KEGG   ENZYME: 2.1.1.191Help
Entry
EC 2.1.1.191                Enzyme                                 

Name
23S rRNA (cytosine1962-C5)-methyltransferase;
RlmI;
rRNA large subunit methyltransferase I;
YccW
Class
Transferases;
Transferring one-carbon groups;
Methyltransferases
BRITE hierarchy
Sysname
S-adenosyl-L-methionine:23S rRNA (cytosine1962-C5)-methyltransferase
Reaction(IUBMB)
S-adenosyl-L-methionine + cytosine1962 in 23S rRNA = S-adenosyl-L-homocysteine + 5-methylcytosine1962 in 23S rRNA
Substrate
S-adenosyl-L-methionine [CPD:C00019];
cytosine1962 in 23S rRNA
Product
S-adenosyl-L-homocysteine [CPD:C00021];
5-methylcytosine1962 in 23S rRNA
Comment
The enzyme specifically methylates cytosine1962 at C5 in 23S rRNA.
History
EC 2.1.1.191 created 2010
Orthology
K06969  23S rRNA (cytosine1962-C5)-methyltransferase
Genes
ECO: b0967(rlmI)
ECJ: JW5898(yccW)
ECD: ECDH10B_1037(yccW)
EBW: BWG_0819(yccW)
ECOK: ECMDS42_0819(yccW)
ECE: Z1319
ECS: ECs1051
ECF: ECH74115_1132
ETW: ECSP_1073(yccW)
ELX: CDCO157_1025
EOJ: ECO26_1094(yccW)
EOI: ECO111_1035(yccW)
EOH: ECO103_1013(yccW)
ECG: E2348C_0953(yccW)
EOK: G2583_1202(yccW)
ECC: c1105(yccW)
ECP: ECP_0973
ECI: UTI89_C1034(yccW)
ECV: APECO1_72(yccW)
ECY: ECSE_1029
ECR: ECIAI1_1008(yccW)
ECQ: ECED1_0990(yccW)
ECK: EC55989_1016(yccW)
ECT: ECIAI39_2178(yccW)
EOC: CE10_0995(rlmI)
EUM: ECUMN_1157(yccW)
ECZ: ECS88_0989(yccW)
ELH: ETEC_1037
ESE: ECSF_0881
ESO: O3O_08790
ESM: O3M_16480
ESL: O3K_16505
EBR: ECB_00971(yccW)
EBD: ECBD_2627
EKF: KO11_17890(yccW)
EAB: ECABU_c09990(yccW)
EDJ: ECDH1ME8569_0920(yccW)
ELW: ECW_m1077(yccW)
ELL: WFL_05250(yccW)
ELC: i14_1012(yccW)
ELD: i02_1012(yccW)
ELP: P12B_c0954(yccW)
EBL: ECD_00971(rlmI)
EBE: B21_00978(rlmI)
ELF: LF82_2696(yccW)
ECOI: ECOPMV1_00997(rlmI)
ECOJ: P423_05315
ECOS: EC958_1172(yccW)
EFE: EFER_1104(yccW)
STY: STY1103
STT: t1840
STM: STM1080(yccW)
SEO: STM14_1225(yccW)
SEY: SL1344_1020(yccW)
SEJ: STMUK_1049(yccW)
SEB: STM474_1072(yccW)
SENI: CY43_05525
SPT: SPA1770(yccW)
SEK: SSPA1643
SEI: SPC_2669
SEC: SCH_1032(yccW)
SHB: SU5_01715
SENS: Q786_04810
SED: SeD_A1155
SEG: SG0970(yccW)
SEL: SPUL_1975
SET: SEN0945(yccW)
SENA: AU38_04880
SENO: AU37_04870
SENV: AU39_04870
SENQ: AU40_05475
SENL: IY59_04960
SEEP: I137_08990
SENB: BN855_10350(yccW)
SENE: IA1_05315
SBG: SBG_0881
SBZ: A464_956
SFL: SF0970
SFX: S1035
SFV: SFV_0977
SFE: SFxv_1052(yccW)
SFN: SFy_1324
SFS: SFyv_1366
SFT: NCTC1_01006(yccW)
SBO: SBO_2264
SDY: SDY_0942(yccW)
ENC: ECL_02679
ECLO: ENC_16600
EEC: EcWSU1_01549(rlmI)
ECLX: LI66_07765
ECLY: LI62_08515
ECLZ: LI64_08070
ESA: ESA_02382
CSK: ES15_2480(rlmI)
CTU: CTU_15750(rlmI)
KPN: KPN_01001(yccW)
KPU: KP1_1968(yccW)
KPP: A79E_3246
KPT: VK055_1491(rlmI)
KPE: KPK_3573
KPR: KPR_3522(rlmI)
KPJ: N559_3286
KPX: PMK1_03327(rlmI)
KPNU: LI86_17075
KPNK: BN49_2090(rlmI)
KVA: Kvar_3390
KOX: KOX_16280
KOE: A225_2099
EAE: EAE_15430
EAR: CCG30873
CKO: CKO_02099
CRO: ROD_10291
CAMA: F384_04615
EBT: EBL_c24650(yccW)
EBF: D782_2846
YPE: YPO1445
YPK: y2725
YPA: YPA_0737
YPN: YPN_2534
YPM: YP_1336
YPZ: YPZ3_1319
YPD: YPD4_1285
YPX: YPD8_1271
YPH: YPC_2714
YPW: CH59_396(rlmI)
YPJ: CH55_1097(rlmI)
YPV: BZ15_2109(rlmI)
YPL: CH46_3682(rlmI)
YPS: YPTB1463
YPO: BZ17_1055(rlmI)
YPY: YPK_2620
YPB: YPTS_1569
YPQ: DJ40_761(rlmI)
YPU: BZ21_741(rlmI)
YPR: BZ20_509(rlmI)
YPC: BZ23_1076(rlmI)
YPF: BZ19_873(rlmI)
YEN: YE1593
YEY: Y11_04741
YEW: CH47_1039(rlmI)
YET: CH48_62(rlmI)
YAL: AT01_925(rlmI)
YFR: AW19_1641(rlmI)
YIN: CH53_105(rlmI)
YKR: CH54_23
YRO: CH64_983(rlmI)
YRU: BD65_24(rlmI)
SPE: Spro_1764
SRL: SOD_c16280(rlmI)
SPLY: Q5A_008765(rlmI)
SMAF: D781_1670
SMW: SMWW4_v1c17460(rlmI)
SMAR: SM39_1218
SERF: L085_19745
RAA: Q7S_07545
SOD: Sant_2584(rlmI)
PES: SOPEG_1596(rlmI)
ETA: ETA_20930
EPY: EpC_22260
EPR: EPYR_02402(yccW)
EAM: EAMY_1397(yccW)
EAY: EAM_1387
EBI: EbC_15510
EGE: EM595_1340(rlmI)
PAM: PANA_1403(yccW)
PLF: PANA5342_2875(rlmI)
PAJ: PAJ_0726(yccW)
PVA: Pvag_0789(yccW)
PSTW: DSJ_09795
ETR: ETAE_1279(yccW)
ETD: ETAF_1193(rlmI)
ETE: ETEE_3233(rlmI)
PSHI: SAMEA2665130_1086(rlmI)
XFA: XF_0407
XFT: PD_1665
XCC: XCC4231
XCB: XC_4320
XCP: XCR_4583
XCV: XCV4476
XAX: XACM_4252
XAC: XAC4364
XFU: XFF4834R_chr42880(rlmI)
XOO: XOO4625
XOM: XOO4361(XOO4361)
XOP: PXO_03498
XOR: XOC_4678
XAL: XALC_3146
XPH: XppCFBP6546_11915(XppCFBP6546P_11915)
SML: Smlt4687
SMT: Smal_4035
SMZ: SMD_4230(rlmI)
SACZ: AOT14_37460(rlmI)
PSUW: WQ53_08210
PSD: DSC_01670
LEZ: GLE_5244
LEM: LEN_0076
VCH: VC1354
VCI: O3Y_06295
VCS: MS6_1130
VPB: VPBB_1489
PPR: PBPRA2194(Y2725) PBPRA2510(SO2919)
PCQ: PcP3B5_48610(rlmI_1) PcP3B5_59250(rlmI_2)
PPU: PP_4306 PP_5127(rlmI)
PPUN: PP4_14600 PP4_51910(rlmI)
PPRC: PFLCHA0_c24990(rlmL2) PFLCHA0_c52560(rlmI1) PFLCHA0_c58260(rlmI2)
SON: SO_1149(rlmI) SO_2451 SO_2919
PHA: PSHAa1111 PSHAa1147(yccW)
PAT: Patl_2168
PSM: PSM_A1876(yccW) PSM_A1917
PTN: PTRA_a1299(rlmI) PTRA_a1346(rlmI)
PEA: PESP_a2469(rlmI) PESP_a2510(rlmI)
PSPO: PSPO_a1393(rlmI) PSPO_a1952(rlmI)
PART: PARC_a1357(rlmI) PARC_a1395(rlmI)
PTU: PTUN_a1592(rlmI) PTUN_a1654(rlmI)
PNG: PNIG_a1381(rlmI) PNIG_a1421(rlmI)
PTD: PTET_a2151(rlmI) PTET_a2196(rlmI)
MAQ: Maqu_0812
MHC: MARHY0682
MAD: HP15_460
MBS: MRBBS_0677(rlmI)
AMAL: I607_07855
AMAE: I876_08120
AMAO: I634_08225
AMAD: I636_08665
AMAI: I635_08935
AMAG: I533_08165
AMAC: MASE_07730
AAUS: EP12_08585
GNI: GNIT_1707
GPS: C427_2832
PIN: Ping_3313
MICC: AUP74_00912(rlmI_1) AUP74_02129(rlmI_2)
LPN: lpg1190
LPH: LPV_1346
LPO: LPO_1205
LPM: LP6_1172
LPF: lpl1198
LPP: lpp1192
LPC: LPC_0657
LPA: lpa_01846
LPE: lp12_1171
LLO: LLO_1296
LFA: LFA_1135
LHA: LHA_1394
LOK: Loa_01453
LCD: clem_07900(rlmI)
TMC: LMI_1945
MCA: MCA1049
TCX: Tcr_1849
TIG: THII_1854
NHL: Nhal_3193
NTT: TAO_1326
AEH: Mlg_0366
HHA: Hhal_2043
GAI: IMCC3135_10335(rlmI)
HCH: HCH_05988
CSA: Csal_2968
HEL: HELO_3822
HAM: HALO4078
HCO: LOKO_03002(rlmI)
HBE: BEI_3238(rlmI)
APAC: S7S_01070
TOL: TOL_3606
AHA: AHA_2227
ASA: ASA_2074
AVR: B565_1894
AMED: B224_2256
ASR: WL1483_2144(rlmI)
ACAV: VI35_10715
TAU: Tola_2004
SLIM: SCL_0450
SVA: SVA_2743
TBN: TBH_C0038
ENM: EBS_2165(rlmI)
NMA: NMA1579
NME: NMB1367
NMP: NMBB_1515
NMC: NMC1302
NMN: NMCC_1278
NMT: NMV_1031
NMI: NMO_1206
NMW: NMAA_1094
NGO: NGO0651
NGK: NGK_1260
NLA: NLA_12110
NWE: SAMEA3174300_0769(rlmL_2)
KKI: KKKWG1_0649(rlmK)
ECOR: SAMEA4412678_1347(rlmL_1)
LHK: LHK_00592
PSE: NH8B_3414
RSO: RSc0051
RSE: F504_58
RPI: Rpic_3698
REH: H16_A0304(asmT)
CNC: CNE_1c03160(asmT)
RME: Rmet_0223
CGD: CR3_0226(rlmI)
BMA: BMA3257
BMAL: DM55_459
BMAE: DM78_2730
BMAQ: DM76_440
BMAI: DM57_1912
BMAF: DM51_2852
BMAZ: BM44_3089
BMAB: BM45_374
BPS: BPSL0207
BPSE: BDL_1784
BPSM: BBQ_3224
BPSU: BBN_3346
BPSD: BBX_174
BPK: BBK_1262
BPSH: DR55_883
BPSA: BBU_1936
BPSO: X996_504
BUT: X994_2494
BTE: BTH_I0169
BTQ: BTQ_194
BTJ: BTJ_2291
BTZ: BTL_206
BTD: BTI_3551
BTV: BTHA_263
BTHE: BTN_1186
BTHM: BTRA_407
BTHA: DR62_1361
BTHL: BG87_370
BOK: DM82_3393
BOC: BG90_1425
BVE: AK36_830
BCN: Bcen_2474
BCJ: BCAL0504
BCEN: DM39_3180
BCEW: DM40_689
BCEO: I35_3162
BAM: Bamb_3134
BMU: Bmul_3083
BMK: DM80_1829
BMUL: NP80_5
BCT: GEM_0354
BCED: DM42_1924
BDL: AK34_23
BCON: NL30_28535
BUB: BW23_1797
BLAT: WK25_14985
BTEI: WS51_25800
BSEM: WJ12_15470
BPSL: WS57_34230
BMEC: WJ16_15655
BSTG: WT74_16270
BGU: KS03_834
BGO: BM43_1311
BUK: MYA_2848
BUL: BW21_37
BXE: Bxe_A4376
BXB: DR64_2053
BPH: Bphy_0073
BPX: BUPH_03993(rlmI)
BFN: OI25_1349
PPNO: DA70_15250
PPNM: LV28_15430
PPUL: RO07_09470
PSPU: NA29_05390
PAPI: SG18_09970
RFR: Rfer_3440
POL: Bpro_1062
PNA: Pnap_3432
DAC: Daci_3357
VPD: VAPA_1c09560(rlmI)
CTES: O987_16020
RTA: Rta_09540
LIM: L103DPR2_02764(rlmI)
LIH: L63ED372_01359(rlmI)
MPT: Mpe_A3242
MMS: mma_0183
JAG: GJA_1403
CARE: LT85_0297
LCH: Lcho_0139
TIN: Tint_2232
THI: THI_2580
RGE: RGE_05150
BBAG: E1O_27350
PBH: AAW51_0950(rlmI)
SLT: Slit_0145
GCA: Galf_2689
EBA: ebA3956
DAR: Daro_0196
AZO: azo0598
AZA: AZKH_0556
AOA: dqs_0666
WSU: WS0017
SULR: B649_06665
ABU: Abu_0932
ABT: ABED_0882
ARC: ABLL_1177
SDL: Sdel_2204
SMUL: SMUL_3168(rlmI)
SHAL: SHALO_2903
SULJ: SJPD1_2788
NIS: NIS_1136
GME: Gmet_0845
GUR: Gura_1435
GBM: Gbem_2702
GEO: Geob_2340
GEM: GM21_1538
GEB: GM18_2569
PPD: Ppro_3540
DVU: DVU0495
DVL: Dvul_2446
DVM: DvMF_1714
DDE: Dde_3451
DMA: DMR_01760
DPS: DP2250
DSF: UWK_00711
DOL: Dole_2658
SAT: SYN_01029
SFU: Sfum_1865
MLO: mlr3209
MES: Meso_3676
SME: SMc01131
SMER: DU99_02080
SMD: Smed_0024
EAD: OV14_1309
ATU: Atu0340
ARA: Arad_0631
AVI: Avi_0413
RLE: RL0412
RLG: Rleg_0054
RHT: NT26_0010
SHZ: shn_00100
BMF: BAB1_0150
BABO: DK55_168
BABR: DO74_1713
BABT: DK49_2017
BABB: DK48_1958
BABU: DK53_163
BABS: DK51_1300
BABC: DO78_80
BMS: BR0151
BSZ: DK67_46
BOV: BOV_0146
BCAR: DK60_256
BCAS: DA85_00745
BMR: BMI_I154
BPP: BPI_I152
BPV: DK65_1216
OAN: Oant_0163
OAH: DR92_84
BHE: BH00120
BQR: RM11_0011
BTR: BT_0012
BGR: Bgr_00110
BANC: PU02_0460
HDN: Hden_0848
MMED: Mame_03919(rlmI)
HDI: HDIA_4657(rlmI)
CAK: Caul_3093
CSE: Cseg_2693
PZU: PHZ_c1897
SIL: SPO2520
RSP: RSP_2647
JAN: Jann_2689
RDE: RD1_2799
PDE: Pden_1954
DSH: Dshi_1771
KVU: EIO_0193
KVL: KVU_1499
KRO: BVG79_01616(rlmI)
PSF: PSE_1022
PGA: PGA1_c19990(rlmI)
PGL: PGA2_c18700(rlmI)
PGD: Gal_01431
PHP: PhaeoP97_01998(rlmI)
PPIC: PhaeoP14_01809(rlmI)
OTM: OSB_18950(rlmI)
CID: P73_2936
MALG: MALG_02025
RSU: NHU_01732
RHC: RGUI_3864
SPSE: SULPSESMR1_01259(rlmI)
RMM: ROSMUCSMR3_00418(rlmI)
LVS: LOKVESSMR4R_01665(rlmI)
AHT: ANTHELSMS3_03479(rlmI)
HNE: HNE_2871
HBA: Hbal_1754
ZMO: ZMO1889
ZMN: Za10_1253
ZMM: Zmob_1279
ZMB: ZZ6_1260
ZMI: ZCP4_1293
NAR: Saro_0922
SAL: Sala_1397
SPHP: LH20_09655
SMAZ: LH19_15000
SWI: Swit_1415
SPHM: G432_14285
STAX: MC45_15330
SPHI: TS85_16885
SSAN: NX02_27425
SPKC: KC8_10680
SPHD: HY78_19495
SSY: SLG_08450
SPMI: K663_01795
SPHB: EP837_01677(rlmI)
SPHR: BSY17_1640
SINB: SIDU_10385
SPHT: K426_03980
SFLA: SPHFLASMR4Y_03053(rlmI)
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KCR: Kcr_1071
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:18786544]
  Authors
Purta E, O'Connor M, Bujnicki JM, Douthwaite S
  Title
YccW is the m5C methyltransferase specific for 23S rRNA nucleotide 1962.
  Journal
J. Mol. Biol. 383 (2008) 641-51.
  Sequence
[eco:b0967]
Reference
2  [PMID:18789337]
  Authors
Sunita S, Tkaczuk KL, Purta E, Kasprzak JM, Douthwaite S, Bujnicki JM, Sivaraman J
  Title
Crystal structure of the Escherichia coli 23S rRNA:m5C methyltransferase RlmI (YccW) reveals evolutionary links between RNA modification enzymes.
  Journal
J. Mol. Biol. 383 (2008) 652-66.
  Sequence
[eco:b0967]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 2.1.1.191
IUBMB Enzyme Nomenclature: 2.1.1.191
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 2.1.1.191
BRENDA, the Enzyme Database: 2.1.1.191

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