KEGG   ENZYME: 2.1.1.35Help
Entry
EC 2.1.1.35                 Enzyme                                 

Name
tRNA (uracil54-C5)-methyltransferase;
transfer RNA uracil54 5-methyltransferase;
transfer RNA uracil54 methylase;
tRNA uracil54 5-methyltransferase;
m5U54-methyltransferase;
tRNA:m5U54-methyltransferase;
RUMT;
TrmA;
5-methyluridine54 tRNA methyltransferase;
tRNA(uracil-54,C5)-methyltransferase;
Trm2;
tRNA(m5U54)methyltransferase
Class
Transferases;
Transferring one-carbon groups;
Methyltransferases
BRITE hierarchy
Sysname
S-adenosyl-L-methionine:tRNA (uracil54-C5)-methyltransferase
Reaction(IUBMB)
S-adenosyl-L-methionine + uracil54 in tRNA = S-adenosyl-L-homocysteine + 5-methyluracil54 in tRNA [RN:R00594]
Reaction(KEGG)
Substrate
S-adenosyl-L-methionine [CPD:C00019];
uracil54 in tRNA
Product
S-adenosyl-L-homocysteine [CPD:C00021];
5-methyluracil54 in tRNA
Comment
Unlike this enzyme, EC 2.1.1.74 (methylenetetrahydrofolate---tRNA-(uracil54-C5)-methyltransferase (FADH2-oxidizing)), uses 5,10-methylenetetrahydrofolate and FADH2 to supply the atoms for methylation of U54 [4].
History
EC 2.1.1.35 created 1972, modified 2011
Orthology
K00557  
tRNA (uracil-5-)-methyltransferase
K15331  
tRNA (uracil-5-)-methyltransferase
Genes
HSA: 
79979(TRMT2B)
PTR: 
465756(TRMT2B)
PPS: 
100989771(TRMT2B)
GGO: 
101132081(TRMT2B)
PON: 
100171443(TRMT2B)
MCC: 
702087(TRMT2B)
MCF: 
102119229(TRMT2B)
MMU: 
215201(Trmt2b)
CGE: 
TUP: 
102470968(TRMT2B)
CFA: 
100855932(TRMT2B)
AML: 
FCA: 
102901007(TRMT2B)
BTA: 
100336991(TRMT2B)
BOM: 
102286120(TRMT2B)
PHD: 
102330992(TRMT2B)
CHX: 
102185069(TRMT2B)
SSC: 
100517798(TRMT2B)
CFR: 
102515727(TRMT2B)
ECB: 
100057429(TRMT2B)
MYB: 
102250543(TRMT2B)
MYD: 
102770929(TRMT2B)
PALE: 
102884267(TRMT2B)
MDO: 
SHR: 
OAA: 
100082614(TRMT2B)
GGA: 
TGU: 
100231999(TRMT2B)
FAB: 
PHI: 
102111035(TRMT2B)
APLA: 
101802201(TRMT2B)
FPG: 
FCH: 
CLV: 
PSS: 
XTR: 
100495482(trmt2b)
DRE: 
606657(trmt2b)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
API: 
ISC: 
SCE: 
YKR056W(TRM2)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0B08100(NCAS0B08100)
NDI: 
NDAI_0B05410(NDAI0B05410)
TPF: 
TPHA_0A02980(TPHA0A02980)
TBL: 
TBLA_0D05720(TBLA0D05720)
TDL: 
TDEL_0H00960(TDEL0H00960)
KAF: 
KAFR_0G00670(KAFR0G00670)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
LEL: 
CAL: 
CaO19.10837(TRM21) CaO19.3327(TRM21)
CTP: 
CDU: 
COT: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
MGR: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
VAL: 
SSL: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_1208014(AO090026000676)
ANG: 
ANI_1_1256164(An18g03220)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
ZTR: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
PPL: 
LBC: 
CCI: 
SCM: 
UMA: 
MGL: 
PGR: 
TGO: 
PTI: 
TPS: 
ECO: 
b3965(trmA)
ECJ: 
Y75_p3223(trmA)
ECD: 
EBW: 
BWG_3633(trmA)
ECOK: 
ECE: 
Z5526(trmA)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_5036(trmA)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c4928(trmA)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_4639(trmA)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_03850(trmA)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m4322(trmA)
ELL: 
WFL_21080(trmA)
ELC: 
i14_4519(trmA)
ELD: 
i02_4519(trmA)
ELP: 
EBL: 
ECD_03850(trmA)
EBE: 
B21_03799(trmA)
ELF: 
LF82_2304(trmA)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
EFE: 
EFER_3795(trmA)
STY: 
STY3745(trmA)
STT: 
t3496(trmA)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM4129(trmA)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA3967(trmA)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_4237(trmA)
SEC: 
SC4018(trmA)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SeD_A4534(trmA)
SEG: 
SG3287(trmA)
SEL: 
SPUL_3529(trmA)
SEGA: 
SET: 
SEN3923(trmA)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_42060(SBOV42171)
SENE: 
SES: 
SBG: 
SBG_3619(trmA)
SBZ: 
YPE: 
YPO3911(trmA)
YPK: 
y0324(trmA)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_3137(trmA2)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPZ3_3452(trmA)
YPT: 
YPD: 
YPD4_3445(trmA)
YPX: 
YPD8_3447(trmA)
YPH: 
YPC_0304(trmA)
YPS: 
YPTB0124(trmA)
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YEN: 
YE0138(trmA)
YEP: 
YEY: 
SFL: 
SF4047(trmA)
SFX: 
S3697(trmA)
SFV: 
SFV_4038(trmA)
SFE: 
SFxv_4410(trmA)
SSN: 
SSON_4138(trmA)
SSJ: 
SBO: 
SBO_3984(trmA)
SBC: 
SDY: 
SDY_3763(trmA)
SDZ: 
ECA: 
ECA4239(trmA)
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
ETA_01430(trmA)
EPY: 
EpC_01650(trmA)
EPR: 
EAM: 
EAMY_0153(trmA)
EAY: 
EAM_0146(trmA)
EBI: 
EbC_01780(trmA)
ERJ: 
PLU: 
plu4736(trmA)
PAY: 
PAU_04228(trmA)
SGL: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ESC: 
EAS: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
ES15_3718(trmA)
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CTU_02000(trmA)
KPN: 
KPN_04254(trmA)
KPU: 
KP1_0119(trmA)
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPK_5427(trmA)
KPO: 
KPR: 
KPR_0213(trmA)
KPJ: 
KPI: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
CKO: 
CRO: 
ROD_37801(trmA)
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
PMR: 
PMI3245(trmA)
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_3472(trmA)
ETD: 
ETC: 
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
XBO: 
XBJ1_4262(trmA)
XNE: 
XNC1_0277(trmA)
PAM: 
PANA_3835(trmA)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_3053(trmA)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_3124(trmA)
PAO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
EBT: 
MMK: 
ROR: 
EBF: 
HIN: 
HI0848(trmA)
HIT: 
NTHI1014(trmA)
HIP: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HDU: 
HD0723(trmA)
HAP: 
HAPS_1963(trmA2)
HPAZ: 
HPR: 
HSO: 
HS_0306(trmA)
HSM: 
PMU: 
PM1803(trmA)
PMV: 
PUL: 
PMP: 
Pmu_15320(trmA)
MSU: 
MS2367(trmA)
MHT: 
MHQ: 
MHX: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
APL: 
APL_1979(trmA)
APJ: 
APJL_2028(trmA2)
APA: 
ASU: 
ASI: 
AAP: 
AAT: 
AAO: 
AAN: 
GAN: 
BTO: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VVU: 
VV1_1171(trmA)
VVY: 
VVM: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VHA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VFI: 
VF_2436(trmA)
VFM: 
VSA: 
PPR: 
PAE: 
PA4720(trmA)
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PPU: 
PP_4654(trmA)
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
T1E_0828(trmA)
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_07030(trmA)
PPUU: 
PST: 
PSB: 
PSP: 
PFL: 
PFL_5373(trmA)
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFLU5353(trmA)
PFE: 
PFC: 
PPZ: 
PEN: 
PSEEN4780(trmA)
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PST_0919(trmA)
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PBA: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
CJA: 
CJA_2186(trmA)
AVN: 
AVL: 
AVD: 
ACI: 
ACIAD1645(trmA)
ACD: 
ACB: 
ABM: 
ABSDF2113(trmA)
ABY: 
ABAYE2110(trmA)
ABC: 
ABN: 
AB57_1768(trmA)
ABB: 
ABX: 
ABZ: 
ABR: 
ABD: 
ABH: 
ABAD: 
ABJ: 
ABAB: 
ABAJ: 
ABAZ: 
ACC: 
SON: 
SO_0206(trmA)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
SVI_4182(trmA)
ILO: 
IL2273(trmA)
ILI: 
CPS: 
CPS_0336(trmA)
PHA: 
PSHAa0250(trmA)
PAT: 
PSM: 
PSM_A0746(trmA)
SDE: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
GAG: 
GNI: 
GNIT_0826(trmA)
GPS: 
PIN: 
PSY: 
TTU: 
FBL: 
TCX: 
TCY: 
CSA: 
HEL: 
HELO_3050(trmA)
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
AHA: 
AHA_4191(trmA)
AHY: 
ASA: 
ASA_0135(trmA)
AVR: 
TAU: 
OCE: 
DNO: 
DNO_1163(trmA)
SAGA: 
NMA: 
NMA1938(trmA)
NME: 
NMB1679(trmA)
NMP: 
NMH: 
NMC: 
NMC1597(trmA)
NMN: 
NMCC_1592(trmA)
NMT: 
NMV_0691(trmA)
NMI: 
NMO_1498(trmA)
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMAA_1396(trmA)
NMZ: 
NGO: 
NGK: 
NGT: 
NLA: 
NLA_6030(trmA)
EBA: 
ebA595(trmA)
AZO: 
AZA: 
AZKH_0227(trmA)
DAR: 
TMZ: 
DSU: 
HHE: 
HH0693(trmA)
HMS: 
HMU02130(trmA)
WSU: 
WS2094(TRMA)
TDN: 
SUA: 
SKU: 
SULR: 
CJE: 
Cj0831c(trmA)
CJJ: 
CJU: 
C8J_0778(trmA)
CJN: 
CJR: 
CJE0918(trmA)
CJD: 
CFF: 
CCV: 
CHA: 
CCO: 
CLA: 
Cla_0969(trmA)
ABU: 
Abu_2207(trmA)
ABT: 
ABL: 
ANT: 
ARC: 
SDL: 
SBA: 
NSA: 
NIS: 
NIS_0702(trmA)
SUN: 
SUN_1832(trmA)
NAM: 
NAMH_1159(trmA)
LAS: 
LAA: 
BAH: 
BAI: 
BAL: 
BCB: 
BCG: 
BCQ: 
BCQ_0515(trmA)
BTL: 
BALH_0425(trmA)
BSE: 
BCO: 
GTH: 
GWC: 
GYC: 
GYA: 
GCT: 
GMC: 
SPH: 
SPI: 
SPJ: 
SPK: 
SPA: 
SUB: 
LSL: 
LSL_0369(trmA)
CTC: 
MMO: 
MMOB5020(trmA)
AVA: 
DGE: 
TTH: 
TTJ: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:4896260]
  Authors
Bjork GR, Svensson I
  Title
Studies on microbial RNA. Fractionation of tRNA methylases from Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
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  Organism
Saccharomyces cerevisiae
Reference
2  [PMID:6997293]
  Authors
Greenberg R, Dudock B.
  Title
Isolation and chracterization of m5U-methyltransferase from Escherichia coli.
  Journal
J. Biol. Chem. 255 (1980) 8296-302.
  Organism
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3  [PMID:14245404]
  Authors
HURWITZ J, GOLD M, ANDERS M.
  Title
THE ENZYMATIC METHYLATION OF RIBONUCLEIC ACID AND DEOXYRIBONUCLEIC ACID. 3. PURIFICATION OF SOLUBLE RIBONUCLEIC ACID-METHYLATING ENZYMES.
  Journal
J. Biol. Chem. 239 (1964) 3462-73.
  Organism
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4  [PMID:6768721]
  Authors
Delk AS, Nagle DP Jr, Rabinowitz JC.
  Title
Methylenetetrahydrofolate-dependent biosynthesis of ribothymidine in transfer RNA of Streptococcus faecalis. Evidence for reduction of the 1-carbon unit by FADH2.
  Journal
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  Authors
Kealey JT, Gu X, Santi DV.
  Title
Enzymatic mechanism of tRNA (m5U54)methyltransferase.
  Journal
Biochimie. 76 (1994) 1133-42.
  Organism
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6  [PMID:8794745]
  Authors
Gu X, Ivanetich KM, Santi DV.
  Title
Recognition of the T-arm of tRNA by tRNA (m5U54)-methyltransferase is not sequence specific.
  Journal
Biochemistry. 35 (1996) 11652-9.
  Organism
Escherichia coli
Reference
7  [PMID:9417931]
  Authors
Becker HF, Motorin Y, Sissler M, Florentz C, Grosjean H.
  Title
Major identity determinants for enzymatic formation of ribothymidine and pseudouridine in the T psi-loop of yeast tRNAs.
  Journal
J. Mol. Biol. 274 (1997) 505-18.
  Organism
Saccharomyces cerevisiae
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8  [PMID:18653523]
  Authors
Walbott H, Leulliot N, Grosjean H, Golinelli-Pimpaneau B
  Title
The crystal structure of Pyrococcus abyssi tRNA (uracil-54, C5)-methyltransferase provides insights into its tRNA specificity.
  Journal
Nucleic. Acids. Res. 36 (2008) 4929-40.
  Organism
Pyrococcus abyssi
  Sequence
[pab:PAB0719]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
37257-02-6

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