
GSTUM_00010625001
SPO: 
SPAC17G8.01c(trl1)
CNE: 
CND03670
CNB: 
CNBD2650
CGI: 
CGB_D6380C
PPL: 
POSPLDRAFT_100403 POSPLDRAFT_101360
LBC: 
LACBIDRAFT_232121
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MPER_04194
CCI: 
CC1G_08970
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SCHCODRAFT_70020
UMA: 
UM00871.1
MGL: 
MGL_3080
PGR: 
PGTG_07519 PGTG_12509
ECU: 
ECU01_1120
EIN: 
Eint_011050
EHE: 
EHEL_011020
NCE: 
NCER_101173
MBR: 
MONBRDRAFT_24995
NGR: 
NAEGRDRAFT_69798 NAEGRDRAFT_73822
DDI: 
DDB_G0278481 DDB_G0289211
DPP: 
DICPUDRAFT_90903
EHI: 
EHI_169260(177.t00019) EHI_184560(391.t00003)
EDI: 
EDI_022970 EDI_260790
PFA: 
PF11_0068 PFL1060c
PFD: 
PFDG_00366 PFDG_03212
PFH: 
PFHG_01610 PFHG_01759
PYO: 
PY03374 PY03776
PCB: 
PC000172.03.0
PBE: 
PB000816.02.0 PB301434.00.0
PKN: 
PKH_090290 PKH_143860
PVX: 
PVX_090965 PVX_123735
PCY: 
PCYB_091270 PCYB_144780
TAN: 
TA10620
TPV: 
TP04_0661
BBO: 
BBOV_III007770(17.m07681)
TGO: 
TGME49_007450
TBR: 
Tb09.160.2970 Tb10.26.0830 Tb927.1.3030(KREL2)
TCR: 
506363.110 507711.140 510155.20 511585.20
LMA: 
LMJF_20_1730(REL2) LMJF_33_0560
LIF: 
LINJ_01_0610 LINJ_20_1700(REL2) LINJ_33_0580
LDO: 
LDBPK_330580
LMI: 
LMXM_32_0560
LBZ: 
LBRM_01_0620 LBRM_33_0570
TVA: 
TVAG_386070
TPS: 
THAPSDRAFT_41953
ECO: 
b3421(rtcB)
ECJ: 
Y75_p3756(rtcB)
ECD: 
ECDH10B_3595(rtcB)
EBW: 
BWG_3114(rtcB)
ECOK: 
ECMDS42_2866(rtcB)
ECE: 
Z4779(rtcB)
ECS: 
ECs4264
ECF: 
ECH74115_4729(rtcB)
ETW: 
ECSP_4373(rtcB)
ELX: 
CDCO157_4005
EOJ: 
ECO26_4508(rtcB)
EOI: 
ECO111_4229(rtcB)
ECG: 
E2348C_3665(rtcB)
EOK: 
G2583_4120(rtcB)
ELR: 
ECO55CA74_19670
ECC: 
c4198(rtcB)
ECP: 
ECP_3506
ECI: 
UTI89_C3921(rtcB)
ECV: 
APECO1_3046(rtcB)
ECX: 
EcHS_A3618(rtcB)
ECW: 
EcE24377A_3896(rtcB)
ECM: 
EcSMS35_3701(rtcB)
ECY: 
ECSE_3687
ECR: 
ECIAI1_3564(rtcB)
ECQ: 
ECED1_4081(rtcB)
ECK: 
EC55989_3828(rtcB)
ECT: 
ECIAI39_0687 ECIAI39_3901(rtcB)
EOC: 
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ECUMN_3879(rtcB)
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ECS88_3809(rtcB)
ELO: 
EC042_3681(rtcB)
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NRG857_16930
ELH: 
ETEC_3670
ESO: 
O3O_23690
ESM: 
O3M_02005
ESL: 
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ECL: 
EcolC_0293
EBR: 
ECB_03272(rtcB)
EBD: 
ECBD_0321
EKO: 
EKO11_0323
EKF: 
KO11_05680
EAB: 
ECABU_c38410(rtcB)
EDH: 
EcDH1_0293
EDJ: 
ECDH1ME8569_3299(rtcB)
EIH: 
ECOK1_3836(rtcB)
ELU: 
UM146_17160
EUN: 
UMNK88_4188
ELW: 
ECW_m3678(rtcB)
ELL: 
WFL_17970
ELC: 
i14_3869(rtcB)
ELD: 
i02_3869(rtcB)
ELP: 
P12B_c3521
EBL: 
ECD_03272(rtcB)
EBE: 
B21_03224(rtcB)
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LF82_2042(rtcB)
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APECO78_20890
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EFER_3389(rtcB)
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STM3519(rtcB)
SEO: 
STM14_4238(rtcB)
SEV: 
STMMW_35091
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SL1344_3486(rtcB)
SEM: 
STMDT12_C35740
SEJ: 
STMUK_3505(rtcB)
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STM474_3687(rtcB)
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UMN798_3822
SEI: 
SPC_3588(rtcB)
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SC3450(rtcB)
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SeHA_C3827(rtcB)
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SU5_03994
SEA: 
SeAg_B3720
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SeD_A3890(rtcB)
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SG3919(rtcB)
SEL: 
SPUL_4060
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SEN3345(rtcB)
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SF3443(rtcB)
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S4321(rtcB)
SFV: 
SFV_3428(rtcB)
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SFxv_3759
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SSON_3552(rtcB)
SSJ: 
SSON53_20475
SBO: 
SBO_3409(rtcB)
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SbBS512_E3801(rtcB)
PCT: 
PC1_0404 PC1_3555
PCC: 
PCC21_004370
PWA: 
Pecwa_0487 Pecwa_3740
PEC: 
W5S_0513 W5S_3882
PLU: 
plu4307(rtcB)
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PAU_00438
ESC: 
Entcl_0663
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EAE_08330
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ST548_p4728
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ESA_00065
CSK: 
ES15_0387(rtcB)
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CSSP291_00295
CTU: 
CTU_37920(rtcB)
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ROD_37281(rtcB)
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Dd586_0013
DZE: 
Dd1591_0013
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XBJ1_0417(rtcB) XBJ1_0478
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XNC1_0541
PSI: 
S70_08035
MMK: 
MU9_137
XCC: 
XCC3883
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XC_3970
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xccb100_4072
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XCV4058
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XCR_0396
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XAC3965
XAX: 
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XAO: 
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XCI: 
XCAW_00337
SML: 
Smlt4533
SMT: 
Smal_3893
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BurJV3_3940
SMZ: 
SMD_4076(rtcB)
PAE: 
PA4583
PAU: 
PA14_60650
PAP: 
PSPA7_5225
PAG: 
PLES_24541 PLES_49661
PAF: 
PAM18_2324 PAM18_4676
PNC: 
NCGM2_1011
PDK: 
PADK2_11405 PADK2_24345
PPG: 
PputGB1_0576
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PPS_0526
PPUH: 
B479_03135
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PFL_2304 PFL_3584
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PEN: 
PSEEN0615
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Pmen_1193
PFV: 
Psefu_3727
PDR: 
H681_04585
AVN: 
Avin_46150
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PsycPRwf_0858
ACD: 
AOLE_03025 AOLE_05690
ACB: 
A1S_2271 A1S_2839
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ABAYE0642
ABC: 
ACICU_03087
ABN: 
AB57_3342
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ABBFA_000623
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ABK1_3139
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ABTJ_00618
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ABTW07_3307
ABH: 
M3Q_3325
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ABD1_22680 ABD1_27840
ACC: 
BDGL_002301
SDE: 
Sde_0273
TTU: 
TERTU_2561
CBD: 
CBUD_1265
CBG: 
CbuG_0839
CBC: 
CbuK_1035
LPN: 
lpg2201
LPU: 
LPE509_00897
LPF: 
lpl2125
LPP: 
lpp2151
LPC: 
LPC_1665
LPA: 
lpa_03159
LPE: 
lp12_2193
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MCA0195
MMT: 
Metme_0630 Metme_3305
MAH: 
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NOC: 
Noc_2009
NHL: 
Nhal_1884 Nhal_2955
NWA: 
Nwat_1815
ALV: 
Alvin_3164
AEH: 
Mlg_1728
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Hhal_2355
TGR: 
Tgr7_1950
TNI: 
TVNIR_1860(rtcB_[H])
HCH: 
HCH_00167 HCH_05061
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CV_1037(rtcb) CV_1425
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RSc0224(rtcB)
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Reut_B5869
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CNE_2c05030(rtcB)
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Bcep18194_B0923 Bcep18194_B2417
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BCT: 
GEM_5070
BAV: 
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Rfer_3852
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Bpro_1473
PNA: 
Pnap_0498
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C380_03580
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Daci_0678 Daci_5648
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Varpa_5105
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CtCNB1_2374
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Nit79A3_2907
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azo0079(rtcB)
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AZKH_1503 AZKH_2570(rtcB)
DAR: 
Daro_1873
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Tmz1t_1711
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Tbd_2359
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NAMH_1741
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GSU1684
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KN400_1706
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Gmet_1619
GUR: 
Gura_1393
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Gbem_0989
GEO: 
Geob_2321
GEM: 
GM21_3271
GEB: 
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PCA: 
Pcar_0019 Pcar_2835(rtcB)
PPD: 
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DVL: 
Dvul_2130
DVM: 
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DVG: 
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DDE: 
Dde_2089
DMA: 
DMR_25460
DSA: 
Desal_2495
DAS: 
Daes_1800
DAF: 
Desaf_3313
DHY: 
DESAM_22337(rtcB)
DBA: 
Dbac_0699 Dbac_1279
DRT: 
Dret_0333
BBA: 
Bd2854
BBAT: 
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DaAHT2_1047
DPR: 
Despr_2496
DOL: 
Dole_2571
DAL: 
Dalk_3935
DAT: 
HRM2_05280(rtcB)
DTO: 
TOL2_C37110
ADE: 
Adeh_0946
ACP: 
A2cp1_1004
AFW: 
Anae109_0986
ANK: 
AnaeK_1007
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MXAN_0064 MXAN_1521 MXAN_4982 MXAN_5426
MFU: 
LILAB_01175 LILAB_07260 LILAB_08425 LILAB_32835
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MYSTI_00055 MYSTI_00276 MYSTI_01648 MYSTI_05473
CCX: 
COCOR_00071 COCOR_01779 COCOR_02473 COCOR_07765
SUR: 
STAUR_0111 STAUR_2015 STAUR_5804
SCL: 
sce1307 sce1954 sce3688 sce7156(rtcB)
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Reference
1  [PMID:4342972]
  Authors
Silber R, Malathi VG, Hurwitz J.
  Title
Purification and properties of bacteriophage T4-induced RNA ligase.
  Journal
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 69 (1972) 3009-13.
  Organism
bacteriophage T4
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
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BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
37353-39-2
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