KEGG C.acetobutylicum: CAC0540

Clostridium acetobutylicum: CAC0540

Entry

CAC0540 CDS C.acetobutylicum

Definition ChW repeat-containing mannanase ManB

Class

SSDB

Motif Pfam: ChW Glyco_hydro_26 CBM_3

Other DBs NCBI-GI: 15893830
NCBI-GeneID: 1116723
JCVI-Pathema: CAC0540
UniProt: Q97LL8

Position 628196..629794

AA seq 532 aa
MILNKRKKVLISMVTMVGILSPLANSKVYAIPTTCNSGIFVGRAENLDAIDIMKDPNYTG
KVSIVGFDVANCSDNNSDDNHKNHNETAIGNGPTPKWHNSNYTSDFLNVAQQGKDTMISA
TLPNPVPSQEIGSVGQIAYGSQISDADFKELASVDIKNINQSSPYFVRNYGQMVSKLGDI
IEKYHTELMDSNGNATIYLRPFHEMNSPWLWWGFKNQDDFKNLWIHLHNYLVNDRKFTWL
KFCFAASAGDPSLDPAHVKGANSYYPGNNYVDTVALDGYSDDPSNDSGIKKQYAELTATG
KPFGFAELGAKVDGDFVNVPNERTQQNVETRPFNYQKWSDAIQKYYSNAKYCIVFGGAYD
PRNNLHGTSLFSNSQEPNTSINYQAHVQNIGWQDSVQDGDAAGTIEKALRMEAIKINYPN
NAGLHVEYSAQVQNKGWMPAVRDGAIAGTVQEGLRMEAIKISLKDSLGNVSNDYSVYYRA
QVQNKGWMPWVKNGAIAGTVQEGLRMEAIEIYVVKNNTPVANFMDNKVANAQ

NT seq 1599 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgatattaaacaaaagaaaaaaagtattgataagtatggtgacaatggtgggtatacta
tcaccattagctaatagcaaagtttatgcaattccaacaacatgtaattcaggaatattt
gttggtagggctgaaaatttagacgctatagatattatgaaagatcctaactatactgga
aaagtaagtatagttgggtttgatgtggctaattgttcggataataatagtgacgataat
cataagaatcataatgagacagcaattggtaatggccctacgccaaaatggcataactct
aattatacatctgattttttgaatgtggcacaacaaggaaaagatacaatgatatcagct
acattacccaaccctgttcctagtcaagaaattggttcagtaggtcagatagcctatggt
tcgcaaatatccgatgctgattttaaagaattagctagtgtagatattaaaaatataaat
cagtcaagtccttactttgttaggaactatggacaaatggttagcaaattaggagatata
attgaaaaatatcatacagagcttatggatagcaatggtaatgcaaccatatacttgaga
ccctttcatgaaatgaattcaccttggttatggtggggatttaaaaatcaggatgacttt
aaaaatctttggatacatcttcataactacttagtgaatgatcgtaagtttacttggtta
aaattctgctttgctgctagtgctggagatcctagcttagatccagcacatgtcaagggt
gcaaattcatattatccaggaaataattatgtggatacggtagctttagatggatatagt
gatgatccttcaaacgatagcggaataaaaaaacaatatgcagaacttacagcaacagga
aaaccatttggatttgctgaacttggtgctaaagttgacggggattttgttaatgtcccg
aatgaaaggactcaacagaatgttgaaacaagaccatttaattatcaaaaatggagtgat
gctattcaaaagtattattctaatgctaaatattgcatagtatttggtggtgcatatgac
cctcgtaataatcttcatggaacttcactttttagtaatagccaggaaccaaatacaagt
ataaattatcaagcgcatgttcagaatataggatggcaagactctgtacaagatggtgat
gcagcaggaacaattgagaaagccttaagaatggaagctataaaaattaattatcctaat
aatgcaggtttacatgtagaatatagtgcacaagttcagaataaaggttggatgccagca
gtaagagatggagctatagcaggaacagttcaagagggattaagaatggaggctataaaa
atttctctaaaagattctttggggaatgtttcaaatgattattctgtatattatagagca
caagttcagaataagggatggatgccatgggtaaaaaatggagctatagcaggaacagtt
caagaaggattaagaatggaagctatagagatatacgttgttaagaataatacacctgta
gctaattttatggataataaagtagcaaatgctcaataa

All links

Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (4)   
   NCBI-Gene (1)   
   NCBI-GI (2)   
   JCVI-PATHEMA-CAC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (2)   
   GenBank (1)   
   EMBL (1)   
Protein domain (3)   
   Pfam (3)   
All databases (12)

DBGET integrated database retrieval system