KEGG   ENZYME: 2.1.1.178Help
Entry
EC 2.1.1.178                Enzyme                                 

Name
16S rRNA (cytosine1407-C5)-methyltransferase;
RNA m5C methyltransferase YebU;
RsmF;
YebU
Class
Transferases;
Transferring one-carbon groups;
Methyltransferases
BRITE hierarchy
Sysname
S-adenosyl-L-methionine:16S rRNA (cytosine1407-C5)-methyltransferase
Reaction(IUBMB)
S-adenosyl-L-methionine + cytosine1407 in 16S rRNA = S-adenosyl-L-homocysteine + 5-methylcytosine1407 in 16S rRNA
Substrate
S-adenosyl-L-methionine [CPD:C00019];
cytosine1407 in 16S rRNA
Product
S-adenosyl-L-homocysteine [CPD:C00021];
5-methylcytosine1407 in 16S rRNA
Comment
The enzyme specifically methylates cytosine1407 at C5 in 16S rRNA.
History
EC 2.1.1.178 created 2010
Orthology
K11392  
16S rRNA (cytosine1407-C5)-methyltransferase
Genes
ECO: 
b1835(rsmF)
ECJ: 
JW5301(yebU)
ECD: 
EBW: 
BWG_1649(rsmF)
ECOK: 
ECE: 
Z2882(yebU)
ECS: 
ECs2545(yebU)
ECF: 
ETW: 
ECSP_2409(yebU)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c2244(yebU)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_2119(rsmF)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
O3O_14855(yebU)
ESM: 
O3M_10740(yebU)
ESL: 
O3K_10770(yebU)
ECL: 
EBR: 
ECB_01806(yebU)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m2006(rsmF)
ELL: 
WFL_09850(rsmF)
ELC: 
i14_2062(yebU)
ELD: 
i02_2062(yebU)
ELP: 
EBL: 
ECD_01806(yebU)
EBE: 
B21_01794(rsmF)
ELF: 
LF82_2026(rsmF)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
EFER_1239(yebU)
EAL: 
STY: 
STT: 
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM1850(rsmF)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SENR: 
SEND: 
SENI: 
SEEN: 
SPT: 
SPA1023(yebU)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SEC: 
SCH_1846(yebU)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG1266(yebU)
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SEN1187(yebU)
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SENB: 
SENE: 
IA1_09185(yebU)
SENC: 
SES: 
SBG: 
SBZ: 
SBV: 
SFL: 
SF1390(yebU)
SFV: 
SFV_1393(yebU)
SFN: 
SFS: 
SFT: 
SSN: 
SSON_1326(yebU)
SSJ: 
SBO: 
SBO_1250(yebU)
SBC: 
SDY: 
SDY_1986(yebU)
SDZ: 
ECA: 
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PCV: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
ETA_15110(yebU)
EPY: 
EpC_15890(rsmF)
EPR: 
EAM: 
EAMY_2028(yebU)
EAY: 
EBI: 
EbC_24760(yebU)
ERJ: 
EGE: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ECLA: 
ECLC: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
ENR: 
ENX: 
ESA: 
CSK: 
ES15_1619(rsmF)
CSZ: 
CSI: 
CSJ: 
CCON: 
CDM: 
CMJ: 
CUI: 
CMW: 
CTU: 
KPN: 
KPN_02351(yebU)
KPU: 
KP1_3478(yebU)
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPV: 
KPW: 
KPY: 
KPG: 
KPC: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPO: 
KPR: 
KPR_3262(rsmF)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KPB: 
KPNE: 
KPNU: 
KVA: 
KVD: 
KVQ: 
KOX: 
KOX_23750(yebU)
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOM: 
KMI: 
KLE: 
EAE: 
EAE_22700(yebU)
EAR: 
CKO: 
CRO: 
CFD: 
CAMA: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
SMAR: 
SM39_1566(rsmF)
SMAC: 
SLQ: 
SERF: 
SERS: 
SFW: 
DDA: 
DDD: 
DZE: 
DDC: 
DZC: 
PAM: 
PANA_2162(yebU)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_1479(yebU)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_1609(yebU)
PAO: 
KLN: 
PANT: 
PANP: 
PAGG: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
Q7S_14395(yebU)
EBT: 
ROR: 
RON: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
CED: 
PGE: 
KSA: 
KIN: 
LAX: 
EBF: 
PSTS: 
VCH: 
VC1502(yebU)
VCF: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
O3Y_07295(yebU)
VCL: 
VCQ: 
VCS: 
VCX: 
VCZ: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VP1612(yebU)
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VAU: 
VCY: 
VCT: 
VTU: 
VFI: 
VF_1274(yebU)
VFM: 
VSA: 
AWD: 
PPR: 
PBPRA1927(YEBU_1)
PGB: 
GHO: 
SON: 
SO_2609(rsmF)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
PHA: 
PSM: 
PSM_A1288(yebU)
PSEO: 
PIA: 
PPHE: 
PBW: 
PRR: 
PTN: 
LAL: 
PIN: 
PSY: 
FBL: 
MVS: 
MVIS_2137(rsmF)
KKO: 
KGE: 
AHA: 
AHA_2262(yebU)
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
AHJ: 
AHH: 
AHI: 
ASA: 
AVR: 
AMED: 
ASR: 
DVM: 
DVG: 
DDE: 
DDS: 
DDN: 
DMA: 
DSA: 
DAS: 
DAF: 
DHY: 
DPI: 
DGG: 
DFI: 
DBA: 
DOA: 
HAU: 
TTR: 
TAZ: 
IAL: 
IALB_2714(rsmF)
TTK: 
DIN: 
DDF: 
DAP: 
CNI: 
FSI: 
SRB: 
PRF: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:16678201]
  Authors
Andersen NM, Douthwaite S
  Title
YebU is a m5C methyltransferase specific for 16 S rRNA nucleotide 1407.
  Journal
J. Mol. Biol. 359 (2006) 777-86.
  Sequence
[eco:b1835]
Reference
2  [PMID:16793063]
  Authors
Hallberg BM, Ericsson UB, Johnson KA, Andersen NM, Douthwaite S, Nordlund P, Beuscher AE 4th, Erlandsen H
  Title
The structure of the RNA m5C methyltransferase YebU from Escherichia coli reveals a C-terminal RNA-recruiting PUA domain.
  Journal
J. Mol. Biol. 360 (2006) 774-87.
  Sequence
[eco:b1835]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 

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