KEGG   ENZYME: 1.1.1.261Help
Entry
EC 1.1.1.261                Enzyme                                 

Name
sn-glycerol-1-phosphate dehydrogenase;
glycerol-1-phosphate dehydrogenase [NAD(P)+];
sn-glycerol-1-phosphate:NAD+ oxidoreductase;
G-1-P dehydrogenase;
Gro1PDH;
AraM
Class
Oxidoreductases;
Acting on the CH-OH group of donors;
With NAD+ or NADP+ as acceptor
BRITE hierarchy
Sysname
sn-glycerol-1-phosphate:NAD(P)+ 2-oxidoreductase
Reaction(IUBMB)
sn-glycerol 1-phosphate + NAD(P)+ = glycerone phosphate + NAD(P)H + H+ [RN:R05679 R05680]
Reaction(KEGG)
Substrate
sn-glycerol 1-phosphate [CPD:C00623];
NAD+ [CPD:C00003];
NADP+ [CPD:C00006]
Product
glycerone phosphate [CPD:C00111];
NADH [CPD:C00004];
NADPH [CPD:C00005];
H+ [CPD:C00080]
Comment
This enzyme is found primarily as a Zn2+-dependent form in archaea but a Ni2+-dependent form has been found in Gram-positive bacteria [6]. The Zn2+-dependent metalloenzyme is responsible for the formation of archaea-specific sn-glycerol-1-phosphate, the first step in the biosynthesis of polar lipids in archaea. It is the enantiomer of sn-glycerol 3-phosphate, the form of glycerophosphate found in bacteria and eukaryotes. The other enzymes involved in the biosynthesis of polar lipids in archaea are EC 2.5.1.41 (phosphoglycerol geranylgeranyltransferase) and EC 2.5.1.42 (geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase), which together alkylate the hydroxy groups of glycerol 1-phosphate to give unsaturated archaetidic acid, which is acted upon by EC 2.7.7.67 (CDP-archaeol synthase) to form CDP-unsaturated archaeol. The final step in the pathway involves the addition of L-serine, with concomitant removal of CMP, leading to the production of unsaturated archaetidylserine [4]. Activity of the enzyme is stimulated by K+ [2].
History
EC 1.1.1.261 created 2000, modified 2009
Pathway
Glycerophospholipid metabolism
Orthology
K00096  
glycerol-1-phosphate dehydrogenase [NAD(P)+]
Genes
SSE: 
SVO: 
SVI_0105(egsA)
VAP: 
VPD: 
DVU: 
DVL: 
DVG: 
DGG: 
SCL: 
sce5394(gldA)
SCU: 
WOL: 
WRI: 
WEN: 
WED: 
WPI: 
AMA: 
AMF: 
AMF_838(egsA)
AMW: 
AMP: 
ACN: 
APH: 
APY: 
APD: 
APHA: 
ERU: 
ERW: 
ERG: 
ECN: 
ECH: 
ECH_1084(araM)
ECHA: 
EMR: 
EHH: 
NSE: 
NRI: 
NHM: 
SMD: 
RET: 
RLB: 
RDE: 
RLI: 
APC: 
BSU: 
BSU28760(araM)
BSR: 
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSS: 
BST: 
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSUB: 
BSX: 
C663_2721(egsA)
BSP: 
BLI: 
BLD: 
BLH: 
BAO: 
BAMF_2681(araM)
BAY: 
BAQ: 
BYA: 
BAMP: 
BAML: 
BAMA: 
RBAU_2719(araM)
BAMN: 
BASU_2525(araM)
BAMB: 
BAZ: 
BQL: 
LL3_02965(araM)
BXH: 
BQY: 
MUS_3151(araM)
BAMI: 
BAMC: 
BAMF: 
BAE: 
BHA: 
BCL: 
ABC0405(araM)
BSE: 
BCO: 
BJS: 
GTN: 
GYC: 
GYA: 
GCT: 
GGH: 
GJF: 
AFL: 
HHD: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPM_1663(araM)
PPOL: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PSAB: 
TCO: 
AAC: 
AAD: 
TC41_3261(araM)
SNE: 
CAC: 
CAE: 
CAY: 
CBK: 
CBT: 
CBE: 
CCE: 
CLS: 
CLB: 
CSR: 
CPAS: 
CSB: 
CLSA_c14810(egsA1) CLSA_c18080(egsA2)
CCL: 
CSS: 
Cst_c15320(egsA1) Cst_c16390(egsA2) Cst_c16420(egsA3)
CSD: 
CLE: 
RIX: 
RIM: 
COO: 
ROB: 
DAI: 
ERE: 
ERT: 
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ELM: 
AWO: 
BPRL: 
TIT: 
TMT: 
CHY: 
CSC: 
ATE: 
COB: 
CHD: 
COW: 
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CLC: 
TTM: 
TTO: 
TXY: 
TSH: 
CPO: 
MAS: 
HAS: 
HHL: 
MSA: 
SCO: 
SCO2598(SCC88.09c) SCO6754(SC6A5.03)
SMA: 
SAV_1659(gldA)
SGR: 
SCB: 
SSX: 
SVL: 
SCT: 
SCY: 
SFA: 
SBH: 
SHY: 
SHO: 
SVE: 
SDV: 
SALB: 
STRP: 
SFI: 
SCI: 
SRC: 
SALU: 
KSK: 
BCV: 
PAC: 
PAK: 
PAV: 
PAX: 
PAZ: 
PAW: 
PAZ_c15740(egsA1) PAZ_c24190(egsA2)
PAD: 
PCN: 
PACC: 
PACH: 
PFR: 
PPC: 
PBO: 
PRA: 
KFL: 
TFU: 
NDA: 
NAL: 
TCU: 
SRO: 
NML: 
TBI: 
STP: 
SAQ: 
MAU: 
MIL: 
VMA: 
AMS: 
ASE: 
ACPL_8272(gldA)
ACTN: 
L083_8085(gldA)
AFS: 
SNA: 
TPY: 
RRD: 
TAZ: 
SSM: 
STA: 
STQ: 
SBU: 
SCC: 
SGP: 
PLM: 
SACI: 
PGI: 
AFD: 
ASH: 
PSN: 
RRS: 
RCA: 
ATM: 
CAP: 
TMA: 
TMM: 
TMI: 
TPT: 
TLE: 
TRQ: 
TNA: 
TNP: 
TTA: 
PMO: 
DIN: 
DTH: 
DTU: 
MJA: 
MFE: 
MVU: 
MFS: 
MIF: 
MIG: 
MMP: 
MMP0225(gldA)
MMQ: 
MMX: 
MMZ: 
MMD: 
MAE: 
MVN: 
MVO: 
MOK: 
MAC: 
MA3686(egsA)
MBA: 
MMA: 
MM_0590(egsA)
MMAZ: 
MBU: 
Mbur_1032(egsA)
MMH: 
MEV: 
MZH: 
MPY: 
MHZ: 
MTP: 
Mthe_0219(egsA)
MCJ: 
MCON_1056(egsA)
MHI: 
MHU: 
Mhun_1136(egsA)
MLA: 
Mlab_1308(egsA)
MEM: 
MBG: 
MPI: 
MBN: 
Mboo_1960(egsA)
MFO: 
MPL: 
Mpal_0948(egsA)
MPD: 
MCP_0189(egsA)
MEZ: 
Mtc_0013(gldA)
RCI: 
RCIX1388(egsA)
MER: 
MTH: 
MTH610(egsA)
MMG: 
MST: 
Msp_0997(egsA)
MSI: 
MRU: 
mru_0955(egsA)
MEB: 
MEL: 
MEW: 
METH: 
MFV: 
MKA: 
MK1230(GldA)
MAX: 
AFU: 
AF1674(gldA)
AVE: 
AST: 
FPL: 
HAL: 
VNG0406C(egsA)
HSL: 
OE1602F(egsA)
HMA: 
rrnAC0175(egsA)
HHI: 
HAH_0925(gldA)
HHN: 
HWA: 
HQ1560A(egsA)
HWC: 
Hqrw_1664(gldA)
NPH: 
NP4492A(egsA)
NMO: 
Nmlp_3111(gldA)
HLA: 
Hlac_0655(egsA)
HUT: 
Huta_0604(egsA)
HTI: 
HMU: 
Hmuk_3139(egsA)
HTU: 
NMG: 
HVO: 
HME: 
HFX_0792(gldA)
HJE: 
HBO: 
HXA: 
NAT: 
NPE: 
NGE: 
HRU: 
NOU: 
SALI: 
TAC: 
Ta1158(egsA)
TVO: 
TVN1227(egsA)
PTO: 
PTO0850(egsA)
FAC: 
TAR: 
PHO: 
PH1475(egsA)
PAB: 
PAB1907(egsA)
PFU: 
PF1382(egsA)
PFI: 
PFC_06135(egsA)
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PYA: 
PYS: 
TKO: 
TK0789(egsA)
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TON_1047(egsA)
TGA: 
TGAM_1402(egsA)
TSI: 
TSIB_0726(egsA)
TBA: 
THE: 
GQS_10330(egsA)
THA: 
THM: 
TLT: 
OCC_04917(egsA)
THS: 
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ACF: 
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ACJ: 
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Smar_0939(egsA)
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DKAM_1289(egsA)
DMU: 
DFD: 
TAG: 
IAG: 
THG: 
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Hbut_1566(egsA)
PFM: 
SSO: 
SSO0760(egsA)
SOL: 
STO: 
ST0344(egsA)
SAI: 
Saci_0640(egsA)
SACN: 
SACR: 
SACS: 
SIS: 
SIA: 
SIM: 
SID: 
M164_1374(egsA)
SIY: 
SIN: 
SII: 
SIH: 
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SIC: 
MSE: 
Msed_2255(egsA)
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PAI: 
PIS: 
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POG: 
TNE: 
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TTN: 
TTX_1518(gldA)
VDI: 
VMO: 
TPE: 
THB: 
ASC: 
CLG: 
FFO: 
NMR: 
NIR: 
CSY: 
NGA: 
CSU: 
KCR: 
HAH: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:8586635]
  Authors
Nishihara M, Koga Y
  Title
sn-glycerol-1-phosphate dehydrogenase in Methanobacterium thermoautotrophicum: key enzyme in biosynthesis of the enantiomeric glycerophosphate backbone of ether phospholipids of archaebacteria.
  Journal
J. Biochem. 117 (1995) 933-5.
  Organism
Methanobacterium thermoautotrophicum
Reference
2  [PMID:9348086]
  Authors
Nishihara M, Koga Y
  Title
Purification and properties of sn-glycerol-1-phosphate dehydrogenase from Methanobacterium thermoautotrophicum: characterization of the biosynthetic enzyme for the enantiomeric glycerophosphate backbone of ether polar lipids of Archaea.
  Journal
J. Biochem. 122 (1997) 572-6.
  Organism
Methanobacterium thermoautotrophicum
  Sequence
[mth:MTH610]
Reference
3  [PMID:9419225]
  Authors
Koga Y, Kyuragi T, Nishihara M, Sone N.
  Title
Did archaeal and bacterial cells arise independently from noncellular precursors? A hypothesis stating that the advent of membrane phospholipid with enantiomeric glycerophosphate backbones caused the separation of the two lines of descent.
  Journal
J. Mol. Evol. 46 (1998) 54-63.
  Organism
Methanobacterium thermoautotrophicum
  Sequence
[mth:MTH610]
Reference
4  [PMID:10960477]
  Authors
Morii H, Nishihara M, Koga Y
  Title
CTP:2,3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase in the methanogenic archaeon Methanothermobacter thermoautotrophicus.
  Journal
J. Biol. Chem. 275 (2000) 36568-74.
  Organism
Methanothermobacter thermoautotrophicus
Reference
5  [PMID:15876564]
  Authors
Han JS, Ishikawa K
  Title
Active site of Zn(2+)-dependent sn-glycerol-1-phosphate dehydrogenase from Aeropyrum pernix K1.
  Journal
Archaea. 1 (2005) 311-7.
  Organism
Aeropyrum pernix
  Sequence
Reference
6  [PMID:18558723]
  Authors
Guldan H, Sterner R, Babinger P
  Title
Identification and characterization of a bacterial glycerol-1-phosphate dehydrogenase: Ni(2+)-dependent AraM from Bacillus subtilis.
  Journal
Biochemistry. 47 (2008) 7376-84.
  Organism
Bacillus subtilis
  Sequence
[bsu:BSU28760]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
204594-18-3

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