KEGG   ENZYME: 1.3.1.1Help
Entry
EC 1.3.1.1                  Enzyme                                 

Name
dihydropyrimidine dehydrogenase (NAD+);
dihydropyrimidine dehydrogenase;
dihydrothymine dehydrogenase;
pyrimidine reductase;
thymine reductase;
uracil reductase;
dihydrouracil dehydrogenase (NAD+)
Class
Oxidoreductases;
Acting on the CH-CH group of donors;
With NAD+ or NADP+ as acceptor
BRITE hierarchy
Sysname
5,6-dihydropyrimidine:NAD+ oxidoreductase
Reaction(IUBMB)
(1) 5,6-dihydrouracil + NAD+ = uracil + NADH + H+ [RN:R00977];
(2) 5,6-dihydrothymine + NAD+ = thymine + NADH + H+ [RN:R01414]
Reaction(KEGG)
Substrate
5,6-dihydrouracil [CPD:C00429];
NAD+ [CPD:C00003];
5,6-dihydrothymine [CPD:C00906]
Product
uracil [CPD:C00106];
NADH [CPD:C00004];
H+ [CPD:C00080];
thymine [CPD:C00178]
Comment
An iron-sulfur flavoenzyme. The enzyme was originally discovered in the uracil-fermenting bacterium, Clostridium uracilicum, which utilizes uracil and thymine as nitrogen and carbon sources for growth [1]. Since then the enzyme was found in additional organisms including Alcaligenes eutrophus [2], Pseudomonas strains [3,4] and Escherichia coli [5,6].
History
EC 1.3.1.1 created 1961, modified 2011
Pathway
Pyrimidine metabolism
beta-Alanine metabolism
Pantothenate and CoA biosynthesis
Metabolic pathways
Orthology
K17722  
dihydropyrimidine dehydrogenase (NAD+) subunit PreT
K17723  
dihydropyrimidine dehydrogenase (NAD+) subunit PreA
Genes
ECO: 
b2146(preT) b2147(preA)
ECJ: 
JW2133(yeiT) JW2134(yeiA)
ECD: 
EBW: 
BWG_1928(yeiT) BWG_1929(yeiA)
ECOK: 
ECE: 
Z3401 Z3402(yeiA)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_3024(yeiT) ECSP_3025(yeiA)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c2679(yeiT) c2680(yeiA)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_2517(yeiT) CE10_2518(yeiA)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_02075(yeiT) ECB_02076(yeiA)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m2347(yeiT) ECW_m2348(yeiA)
ELL: 
WFL_11480(yeiT) WFL_11485(yeiA)
ELC: 
i14_2478(yeiT) i14_2479(yeiA)
ELD: 
i02_2478(yeiT) i02_2479(yeiA)
ELP: 
EBL: 
ECD_02075(yeiT) ECD_02076(yeiA)
EBE: 
B21_02034(yeiT) B21_02035(yeiA)
ELF: 
LF82_3007(yeiA) LF82_3021(yeiT)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
EFER_2231(yeiT) EFER_2232(yeiA)
EAL: 
STY: 
STT: 
SEX: 
SENT: 
STM: 
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SENR: 
SEND: 
SENI: 
SEEN: 
SPT: 
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SEC: 
SCH_2203(yeiT) SCH_2204(yeiA)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
SENE: 
SENC: 
SBG: 
SBZ: 
SBV: 
SFL: 
SFX: 
SFV: 
SFE: 
SFxv_2463(yeiT)
SFN: 
SFS: 
SFT: 
NCTC1_02451(preT) NCTC1_02452(preA_1) NCTC1_02453(preA_2)
SSN: 
SSON_2203(yeiA)
SSJ: 
SBO: 
SBC: 
SDY: 
SDZ: 
ESC: 
KLE: 
CFD: 
SERR: 
DDA: 
KIN: 
EBF: 
PAE: 
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PAEB: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
PPSE: 
BN5_0328(pydA) BN5_0329(gltD1)
PPU: 
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
T1E_3293(pyd1) T1E_3294(yeiA)
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_17170(preA) PP4_17180(preT)
PPUD: 
PMON: 
PMOT: 
PMOS: 
PPJ: 
PFL: 
PPRC: 
PPRO: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PFW: 
PFB: 
PFF: 
PMAN: 
PTV: 
PEN: 
PBA: 
PBC: 
PPUU: 
PSV: 
PSK: 
PCH: 
PCZ: 
PCP: 
PFZ: 
PALK: 
PPV: 
PSEM: 
PSEC: 
PPSY: 
PSOS: 
HAK: 
HAM: 
GSN: 
GAP: 
RSL: 
BVI: 
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BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCEN: 
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BCEO: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BMK: 
BMUL: 
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BPYR: 
BCON: 
BUG: 
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BGF: 
BGD: 
BGO: 
BYI: 
BUK: 
BUO: 
BUE: 
BUB: 
BUQ: 
BXE: 
BXB: 
BPH: 
BRH: 
BPX: 
BPY: 
BFN: 
BCAI: 
PNA: 
AAV: 
AAA: 
ACK: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
JAG: 
MNR: 
MASW: 
THI: 
GLO: 
SUR: 
SCL: 
sce6397(yeiA) sce6398(gltB2)
SCU: 
CCRO: 
LLU: 
DTI: 
MLO: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
MES: 
HOE: 
SME: 
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
SMEG: 
SMEL: 
SMER: 
SMD: 
RHI: 
SFH: 
SFD: 
EAD: 
ARA: 
AVI: 
RET: 
REC: 
REL: 
REI: 
REP: 
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RLU: 
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RHL: 
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SHZ: 
BME: 
BMEL: 
BMI: 
BMZ: 
BMG: 
BMW: 
BMEE: 
BMF: 
BMB: 
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BABO: 
BABR: 
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BABC: 
BMS: 
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BSUP: 
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BSV: 
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BOV: 
BCS: 
BSK: 
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BCAR: 
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BMR: 
BPP: 
BPV: 
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BCEE: 
BVL: 
OAN: 
OAH: 
BBT: 
DEQ: 
MEY: 
AUA: 
SIL: 
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RSP: 
RSH: 
RSQ: 
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RCP: 
JAN: 
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RLI: 
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DSH: 
PGA: 
PGL: 
PGD: 
OAT: 
OAR: 
OTM: 
OSB_04390(preA) OSB_04410(gltD_1)
LMD: 
RED: 
PTP: 
CID: 
CMAR: 
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CON: 
RSU: 
PPHR: 
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GDJ: 
GXY: 
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APT: 
APW: 
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APG: 
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APZ: 
APK: 
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AZL: 
ALI: 
ATI: 
TMO: 
TMO_c0377(yeiA) TMO_c0378(yeiT)
TXI: 
PGV: 
BCZ: 
BCL: 
BPF: 
BMQ: 
BMD: 
BMH: 
BMEG: 
BCO: 
BAG: 
BACI: 
BIF: 
BLE: 
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BEO: 
BSM: 
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GKA: 
GTH: 
GTE: 
GYC: 
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GSE: 
LSP: 
LGY: 
LFU: 
HHD: 
BBE: 
PJD: 
PMS: 
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POD: 
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PSTE: 
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AAD: 
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CTC: 
CTET: 
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CBI: 
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CKL_2399(pyrD1)
CKR: 
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CSR: 
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SGY: 
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TPZ: 
Tph_c23940(pyrD2) Tph_c24020(pyrD3)
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DPD: 
TRA: 
MRB: 
MRE: 
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Minf_0626(pyrD) Minf_0627(gltD)
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HSW: 
HYG: 
CEX: 
STO: 
STK_11200(pydA)
BARC: 
AOA65_0974(hdlA_1)
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:13462991]
  Authors
CAMPBELL LL Jr.
  Title
Reductive degradation of pyrimidines. III. Purification and properties of dihydrouracil dehydrogenase.
  Journal
J. Biol. Chem. 227 (1957) 693-700.
Reference
2  [PMID:8806723]
  Authors
Schmitt U, Jahnke K, Rosenbaum K, Cook PF, Schnackerz KD
  Title
Purification and characterization of dihydropyrimidine dehydrogenase from Alcaligenes eutrophus.
  Journal
Arch. Biochem. Biophys. 332 (1996) 175-82.
Reference
3  [PMID:1903745]
  Authors
Kim S, West TP
  Title
Pyrimidine catabolism in Pseudomonas aeruginosa.
  Journal
FEMS. Microbiol. Lett. 61 (1991) 175-9.
Reference
4  [PMID:11759049]
  Authors
West TP
  Title
Pyrimidine base catabolism in Pseudomonas putida biotype B.
  Journal
Antonie. Van. Leeuwenhoek. 80 (2001) 163-7.
Reference
5  [PMID:10030006]
  Authors
West TP
  Title
Isolation and characterization of an Escherichia coli B mutant strain defective in uracil catabolism.
  Journal
Can. J. Microbiol. 44 (1998) 1106-9.
Reference
6  [PMID:21169495]
  Authors
Hidese R, Mihara H, Kurihara T, Esaki N
  Title
Escherichia coli dihydropyrimidine dehydrogenase is a novel NAD-dependent heterotetramer essential for the production of 5,6-dihydrouracil.
  Journal
J. Bacteriol. 193 (2011) 989-93.
  Sequence
[eco:b2146 b2147]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9026-89-5

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