| Entry |
|
|---|
| Gene name |
gyrA
|
|---|
| Definition |
DNA gyrase subunit A (EC:5.99.1.3)
|
|---|
| Orthology |
|
|---|
| Organism |
ddf Deferribacter desulfuricans SSM1
|
|---|
| Class |
|
|---|
| SSDB |
    |
|---|
| Motif |
 |
|---|
| Other DBs |
NCBI-GI: NCBI-GeneID: UniProt: |
|---|
| Position |
4621..7029
 |
|---|
| AA seq |
802 aa  
MKEKGIIEVNIEDSLKDSYLDYAMSVIIGRALPDVRDGLKPVHRRVLYAMYEMGVLHNKP
YKKSARIVGDVIGKYHPHGDSAVYDTLVRMAQDFSMRYPLVDGQGNFGSIDGDSAAAMRY
TEVRMTKIAEEMLSDIDKDTVDFSPNYDGSLKEPVVLPTRIPNMLINGTSGIAVGMATNI
PPHNLTEVIDALVYIIDNPSNTDEEILNFIKGPDFPTYGIIYGKDEILKAYKTGKGVIKV
RAKVKKEITTTGKELLVVTELPYQVNKANLIEKIANLARDKKINGIVDLRDESDRDGIRI
VIELKRGENADIIINQLYKFTQMEIAYGINLVGIVNNKPKTLTLRDLLEQFLEHRKVVVI
RRTKFLLKKAEDRLHILEGLIKAVENIDEVVALIKSSKNAAEAKEKLMNRFELSDKQAQA
ILDMRLHRLTGLEIEKLRNEYKETLKNIEFYKSILNNKSVLMGIIKEELIDIKNKYGDER
RTQIVNSSEEINIEDLIPDDEVVVTLSYQGFIKRTPLSNFKSQKRGGKGKTGAGNVKEDF
IKDILVTTNHSTLMFFTNKGRIHYLKVYELPELARDAKGKYIANLISLDKDEKVAAMIST
KEFDRDRYIFMCTKEGIVKKTSLDAFSSGRSGIIAIKLRDGDEIVDASLISKNDSIFIST
RKGKCIQFNSSEVRNMGRNATGVKGITLTKDDKVVSMEAVKGDPLILTVTTKGFGKSSLI
TDYRIQSRGGKGIKLSKVTERTGEIVGARQVKLEDDVMLISKSSKVIRLSVSDIPILGRD
TQGVKLMGLDDEIISFDVIRED |
|---|
| NT seq |
2409 nt  +upstreamnt +downstreamnt
atgaaagagaaagggattatcgaagttaatatcgaagattctttaaaagatagttattta
gattatgctatgagtgtaatcataggtagggcactacctgatgtaagggatggtttaaaa
cctgttcatagaagagttttgtatgcaatgtatgaaatgggtgttttacacaataagcct
tataaaaaatcggcaagaattgtaggggatgtgataggtaaatatcaccctcacggtgat
tctgctgtttatgatacattggtaagaatggcacaagatttttcaatgagatatccattg
gtagatggtcagggaaattttggttccatagatggtgattcagccgctgccatgagatat
actgaagttaggatgaccaaaattgcagaagaaatgctttccgatattgataaagatact
gtggatttttcaccgaactatgacggttctttgaaagaacctgtagtacttcctactaga
ataccaaatatgcttataaatggaacaagtggtattgctgttggtatggcaacaaatata
cctcctcataatttaacagaagttatcgacgctttagtttatattatagataacccatca
aatacagatgaagaaattttaaattttataaaagggccggattttccaacatacggcata
atatacggtaaagatgagattttaaaagcatataaaacaggtaaaggcgtaataaaagta
agggcaaaggtaaagaaggaaataaccacaacaggtaaagaactcttagttgtgacagaa
cttccttatcaggtgaataaagctaatttaattgaaaaaatagctaatttagcaagagat
aaaaaaataaatgggattgttgatttaagagatgaatctgacagagatggtattcgtatt
gttatagagttaaaaagaggtgaaaatgcagatataataataaaccagttgtataaattt
acacaaatggaaattgcatacggtataaatcttgtgggtattgtaaataataaacctaag
actttaactttaagagatctattagaacagtttttagaacatagaaaagttgtagttata
agaagaacaaaatttttactaaaaaaagctgaagatagactgcatattttagaaggtttg
ataaaagcagttgagaatatagatgaagttgttgcgctgattaaaagttctaaaaatgcg
gcagaggcaaaagagaaactgatgaataggtttgaattatcagataaacaggctcaagct
attttagatatgaggctacacagattaactgggcttgaaattgaaaaacttagaaatgaa
tataaagaaacattaaaaaatattgaattttataagtctattttgaataacaagtcagtt
ttaatggggattataaaggaagaattaattgatattaaaaataaatatggggatgaaaga
agaacacaaattgtaaatagttcggaagaaataaatattgaagatctaattcctgatgat
gaagttgtagtaacactttcttatcaagggtttattaaacgtactccactatcaaacttt
aaatctcaaaaacgaggtggaaaagggaaaacaggtgccggtaatgtcaaagaagatttt
ataaaggatattcttgtaactacaaaccattccacattgatgttttttacaaacaaagga
agaattcattatttaaaggtttacgaattgccagagcttgctagagacgcaaagggtaag
tatattgcaaatttaatctccttagataaggatgaaaaagttgcagcgatgatttccact
aaagagtttgatagagataggtatatatttatgtgtactaaagaaggtattgttaaaaag
acatctcttgatgcttttagtagtggtagaagtggaattatcgctataaagcttagagat
ggggatgaaatagtagatgcttcattaatttctaaaaacgattctatctttatatccaca
agaaaaggtaaatgtattcagtttaacagctccgaagtaagaaatatgggtagaaatgct
actggtgtaaaagggataacgttgactaaagatgataaggtcgtttcaatggaagcggtc
aagggggatccacttattttaaccgttactacaaaaggatttggtaaatcttctttaatt
actgattatagaattcaatcaagaggtggtaaagggataaaattatcaaaggttacagaa
agaactggtgaaatagttggtgcaagacaggttaagttggaggatgatgtgatgctgatt
tccaagtcttcaaaggttataaggctctcagtttctgatattcctattttagggagagat
actcaaggtgtgaaattaatgggtcttgacgatgaaataatatcttttgatgtaataaga
gaggattaa |
|---|
