Database: AAindexEntry: OVEJ920104
LinkDB: OVEJ920104
H OVEJ920104
D Environment-specific amino acid substitution matrix for accessible
residues (Overington et al., 1992)
R LIT:1811128 PMID:1304904
A Overington, J., Donnelly, D., Johnson, M.S., Sali, A. and Blundell, T.L.
T Environment-specific amino acid substitution tables: tertiary templates
and prediction of protein folds
J Protein Science 1, 216-226 (1992)
M rows = ACDEFGHIKLMNPQRSTVWYJ-, cols = ACDEFGHIKLMNPQRSTVWYJ
0.224 0.013 0.055 0.068 0.031 0.067 0.048 0.053 0.068 0.050 0.087 0.059 0.067 0.073 0.062 0.074 0.059 0.079 0.033 0.035 0.121
0.002 0.739 0.001 0.006 0.012 0.000 0.001 0.004 0.003 0.000 0.000 0.001 0.001 0.005 0.008 0.001 0.001 0.000 0.001 0.000 0.008
0.044 0.007 0.284 0.091 0.016 0.041 0.056 0.033 0.034 0.012 0.022 0.094 0.047 0.052 0.025 0.054 0.044 0.025 0.014 0.023 0.030
0.052 0.029 0.079 0.251 0.016 0.028 0.026 0.026 0.053 0.019 0.031 0.038 0.037 0.071 0.049 0.031 0.044 0.034 0.010 0.027 0.008
0.010 0.029 0.006 0.008 0.291 0.004 0.023 0.046 0.011 0.047 0.032 0.012 0.006 0.010 0.009 0.011 0.013 0.018 0.093 0.073 0.000
0.079 0.000 0.066 0.047 0.020 0.455 0.042 0.024 0.033 0.028 0.039 0.073 0.054 0.054 0.040 0.064 0.037 0.039 0.041 0.036 0.038
0.013 0.003 0.021 0.011 0.024 0.010 0.284 0.008 0.021 0.011 0.020 0.035 0.008 0.020 0.023 0.013 0.012 0.020 0.014 0.025 0.023
0.014 0.016 0.017 0.014 0.058 0.006 0.010 0.235 0.015 0.050 0.048 0.018 0.009 0.009 0.015 0.014 0.023 0.075 0.015 0.030 0.008
0.062 0.007 0.039 0.072 0.032 0.027 0.068 0.039 0.294 0.050 0.077 0.055 0.045 0.077 0.122 0.043 0.059 0.044 0.037 0.035 0.053
0.028 0.000 0.010 0.017 0.097 0.013 0.024 0.094 0.035 0.311 0.141 0.030 0.030 0.028 0.027 0.019 0.029 0.073 0.064 0.033 0.015
0.010 0.000 0.003 0.005 0.015 0.005 0.005 0.020 0.011 0.030 0.167 0.004 0.003 0.017 0.005 0.003 0.007 0.013 0.004 0.008 0.015
0.041 0.007 0.080 0.041 0.022 0.044 0.087 0.031 0.042 0.035 0.024 0.239 0.019 0.040 0.031 0.050 0.051 0.021 0.008 0.036 0.030
0.053 0.000 0.039 0.036 0.036 0.006 0.027 0.018 0.017 0.034 0.014 0.018 0.412 0.021 0.026 0.037 0.031 0.019 0.018 0.008 0.015
0.040 0.013 0.038 0.060 0.018 0.025 0.042 0.017 0.046 0.026 0.075 0.032 0.019 0.231 0.056 0.032 0.042 0.036 0.007 0.015 0.023
0.025 0.023 0.015 0.031 0.010 0.017 0.033 0.017 0.062 0.019 0.015 0.022 0.018 0.047 0.248 0.026 0.028 0.022 0.022 0.023 0.000
0.100 0.013 0.088 0.059 0.044 0.073 0.057 0.051 0.062 0.043 0.026 0.096 0.070 0.072 0.079 0.290 0.138 0.057 0.025 0.059 0.053
0.054 0.010 0.049 0.058 0.042 0.029 0.037 0.059 0.058 0.039 0.049 0.068 0.042 0.066 0.053 0.099 0.266 0.061 0.021 0.041 0.015
0.041 0.000 0.021 0.033 0.040 0.020 0.038 0.148 0.031 0.077 0.051 0.018 0.020 0.043 0.033 0.028 0.044 0.269 0.023 0.049 0.091
0.005 0.000 0.002 0.002 0.049 0.006 0.006 0.009 0.006 0.017 0.005 0.003 0.004 0.003 0.008 0.003 0.004 0.003 0.421 0.038 0.000
0.014 0.000 0.013 0.018 0.111 0.012 0.034 0.028 0.017 0.023 0.026 0.023 0.005 0.012 0.024 0.018 0.019 0.028 0.109 0.355 0.023
0.002 0.000 0.001 0.000 0.001 0.002 0.002 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.007 0.000 0.001 0.341
0.086 0.092 0.072 0.072 0.045 0.089 0.060 0.043 0.061 0.075 0.048 0.061 0.083 0.050 0.056 0.087 0.050 0.057 0.021 0.048 0.091
//
DBGET integrated database retrieval system
