KEGG   ORTHOLOGY: K03182Help
Entry
K03182                      KO                                     

Name
ubiD
Definition
4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase [EC:4.1.1.98]
Pathway
Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis
Module
M00117  
Ubiquinone biosynthesis, prokaryotes, chorismate => ubiquinone
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Metabolism
  Metabolism of cofactors and vitamins
   00130 Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis
    K03182  ubiD; 4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase
KEGG modules [BR:ko00002]
 Pathway module
  Nucleotide and amino acid metabolism
   Cofactor and vitamin biosynthesis
    M00117  Ubiquinone biosynthesis, prokaryotes, chorismate => ubiquinone
     K03182  ubiD; 4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase
Enzymes [BR:ko01000]
 4. Lyases
  4.1  Carbon-carbon lyases
   4.1.1  Carboxy-lyases
    4.1.1.98  4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase
     K03182  ubiD; 4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase
BRITE hierarchy
Other DBs
Genes
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b3843(ubiD)
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JW3819(ubiD)
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HSM_0773
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BTN_187(ubiD)
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Dmul_34360
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DAP: 
Dacet_2592
CNI: 
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FSI: 
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CABY: 
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TYE: 
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TID: 
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TOPB45_0561
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T478_0481
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SU86_003310
NDV: 
NDEV_0556
KCR: 
Kcr_0485
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Zhang H, Javor GT
  Title
Identification of the ubiD gene on the Escherichia coli chromosome.
  Journal
J Bacteriol 182:6243-6 (2000)
DOI:10.1128/JB.182.21.6243-6246.2000
  Sequence
[eco:b3843]
KEGG   ORTHOLOGY: K03186Help
Entry
K03186                      KO                                     

Name
ubiX, bsdB, PAD1
Definition
flavin prenyltransferase [EC:2.5.1.129]
Pathway
Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis
Aminobenzoate degradation
Phenylpropanoid biosynthesis
Module
M00117  
Ubiquinone biosynthesis, prokaryotes, chorismate => ubiquinone
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Metabolism
  Metabolism of cofactors and vitamins
   00130 Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis
    K03186  ubiX, bsdB, PAD1; flavin prenyltransferase
  Biosynthesis of other secondary metabolites
   00940 Phenylpropanoid biosynthesis
    K03186  ubiX, bsdB, PAD1; flavin prenyltransferase
  Xenobiotics biodegradation and metabolism
   00627 Aminobenzoate degradation
    K03186  ubiX, bsdB, PAD1; flavin prenyltransferase
KEGG modules [BR:ko00002]
 Pathway module
  Nucleotide and amino acid metabolism
   Cofactor and vitamin biosynthesis
    M00117  Ubiquinone biosynthesis, prokaryotes, chorismate => ubiquinone
     K03186  ubiX, bsdB, PAD1; flavin prenyltransferase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.129  flavin prenyltransferase
     K03186  ubiX, bsdB, PAD1; flavin prenyltransferase
BRITE hierarchy
Other DBs
Genes
SCE: 
YDR538W(PAD1)
ZRO: 
DHA: 
CAL: 
CDU: 
TMN: 
FGR: 
FPU: 
FVR: 
FOX: 
NHE: 
NECHADRAFT_97489 NECHADRAFT_98161
TRE: 
TRIREDRAFT_72549
MAW: 
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MAJ: 
MAA_01632 MAA_06753
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CFIO01_10373
ELA: 
UCREL1_1237
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BC1G_15774
AOR: 
AOR_1_146164(AO090001000094) AOR_1_736154(AO090003000423)
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ANI_1_1572034(An03g06570) ANI_1_916084(An09g00010)
AFV: 
AFLA_033960 AFLA_065000
NFI: 
NFIA_026000
PCS: 
Pc22g03320
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PTE: 
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BZE: 
COCCADRAFT_108287
BSC: 
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UCRNP2_4414
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CGB_G5615C
MRR: 
Moror_16771
PSOJ: 
PHYSODRAFT_310787
ECO: 
b2311(ubiX)
ECJ: 
JW2308(ubiX)
ECD: 
ECDH10B_2473(ubiX)
EBW: 
BWG_2085(ubiX)
ECOK: 
ECMDS42_1882(ubiX)
ECE: 
Z3573(ubiX) Z4047
ECS: 
ECs3195 ECs3593
ECF: 
ECH74115_3451(ubiX) ECH74115_3990(kpdB)
ETW: 
ECSP_3186(ubiX) ECSP_3687
ELX: 
CDCO157_2959 CDCO157_3353
EOJ: 
ECO26_3299(ubiX) ECO26_3808
EOI: 
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EOH: 
ECO103_2775(ubiX) ECO103_3281
ECG: 
E2348C_2451(ubiX) E2348C_3009
EOK: 
G2583_2848(ubiX) G2583_3387(padI)
ELR: 
ECO55CA74_14115 ECO55CA74_16125
ECC: 
c2855(ubiX)
ECP: 
ECP_2350
ECI: 
UTI89_C2595(ubiX)
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APECO1_4253(ubiX)
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EcE24377A_2605(ubiX) EcE24377A_3040(kpdB)
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ESO: 
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ESM: 
O3M_05880 O3M_07890
ESL: 
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EcolC_1341
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CFSAN001921_02470 CFSAN001921_05010
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SeSA_A2586 SeSA_A3071(kpdB)
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SeAg_B2498 SeAg_B3042(kpdB)
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Q786_11630 Q786_14075
SED: 
SeD_A2707 SeD_A3230(kpdB)
SEG: 
SG2385(ubiX) SG2824
SEL: 
SPUL_0529(ubiX) SPUL_2919
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SFV: 
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Gulmezian M, Hyman KR, Marbois BN, Clarke CF, Javor GT
  Title
The role of UbiX in Escherichia coli coenzyme Q biosynthesis.
  Journal
Arch Biochem Biophys 467:144-53 (2007)
DOI:10.1016/j.abb.2007.08.009
  Sequence
[eco:b2311]
Reference
  Authors
White MD, Payne KA, Fisher K, Marshall SA, Parker D, Rattray NJ, Trivedi DK, Goodacre R, Rigby SE, Scrutton NS, Hay S, Leys D
  Title
UbiX is a flavin prenyltransferase required for bacterial ubiquinone biosynthesis.
  Journal
Nature 522:502-6 (2015)
DOI:10.1038/nature14559
  Sequence
[pae:PA4019]
Reference
  Authors
Lin F, Ferguson KL, Boyer DR, Lin XN, Marsh EN
  Title
Isofunctional enzymes PAD1 and UbiX catalyze formation of a novel cofactor required by ferulic acid decarboxylase and 4-hydroxy-3-polyprenylbenzoic acid decarboxylase.
  Journal
ACS Chem Biol 10:1137-44 (2015)
DOI:10.1021/cb5008103
  Sequence
[sce:YDR538W]
Reference
  Authors
Lupa B, Lyon D, Shaw LN, Sieprawska-Lupa M, Wiegel J
  Title
Properties of the reversible nonoxidative vanillate/4-hydroxybenzoate decarboxylase from Bacillus subtilis.
  Journal
Can J Microbiol 54:75-81 (2008)
DOI:10.1139/w07-113
  Sequence
[bsu:BSU03630]
KEGG   REACTION: R04985Help
Entry
R04985                      Reaction                               

Name
4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate carboxy-lyase
Definition
2-Polyprenylphenol + CO2 <=> 4-Hydroxy-3-polyprenylbenzoate
Equation
Comment
general reaction (see R04986)
Reaction class
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Enzyme
Pathway
Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis
Metabolic pathways
Biosynthesis of secondary metabolites
Module
M00117  
Ubiquinone biosynthesis, prokaryotes, chorismate => ubiquinone
Orthology
K03182  
4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase [EC:4.1.1.98]
K03186  
flavin prenyltransferase [EC:2.5.1.129]
DBGET integrated database retrieval system