KEGG   ENZYME: 2.1.1.282Help
Entry
EC 2.1.1.282                Enzyme                                 

Name
tRNAPhe 7-[(3-amino-3-carboxypropyl)-4-demethylwyosine37-N4]-methyltransferase;
TYW3 (gene name);
tRNA-yW synthesizing enzyme-3
Class
Transferases;
Transferring one-carbon groups;
Methyltransferases
BRITE hierarchy
Sysname
S-adenosyl-L-methionine:tRNAPhe 7-[(3S)-(3-amino-3-carboxypropyl)-4-demethylwyosine-N4]-methyltransferase
Reaction(IUBMB)
S-adenosyl-L-methionine + 7-[(3S)-(3-amino-3-carboxypropyl)]-4-demethylwyosine37 in tRNAPhe = S-adenosyl-L-homocysteine + 7-[(3S)-(3-amino-3-carboxypropyl)]wyosine37 in tRNAPhe [RN:R10498]
Reaction(KEGG)
Substrate
S-adenosyl-L-methionine [CPD:C00019];
7-[(3S)-(3-amino-3-carboxypropyl)]-4-demethylwyosine37 in tRNAPhe
Product
S-adenosyl-L-homocysteine [CPD:C00021];
7-[(3S)-(3-amino-3-carboxypropyl)]wyosine37 in tRNAPhe
Comment
The enzyme is involved in the biosynthesis of hypermodified tricyclic bases found at position 37 of certain tRNAs. These modifications are important for translational reading-frame maintenance. The enzyme is found in all eukaryotes and in some archaea, but not in bacteria. The eukaryotic enzyme is involved in the biosynthesis of wybutosine.
History
EC 2.1.1.282 created 2013, modified 2014
Orthology
K15450  tRNA wybutosine-synthesizing protein 3
Genes
HSA: 127253(TYW3)
PTR: 745288(TYW3)
PPS: 100989797(TYW3)
GGO: 101137627(TYW3)
PON: 100173692(TYW3)
NLE: 100598652(TYW3)
MCC: 704515(TYW3)
MCF: 102131944(TYW3)
CSAB: 103224601(TYW3)
RRO: 104676320(TYW3)
RBB: 108527891(TYW3)
CJC: 100385836(TYW3)
SBQ: 101035404(TYW3)
MMU: 209584(Tyw3)
RNO: 499731(Tyw3)
CGE: 100769973(Tyw3)
NGI: 103750545(Tyw3)
HGL: 101713190(Tyw3)
CCAN: 109699393(Tyw3)
OCU: 100348497(TYW3)
TUP: 102468826(TYW3)
CFA: 479986(TYW3)
AML: 100479651(TYW3)
UMR: 103663004(TYW3)
ORO: 101368372(TYW3)
FCA: 101086328(TYW3)
PTG: 102963178(TYW3)
AJU: 106971816(TYW3)
BTA: 519731(TYW3)
BOM: 102287033(TYW3)
BIU: 109556159(TYW3)
PHD: 102340383(TYW3)
CHX: 102169351(TYW3)
OAS: 101107062(TYW3)
SSC: 733652(TYW3)
CFR: 102518413(TYW3)
CDK: 105096647(TYW3)
BACU: 103013167(TYW3)
LVE: 103076037(TYW3)
OOR: 101286224(TYW3)
ECB: 100053370(TYW3)
EPZ: 103554141(TYW3)
EAI: 106824900(TYW3)
MYB: 102251617(TYW3)
MYD: 102759915(TYW3)
HAI: 109383503(TYW3)
RSS: 109453754(TYW3)
PALE: 102892456(TYW3)
LAV: 100661348(TYW3)
TMU: 101356763
MDO: 100011614(TYW3)
SHR: 100929848(TYW3)
OAA: 100074370(TYW3)
GGA: 424720(TYW3)
MGP: 104912408(TYW3)
CJO: 107317803(TYW3)
APLA: 101794609(TYW3)
ACYG: 106043617(TYW3)
TGU: 101233321(TYW3)
GFR: 102036499(TYW3)
FAB: 101818854(TYW3)
PHI: 102112648(TYW3)
PMAJ: 107208284(TYW3)
CCW: 104695482(TYW3)
FPG: 101919625(TYW3)
FCH: 102055133(TYW3)
CLV: 102093600(TYW3)
EGZ: 104123855(TYW3)
AAM: 106486523(TYW3)
ASN: 102384683(TYW3)
AMJ: 102576139(TYW3)
PSS: 102448111(TYW3)
CMY: 102944527(TYW3)
CPIC: 101948228(TYW3)
ACS: 100566113(tyw3)
PVT: 110079525(TYW3)
PBI: 103062825(TYW3)
GJA: 107113038(TYW3)
XLA: 447714(tyw3.L)
XTR: 549182(tyw3)
NPR: 108804942(TYW3)
DRE: 436884(tyw3)
SRX: 107716943(tyw3)
SANH: 107700527(tyw3)
SGH: 107588882(tyw3)
CCAR: 109099260(tyw3)
IPU: 108280477(tyw3)
AMEX: 103027647(tyw3)
TRU: 101073335(tyw3)
LCO: 104933486(tyw3)
MZE: 101471765(tyw3)
OLA: 101155543(tyw3)
XMA: 102235951(tyw3)
PRET: 103479205(tyw3)
NFU: 107384217(tyw3)
CSEM: 103396634(tyw3)
LCF: 108885344(tyw3)
HCQ: 109521294(tyw3)
BPEC: 110155734(tyw3)
SASA: 106569012(tyw3)
ELS: 105007087(tyw3)
SFM: 108935030(tyw3)
LCM: 102351252(TYW3)
CMK: 103174739(tyw3)
CIN: 100176625
SPU: 100890851
APLC: 110975831
SKO: 102807046
ZNE: 110831496
FCD: 110863575
MYI: 110446662
OBI: 106875964
LAK: 106161327
EPA: 110246328
ADF: 107339419
HMG: 105843790
ATH: AT4G04670
CRB: 17883143
BRP: 103858670
THJ: 104813121
CPAP: 110808043
CIT: 102630801
TCC: 18597148
GRA: 105768444
DZI: 111280313
EGR: 104445708
GMX: 100816336
VRA: 106769298
VAR: 108323147
CCAJ: 109807775
CAM: 101500265
ADU: 107466736
AIP: 107637231
LJA: Lj4g3v0153680.1(Lj4g3v0153680.1)
LANG: 109361729
FVE: 101292484
PPER: 18780475
PMUM: 103324538
PAVI: 110763082
MDM: 103446720
PXB: 103948175
ZJU: 107420278
CSV: 101218510
CMO: 103484609
MCHA: 111012371
CMAX: 111496687
CMOS: 111433898
CPEP: 111781253
RCU: 8284198
JCU: 105649334
POP: 7458525
JRE: 108988715
VVI: 100257307
SLY: 101263515
SPEN: 107020397
SOT: 102599033
CANN: 107871430
NSY: 104240885
NTO: 104101502
INI: 109188343
SIND: 105175344
OEU: 111395202
LSV: 111890917
DCR: 108199623
BVG: 104900995
SOE: 110777318
NNU: 104612804
OSA: 4343372
OBR: 102702769
BDI: 100836909
ATS: 109737597(LOC109737597) 109751969(LOC109751969)
SBI: 110432829
ZMA: 103633227
SITA: 101786401
PDA: 103717625
EGU: 105051262
MUS: 103989848
DCT: 110092071
AOF: 109848458
ATR: 18445684
PPP: 112286221
SCE: YGL050W(TYW3)
ERC: Ecym_7281
NCS: NCAS_0A05860(NCAS0A05860)
NDI: NDAI_0D02870(NDAI0D02870)
TPF: TPHA_0K01950(TPHA0K01950)
TBL: TBLA_0B09900(TBLA0B09900)
TDL: TDEL_0E05640(TDEL0E05640)
KAF: KAFR_0F03080(KAFR0F03080)
CAL: CAALFM_CR03160WA(CaO19.2408)
CAUR: QG37_01946
SLB: AWJ20_2119(TYW3)
NCR: NCU02014
NTE: NEUTE1DRAFT125395(NEUTE1DRAFT_125395)
MGR: MGG_03665
MAW: MAC_06093
MAJ: MAA_09058
CMT: CCM_00960
MBE: MBM_06462
ANI: AN8696.2
ANG: ANI_1_2156104(An12g08400)
ABE: ARB_01988
TVE: TRV_05810
PTE: PTT_12676
TAN: TA11725
TPV: TP02_0179
BBO: BBOV_II007240(18.m06602)
SMIN: v1.2.032250.t1(symbB.v1.2.032250.t1)
MJA: MJ_1510
MMP: MMP0310
MMD: GYY_01590
MAE: Maeo_1057
MVO: Mvol_1232
MKA: MK0048
AFU: AF_2059
FPL: Ferp_0738
GAC: GACE_0352
GAH: GAH_01146
PHO: PH1069(PH1069) PH1887(PH1887)
ABI: Aboo_1247
APE: APE_0816
ACJ: ACAM_0574
SMR: Smar_0446
IHO: Igni_1050
DKA: DKAM_0848
TAG: Tagg_0723
IAG: Igag_0026
HBU: Hbut_0026
SSO: SSO0622
SOL: Ssol_1686
SSOA: SULA_1714
SSOL: SULB_1715
SSOF: SULC_1713
STO: STK_14890
SAI: Saci_1603
SID: M164_1507
SII: LD85_1717
SIH: SiH_1477
SIC: SiL_1388
MSE: Msed_1973
AHO: Ahos_1120
PAI: PAE2913
PIS: Pisl_0308
PCL: Pcal_0351
PAS: Pars_0991
PYR: P186_1609
POG: Pogu_1329
TNE: Tneu_1813
CMA: Cmaq_0720
TUZ: TUZN_0351
TTN: TTX_0700
VDI: Vdis_1927
VMO: VMUT_0339
TPE: Tpen_0125
NEQ: NEQ325
KCR: Kcr_0381
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:16642040]
  Authors
Noma A, Kirino Y, Ikeuchi Y, Suzuki T
  Title
Biosynthesis of wybutosine, a hyper-modified nucleoside in eukaryotic phenylalanine tRNA.
  Journal
EMBO. J. 25 (2006) 2142-54.
  Sequence
[sce:YGL050W]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 2.1.1.282
IUBMB Enzyme Nomenclature: 2.1.1.282
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 2.1.1.282
BRENDA, the Enzyme Database: 2.1.1.282

DBGET integrated database retrieval system