KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0273795Help
Entry
DDB_G0273795      CDS       T00245                                 

Definition
hypothetical protein
Orthology
K14310  
nuclear pore complex protein Nup205
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
RNA transport
Class
Genetic Information Processing; Translation; RNA transport [PATH:ddi03013]
BRITE hierarchy
SSDB OrthologParalogGFIT
Motif
Pfam: 
Motif
Other DBs
NCBI-GI: 
NCBI-GeneID: 
DictyBase: 
UniProt: 
Position
2
AA seq 1916 aa AA seqDB search
MEFINSFNLVMSNIFDNHNNSSIEFWRICEQINYFQNLWFRIHDDLIISSFKLMGSLARC
NTNEVFNFFAQGSAQFTWAKLFQNFSSYAHALNSIEFSQSIQSNQMNSSTTTTQQISSTP
QQHQQHQQQQQQQQGYNNQQIPNTPYQQFQPTMQYQGQQSSMQQSVGQQQQPQQQPQQQN
TPNTPNSTTSSNTANTTSPVKITQLLLSEKDSDALSSIFQLISRLVESSMAVGNVFLKIG
PLISLAFQFAVSQVDSKLKSSALSVITSYSQYPIYVADIWRLINETNLFNSGLSAIGGLN
ELSFTQQSLELLLQLIQQSSFLFDKSNHYQESLKLKSYLDSCMDLFNLLNIKSFNTLDEK
WKFALTLMKIFEFSIIQFNQSIQNFQIDKQHPCYQLYIELNRSSLSSNLYQQQQQQQNKY
QQQQQQQQQSKKTTLENIIKIIDYSNDQSILIQQQIQQQQQQQQQGYNQDSSRVILNLVF
QQLQQQDNDDFNLLVLKCLDLLLLISDNTVYDIENAKSLVVNLSNMDYSRPIVSIAKLID
HELPAISLRAIRLIYSFECYTHQISTVFLDSDPNLILSKFIKMMEFNESNFEDFSGTNYD
QTISFIRYASNSVQWTIAQLIMLCLSNISSGRYTLAHFLLGCSSNLDLSKDFIPNSKSCL
TLIIKNVMNSQFVERYPHLVDCYHEIIWKMSSDPITWKPMIKYIQEEFPNYYHDSLLILR
NAITINGSSERRTEALISSMSWVFKTCSISIQNSYSIEMKQFLTRLIFPSLMNLNQPSMN
GGIGGLNGTINNGLIMGISPINILSLYNTIEFQLPEINRPRIFSMYPNLIEYFTTNININ
NLNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNITNGGTSQLLDIIKIR
EVLKNDFNRFSNEFEIERELEECCLINSSIQLYNSKLKALDGWKSFINISLAQNTIEIDT
LDESLLLSLLQRIVIDFSNERNPIESTLSIGYTILTILFTLKLKKDSYQLFINSSLTTNS
TDSNVIEQKMKSIFEGLLQTVLKSPHQAIRGISYTCLIQYLDLSATTPTTPSLSPLSTSI
NNVVEMNNKSKNKNNQDKEQGYGNLNIGLIISKIEDKFIRILSSDCNSFSRGWRITAISC
MQSILSIDNLCGHRSLMFLQNKGFIINMINDTCSKYLSDNWENIDPKDLHVYKSQMSLLL
KISQQMDGVHLLMNNNVIGSFVKSPFLNYIPTDKIFGKFIEILLPILQLFASLCCYCNNT
SKNNGNINNNNNVGGTVLIGSDRNEIYQELFDFLSNHSDLFIIILSDQSSFSHPTLSSLK
VLKLTCFLFSKVSSLFFKKSTTTSSSTSTTSSHNRTQFNRFHYCLINLLVKYSVNSKQII
ELVKPENIDEELLTEKIDFSYLPKSSIENQFKNIPDDINIGGVNIGLTSKNSNNNNNNNN
NNNGSINGKKSKRKNQFQILIKETITSIIHDLLLYCRKVSIVQDSNFGFVCFNSNLNIYQ
QFQSFSSLRSTNRNNSNNNNINNNNNNNSNNNYNNNSMNSDMDNDDDNIINNNSYKFNNK
NNNNNNDNNNQNKNSIFGGFGVNNSIINGNNNNNNGNNNNNNGNNGVNILPSIDLAINIL
VDNILQYSFYKVDLSQCFKLLQSYDQLTNYQYQEILQTGEDYPAFGPTQRNHMVENILKE
KIIDIETQISIIHENIEILLLLIVSHSFYFCNSLYLLFQNSNNNFYSSAIGGTISPTLAS
SAYYPTTQQQQQQQQQGGSNLKITDLNASTTTSNIKKNNESAFLSSKTNQNSGGMLSSVF
SYFKGQQNNTPSAQVSQIPINSTPYSTNYATPHQHQQLLQQQQQRQQQIQQQINQTPSNE
LSPQEIEVFLKRLKQSIFEREVNQLGGKLSDVILNQIDKKSTLIDLLLKKLQDLTK
NT seq 5751 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt
atggaatttataaattcatttaatttagtaatgtcaaatatatttgataatcataataat
agttcaattgaattttggagaatttgtgaacaaattaattattttcaaaatctttggttt
agaattcatgatgatttaatcatttcatcatttaaattaatggggtcattagctagatgt
aatacaaatgaagttttcaatttctttgctcaaggtagtgcgcaatttacatgggcaaaa
ttattccaaaatttttcatcctatgctcatgctttaaatagtattgaatttagtcaatca
attcaatcgaatcaaatgaattcatcaacgactacaactcaacaaatttcatcaactcca
caacaacaccaacaacatcagcagcaacaacaacaacaacaaggttataataaccaacaa
ataccaaatacaccatatcaacaattccaaccaacaatgcaataccaaggacaacaatcg
tcaatgcaacaaagtgtaggacaacaacaacaacctcaacaacaacctcaacaacaaaat
acaccaaatacaccaaattcaacaacaagttcaaatacagcaaatacaacatcacctgta
aagattacacaattattattatcagagaaagatagtgatgcactttcaagtattttccaa
ttgatttcaagattggttgaatcttcaatggcagttggaaatgtatttttaaagattgga
ccattgatttcattagcatttcaatttgcagtatcacaagttgattcaaaattaaaatct
agtgcattatcagtgattacatcatattctcaatatccaatttatgtagctgatatttgg
agattaataaatgaaaccaatctattcaatagtggtcttagtgcaattggtgggctaaat
gaattatctttcactcaacaatcattagagttgttattacaattgattcaacaatcatca
ttcctattcgataagagtaatcattatcaagaatctttgaaactcaaatcctatttagat
agttgtatggatttattcaatttattaaatataaaatcatttaatactttggatgaaaaa
tggaaatttgctttaactttgatgaaaatatttgaattctcaatcattcaattcaatcaa
tcaattcaaaattttcaaattgataaacaacatccatgttatcaattatatattgaatta
aatcgttcttctttatctagtaatttgtatcaacaacaacaacaacagcaaaataaatat
caacagcaacaacaacaacaacaacaaagtaaaaaaacaacattagagaatattataaag
ataattgattattcaaatgatcaatcaatattaattcaacaacaaattcaacaacaacag
caacaacaacaacaaggttataatcaagattcatcaagagtaattttaaatttagtattc
caacaattacaacaacaagataatgatgattttaatttattagtattgaaatgtttagat
ttgttattgttaatctctgataatacagtttacgatattgaaaatgcaaagagtttagtt
gttaatttatcaaatatggattatagcagaccaattgtgtcaattgccaaattgattgac
catgaattaccagctatttcattacgtgcaattagattaatctatagtttcgaatgttat
actcatcaaatttcaacggttttcttggatagtgatccaaatttaatactttccaagttt
ataaagatgatggaattcaatgaatccaatttcgaggatttctctggtacaaactatgat
caaaccatttcattcattagatatgcaagtaattccgtacaatggacaatagctcaattg
attatgttatgtctttcaaatattagtagtggaagatatacattggctcatttcctattg
ggttgttcatcaaatttagatctttcaaaggatttcataccaaatagtaaatcatgttta
actttgatcataaagaatgttatgaattcacaattcgtagagagatatccacatttggtc
gattgttatcatgaaatcatttggaaaatgtcaagtgatccaatcacttggaaaccaatg
atcaaatatattcaagaggaatttccaaactattatcatgatagtttattaatattaaga
aatgcaattacaatcaatggttcatcagagagaagaactgaagcattgatctcttcaatg
tcatgggttttcaagacttgttccatttcaattcaaaattcttattcaatcgaaatgaaa
caattcttaactcgtttaatctttccatcattgatgaacttaaatcaaccttcaatgaat
ggtggtattggtggtcttaatggtacaattaataatggtttaatcatgggtatttcacca
attaatatcttatcactctataatacaattgaatttcaattacctgaaattaatagacca
agaatattttcaatgtatccaaatttaattgaatattttacaacaaatattaatattaat
aatttaaattcaaataataataataataataataataacaataataataataacaataat
aacaataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataatattactaatggtggtacaagtcaattattagatattattaaaattaga
gaggttttaaagaatgattttaatagattttcaaatgaatttgaaattgaaagagaatta
gaagaatgttgtttaattaattcaagtattcaattatataatagtaaattaaaagcatta
gatggttggaaatcatttattaatatttctttagctcaaaatacaattgaaattgataca
ttggatgaatcattattattatcattattacaaagaatagttattgatttctcaaatgaa
cgtaatccaattgaatcaacattatcaattggttatacaattttaaccattttattcaca
ttgaaattgaaaaaagatagttatcaattatttatcaattcttcactcactaccaatagc
acagattcaaatgtaattgaacaaaagatgaaatcaatctttgaaggattattacaaact
gttttaaaatcaccacatcaagcaataagaggtattagttatacttgtttaattcaatat
ttggatttatcagctacaactccaacaactccatcattatcacctttatcaacctcaatt
aataatgtcgttgaaatgaataataaaagtaaaaataaaaataatcaagataaagaacaa
ggatatggtaatttaaatattggtttaatcattagtaaaattgaagataaatttattaga
atcttatcgagtgattgtaattcatttagtagaggttggagaattaccgctataagttgt
atgcaaagtattttatcaattgacaatctttgtggacatagatcattaatgtttttacaa
aacaaaggattcatcatcaatatgatcaatgatacttgttcaaaatatttatcagataat
tgggaaaacattgatccaaaggatttacatgtctataaatcacaaatgtccttactctta
aagatttctcaacaaatggatggtgttcacctcttaatgaataataatgtaattggtagt
tttgttaaatcaccatttttaaattatattccaaccgataaaatctttggtaaatttata
gagatacttttaccaattttacaattattcgcttcattatgttgttattgtaataatact
tcaaagaataatggtaatattaataataataacaatgttggtggtacagttttaattggt
agtgatagaaatgaaatttatcaagaattatttgatttcctttcaaatcattcagattta
ttcatcattattttatcagatcaaagtagttttagtcatccaactttatcaagcttaaaa
gttttaaaattaacttgtttcttattttcaaaagtttcaagtttattctttaaaaaatca
actaccacctcttcttcaacttcaactacaagtagccataatagaacacaatttaataga
ttccattattgtttaattaatttattagttaaatattcagtaaattcaaaacaaatcatt
gaattggttaaacctgaaaatattgatgaagaattattaaccgagaaaattgattttagt
tatttaccaaagagttcaattgaaaatcaatttaagaatattcctgatgatattaatatt
ggtggtgttaatattggtttaacaagtaaaaactcaaataataataacaataataataat
aataataatggtagcatcaatggtaagaaatcaaagagaaagaatcaattccaaatttta
attaaagaaactatcacttcaatcattcatgatttattattatattgcagaaaagtttca
attgttcaagattcaaattttggtttcgtttgttttaattcaaatttaaatatttatcaa
caattccaatcattttcaagtttaagatcaactaatcgtaataatagtaataataataat
attaataataacaataataataatagcaacaataattataataataatagtatgaatagt
gatatggataatgatgatgataatataattaataataatagttataaatttaataataaa
aataataataataataatgataataataatcaaaataagaatagtatatttggtggcttt
ggagtgaataatagtattatcaatggaaataataataataataatggtaataataataat
aataatggaaataatggagttaatattttaccatcaattgatttagctattaatatattg
gttgataatattcttcaatattcattctataaggtggatttaagtcaatgtttcaaatta
ttacaatcctatgatcaattaaccaactatcaatatcaagagatcttacaaactggtgaa
gattatcctgcatttggcccaactcaaagaaatcatatggttgaaaatattttgaaagag
aaaatcattgatattgaaactcaaatctctatcatccatgaaaatattgaaatcctattg
ttattgattgtttctcattctttctacttttgtaattctttatatttgttattccaaaat
tcaaataataatttctatagtagtgcaattggaggcaccataagtccaactttagctagt
agtgcttattatccaacaacacaacaacaacaacaacaacaacaacaaggtggttcaaat
ttaaagattacagatttaaatgcttcaacaactacctcaaacattaaaaagaataatgaa
tcagcatttttatcttcaaaaacaaatcaaaatagtggtggtatgttatcatcagttttc
tcttactttaaaggtcaacaaaataatacaccatcagctcaggtatcacaaattccaata
aattcaacaccttattcaacaaattatgcaactccacatcaacatcaacaacttttacaa
caacaacaacaaagacaacaacaaattcaacaacaaattaatcaaacaccatcaaatgaa
ttatctccacaagagattgaagtattccttaaacgtttaaaacaatccatttttgaacgt
gaagttaatcaattaggtggtaaattatctgacgtcattttaaaccaaatcgataaaaaa
tcaactctcattgatttattattgaaaaaattacaagatttaacaaaataa

DBGET integrated database retrieval system