KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0280971
Entry
DDB_G0280971      CDS       T00245                                 
Symbol
lvsC
Name
(RefSeq) BEACH domain-containing protein
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Motif
Pfam: Beach DUF4704 NBCH_WD40 Neurobeachin PH_BEACH Laminin_G_3 WD40 DUF4800 DUF1088
Other DBs
NCBI-GeneID: 8622975
NCBI-ProteinID: XP_640913
dictyBase: DDB_G0280971
UniProt: Q54U63
Position
3:4286715..4294937
AA seq 2491 aa
MLDGIRQIIKNNPKKQNLFKKFRVFIKIVNLVNADDKKERLSVLCHSVLRTVILLMANNP
KIKKHFRNHIGYDTIKDLIIKSEGIVSETTMNILFDMIVDGEFDIEYKYVIQNPDSCLLI
FNLLKYFPTKLQHEILDRFTVMVEKCTTNQSVCCNCHLIYNLLEAIYKGQPMEVTTKILK
LIERLGIHSVTVRELKKLFGLLKSEQGDYLPPTTSALLTTLQNISNSRNPGPQVYFDFDG
KDSCIILPTFDKWPFPKGFSFCTWVRIESFVDPTGTPEYKPRLFSFLSDSGCGIEVLFIY
QQLQVLTVNNHQSKAVFQSPPTFVEREWYFVSVVYSINLISSNEIRIYINGQQSAKSSIK
LNISGTLWNHFKIGNNSKKMSGERECPLYGQMGAFNIFDESLSPSQIQAIYTLGPNFNTS
FQDVEGSTKSAHTFESSLTSHLFLNYNCRALDGDLCLDNTPDIGGDKNYDATLVSINPCV
SRDIKDIIYCLGGIKVLFPLIQQINNPISPLSLELITNENNNNNNNNLSLSSQQQTLEQL
QQSINIKLTNQVLALFKFMLKESEANQEEMLRCQGFSVMGYLLQQISPEYLTIGCTNIFI
DMSNQISDPTLVEEVYSNLMLNFCIWIKTKYELQRNLLVIIKQIVFEKYDQVSDIITVQL
ILDIMNDFYWYDDSKNEAHRNHHFFNKDILSKRPSISNIRELRQILFEVLRILLRHQKST
DIQAIIKFLIYCKDYQQLIEMMEFVLGLNGNGHNCQQFFDEIMGLGGTDVFLTLLKIDDE
GVRNTAIQLISKIHGLCNHSQNKKHKANLFQDSIIITRCLHTFPMTEETFRYLLSFAMGY
DFTPANSTSHNNGQMVPPCLDKHKVIKNNEILSVIFKLLSNTDVILVQTVLQEIKLYISN
EESSHVNRNACLSIDKWFDHLFAIISSVEKTDTQYSNVTDLIIDIIKILVIHSFDESKGI
QKTLEIVLATLRPYDERGVLDYHSLARTLFLNIVQSIKSKALTTIGDNQSPLKKSKKAFI
ENLIQFFILTEEFIFYSPKGGNHDLHSSLSSIRTSILGGGGGFNEFGIGSSTIVTSSAHS
ASSSVHSSFDGSFSPSSPQLLSSSTSSTSQLQQQQQLQQLQQLQQQGQSKSGSNTPSNSN
HGSYNYNNNNSPNLISSSNSLLNSPSSIGQSLSSSFSLSSSSKEVNIGGGGGIGGFSKLH
YNSETKEWEDTLLVKEILDLVDTLKLLDNLSESDFSTSNIQATTSKSTSNLMFTTHYHRI
FLRFTLEAIKICNKQEPLQTLMSHVMRLKTLSEKDRQKVENDTMSNNRLTFILSHLAKAL
RSIIDLNLPLHQKALVPLMKDIIRKLNSTLISTLSKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQI
HQHQSVSGPLNLYQLSLPQSALSQSQQFIIQQTQQILNGVGVGAGNSSPSSSSSSSSNSV
NIDQSEISGWVEELTDSSRIVEFCSIVVTSPRWSQIVQYIDNQTYFTTVEEKSLYSWLEK
RKKKLTKVVLNTDEKEAESFNAAERKADNDLNSIHVKLWMPECERRALHLYKARELRNQT
TVQWRKILRSLTNERGPWGTTESIVHWKLDKTENSSRMRIKLKRNYKFDEHLNCAINDSE
IQDDHNNSNSNNNNDSNNSDGEHLSESANLLSIKPNEKQQQQQQSDEVDSDWTMVPKDID
SEENIDSLIQQQQQQQHQQQKEKEKLIYSTSCHWITPSSCKKGKLEITTFNLIFTEEEEL
PPPSTTTTNTTNTTNTNSTTNDSTFLKIKRWPNEMIKDVHLRRYLLRGSAIEIFMRDKTN
YLFNFKKNERNKVYNKINSVKREFSKEPTLSPSDMLKKATSEWQARRISNFDYLMTLNTI
AGRTYNDLTQYPVFPWVIADYTSPVLDLNKAETFRDLSKPIGALNEKRLEIFKDRYESFD
DPVIPKFYYGSHYSSAGIVLFYLIRLEPFTTQFLNLQGGRFDHPDRMFDSIALAWDNSLT
SSTDVKELIPEFYYMPEFLTNHNHINFGIKQNGIGIEDVLLPPWASSPSDFIRINREALE
SDYVSSHLHEWIDLIFGIKQRGKQAKEVFNVFYYLTYEGSVDIDSIEDETTRRATESQIN
NFGQTPTQLFSKKHHIQRDPLNESHISILKTPPNQLQAYFLKITNKNPIVYVYIPEPNPI
MSYLVADKVTVIDKSRTTTNHKWFPSTPNDKISPFTFELDPSSTTKRRIGLPFANDVTIS
PNCFAITSDGRYVISCAHWDNSFKLSFVDSAKLIQSVVKHKDTVTCLSLASDGQTLITGS
KDTTVMVWRIATTNKSGAPKFNDVPDHILYGHDDEITCVDVNVGLDISISGSKDGTCIIH
NLKHGEYVRSIYLPRQSPISLIAISNQGYIVIYSQADLMIYLYSINGGLLKTVDTHERLH
SIIISKDSEYLITGGERGVVVIRTLFNLKPTNHKLVFGTPIHSLAMASDQKHLMVGLEDG
RLLIIASNSASPPTNYYSITKFLIFITFIIQ
NT seq 7476 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttggatggtattagacaaattattaaaaacaatccaaagaaacaaaatctatttaaa
aagtttcgtgttttcattaaaatcgttaacttggttaatgctgatgataaaaaagaacgt
ttgtcagttttatgtcattcagtattacgtactgtaattttattaatggcaaataatcca
aaaattaaaaaacattttcgtaatcatattggttatgatacaattaaagatttaattatt
aaatctgaaggtattgtttctgaaacaacaatgaatattttatttgatatgattgttgat
ggtgaatttgatattgaatataaatatgttattcaaaatccagattcatgtttattaata
tttaatttattaaaatatttcccaactaaattacaacatgaaatattggatagatttaca
gtgatggtagagaaatgtacaactaatcaatcagtttgttgtaattgtcatttaatttat
aatttattagaggcaatttataagggtcaaccaatggaagttacaacaaagatattgaaa
ttaattgaaagattaggtattcatagtgttacagttagagaattaaagaaattatttggt
ttattaaagagtgaacaaggtgattatcttcctccaacaacatcggctctattgacaaca
ttacaaaatatatcaaattcacgtaatccaggaccacaggtttatttcgatttcgatgga
aaagatagttgtatcatattgccaacatttgataaatggccatttccaaagggtttttca
ttttgtacttgggttagaattgaatcatttgttgatccaaccggtacaccagagtataaa
ccaagattatttagtttcctctctgatagtggttgtggtattgaggtgttgttcatttat
caacaacttcaagtattgacagtgaataatcaccaaagtaaagccgtatttcaatcacca
cctacctttgtcgaaagggaatggtatttcgtatcggtggtttattcaattaatttaatc
tcttctaatgagattagaatttatattaatggtcaacagtcagcgaaatcatccattaaa
ttgaatatatcaggtacactttggaatcatttcaaaattggtaataatagtaagaaaatg
tctggtgaacgtgaatgtccactctatggtcaaatgggtgctttcaacattttcgatgaa
tcattatcaccaagtcaaattcaagcaatctatacattgggtccaaattttaatacctct
tttcaagatgttgaaggttcaactaaatctgctcacacttttgaatcttcacttactagt
catctctttttaaattataattgtcgtgcattagatggtgatctttgtttagataataca
cccgatattggtggtgataaaaattatgatgcaactttagtctcaattaatccatgtgta
tcaagagatattaaagatattatctattgtttaggtggcattaaagtattatttccatta
attcaacaaattaataatccaatatcacctttatctttagaattaattacaaatgaaaat
aataataataataataataatttatcattgtcatcacaacaacaaacattagaacaatta
caacaatctataaatattaaattaacaaatcaagttttagcattatttaaatttatgtta
aaagagagtgaagcaaatcaagaggaaatgttacgttgtcaaggtttctctgttatgggt
tatttattacaacaaatttcaccagaatatctaacgattggatgtacaaatatctttatt
gatatgtcaaatcaaatttctgatccaacattggttgaagaggtgtatagtaatttaatg
ttaaatttctgtatttggattaaaactaaatatgaattacaaagaaatctattggtaatc
attaaacaaatcgtttttgaaaagtatgatcaagtctctgatatcattacagttcaattg
atattagatataatgaatgatttctattggtatgatgattcaaagaatgaagcacatcgt
aatcatcatttctttaataaagatatcttatcgaaacgtccttcaatttcaaatattcga
gaattacgtcaaatcctatttgaagttttacgtattctattacgtcatcaaaaatcaaca
gatattcaagctatcattaaatttttaatttattgtaaagattatcaacaattaattgaa
atgatggaatttgtattaggtttaaatggtaatggtcataattgtcaacaattttttgat
gaaattatgggattaggtggtacagatgtatttttaacattattaaagattgatgatgaa
ggtgttagaaatactgctattcaattgattagtaaaattcatggattatgtaatcattct
caaaataaaaaacataaagcaaatttatttcaagattcaattattattactcgttgttta
catacattcccaatgacagaggaaacttttagatatttattatcgtttgctatgggttac
gattttacacctgcaaatagcaccagtcacaataatggtcaaatggtaccaccatgttta
gataaacataaagtcataaagaataatgagatcctatcggttatattcaaactactatca
aatactgatgttatattggttcaaacggttttacaagagattaaactctacatatccaat
gaagaatcatcacatgtcaatagaaatgcatgtctatcaattgataaatggttcgatcat
ttattcgcaatcattagtagtgtagagaaaaccgatactcaatattcaaatgtaacggat
ttaatcattgatatcataaagattttggtaattcattcattcgatgaatcaaaaggtatt
caaaaaacattggaaatcgtattggcaactcttagaccttatgatgaacgtggtgtatta
gattatcattcattggctcgtactttatttttaaatatcgttcaatccattaaatctaaa
gctctaactaccattggtgataatcaatcaccattaaagaaatcaaagaaagcttttatt
gaaaatttaattcaattctttattttaactgaagaatttatattttattctccaaaaggt
ggtaatcatgatttacattcaagtttatcatcaattagaacttcaattttaggtggtggc
ggtggtttcaatgaatttggtattggtagtagtactatagttacttcatcagctcattca
gcatcatcttcagttcatagtagttttgatggtagtttctctccatcttcaccacaatta
ttatcatcatcaacttcatcaacatcacaattacaacaacaacaacaacttcaacaactt
caacaacttcaacaacaaggtcaatcaaagagtggatcaaatacaccttcaaatagtaat
catggtagttataattataataataataattcaccaaatttaatatcatcttcaaattct
ttattaaattcaccatcatcaattggtcaatcattatcttcatcatttagtttatcatca
tcatcaaaagaagttaatattggtggtggtgggggtattggtggttttagtaaattacat
tataatagtgaaactaaagaatgggaagatacattattagttaaagagatacttgatcta
gttgatacattaaagctattggataatttaagtgaaagtgatttttcaacttcaaatatt
caagcaacaacatcaaaatcaacatcaaatttaatgtttacaactcattatcatagaatt
ttcctaagatttacattggaagcaattaaaatttgtaataaacaagaacctttacaaact
ttgatgtctcatgttatgagattgaaaacactctctgaaaaagatcgtcaaaaagtagaa
aatgatacaatgagtaataatagattaacttttattttatctcatttagctaaagcatta
agatcaatcattgatttaaatttaccattacatcaaaaagcattagtaccattaatgaaa
gatatcattcgtaaattaaattcaacattaattagtacattatcaaaacagcagcaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaaatt
catcaacatcaatctgtatcaggtcctttaaatctttaccaattatcattaccccaatca
gcattgtcgcaatctcaacaatttataattcaacaaactcaacaaattttaaatggtgtt
ggagttggtgcaggaaattcatcaccatcgtcatcatcatcatcatcatcaaactctgta
aacattgatcaaagtgaaatatcaggatgggttgaagaattaactgactcaagtagaatt
gtcgaattttgttcaattgttgttacatcaccaagatggtcacaaatcgttcaatatatt
gataatcaaacttattttacaacagttgaagagaaatcactttattcttggttagagaag
agaaagaagaaattaacaaaggttgtattgaatactgatgaaaaagaagcagaatcattc
aatgccgcagagagaaaagctgataatgatttgaattcaattcatgttaaactttggatg
ccagaatgtgaaagacgtgcattacatctttataaagcaagagaattacgtaatcaaacc
actgttcaatggagaaagattttaagatctctaactaatgaacgtggtccttggggtaca
actgaatcaatcgttcattggaaattagataaaactgaaaactcttcaagaatgagaatt
aaattaaaaagaaattataaatttgatgaacatttaaattgtgcaattaatgattcagaa
attcaagatgatcataataatagtaatagtaataataataatgattcaaataattctgat
ggtgaacatttatcagaaagtgcaaatttactctcaattaaaccaaatgaaaaacaacaa
caacaacaacaaagtgatgaagtcgattctgattggacaatggtaccaaaggatattgat
agtgaagaaaatattgatagtttaattcaacaacaacaacaacagcaacatcaacaacaa
aaagaaaaagaaaaattaatttattcaacaagttgtcattggattacaccatcaagttgt
aaaaaaggtaaattagaaattacaacttttaatttaatttttactgaagaagaggaatta
ccaccaccatcaactaccactacaaatacaacaaatacaacaaatacaaattcaacaaca
aatgattcaacatttttaaaaattaaaagatggccaaatgaaatgattaaagatgttcat
ttaagacgttatttattaagaggtagtgcaattgaaatatttatgcgtgataaaacaaat
tatttatttaatttcaaaaagaatgaaagaaataaagtttataataagatcaatagtgta
aagagagagttttcaaaggaaccaacattatcaccatccgatatgttaaagaaagcaaca
tcagaatggcaagctagaagaatatcaaactttgattatctaatgacattgaatacaata
gcaggtagaacctataatgatctaacacaatatccagtattcccttgggtgattgcagat
tatacatcaccagtgttggatttaaataaagcagaaactttcagagatttatcaaaacca
attggtgcattaaatgaaaagagattggaaatctttaaagatcgttatgaatcattcgat
gatccagtgattccgaaattctattatggcagtcattatagtagtgctggtattgtattg
ttttatttaattcgtttggaaccattcacaactcagttccttaatcttcaaggtggaaga
ttcgatcatcccgatcgtatgtttgacagtatagcattggcatgggataattcattgacc
tcttcaaccgatgtcaaagagttaatacccgagttttactatatgccagagtttttaaca
aatcataatcatatcaattttggtattaaacaaaatggtattggcattgaagatgttctt
ttaccaccatgggcttcatcaccatcggatttcattcgtatcaatagagaggcattggag
agtgattacgtttcaagtcatcttcatgaatggatcgatttaatatttggtattaagcaa
cgtggtaaacaagccaaggaggtattcaatgttttctattatctaacttatgaaggttct
gttgatatcgattccattgaggatgaaacaactcgtcgtgcaactgaaagtcaaatcaat
aatttcggtcaaacaccaactcaactcttttcaaagaaacatcatattcaacgtgatcct
ttgaacgaatctcatatctcaattttgaaaactcctccaaatcaattacaagcttacttt
ttaaagattaccaataagaatccaatcgtttacgtttacattccagagccaaatccaatc
atgtcctatttggttgctgataaagttacggtcattgataaatctagaaccactaccaat
cataaatggttcccttccactccaaatgataagatctcaccattcacttttgaattggat
ccatcttcaaccactaaacgtagaattggtttaccatttgcaaatgatgtaacaatctct
ccaaattgttttgctatcacctctgatggtagatatgttattagttgtgctcattgggat
aatagtttcaaactatcatttgttgatagtgcaaaattaattcaaagtgttgtaaaacat
aaagatactgtcacttgtttatctttggcttctgatggtcaaactttaatcactggttca
aaagatacaaccgtaatggtttggagaattgcaacaaccaataaaagtggtgctccaaaa
ttcaatgatgtacctgatcatattctttatggtcatgatgatgaaatcacctgtgtagat
gtaaatgttggtttagatatctctatctctggttcaaaagatggtacttgtatcattcac
aacttaaaacatggtgaatatgttagatcaatttatttaccaagacaatctccaattagt
ttaattgcaatttcaaatcaaggttatattgtaatttattcacaagccgatttaatgatt
tatctatacagtataaatggtggactcttgaaaacagttgatacacacgaaagattacat
agtattataataagtaaagattcagagtatttaattactggtggcgaaagaggggttgtt
gttattagaacacttttcaatttaaaaccaactaatcataaattagtgtttggaactcca
attcattctttagccatggcatccgatcaaaaacatttaatggttggtttagaagatggt
agattattaattattgcatctaatagtgcatctcctccaacaaattattattccattacc
aaattcctcatcttcattaccttcatcatccaataa

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (157)   
   RefGene (153)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (3)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (9)   
   Pfam (9)   
All databases (171)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system