KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0287497
Entry
DDB_G0287497      CDS       T00245                                 
Symbol
nup133
Name
(RefSeq) nucleoporin 133
  KO
K14300  nuclear pore complex protein Nup133
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi03013  Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03013 Nucleocytoplasmic transport
    DDB_G0287497 (nup133)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:ddi03019]
    DDB_G0287497 (nup133)
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:ddi03036]
    DDB_G0287497 (nup133)
Messenger RNA biogenesis [BR:ddi03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Nuclear pore complex
     DDB_G0287497 (nup133)
Chromosome and associated proteins [BR:ddi03036]
 Eukaryotic type
  Centrosome formation proteins
   Spindle formation proteins
    DDB_G0287497 (nup133)
SSDB
Motif
Pfam: Nucleoporin_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 8626153
NCBI-ProteinID: XP_637195
dictyBase: DDB_G0287497
UniProt: Q54KA3
Position
5:329850..333647
AA seq 1206 aa
MYYSSSKPIKKKPNTGISEFNPTQSQIQQQSCNYKITPTYDLPFILTQAINDENQQHQIE
QDLTGSLSSRDGTCFIIYSNELFIWTIDKPQYCDRIELPIKQNITRQHIVVYKNKSSSER
FSVFLCSPLTGYIRFWGNSSKPNVSQDLPLENPGNNNNFKIFITECQPFGVIVGNSLGSI
YLVSVKNNNNLISKKINKSQGMLSYLYLSRQSPVISVFSSPINQQQLQNNNNSHHHHHHH
STTLSSNNFSTIPSRFIYILTEGSLLKYEIENGTERIILDFPIQKEITKLFSNFPKFHQM
NIDTIIDQNKDEIQIVNFILYETSASQNLVKYYILQIEIQDDQVLRIKRLDSFSANKKLG
GGVTSIEPILQTNSLKYYLTWFDNIYYYSNGGGGGGGVNGIISGSISFQSDIAFSGFYKN
QFYFFSEQGINKLDIQPFGSGQLASSELHIQDTIKNIESDIYMDTDNTTSVTGTPATTAS
ATISTTPTIVSPILFDIPKDENLIGSKRNNVLKLMNSFSLKQHTRVDQFVKICKGYNDFD
QVIQQVSLWIIDQQPNSKFWAEDGKLLHMFVKEISVQLNQQLEDKKKRHNFLLTCIKDTD
LDKLLTTQTKEILKKNEIKIKCAIELRNYQNQQEQSRKSLNYTTTTTTIMKGASSSSSIF
SQLIESLVAERNPNWTNIGMNVFELFYSNVSGIDQILINITSKLQELLQNQPQQQQLLTS
ANKAQILLENCELFYLISSSFPVEYLNSPIIQSTSISIHNLFPKVIQSILNFIQLEFPNQ
VAGLLGGGGIGGLGNGHSSSSSTILFKKDLGIPNVDKQLYDHLYKLTEKYLYSLKINQFE
QFNQFKTKLIEPFVECFKFQEAITLANQFDDFFTLINVYCYQQHQLQNSTITIATTITPA
DNNKLLIDCLNKFEKIGQLSKVYEYMLERDLKSELLQLPSDFNDSLFRFLQSNSELSWIH
SIRMKNWTNVSNTLYQKSISNQHHQQQQQQQQHQVMTLKEKQKLLSLSKVSLMVSTATSS
SSSSSSLELQLQPSQQIQLDVINQNLSLIKSQKFFLPDLKNVLSVSEVVQLILQREIGDE
DPMVNFVSCIEIISESPLLLKKEEVKELLKLILELSIVNETVFFEKSISDIQLSYSLKET
KFYNLISHPHFPKEIALVLLSPIIEDFYKTHINSNKFSSLDDKRQFEISVARLLELSKLE
IGQKQI
NT seq 3621 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtattattcatcatctaaaccaattaaaaagaaaccaaatacaggtataagtgaattt
aatccaactcaatcacaaattcaacaacaatcttgtaattacaagataacaccaacttat
gatctaccattcatattaacacaagcaataaatgatgagaatcaacaacatcaaatagaa
caagatttaactggttctttatcatctcgtgatggtacttgttttatcatttattcaaat
gaattatttatttggacaattgataaaccacaatattgtgatagaattgaattaccaatt
aaacaaaatataacaagacaacatattgtagtttataaaaataaatcatcaagtgaaaga
ttttcagtctttttatgttcaccattgactggttatattagattttggggaaacagttca
aaaccaaatgtatctcaagatttaccattggaaaatccaggtaataataataactttaaa
atattcatcactgaatgtcaaccatttggtgtcatcgttggtaattctttaggttcaatc
tatttagttagtgtaaagaataataataatttaatctctaaaaagattaataaatcacaa
ggaatgttaagttatctttatttatcaagacaatcacctgtaatctctgtattctcttca
ccaattaatcaacaacaattacaaaataataataatagtcatcaccaccaccaccatcat
tcaaccacactttcatcaaataatttttcaaccattccaagtagatttatttatatttta
acagagggttcattattaaaatatgaaattgagaatggtacagagagaattattttagat
tttccaattcaaaaagaaattacaaaacttttttcaaattttccaaaatttcatcaaatg
aatatagacacaatcattgatcaaaataaagatgaaatacaaattgtaaactttatatta
tatgaaacttctgcttctcaaaatttagttaaatattatatattacaaattgaaattcaa
gatgatcaagttttaagaataaaaagattagatagtttttctgcaaataaaaaattaggt
ggtggtgttacttcaattgaaccaattttacaaacaaattcattaaaatattatttaaca
tggtttgataatatttattattattcaaatggtggtggtggtggtggtggtgttaatggt
attatatcaggttcaatttcatttcaaagtgatatagcatttagtggtttctataagaat
caattttatttcttttctgaacaaggtattaataaattagatattcaaccatttggtagt
ggtcagttggcaagttcagaattacatattcaagatacaattaaaaatattgaatctgat
atttatatggatacagataatacaacatcagtaacaggtacaccagcaacaacagcatca
gcaacaatatcaacaacaccaactattgtatcaccaattttatttgatataccaaaagat
gagaatttaattggtagtaaaagaaataatgtattaaagttaatgaattcattttcattg
aaacaacatacaagagttgatcaatttgtaaagatttgtaaaggttataatgatttcgat
caagtgattcaacaagtttcactttggattattgatcaacaaccaaatagtaagttttgg
gctgaagatggtaaattgttacatatgtttgttaaagagatctctgtacaattgaatcaa
caattagaggataaaaagaaacgtcataactttttattgacttgtattaaagatactgat
ttggataaactcttgacaactcaaacaaaggaaatcttaaaaaagaatgaaattaaaatt
aaatgtgctattgaattaagaaattaccaaaatcaacaagaacaatctagaaaatcttta
aattataccaccaccaccaccaccattatgaaaggagcatcatcatcatcatcaatattc
tcacaattaattgaatcattagtggctgaacgtaatccaaattggacaaatattggtatg
aatgtttttgaattattttatagtaatgtttctggtattgatcaaattttaattaatata
acaagtaaattacaagaattattacaaaatcaacctcaacaacaacaactattaacatca
gcaaataaagctcaaattttattagaaaattgtgaattattttatttaatttcttcaagt
ttcccagttgaatatttaaattcaccaattattcaaagtacatcaatttcaattcataat
ttgtttccaaaagttattcaatctatattaaatttcattcaattggaatttccaaatcaa
gttgcaggtttacttggtggtggtggtattggtggtttaggtaatggtcattcatcttca
agttcaacgatattatttaaaaaggatttaggtattccaaatgttgataaacaactctat
gatcatctttataaattaacagagaaatatttatattctttaaagattaatcaatttgaa
caattcaatcaatttaaaactaaattaattgaaccgtttgttgaatgttttaaatttcaa
gaagcaattacattggcaaatcaatttgatgatttctttactttaattaatgtttattgt
tatcaacaacatcaattacaaaattcaaccataactatcgccactaccattacgccagct
gataataataaacttttaattgattgtttaaataaatttgaaaagatcggtcaattatca
aaagtttatgaatacatgttagaaagagatttaaagagtgaattacttcaattaccttca
gattttaatgatagtttatttagattcttacaatcaaattctgaattatcttggatacac
tcaattagaatgaaaaattggacaaatgtttcaaatacattatatcaaaaatcaatttca
aatcaacatcatcaacaacaacaacaacaacaacaacatcaagttatgacattaaaagaa
aaacaaaaattattaagtttatcaaaagtttctttaatggtatctactgcaacttcttca
tcatcatcatcttcttcattagaattacaattacaaccatcacaacaaattcaattagat
gttattaatcagaatttatcattaattaaatcacaaaaattctttttaccagatttaaag
aatgttttatcagtgtcagaggttgttcaattaatattacaaagagaaattggtgatgaa
gatccaatggttaattttgttagttgcattgaaatcatctctgaatcaccattattatta
aagaaagaagaagttaaggaattgttgaaattgattttagaattatctattgttaatgaa
actgttttctttgagaaatcaatctctgatattcaattaagttatagtttaaaggaaact
aaattctataatttaatatctcatccacatttcccaaaagaaatcgcattggtactatta
tcaccaatcattgaagatttttataaaactcatattaactctaataaattctcaagttta
gatgataaaagacaatttgaaatctcggttgctagattattggaattatcgaaattggaa
attggtcaaaaacaaatttaa

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (46)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (41)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (55)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system