KEGG   ENZYME: 2.1.1.178Help
Entry
EC 2.1.1.178                Enzyme                                 

Name
16S rRNA (cytosine1407-C5)-methyltransferase;
RNA m5C methyltransferase YebU;
RsmF;
YebU
Class
Transferases;
Transferring one-carbon groups;
Methyltransferases
BRITE hierarchy
Sysname
S-adenosyl-L-methionine:16S rRNA (cytosine1407-C5)-methyltransferase
Reaction(IUBMB)
S-adenosyl-L-methionine + cytosine1407 in 16S rRNA = S-adenosyl-L-homocysteine + 5-methylcytosine1407 in 16S rRNA
Substrate
S-adenosyl-L-methionine [CPD:C00019];
cytosine1407 in 16S rRNA
Product
S-adenosyl-L-homocysteine [CPD:C00021];
5-methylcytosine1407 in 16S rRNA
Comment
The enzyme specifically methylates cytosine1407 at C5 in 16S rRNA.
History
EC 2.1.1.178 created 2010
Orthology
K11392  16S rRNA (cytosine1407-C5)-methyltransferase
Genes
ECO: b1835(rsmF)
ECJ: JW5301(yebU)
ECD: ECDH10B_1974(yebU)
EBW: BWG_1649(rsmF)
ECOK: ECMDS42_1510(yebU)
ECE: Z2882(yebU)
ECS: ECs2545(yebU)
ECF: ECH74115_2568(rsmF)
ETW: ECSP_2409(yebU)
ELX: CDCO157_2380(yebU)
EOJ: ECO26_2605(yebU)
EOI: ECO111_2343(yebU)
EOH: ECO103_2026(yebU)
ECG: E2348C_1960(rsmF)
EOK: G2583_2285(rsmF)
ELR: ECO55CA74_10990(yebU)
ECC: c2244(yebU)
ECP: ECP_1779
ECI: UTI89_C2036(yebU)
ECV: APECO1_889(yebU)
ECM: EcSMS35_1352(rsmF)
ECY: ECSE_2010
ECR: ECIAI1_1906(yebU)
ECQ: ECED1_2039(yebU)
ECK: EC55989_2012(yebU)
ECT: ECIAI39_1215(yebU)
EOC: CE10_2119(rsmF)
EUM: ECUMN_2129(yebU)
ECZ: ECS88_1888(yebU)
ELN: NRG857_09185(yebU)
ELH: ETEC_1868
ESE: ECSF_1692
ESO: O3O_14855(yebU)
ESM: O3M_10740(yebU)
ESL: O3K_10770(yebU)
EBR: ECB_01806(yebU)
EBD: ECBD_1805
EKF: KO11_13540(rsmF)
EAB: ECABU_c20940(rsmF)
EDJ: ECDH1ME8569_1781(yebU)
ENA: ECNA114_1881(yebU)
ELU: UM146_07990(yebU)
ELW: ECW_m2006(rsmF)
ELL: WFL_09850(rsmF)
ELC: i14_2062(yebU)
ELD: i02_2062(yebU)
ELP: P12B_c1248(yebU)
EBL: ECD_01806(rsmF)
EBE: B21_01794(rsmF)
ELF: LF82_2026(rsmF)
ECOA: APECO78_12980(yebU)
ECOL: LY180_09550(yebU)
ECOI: ECOPMV1_01926(rsmF)
ECOJ: P423_09730(yebU)
ECOO: ECRM13514_2342(yebU)
ECOH: ECRM13516_2245(yebU)
ECOS: EC958_2054(yebU)
EFE: EFER_1239(yebU)
EAL: EAKF1_ch4215c(yebU)
STY: STY1981
STT: t1028
SENT: TY21A_05235(yebU)
STM: STM1850(yebU)
SEO: STM14_2237(yebU)
SEY: SL1344_1779(yebU)
SEM: STMDT12_C18710(rsmF)
SEJ: STMUK_1823(yebU)
SEB: STM474_1873(yebU)
SETU: STU288_05615(yebU)
SETC: CFSAN001921_07840(yebU)
SENI: CY43_09440(yebU)
SEEN: SE451236_15190(yebU)
SPT: SPA1023(yebU)
SEK: SSPA0954
SEI: SPC_1879
SEC: SCH_1846(yebU)
SHB: SU5_02451
SENH: CFSAN002069_22590(yebU)
SEEH: SEEH1578_18510(yebU)
SENS: Q786_05940(yebU)
SED: SeD_A1465
SEG: SG1266(yebU)
SEL: SPUL_1667
SET: SEN1187(yebU)
SENA: AU38_06110(yebU)
SENO: AU37_06105(yebU)
SENV: AU39_06105(yebU)
SENQ: AU40_06880(yebU)
SENL: IY59_06265(yebU)
SENJ: CFSAN001992_02220(yebU)
SEEC: CFSAN002050_15725(yebU)
SEEB: SEEB0189_010245(yebU)
SENE: IA1_09185(yebU)
SENC: SEET0819_15995(yebU)
SBG: SBG_1704
SBZ: A464_1950
SBV: N643_08285(yebU)
SFL: SF1390(yebU)
SFV: SFV_1393(yebU)
SFN: SFy_1998
SFS: SFyv_2050
SFT: NCTC1_01489(yebU)
SSN: SSON_1326(yebU)
SBO: SBO_1250(yebU)
SBC: SbBS512_E2103(rsmF)
SDY: SDY_1986(yebU)
SHQ: A0259_13285(yebU)
ENC: ECL_01466
ENO: ECENHK_13560(yebU)
ECLO: ENC_06590
EEC: EcWSU1_02761(rsmF)
ENL: A3UG_13820(yebU)
ECLE: ECNIH2_13355(yebU)
ECLN: ECNIH4_09390(yebU)
ECLI: ECNIH5_12820(yebU)
ECLX: LI66_13180(yebU)
ECLY: LI62_14870(yebU)
ECLZ: LI64_12920(yebU)
ECLA: ECNIH3_12865(yebU)
ECLC: ECR091_12800(yebU)
EAU: DI57_05650(yebU)
EHM: AB284_12260(yebU)
ECLS: LI67_012410(yebU)
ENR: H650_04900(yebU)
ENX: NI40_013535(yebU)
ESA: ESA_01414
CSK: ES15_1619(rsmF)
CSZ: CSSP291_06910(yebU)
CCON: AFK62_11470(yebU)
CDM: AFK67_11815(yebU)
CMJ: AFK66_007775(yebU)
CUI: AFK65_11860(yebU)
CMW: AFK63_06770(yebU)
CTU: CTU_25180
KPN: KPN_02351(yebU)
KPU: KP1_3478(yebU)
KPP: A79E_1882
KPK: A593_01370(yebU)
KPH: KPNIH24_11730(yebU)
KPZ: KPNIH27_16265(yebU)
KPV: KPNIH29_16750(yebU)
KPW: KPNIH30_17065(yebU)
KPY: KPNIH31_16165(yebU)
KPG: KPNIH32_16960(yebU)
KPC: KPNIH10_16520(yebU)
KPQ: KPR0928_16495(yebU)
KPT: VK055_0098(rsmF)
KPE: KPK_1939
KPO: KPN2242_14730(yebU)
KPR: KPR_3262(rsmF)
KPJ: N559_1912
KPI: D364_11950(yebU)
KPX: PMK1_04713(rsmF)
KPB: FH42_07840(yebU)
KPNE: KU54_009555(yebU)
KPNU: LI86_09510(yebU)
KPNK: BN49_3456(rsmF)
KVA: Kvar_1830
KOX: KOX_23750(yebU)
KOE: A225_3641
KOY: J415_13885(yebU)
KMI: VW41_13155(yebU)
KOK: KONIH1_18030(yebU)
KOC: AB185_18095(yebU)
KOM: HR38_22055(yebU)
EAE: EAE_22700(yebU)
EAR: CCG29463
CKO: CKO_01138
CRO: ROD_18751
CFD: CFNIH1_19995(yebU)
CAMA: F384_08850(yebU)
GQU: AWC35_22740(yebU)
ROR: RORB6_03015(yebU)
RON: TE10_18270(yebU)
CNT: JT31_22015(yebU)
CEM: LH23_19205(yebU)
CEN: LH86_17885(yebU)
CED: LH89_00155(yebU)
PGE: LG71_14585(yebU)
KLE: AO703_12395(yebU)
KOR: AWR26_10505(yebU)
KRD: A3780_13635(yebU)
KIN: AB182_15490(yebU)
LAX: APT61_08705(yebU)
EBF: D782_1806
PSTS: E05_15000
SPE: Spro_2113
SRL: SOD_c19270(rsmF)
SRY: M621_10625(yebU)
SPLY: Q5A_010665(rsmF)
SMAF: D781_1933
SMW: SMWW4_v1c21260(rsmF)
SMAR: SM39_1566(rsmF)
SMAC: SMDB11_1379(rsmF)
SLQ: M495_10250(yebU)
SERF: L085_18125(yebU)
SERS: SERRSCBI_09955(yebU)
SFW: WN53_19735(yebU)
SFG: AV650_15105(yebU)
RAA: Q7S_14395(yebU)
ECA: ECA2464
PATR: EV46_11865(yebU)
PATO: GZ59_20950
PCT: PC1_1848
PCV: BCS7_09550(yebU)
PEC: W5S_2081
DZC: W909_11030(yebU)
DSO: A4U42_20970(yebU)
DDQ: DDI_2256
BGJ: AWC36_08565(yebU)
ETA: ETA_15110(yebU)
EPY: EpC_15890(rsmF)
EPR: EPYR_01711(yebU)
EAM: EAMY_2028(yebU)
EAY: EAM_1978
EBI: EbC_24760(yebU)
ERJ: EJP617_31090(yebU)
EGE: EM595_2068(rsmF)
PAM: PANA_2162(yebU)
PLF: PANA5342_2009(yebU)
PAJ: PAJ_1479(yebU)
PVA: Pvag_1609(yebU)
KLN: LH22_11345(yebU)
PANT: PSNIH1_14665(yebU)
PANP: PSNIH2_07040(yebU)
PSTW: DSJ_15105
VCH: VC1502(yebU)
VCF: IR04_12745(yebU)
VCE: Vch1786_I1001(yebU)
VCI: O3Y_07295(yebU)
VCQ: EN18_10710(yebU)
VCS: MS6_1288
VVU: VV1_2649
VVY: VV1641
VVL: VV93_v1c15160(yebU)
VPA: VP1612(yebU)
VPB: VPBB_1472
VAG: N646_0638
VNA: PN96_05555(yebU)
VSP: VS_1411
VEJ: VEJY3_07650(yebU)
VNI: VIBNI_A1798(rsmF)
VAN: VAA_01878
VAU: VANGNB10_cI1250c(rsmF)
VCY: IX92_06810(yebU)
VCT: JV59_31720(yebU)
VTU: IX91_07370(yebU)
VSC: VSVS12_01659(rsmF)
VFI: VF_1274(yebU)
AWD: AWOD_I_1398(rsmF)
PPR: PBPRA1927(YEBU_1)
PMAI: CF386_06895(yebU)
SON: SO_2609(rsmF)
SDN: Sden_2046
SFR: Sfri_2236
SAZ: Sama_2039
SBL: Sbal_2455
SLO: Shew_1583
SSE: Ssed_2644
SPL: Spea_1927
SHL: Shal_2372
SWD: Swoo_1986
SWP: swp_2828
SVO: SVI_2568
SPSW: Sps_01383
PHA: PSHAa1777
PSM: PSM_A1288(yebU)
PSEO: OM33_11340(yebU)
PBW: D172_007090(yebU)
PRR: AT705_01085(yebU)
PTN: PTRA_a2209(rsmF)
PLZ: S4054249_13965(yebU)
PEA: PESP_a1596(rsmF)
PSPO: PSPO_a1790(rsmF)
PART: PARC_a2386(rsmF)
PTU: PTUN_a2490(rsmF)
PNG: PNIG_a2390(rsmF)
PTD: PTET_a1481(rsmF)
LAL: AT746_09455(yebU)
PIN: Ping_2224
PSY: PCNPT3_05130(yebU)
FBL: Fbal_1866
MVS: MVIS_2137(rsmF)
KKO: Kkor_2155
KGE: TQ33_0417
AHA: AHA_2262(yebU)
AHY: AHML_11630(yebU)
AHD: AI20_08320(yebU)
AHR: V428_11980(yebU)
AHP: V429_11995(yebU)
AHJ: V469_11425(yebU)
AHH: RY45_11555(yebU)
AHI: VU14_11290(yebU)
ASA: ASA_2044
AVR: B565_1987
AVO: AMS64_09735(yebU)
AMED: B224_2304
ASR: WL1483_1585(rsmF)
ACAV: VI35_10855
DVM: DvMF_2026
DDE: Dde_0122
DDS: Ddes_2325
DMA: DMR_06130
DAS: Daes_2935
DPI: BN4_12665
PPRF: DPRO_1414
DBA: Dbac_3109
HAU: Haur_1936
TTR: Tter_2695
TTK: TST_1169
CABY: Cabys_3346
SRB: P148_SR1C001G1053(yebU)
SRG: XF24_00581(rsmF)
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:16678201]
  Authors
Andersen NM, Douthwaite S
  Title
YebU is a m5C methyltransferase specific for 16 S rRNA nucleotide 1407.
  Journal
J. Mol. Biol. 359 (2006) 777-86.
  Sequence
[eco:b1835]
Reference
2  [PMID:16793063]
  Authors
Hallberg BM, Ericsson UB, Johnson KA, Andersen NM, Douthwaite S, Nordlund P, Beuscher AE 4th, Erlandsen H
  Title
The structure of the RNA m5C methyltransferase YebU from Escherichia coli reveals a C-terminal RNA-recruiting PUA domain.
  Journal
J. Mol. Biol. 360 (2006) 774-87.
  Sequence
[eco:b1835]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 2.1.1.178
IUBMB Enzyme Nomenclature: 2.1.1.178
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 2.1.1.178
BRENDA, the Enzyme Database: 2.1.1.178

DBGET integrated database retrieval system