KEGG   ORTHOLOGY: K03077Help
Entry
K03077                      KO                                     

Name
ulaF, sgaE
Definition
L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase [EC:5.1.3.4]
Pathway
Ascorbate and aldarate metabolism
Module
M00550  
Ascorbate degradation, ascorbate => D-xylulose-5P
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Metabolism
  Carbohydrate metabolism
   00053 Ascorbate and aldarate metabolism
    K03077  ulaF, sgaE; L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase
KEGG modules [BR:ko00002]
 Pathway module
  Nucleotide and amino acid metabolism
   Cofactor and vitamin biosynthesis
    M00550  Ascorbate degradation, ascorbate => D-xylulose-5P
     K03077  ulaF, sgaE; L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase
Enzymes [BR:ko01000]
 5. Isomerases
  5.1  Racemases and epimerases
   5.1.3  Acting on carbohydrates and derivatives
    5.1.3.4  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase
     K03077  ulaF, sgaE; L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase
BRITE hierarchy
Other DBs
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MROS_0029
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:11741871 (E.coli)
  Authors
Yew WS, Gerlt JA.
  Title
Utilization of L-ascorbate by Escherichia coli K-12: assignments of functions to products of the yjf-sga and yia-sgb operons.
  Journal
J Bacteriol 184:302-6 (2002)
DOI:10.1128/JB.184.1.302-306.2002
KEGG   ENZYME: 5.1.3.4Help
Entry
EC 5.1.3.4                  Enzyme                                 

Name
L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase;
phosphoribulose isomerase;
ribulose phosphate 4-epimerase;
L-ribulose-phosphate 4-epimerase;
L-ribulose 5-phosphate 4-epimerase;
AraD;
L-Ru5P
Class
Isomerases;
Racemases and epimerases;
Acting on carbohydrates and derivatives
BRITE hierarchy
Sysname
L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase
Reaction(IUBMB)
L-ribulose 5-phosphate = D-xylulose 5-phosphate [RN:R05850]
Reaction(KEGG)
Substrate
L-ribulose 5-phosphate [CPD:C01101]
Product
D-xylulose 5-phosphate [CPD:C00231]
Comment
Requires a divalent cation for activity.
History
EC 5.1.3.4 created 1965, modified 2005
Pathway
Pentose and glucuronate interconversions
Ascorbate and aldarate metabolism
Metabolic pathways
Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K01786  
L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase
K03077  
L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase
K03080  
L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase
Genes
ECO: 
b0061(araD) b3583(sgbE) b4198(ulaF)
ECJ: 
JW0060(araD) JW3555(sgbE) JW4156(ulaF)
ECD: 
EBW: 
BWG_3273(sgbE) BWG_3910(ulaF)
ECOK: 
ECE: 
Z0069(araD) Z5807(sgaE)
ECS: 
ECs0065(araD) ECs5174(sgaE)
ECF: 
ETW: 
ECSP_0065(araD) ECSP_5298(ulaF)
ELX: 
EOJ: 
ECO26_0063(araD) ECO26_5018(sgbE) ECO26_5365(ulaF)
EOI: 
ECO111_0063(araD) ECO111_4403(sgbE) ECO111_5016(ulaF)
EOH: 
ECO103_0062(araD) ECO103_4651(sgbE) ECO103_4991(ulaF)
ECG: 
E2348C_0062(araD) E2348C_3836(sgbE) E2348C_4521(ulaF)
EOK: 
G2583_0064(araD) G2583_5025(ulaF)
ELR: 
ECO55CA74_00310(araD) ECO55CA74_24095(sgaE)
ECC: 
c0073(araD) c4406(sgbE) c5288(sgaE)
ECP: 
ECP_0062 ECP_3688 ECP_4443
ECI: 
UTI89_C0066(araD) UTI89_C4127(sgbE) UTI89_C4798(sgaE)
ECV: 
APECO1_1923(araC) APECO1_2194(sgaE)
ECX: 
EcHS_A0065(araD) EcHS_A3787(sgbE) EcHS_A4442(ulaF)
ECW: 
EcE24377A_0063(araD) EcE24377A_4080(sgbE) EcE24377A_4759(ulaF)
ECM: 
EcSMS35_0063(araD) EcSMS35_3906(sgbE) EcSMS35_4669(ulaF)
ECY: 
ECSE_0061 ECSE_3859 ECSE_4496
ECR: 
ECIAI1_0061(araD) ECIAI1_3750(sgbE) ECIAI1_4431(ulaF)
ECQ: 
ECED1_0060(araD) ECED1_4272(sgbE) ECED1_5048(ulaF)
ECK: 
EC55989_0059(araD) EC55989_4040(sgbE) EC55989_4755(ulaF)
ECT: 
ECIAI39_0064(araD) ECIAI39_4095(sgbE) ECIAI39_4663(sgaE)
EOC: 
CE10_0062(araD) CE10_4137(yiaS) CE10_4937(ulaF)
EUM: 
ECUMN_0062(araD) ECUMN_4096(sgbE) ECUMN_4731(ulaF)
ECZ: 
ECS88_0064(araD) ECS88_4003(sgbE) ECS88_4784(ulaF)
ELO: 
EC042_0064(araD) EC042_3889(sgbE) EC042_4680(ulaF)
ELN: 
NRG857_00315(araD) NRG857_17845(sgbE) NRG857_21335(sgaE)
ELH: 
ETEC_0060 ETEC_3826
ESE: 
ECSF_0066 ECSF_3419 ECSF_4084
ESO: 
O3O_02735(sgaE) O3O_04135(araD) O3O_24735(sgbE)
ESM: 
O3M_00965(sgbE) O3M_21150(araD) O3M_22555(sgaE)
ESL: 
O3K_00935(sgbE) O3K_21250(araD) O3K_22650(sgaE)
ECL: 
EcolC_0131 EcolC_3596 EcolC_3815
EBR: 
ECB_00063(araD) ECB_03435(sgbE) ECB_04065(sgaE)
EBD: 
ECBD_0151 ECBD_3556 ECBD_3836
EKO: 
EKO11_0143 EKO11_3853 EKO11_4114
EKF: 
KO11_00295(araD) KO11_04805(sgbE) KO11_22620(ulaF)
EAB: 
ECABU_c00670(araD) ECABU_c40270(sgbE) ECABU_c47570(ulaF)
EDH: 
EcDH1_0127 EcDH1_3538 EcDH1_3795
EDJ: 
ECDH1ME8569_0060(araD) ECDH1ME8569_3464(sgbE) ECDH1ME8569_4055(sgaE)
EIH: 
ECOK1_0060(araD) ECOK1_4031(sgbE) ECOK1_4712(ulaF)
ENA: 
ECNA114_0049(araD) ECNA114_3736(sgbE) ECNA114_4414(ulaF)
ELU: 
UM146_18095(sgbE) UM146_21230(sgaE) UM146_23090(araD)
EUN: 
UMNK88_4368(araD) UMNK88_5146 UMNK88_59(araD)
ELW: 
ECW_m0059(araD) ECW_m3857(sgbE) ECW_m4560(ulaF)
ELL: 
WFL_00295(araD) WFL_18835(sgbE) WFL_22185(ulaF)
ELC: 
i14_0063(araD) i14_4072(sgbE) i14_4790(sgaE)
ELD: 
i02_0063(araD) i02_4072(sgbE) i02_4790(sgaE)
ELP: 
P12B_c0054(araD) P12B_c3712(sgbE) P12B_c4295(ulaF)
EBL: 
ECD_00063(araD) ECD_03435(sgbE) ECD_04065(ulaF)
EBE: 
B21_00062(araD) B21_03386(sgbE) B21_04027(ulaF)
ELF: 
LF82_0108(arad) LF82_2127(sgbE) LF82_2377(ulaF)
ECOA: 
APECO78_01920(sgaE) APECO78_03755(araD) APECO78_21730
ECOL: 
LY180_00300(araD) LY180_18425(araD) LY180_22055(sgaE)
ECOI: 
ECOPMV1_00062(araD) ECOPMV1_03922(sgbE) ECOPMV1_04662(ulaF)
ECOJ: 
P423_00305(araD) P423_19935(araD) P423_23365(sgaE)
ECOO: 
ECRM13514_0063(araD) ECRM13514_5462(sgaE)
ECOH: 
ECRM13516_0065(araD) ECRM13516_5149(sgaE)
ECOS: 
EC958_0195(araD) EC958_3991(sgbE) EC958_4685(sgaE)
EFE: 
EFER_0070(araD) EFER_3581(sgbE) EFER_4251(ulaF)
EAL: 
EAKF1_ch1360(araD) EAKF1_ch1631c(sgaE) EAKF1_ch2362c
STY: 
STY0118(araD) STY4119(sgbE) STY4744(sgaE)
STT: 
t0105(araD) t3842(yiaS) t4439(sgaE)
SEX: 
STBHUCCB_1180 STBHUCCB_40550 STBHUCCB_46900
SENT: 
TY21A_00540(araD) TY21A_19520(sgbE) TY21A_22590(sgaE)
STM: 
STM0101(araD) STM3677(sgbE) STM4388(sgaE)
SEO: 
STM14_0120(araD) STM14_4434(sgbE) STM14_5270(sgaE)
SEV: 
STMMW_01071 STMMW_36651 STMMW_43321
SEY: 
SL1344_0101(araD) SL1344_3642(sgbE) SL1344_4321(sgaE)
SEM: 
STMDT12_C01010(araD) STMDT12_C37340(sgbE) STMDT12_C45170(sgaE)
SEJ: 
STMUK_0102(araD) STMUK_4373(ulaF)
SEB: 
STM474_0104(araD) STM474_3849(sgbE) STM474_4585(sgaE)
SEF: 
UMN798_0110(araD) UMN798_3994(sgbE) UMN798_4752(sgaE)
SETU: 
STU288_00500(araD) STU288_18575(sgbE) STU288_22020(sgaE)
SETC: 
CFSAN001921_16920(araD) CFSAN001921_18475(araD) CFSAN001921_22060(araD)
SENR: 
STMDT2_01031(araD) STMDT2_35611(sgbE) STMDT2_42361(sgaE)
SEND: 
DT104_01061(araD) DT104_36601(sgbE) DT104_43761(sgaE)
SENI: 
CY43_00495(araD) CY43_19085(araD) CY43_22875(araD)
SEEN: 
SE451236_02535(araD) SE451236_04975(araD) SE451236_06510(araD)
SPT: 
SPA0103(araD) SPA3528(yiaS) SPA4205(sgaE)
SEK: 
SSPA0099 SSPA3294 SSPA3905
SPQ: 
SPAB_00128 SPAB_04568 SPAB_05522
SEI: 
SPC_0108(araD) SPC_3757(yiaS) SPC_4535(sgaE)
SEC: 
SCH_0095(araD) SCH_4262(sgaE)
SEH: 
SeHA_C0107(araD) SeHA_C4000(sgbE) SeHA_C4806(ulaF)
SHB: 
SU5_04154 SU5_0458 SU5_0734
SENH: 
CFSAN002069_08730(araD) CFSAN002069_10145(sgaE) CFSAN002069_13655(araD)
SEEH: 
SEEH1578_04470(sgbE) SEEH1578_08110(sgaE) SEEH1578_09530(araD)
SEE: 
SNSL254_A0108(araD) SNSL254_A3955(sgbE) SNSL254_A4749(ulaF)
SENN: 
SN31241_10820 SN31241_2060 SN31241_7740
SEW: 
SeSA_A0112(araD) SeSA_A3875(araD) SeSA_A4656(ulaF)
SEA: 
SeAg_B0112(araD) SeAg_B3891(sgbE) SeAg_B4666(ulaF)
SENS: 
Q786_00505(araD) Q786_17965(araD) Q786_21610(araD)
SED: 
SeD_A0105(araD) SeD_A4062(sgbE) SeD_A4785(ulaF)
SEG: 
SG0102(araD) SG3753(sgbE) SG4230(sgaE)
SEL: 
SPUL_0106(araD) SPUL_3888(sgbE) SPUL_4378(sgaE)
SEGA: 
SPUCDC_0106(araD) SPUCDC_3874(sgbE) SPUCDC_4364(sgaE)
SET: 
SEN0102(araD) SEN3499(sgbE) SEN4154(sgaE)
SENA: 
AU38_00500(araD) AU38_17875(araD) AU38_21465(araD)
SENO: 
AU37_00500(araD) AU37_18065(araD) AU37_21480(araD)
SENV: 
AU39_00500(araD) AU39_18070(araD) AU39_21500(araD)
SENQ: 
AU40_00570(araD) AU40_20125(araD) AU40_24000(araD)
SENL: 
IY59_00520(araD) IY59_18510(araD) IY59_22015(araD)
SENJ: 
CFSAN001992_10505(araD) CFSAN001992_11940(sgaE) CFSAN001992_15260(sgbE)
SEEC: 
CFSAN002050_05350(araD) CFSAN002050_06950(araD) CFSAN002050_25355(araD)
SEEB: 
SEEB0189_001490(araD) SEEB0189_018885(araD) SEEB0189_020430(araD)
SEEP: 
I137_00470(araD) I137_18655(araD) I137_20970(araD)
SENB: 
BN855_1040(araD) BN855_37650 BN855_44610(ulaF)
SENE: 
IA1_00505(araD) IA1_17860(araD) IA1_21390(araD)
SENC: 
SEET0819_02145(araD) SEET0819_05815(araD) SEET0819_07385(araD)
SES: 
SARI_02904 SARI_03245
SBG: 
SBG_0087(araD) SBG_3831(sgaE)
SBZ: 
A464_4394 A464_92
SBV: 
N643_00415(araD) N643_19395(araD)
SFL: 
SF0056(araD) SF4353(sgaE)
SFX: 
S0058(araD) S4623(sgaE)
SFV: 
SFV_0053(araD) SFV_3956(sgbE) SFV_4354(sgaE)
SFE: 
SFxv_0058(araD) SFxv_4744(ulaF)
SFN: 
SFy_0071 SFy_6246
SFS: 
SFyv_0074 SFyv_6318
SFT: 
NCTC1_00056(araD) NCTC1_04728(sgaE)
SSN: 
SSON_0067(araD) SSON_4380(sgaE)
SBO: 
SBO_0048(araD)
SBC: 
SbBS512_E0053(araD) SbBS512_E4728(ulaF)
SDY: 
SDY_0088(araD) SDY_4367(sgaE)
SDZ: 
Asd1617_00104 Asd1617_05729
SHQ: 
A0259_02630(araD) A0259_04135(araD) A0259_21745(araD)
ENT: 
Ent638_0608
ENC: 
ECL_00184 ECL_00592 ECL_00857
ENO: 
ECENHK_02180(sgaE) ECENHK_03665(araD)
ECLO: 
ENC_45740 ENC_47510
EEC: 
EcWSU1_00153(sgbE) EcWSU1_00394(ulaF) EcWSU1_00674(araD)
ENL: 
A3UG_00950(sgbE) A3UG_02205(sgaE) A3UG_03525(araD)
ECLG: 
EC036_01770 EC036_04170 EC036_06870
ECLE: 
ECNIH2_03155(araD) ECNIH2_04440(araD) ECNIH2_22630(araD)
ECLN: 
ECNIH4_19310(araD) ECNIH4_20660(araD)
ECLI: 
ECNIH5_02375(araD) ECNIH5_03525(araD) ECNIH5_21150(araD)
ECLX: 
LI66_02215(araD) LI66_03540(araD) LI66_21920(araD)
ECLY: 
LI62_02670(araD) LI62_04030(araD) LI62_23940(araD)
ECLZ: 
LI64_02350(araD) LI64_03600(araD)
ECLA: 
ECNIH3_02375(araD) ECNIH3_03520(araD) ECNIH3_21230(araD)
ECLC: 
ECR091_02365(araD) ECR091_03500(araD) ECR091_21160(araD)
ESC: 
Entcl_0156 Entcl_3664 Entcl_3966
KLE: 
AO703_02120(araD) AO703_03585(araD) AO703_20655(araD)
EAS: 
Entas_0160 Entas_0413 Entas_0661
EAU: 
DI57_15070(araD)
EHM: 
AB284_02900(araD) AB284_21445(araD) AB284_22865(araD)
EKB: 
BFV64_01860 BFV64_03230
ELG: 
BH714_15920 BH714_16650 BH714_18230
EXF: 
BFV63_02190 BFV63_03500 BFV63_21260
ECLS: 
LI67_001670(araD) LI67_003235(araD) LI67_004505(araD)
ENR: 
H650_19140(araD)
ENX: 
NI40_003370(araD)
ENF: 
AKI40_2085(sgbE) AKI40_4223(araD)
ESA: 
ESA_03278
CSK: 
ES15_3261
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CSSP291_15175(araD)
CSI: 
P262_04830
CSJ: 
CSK29544_00211
CCON: 
AFK62_03530(araD)
CDM: 
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CMJ: 
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CUI: 
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CMW: 
AFK63_15125(araD)
CTU: 
CTU_06930(araD)
KPN: 
KPN_00060(araD) KPN_04591(sgaE)
KPU: 
KP1_0465(sgaE) KP1_0873(araD)
KPM: 
KPHS_04380 KPHS_07730
KPP: 
A79E_4241 A79E_4602
KPK: 
A593_13025(araD) A593_14700(araD)
KPH: 
KPNIH24_02280(araD) KPNIH24_03940(araD)
KPZ: 
KPNIH27_02225(araD) KPNIH27_03760(araD)
KPV: 
KPNIH29_02350(araD) KPNIH29_04115(araD)
KPW: 
KPNIH30_02385(araD) KPNIH30_04130(araD)
KPY: 
KPNIH31_02410(araD) KPNIH31_03905(araD)
KPG: 
KPNIH32_02395(araD) KPNIH32_04135(araD)
KPC: 
KPNIH10_02265(araD) KPNIH10_03925(araD)
KPQ: 
KPR0928_02270(araD) KPR0928_03935(araD)
KPT: 
VK055_2514(araD) VK055_2872(ulaF)
KPE: 
KPK_0159(sgbE) KPK_4682(araD) KPK_5076(ulaF)
KPO: 
KPN2242_01015(sgaE) KPN2242_02735(araD)
KPR: 
KPR_0567(ulaF) KPR_0984(araD)
KPJ: 
N559_4703
KPI: 
D364_00250(araD) D364_23350(sgaE)
KPA: 
KPNJ1_04681 KPNJ1_05038
KPS: 
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KPX: 
PMK1_02061(ulaF) PMK1_02368(araD)
KPB: 
FH42_19330(araD) FH42_21120(araD)
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KU54_022615(araD) KU54_024345(araD)
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Kvar_4323 Kvar_4663
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KR75_07290 KR75_10470 KR75_12085
KVQ: 
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KOX: 
KOX_05710(sgbE) KOX_08950(sgaE) KOX_10755(araD) KOX_14480(sgbE)
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A225_0463 A225_0860 A225_1721 A225_5612
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J415_00800(sgaE) J415_04045(sgbE) J415_23050(sgbE) J415_26965(araD)
KOK: 
KONIH1_02590(araD) KONIH1_04490(araD) KONIH1_08455(araD) KONIH1_28240(araD)
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AB185_08160(araD) AB185_27670(araD) AB185_31690(araD) AB185_33620(araD)
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CFD: 
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1  [PMID:13539036]
  Authors
BURMA DP, HORECKER BL.
  Title
Not Available
  Journal
J. Biol. Chem. 231 (1958) 1053-64.
Reference
2  [PMID:4395381]
  Authors
Deupree JD.
  Title
Wood WA: L-ribulose 5-phosphate 4-epimerase of Aerobacter aerogenes. Evidence for nicotinamide adenine dinucleotide-independent 4-epimerization by the crystalline enzyme.
  Journal
J. Biol. Chem. 245 (1970) 3988-95.
Reference
3  [PMID:4879898]
  Authors
Lee N, Patrick JW, Masson M.
  Title
Crystalline L-ribulose 5-phosphate 4-epimerase from Escherichia coli.
  Journal
J. Biol. Chem. 243 (1968) 4700-5.
  Sequence
[eco:b0061]
Reference
4  [PMID:13549442]
  Authors
WOLIN MJ, SIMPSON FJ, WOOD WA.
  Title
Degradation of L-arabinose by Aerobacter aerogenes. III. Identification and properties of L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase.
  Journal
J. Biol. Chem. 232 (1958) 559-75.
Reference
5  [PMID:8520491]
  Authors
Andersson A, Schneider G, Lindqvist Y.
  Title
Purification and preliminary X-ray crystallographic studies of recombinant L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase from Escherichia coli.
  Journal
Protein. Sci. 4 (1995) 1648-50.
  Sequence
[eco:b0061]
Reference
6  [PMID:10769139]
  Authors
Lee LV, Poyner RR, Vu MV, Cleland WW.
  Title
Role of metal ions in the reaction catalyzed by L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase.
  Journal
Biochemistry. 39 (2000) 4821-30.
Reference
7  [PMID:11732896]
  Authors
Samuel J, Luo Y, Morgan PM, Strynadka NC, Tanner ME.
  Title
Catalysis and binding in L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase: a comparison with L-fuculose-1-phosphate aldolase.
  Journal
Biochemistry. 40 (2001) 14772-80.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9024-19-5
KEGG   REACTION: R05850Help
Entry
R05850                      Reaction                               

Name
L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase
Definition
L-Ribulose 5-phosphate <=> D-Xylulose 5-phosphate
Equation
Reaction class
C00231_C01101
Enzyme
Pathway
Pentose and glucuronate interconversions
Ascorbate and aldarate metabolism
Metabolic pathways
Microbial metabolism in diverse environments
Module
M00550  
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Orthology
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L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase [EC:5.1.3.4]
K03077  
L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase [EC:5.1.3.4]
K03080  
L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase [EC:5.1.3.4]
DBGET integrated database retrieval system