KEGG   Buchnera aphidicola Bp (Baizongia pistaciae): bbp_540
Entry
bbp_540           CDS       T00111                                 
Symbol
rep
Name
(GenBank) ATP-dependent DNA helicase Rep
  KO
K03656  ATP-dependent DNA helicase Rep [EC:5.6.2.4]
Organism
bab  Buchnera aphidicola Bp (Baizongia pistaciae)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bab00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:bab03400]
    bbp_540 (rep)
Enzymes [BR:bab01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     bbp_540 (rep)
DNA repair and recombination proteins [BR:bab03400]
 Prokaryotic type
  Other factors with a suspected DNA repair function
   DNA helicases
    bbp_540 (rep)
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 AAA_30 AAA_11
Other DBs
NCBI-ProteinID: AAO27239
UniProt: Q89A21
Position
complement(603522..605534)
AA seq 670 aa
MLFNEHQKKAISYISGPCLILAGAGSGKTRVIINKIVHLIKICHFDPKCITAITFTNKAA
CEMKSRILNVLSVNVSNLVKISTFHALGLEIIKSEIELLNIKSNFTIFDEQDQISILQEI
VSKEDRSFVRQIRQSISNWKNKLLCPNQVNKISNSSIEFKFFRYYELYNAYLKSSNILDF
DDLIFLPTILLRDNKLSRERWNDKIKYLLVDEYQDTNFIQYKLIKLLSSKRSNFTLVGDD
DQSIYSWRGANIHNFESLKHDYPNLRTIIMQHNYRSSGRILKVANALISNNLHFFNKKLF
SNLDYGSIVEIISAKNEEDEARVILQTLMLHKSNYNAQYKDYAILYRSNYQVKIFEKFLI
KFKIPYKILANISFFSRPEIKDLIAYLRLIINPDDNAAFLRVVNRPLRGIGAVTLQKLKE
WSKKRNQSFFMASLDIGLESILPVHNLKSLQEFVYLIQTISYQIQLNPIEVLEKLVATIK
YEKWLMRSLKFSKLYVASIKNISIVLNWIINELKYKIMNSKKFVMKYLIDIISEFILQNS
LNEDIVINNDYVQLMTLHASKGLEFLYVFIVGVEEGVLPYYRNTTMENNIDEERRLAYVG
ITRAQKKLFLSYAIQRCQYGVVINTKPSRFLRELPQSDILWQKSKILNLNEKNNFLFKAY
KKSLKKKLLR
NT seq 2013 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttatttaatgaacatcaaaaaaaggctataagttatatttctggaccctgtttaata
ttagcaggagctggttcaggaaaaactagggtaattattaataaaattgttcatttaatt
aaaatttgtcattttgatcccaaatgtattacagctattacctttacgaataaagctgct
tgtgaaatgaaaagtagaattttaaatgtattatctgttaatgtatctaatttagttaaa
atttctacttttcatgcattaggtttagaaattattaaatctgaaatagaattattaaat
ataaaatctaattttactatttttgatgaacaggatcaaatttcaatattgcaggaaatt
gtttcaaaagaagataggagttttgtacgtcaaattcgtcaatcaatttctaattggaaa
aataagttattatgtccaaatcaagttaataaaatttctaattctagcatagaatttaaa
ttttttcgctattacgaattatataatgcatatttgaagtcttctaatatattagatttt
gatgatttaatatttttaccaacaatattgttgagagataataagttatctagggaacgt
tggaatgataaaattaaatatttgttagtagatgaatatcaggacacaaattttattcaa
tataaattaattaaattattaagcagtaagaggtctaattttactttagttggtgatgac
gatcaatctatttattcttggagaggtgcaaatattcataattttgaatctttaaagcat
gattatcctaatttacgtactattatcatgcagcataattatcgttcttctggaagaatt
ttaaaagtagctaatgcgttaatatcaaataatttgcatttttttaataagaaattattt
tcaaatttagattatggttcgatagtagaaataatatcagcaaagaacgaagaagatgaa
gctagagtaatattgcaaacattgatgttgcacaaatctaattataatgctcaatataaa
gattatgctattttgtataggagtaattatcaagttaaaatatttgaaaaatttttaatt
aaatttaaaattccatataaaattttagctaatatatcttttttctctagaccagaaatt
aaagatttaatagcatatttgcgtttgataattaatcctgatgacaatgcagcgttttta
agagtagtaaatagaccgttaaggggaatcggtgctgttactttgcagaagttaaaagag
tggagtaaaaaaagaaatcaaagtttttttatggctagtttagacattggtttagaatct
attttacctgttcataatttaaaaagtttacaagaatttgtttatttaattcaaactatt
tcgtatcaaattcaattaaatcctattgaggttttagaaaaattagtagcgacaataaaa
tatgaaaaatggttaatgagaagtttaaaattttctaaattatatgttgctagtattaaa
aatatttcgatagttttaaattggataattaatgaattaaaatataaaattatgaattcg
aagaagtttgtaatgaagtatttaattgatattatttcagagtttattttacagaattca
ctcaatgaagatattgtaattaataacgattatgttcaattaatgactttacatgcgtca
aaaggattagagtttttatatgtttttattgtaggtgtagaggaaggagtattgccatat
tatcgaaatactactatggaaaataacattgatgaggaacgaagattagcgtatgtaggc
attactagagctcaaaaaaagttatttttaagttatgctatacagcgttgtcagtatgga
gttgtaataaatactaaaccgagtagatttttgcgagaattacctcaatctgatatatta
tggcagaaaagtaaaatattaaatttaaatgaaaaaaataattttttatttaaagcatac
aaaaaatcgttaaaaaagaaattattacgataa

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
Protein domain (6)   
   Pfam (6)   
All databases (16)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system