KEGG   ENZYME: 6.5.1.3Help
Entry
EC 6.5.1.3                  Enzyme                                 

Name
RNA ligase (ATP);
polyribonucleotide synthase (ATP);
RNA ligase;
polyribonucleotide ligase;
ribonucleic ligase
Class
Ligases;
Forming phosphoric-ester bonds;
Ligases that form phosphoric-ester bonds (only sub-subclass identified to date)
BRITE hierarchy
Sysname
poly(ribonucleotide):poly(ribonucleotide) ligase (AMP-forming)
Reaction(IUBMB)
ATP + (ribonucleotide)n + (ribonucleotide)m = AMP + diphosphate + (ribonucleotide)n+m [RN:R07640]
Reaction(KEGG)
R07640;
(other) R00436
Show
Substrate
ATP [CPD:C00002];
(ribonucleotide)n [CPD:C00046];
(ribonucleotide)m [CPD:C00046]
Product
AMP [CPD:C00020];
diphosphate [CPD:C00013];
(ribonucleotide)n+m [CPD:C00046]
Comment
Converts linear RNA to a circular form by transfer of the 5'-phosphate to the 3'-hydroxy terminus.
Orthology
K01973  
RNA-editing ligase
K14415  
tRNA-splicing ligase RtcB
K14679  
tRNA ligase
K14680  
RNA ligase
Genes
HSA: 
51493(RTCB)
PTR: 
458782(C22H22orf28)
PPS: 
GGO: 
101144723(C22H22orf28)
PON: 
100439200(C22H22orf28)
MCC: 
717258(C10H22orf28)
MCF: 
102144880(RTCB)
MMU: 
28088(Rtcb)
RNO: 
362855(Rtcb)
CGE: 
HGL: 
101717628(Rtcb)
TUP: 
102492731(RTCB)
CFA: 
474524(RTCB)
AML: 
FCA: 
101090197(CB4H22orf28)
BTA: 
525106(RTCB)
BOM: 
102286278(RTCB)
PHD: 
102318020(RTCB)
CHX: 
102189284(RTCB)
SSC: 
733658(RTCB)
CFR: 
102520545(RTCB)
ECB: 
100054153(RTCB)
MYB: 
102243411(RTCB)
MDO: 
SHR: 
100928215(C5H22orf28)
OAA: 
GGA: 
418064(C22ORF28)
MGP: 
TGU: 
100227339(C1AH22orf28)
FAB: 
101819411(RTCB)
PHI: 
102099960(RTCB)
APLA: 
FPG: 
101916493(RTCB)
FCH: 
102051051(RTCB)
CLV: 
102087886(RTCB)
ASN: 
102379448(RTCB)
PSS: 
102463710(RTCB)
ACS: 
XLA: 
779280(rtcb)
XTR: 
595066(rtcb)
DRE: 
406376(rtcb)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102358373(RTCB)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
409653(GB14373)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CELE_F16A11.2(F16A11.2)
CBR: 
BMY: 
LOA: 
TSP: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
SCE: 
YJL087C(TRL1)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0A09580(NCAS0A09580)
NDI: 
NDAI_0G05550(NDAI0G05550)
TPF: 
TPHA_0I00970(TPHA0I00970)
TBL: 
TBLA_0C02880(TBLA0C02880)
TDL: 
TDEL_0D01480(TDEL0D01480)
KAF: 
KAFR_0A01500(KAFR0A01500)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
LEL: 
CAL: 
CaO19.13864(TRL1) CaO19.6511(TRL1) CaO19_6511(CaJ7_0238)
CTP: 
CDU: 
COT: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
MGR: 
NHE: 
VAL: 
SSL: 
BFU: 
ANI: 
NFI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_1536194(AO090012000873)
ANG: 
ANI_1_218074(An08g01480)
AFV: 
ACT: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
ZTR: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
PPL: 
LBC: 
MPR: 
CCI: 
SCM: 
UMA: 
MGL: 
PGR: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
NCE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
EHI: 
EHI_169260(177.t00019) EHI_184560(391.t00003)
EDI: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
BBO: 
BBOV_III007770(17.m07681)
BEQ: 
TGO: 
TPS: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
TVA: 
ECO: 
b3421(rtcB)
ECJ: 
Y75_p3756(rtcB)
ECD: 
EBW: 
BWG_3114(rtcB)
ECOK: 
ECE: 
Z4779(rtcB)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_4373(rtcB)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c4198(rtcB)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_03272(rtcB)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m3678(rtcB)
ELL: 
ELC: 
i14_3869(rtcB)
ELD: 
i02_3869(rtcB)
ELP: 
EBL: 
ECD_03272(rtcB)
EBE: 
B21_03224(rtcB)
ELF: 
LF82_2042(rtcB)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
EFE: 
EFER_3389(rtcB)
STM: 
STM3519(rtcB)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SEI: 
SPC_3588(rtcB)
SEC: 
SC3450(rtcB)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SeD_A3890(rtcB)
SEG: 
SG3919(rtcB)
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SEN3345(rtcB)
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENE: 
SFL: 
SF3443(rtcB)
SFX: 
S4321(rtcB)
SFV: 
SFV_3428(rtcB)
SFE: 
SSN: 
SSON_3552(rtcB)
SSJ: 
SBO: 
SBO_3409(rtcB)
SBC: 
SDZ: 
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
PLU: 
plu4307(rtcB)
PAY: 
ESC: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
ES15_0387(rtcB)
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CTU_37920(rtcB)
CRO: 
ROD_37281(rtcB)
SFO: 
DDC: 
DZE: 
XBO: 
XNE: 
PSI: 
MMK: 
XCC: 
XCB: 
XCA: 
XCV: 
XCP: 
XAC: 
XAX: 
XAO: 
XCI: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SMD_4076(rtcB)
VNI: 
PAE: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PPG: 
PPT: 
PPUH: 
PPUN: 
PP4_05660(rtcB)
PFL: 
PPRC: 
PFO: 
PEN: 
PMY: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PMON: 
PMOT: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PRW: 
ACD: 
ACB: 
ABY: 
ABC: 
ABN: 
ABB: 
ABX: 
ABZ: 
ABR: 
ABD: 
ABH: 
ABAD: 
ABJ: 
ABAB: 
ABAJ: 
ABAZ: 
ACC: 
SDE: 
TTU: 
CBD: 
CBG: 
CBC: 
LPN: 
LPU: 
LPH: 
LPO: 
LPM: 
LPF: 
LPP: 
LPC: 
LPA: 
LPE: 
LLO: 
MCA: 
MMT: 
MAH: 
NOC: 
NHL: 
NWA: 
ALV: 
AEH: 
HHA: 
TGR: 
TNI: 
TVNIR_1860(rtcB_[H])
HCH: 
CVI: 
PSE: 
RSO: 
RSc0224(rtcB)
RSC: 
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
REU: 
REH: 
CTI: 
CNC: 
BTE: 
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BAM: 
BAC: 
BCT: 
BAV: 
BAV3408(rtcB)
RFR: 
POL: 
PNA: 
AAA: 
ACK: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
NET: 
NIT: 
NII: 
NMU: 
AZO: 
azo0079(rtcB)
AZA: 
DAR: 
TMZ: 
TBD: 
APP: 
NAM: 
GSU: 
GSK: 
GME: 
GUR: 
GBM: 
GEO: 
GEM: 
GEB: 
PCA: 
PPD: 
DVU: 
DVL: 
DVM: 
DVG: 
DDE: 
DMA: 
DSA: 
DAS: 
DAF: 
DHY: 
DGG: 
DGI_0981(rtcB)
DBA: 
DRT: 
BBA: 
BBAT: 
DAK: 
DPR: 
DOL: 
DAL: 
DAT: 
DTO: 
ADE: 
ACP: 
AFW: 
ANK: 
MXA: 
MFU: 
MSD: 
CCX: 
SUR: 
SCL: 
SCU: 
HOH: 
SAT: 
DAO: 
DTI: 
SFU: 
DBR: 
HMR: 
REC: 
RLT: 
BRA: 
BBT: 
AOL: 
MET: 
MNO: 
BSB: 
AEX: 
SSY: 
TMO: 
BHA: 
BCR: 
BCQ: 
BCL: 
BBE: 
PJD: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPM_0868(hint) PPM_3745(rtcB)
PPOL: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
SUO: 
CAE: 
CAY: 
CSO: 
STH: 
SLP: 
DKU: 
PTH: 
PTH_1582(RtcB)
DAU: 
CLE: 
RAL: 
TMR: 
BPRM: 
TTE: 
TTE0709(RtcB)
TPD: 
TIT: 
TMT: 
TBO: 
TWI: 
CHY: 
ADG: 
TPZ: 
CSC: 
ATE: 
CHD: 
COW: 
CKI: 
CKN: 
CLC: 
TOC: 
CPO: 
NTH: 
HOR: 
HAS: 
MTU: 
MTV: 
MTC: 
MRA: 
MTF: 
MTB: 
MTK: 
MTZ: 
MTG: 
MTI: 
MTE: 
MTUR: 
MTL: 
MTO: 
MTD: 
MTN: 
MTJ: 
MTUB: 
MTUC: 
MTUE: 
MTX: 
MTUH: 
MTUL: 
MBO: 
MBB: 
MBT: 
MBM: 
MBK: 
MAF: 
MCE: 
MCQ: 
MCV: 
MCX: 
MCZ: 
MABB: 
MKN: 
CGL: 
NCgl2899(Cgl3001)
CGB: 
CGU: 
CGT: 
CGS: 
CGG: 
CGM: 
CEF: 
CDI: 
CDH: 
CDE: 
CDR: 
CDA: 
CDB: 
CDS: 
CDW: 
CDV: 
CUR: 
CUA: 
CAR: 
CHN: 
CMD: 
NFA: 
NCY: 
NBR: 
RHA: 
RER: 
REY: 
ROP: 
REQ: 
GOR: 
TPR: 
SCO: 
SCO3299(SCE15.16c)
SMA: 
SGR: 
SCB: 
SSX: 
SVL: 
SCT: 
SCY: 
SFA: 
SBH: 
SHY: 
SHO: 
SVE: 
SDV: 
SALB: 
STRP: 
F750_3148(rtcB)
SFI: 
SCI: 
SRC: 
KSK: 
MTS: 
ART: 
ACH: 
APN: 
RSA: 
BFA: 
JDE: 
IVA: 
CFL: 
CFI: 
CGA: 
ICA: 
PFR: 
PPC: 
PBO: 
MPH: 
KFL: 
TFU: 
NDA: 
NAL: 
TCU: 
SRO: 
FRE: 
FRI: 
FAL: 
NML: 
GOB: 
BSD: 
MMAR: 
KRA: 
SEN: 
SVI: 
TBI: 
AMD: 
AMN: 
AMM: 
AMZ: 
AOI: 
AMI: 
SESP: 
BN6_17540(rtcB)
STP: 
SAQ: 
MAU: 
MIL: 
VMA: 
AMS: 
ASE: 
CAI: 
SNA: 
RXY: 
PUV: 
WCH: 
SNG: 
MIN: 
Minf_0304(rtcB)
SCD: 
STA: 
STQ: 
ABA: 
GMA: 
ACO: 
AMO: 
RBA: 
PSL: 
PLM: 
PBS: 
IPA: 
SACI: 
SYP: 
CYA: 
SYNP: 
MAR: 
CYT: 
CYP: 
CYC: 
CYN: 
CYH: 
CYJ: 
AMR: 
CAN: 
HAO: 
GLP: 
CMP: 
GLJ: 
GKIL_4162(rtcB)
ANA: 
NPU: 
NOS: 
NOP: 
AVA: 
ACY: 
CSG: 
CALO: 
CALT: 
RIV: 
LEP: 
GEI: 
OAC: 
ONI: 
CEP: 
MIC: 
CTHE: 
PLP: 
SCS: 
BTH: 
BFR: 
BFS: 
BFG: 
BXY: 
SRU: 
SRM: 
RMR: 
RMG: 
CPI: 
NKO: 
PHE: 
SHG: 
SCN: 
HHY: 
SGN: 
CHU: 
DFE: 
SLI: 
RSI: 
FAE: 
FJO: 
FBR: 
FCO: 
FIN: 
KQS_11450(rtcB)
CHE: 
CAHE_0550(rtcB)
CTE: 
CPC: 
CTS: 
IAL: 
MRO: 
DET: 
DEH: 
DEB: 
DEV: 
DEG: 
DMC: 
DMD: 
DMG: 
RRS: 
RCA: 
CAU: 
CAG: 
CHL: 
HAU: 
TRO: 
STI: 
ATM: 
CAP: 
DRA: 
DDR: 
DMR: 
DPT: 
DGO: 
DPD: 
TTH: 
TTC1426(rtcB)
TTJ: 
TTS: 
TTL: 
TSC: 
THC: 
TOS: 
MSV: 
OPR: 
MHD: 
AAE: 
HTH: 
HTE: 
TAL: 
TRD: 
PMX: 
TAM: 
TMA: 
TMM: 
TMI: 
TPT: 
TLE: 
TRQ: 
TNA: 
TNP: 
TTA: 
TME: 
TAF: 
FNO: 
FPE: 
KOL: 
MPZ: 
CCZ: 
CEX: 
DIN: 
DDF: 
FSI: 
DTH: 
DTU: 
TYE: 
NDE: 
TID: 
TOP: 
TTR: 
MOX: 
MJA: 
MFE: 
MVU: 
MFS: 
MIF: 
MIG: 
MMP: 
MMQ: 
MMX: 
MMZ: 
MMD: 
MAE: 
MVN: 
MVO: 
MOK: 
MAC: 
MBA: 
MMA: 
MMAZ: 
MBU: 
MMH: 
MEV: 
MZH: 
MPY: 
MHZ: 
MTP: 
MCJ: 
MHI: 
MHU: 
MLA: 
MEM: 
MBG: 
MPI: 
MBN: 
MFO: 
MPL: 
MPD: 
MEZ: 
RCI: 
MER: 
MTH: 
MMG: 
MST: 
MSI: 
MRU: 
MEB: 
MEL: 
MEW: 
METH: 
MFV: 
MKA: 
MK1682(RtcB)
MAX: 
AFU: 
APO: 
AVE: 
AST: 
FPL: 
HAL: 
HSL: 
OE3085R(rtcB)
NPH: 
NP1934A(rtcB_2) NP2178A(rtcB_1)
NMO: 
Nmlp_2687(rtcB1)
HLA: 
HUT: 
HTI: 
HTU: 
NMG: 
HVO: 
HVO_2712(rtcB)
HME: 
HFX_2723(rtcB)
HJE: 
HBO: 
HXA: 
NAT: 
NPE: 
NGE: 
HRU: 
NOU: 
SALI: 
TAC: 
TVO: 
PTO: 
FAC: 
TAR: 
PHO: 
PAB: 
PFU: 
PFI: 
PYN: 
PYA: 
PYS: 
TKO: 
TON: 
TGA: 
TSI: 
TBA: 
THE: 
THA: 
THM: 
TLT: 
THS: 
ABI: 
ACF: 
APE: 
ACJ: 
SMR: 
SHC: 
IHO: 
DKA: 
DMU: 
DFD: 
TAG: 
IAG: 
THG: 
HBU: 
PFM: 
SSO: 
SOL: 
STO: 
SAI: 
SACN: 
SACR: 
SACS: 
SIS: 
SIA: 
SIM: 
SID: 
SIY: 
SIN: 
SII: 
SIH: 
SIR: 
SIC: 
MSE: 
MCN: 
AHO: 
PAI: 
PIS: 
PCL: 
PAS: 
PYR: 
POG: 
TNE: 
CMA: 
TUZ: 
TTN: 
VDI: 
VMO: 
TPE: 
THB: 
CLG: 
FFO: 
NMR: 
NIR: 
NKR: 
CSY: 
NGA: 
CSU: 
NEQ: 
KCR: 
HAH: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:4342972]
  Authors
Silber R, Malathi VG, Hurwitz J.
  Title
Purification and properties of bacteriophage T4-induced RNA ligase.
  Journal
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 69 (1972) 3009-13.
  Organism
bacteriophage T4
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
37353-39-2

DBGET integrated database retrieval system