KEGG   ENZYME: 2.4.2.21Help
Entry
EC 2.4.2.21                 Enzyme                                 

Name
nicotinate-nucleotide---dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase;
nicotinate mononucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase;
nicotinate ribonucleotide:benzimidazole (adenine) phosphoribosyltransferase;
nicotinate-nucleotide:dimethylbenzimidazole phospho-D-ribosyltransferase;
CobT;
nicotinate mononucleotide (NaMN):5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase
Class
Transferases;
Glycosyltransferases;
Pentosyltransferases
BRITE hierarchy
Sysname
nicotinate-nucleotide:5,6-dimethylbenzimidazole phospho-D-ribosyltransferase
Reaction(IUBMB)
beta-nicotinate D-ribonucleotide + 5,6-dimethylbenzimidazole = nicotinate + alpha-ribazole 5'-phosphate [RN:R04148]
Reaction(KEGG)
Substrate
beta-nicotinate D-ribonucleotide [CPD:C01185];
5,6-dimethylbenzimidazole [CPD:C03114]
Product
nicotinate [CPD:C00253];
alpha-ribazole 5'-phosphate [CPD:C04778]
Comment
Also acts on benzimidazole, and the clostridial enzyme acts on adenine to form 7-alpha-D-ribosyladenine 5'-phosphate. The product of the reaction, alpha-ribazole 5'-phosphate, forms part of the corrin-biosynthesis pathway and is a substrate for EC 2.7.8.26, adenosylcobinamide-GDP ribazoletransferase [4]. It can also be dephosphorylated to form alpha-ribazole by the action of EC 3.1.3.73, alpha-ribazole phosphatase.
History
EC 2.4.2.21 created 1972
Pathway
Porphyrin and chlorophyll metabolism
Metabolic pathways
Orthology
K00768  
nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase
Genes
RCU: 
ECO: 
b1991(cobT)
ECJ: 
Y75_p1952(cobT)
ECD: 
EBW: 
BWG_1785(cobT)
ECOK: 
ECE: 
Z3151(cobT)
ECS: 
ECs2786(cobT)
ECF: 
ETW: 
ECSP_2656(cobT)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c2477(cobT)
ECP: 
ECP_1989(cobT)
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECSE_2275(cobT)
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_2282(cobT)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
O3O_16010(cobT)
ESM: 
O3M_09580(cobT)
ESL: 
O3K_09615(cobT)
ECL: 
EBR: 
ECB_01900(cobT)
EBD: 
ECBD_1658(cobT)
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m2163(cobT)
ELL: 
WFL_10590(cobT)
ELC: 
i14_2287(cobT)
ELD: 
i02_2287(cobT)
ELP: 
EBL: 
ECD_01900(cobT)
EBE: 
B21_01889(cobT)
ELF: 
LF82_0336(cobT)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
STY: 
STY2219(cobT)
STT: 
t0858(cobT)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM2016(cobT)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA0855(cobT)
SEK: 
SSPA0800(cobT)
SPQ: 
SEI: 
SPC_1699(cobT)
SEC: 
SC2024(cobT)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SeD_A2351(cobT)
SEG: 
SG2040(cobT)
SEL: 
SPUL_0884(cobT)
SEGA: 
SET: 
SEN2014(cobT)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_21010(SBOV20761)
SENE: 
IA1_10060(cobT)
SES: 
SBZ: 
YEN: 
YE2707(cobT)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
SFL: 
SF2059(cobT)
SFX: 
S2169(cobT)
SFV: 
SFV_2063(cobT)
SFE: 
SFxv_2293(cobT)
SSN: 
SSON_2052(cobT)
SSJ: 
SBO: 
SBO_1212(cobT)
SBC: 
SDY: 
SDY_2242(cobT)
SDZ: 
PLU: 
plu2980(cobT)
PAY: 
PAU_01618(cobT)
ESC: 
EAE: 
EAE_23295(cobT)
EAR: 
ENR: 
KPN: 
KPN_02463(cobT) KPN_03182(cobT)
KPU: 
KP1_3667(cobT) KP1_4446(cobT)
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPK_0934(cobT) KPK_1724(cobT)
KPO: 
KPR: 
KPR_1640(cobT) KPR_1853(cobT)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KVA: 
KOX: 
KOX_01340(cobT)
KOE: 
KOY: 
CKO: 
CKO_00822(cobT)
CRO: 
ROD_21011(cobT)
CFD: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_1847(cobT)
ETD: 
ETC: 
XBO: 
XBJ1_0833(cobT)
XNE: 
XNC1_1169(cobT)
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
Q7S_12995(cobT)
EBT: 
MMK: 
ROR: 
EBF: 
XCC: 
XCC3059(cobT)
XCB: 
XC_1099(cobT)
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XCV3315(cobT)
XAC: 
XAC3186(cobT)
XCI: 
XAX: 
XACM_3101(cobT)
XAO: 
XOO: 
XOO1351(cobT)
XOM: 
XOO_1241(cobT)
XOP: 
PXO_01924(cobT)
XOR: 
XFU: 
FAU: 
DJI: 
DJA: 
VCH: 
VC1237(cobT)
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
O3Y_05760(cobT)
VCL: 
VVU: 
VV1_2788(cobT)
VVY: 
VV1474(cobT)
VVM: 
VPA: 
VP1304(cobT)
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VS_1702(cobT)
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
PPR: 
PBPRA1182(cobT)
PAE: 
PA1279(cobU)
PAEV: 
N297_1319(cobT)
PAEI: 
N296_1319(cobT)
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
M802_1316(cobT)
PAEO: 
M801_1318(cobT)
PPU: 
PP_1679(cobT)
PPF: 
Pput_4040(cobT)
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
T1E_3643(cobT)
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_40920(cobT)
PPUU: 
PST: 
PSB: 
Psyr_3674(cobT)
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PFL_4424(cobT)
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFLU4483(cobT)
PFE: 
PFC: 
PPZ: 
PEN: 
PSEEN1385(cobT)
PMY: 
Pmen_1757(cobT)
PMK: 
PSA: 
PST_1299(cobT)
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PBA: 
PBC: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
PKC: 
PKB_1574(cobT)
PCH: 
CJA: 
CJA_2896(cobT)
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PCR: 
PRW: 
PSO: 
ACD: 
ACB: 
ABY: 
ABAYE1993(cobT)
ABC: 
ABN: 
AB57_1885(cobT)
ABB: 
ABX: 
ABZ: 
ABR: 
ABD: 
ABH: 
ABAD: 
ABJ: 
ABAB: 
ABAJ: 
ABAZ: 
ACC: 
SON: 
SO_1035(cobT)
SFR: 
Sfri_0876(cobT)
SAZ: 
Sama_0762(cobT)
SBL: 
Sbal_3364(cobT)
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
Shew_0714(cobT)
SPC: 
SHP: 
SSE: 
Ssed_3734(cobT)
SPL: 
Spea_3380(cobT)
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
Shal_3458(cobT)
SWD: 
Swoo_4084(cobT)
SWP: 
swp_0996(cobT)
SVO: 
SVI_0656(cobT)
CPS: 
PHA: 
PSHAa2999(cobT)
PAT: 
SDE: 
MAQ: 
MHC: 
MARHY0212(cobT)
MBS: 
GAG: 
GPS: 
TTU: 
MCA: 
MCA0463(cobT)
MMT: 
MAH: 
MEJ: 
ALV: 
TVI: 
TMB: 
AEH: 
HHA: 
HHC: 
TKM: 
TNI: 
TVNIR_3487(cobT_[H])
HCH: 
HCH_00964(cobT)
HEL: 
HELO_1815(cobT)
HCS: 
ABO: 
ABO_2378(cobT)
ADI: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
TAU: 
Tola_1662(cobT) Tola_2005(cobT)
OCE: 
SAGA: 
M5M_10525(cobT)
GPB: 
CVI: 
CV_0493(cobT)
LHK: 
LHK_03224(cobT)
PSE: 
RSO: 
RSc2397(cobT)
RSC: 
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPI: 
Rpic_2663(cobT)
RPF: 
RPJ: 
REU: 
REH: 
H16_A2968(cobT)
CNC: 
RME: 
Rmet_2785(cobT)
CTI: 
BMA: 
BMA0688(cobT)
BMV: 
BML: 
BMN: 
BPS: 
BPSL0979(cobT)
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
BPSE: 
BDL_1057(cobT)
BPSM: 
BBQ_2467(cobT)
BPSU: 
BBN_2591(cobT)
BPSD: 
BBX_3001(cobT)
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BTE: 
BTH_I0837(cobT)
BTQ: 
BTQ_855(cobT)
BTJ: 
BTJ_1586(cobT)
BTZ: 
BTL_2855(cobT)
BTD: 
BTI_2848(cobT)
BVI: 
BUR: 
BCN: 
Bcen_1842(cobT)
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCAL2663(cobT)
BAM: 
Bamb_2501(cobT)
BAC: 
BMU: 
Bmul_0841(cobT)
BMJ: 
BCT: 
BXE: 
Bxe_A3499(cobT)
BPH: 
Bphy_2210(cobT)
BPY: 
BGL: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BGD: 
BYI: 
BUK: 
BPX: 
BUO: 
PPK: 
PPNO: 
PRB: 
RFR: 
POL: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
CTES: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
MPT: 
HAR: 
HEAR0954(cobT)
MMS: 
mma_1087(cobT)
HSE: 
LCH: 
RGE: 
RGE_08050(cobT) RGE_15090(cobT)
NII: 
EBA: 
ebA4008(cobT)
AZO: 
azo3560(cobT)
AZA: 
AZKH_0609(cobT_cobU)
DAR: 
Daro_0148(cobT)
TMZ: 
DSU: 
TBD: 
Tbd_2712(cobT)
MFA: 
MMB: 
MEH: 
MEI: 
MEP: 
MPQ_0144(cobT)
APP: 
SMUL: 
SMUL_1547(cobT)
GSU: 
GSU3009(cobT)
GSK: 
GME: 
Gmet_0467(cobT)
GUR: 
Gura_4187(cobT)
GLO: 
Glov_3082(cobT) Glov_3678(cobT)
GBM: 
Gbem_3813(cobT)
GEO: 
Geob_0539(cobT)
GEM: 
GM21_3897(cobT)
GEB: 
PCA: 
Pcar_0486(cobT)
PPD: 
Ppro_2806(cobT)
DVU: 
DVU3279(cobT)
DVL: 
DVM: 
DVG: 
DDE: 
DDS: 
DDN: 
DMA: 
DMR_38030(cobT)
DSA: 
DAS: 
DAF: 
DHY: 
DPI: 
BN4_12799(cobT)
DGG: 
DBA: 
DPS: 
DAK: 
DPR: 
DSF: 
DOL: 
DAL: 
DAT: 
HRM2_06750(cobT1) HRM2_16020(cobT2)
DTO: 
MSD: 
SCL: 
sce4943(cobT1) sce6908(cobT2)
SCU: 
HOH: 
DAO: 
DTI: 
SFU: 
DBR: 
HMR: 
DAV: 
MLO: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
MES: 
PLA: 
SME: 
SMc04214(cobT)
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
SMEG: 
SMEL: 
SMD: 
Smed_1603(cobT)
RHI: 
SFH: 
SFD: 
EAD: 
OV14_3082(cobU)
ATU: 
Atu1890(cobT)
ARA: 
Arad_2733(cobT)
AVI: 
Avi_2018(cobT)
AGR: 
RET: 
REC: 
REL: 
RLE: 
RL2781(cobT)
RLT: 
RLG: 
Rleg_2318(cobT)
RLB: 
RLU: 
RTR: 
RIR: 
RHL: 
LPU83_2193(cobT1)
NGL: 
LCC: 
BME: 
BMEI1099(cobT)
BMI: 
BMZ: 
BMG: 
BMW: 
BMF: 
BAB1_0886(cobT)
BMB: 
BMC: 
BAA: 
BMS: 
BR0867(cobT)
BSI: 
BMT: 
BSV: 
BSF: 
BOV: 
BOV_0859(cobT)
BCS: 
BSK: 
BOL: 
BMR: 
BMI_I864(cobT)
BPP: 
BPI_I903(cobT-1)
BCET: 
BCEE: 
OAN: 
Oant_2360(cobT)
BJA: 
blr3276(cobT)
BJU: 
BRA: 
BRADO4918(cobT)
BBT: 
BBta_3133(cobT)
BRS: 
S23_47280(cobU)
AOL: 
RPA: 
RPA0712(cobT) RPA2094(cobT1)
RPB: 
RPC: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
BHE: 
BH08100(cobT)
BHN: 
BQR: 
BBK: 
BTR: 
Btr_1128(cobT)
BGR: 
Bgr_11220(cobT)
BCD: 
BAUS: 
BVN: 
XAU: 
AZC: 
SNO: 
MEX: 
MEA: 
MDI: 
METDI1054(cobT)
MCH: 
MRD: 
MET: 
MPO: 
MNO: 
BID: 
MSL: 
HDN: 
HDT: 
HMC: 
HNI: 
RVA: 
PHL: 
MSC: 
BN69_0560(cobT)
CCR: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
SIL: 
SPO1423(cobT)
SIT: 
RSP: 
RSP_2428(cobT1)
RSH: 
RSQ: 
RSK: 
RCP: 
JAN: 
Jann_3305(cobT)
RDE: 
RD1_1827(cobT)
RLI: 
PDE: 
PAMI: 
DSH: 
Dshi_0788(cobT)
PSF: 
PGA: 
PGL: 
PGD: 
OAT: 
OAR: 
LMD: 
RED: 
PTP: 
HNE: 
HBA: 
NAR: 
NPP: 
SPHM: 
SJP: 
SCH: 
GOH: 
GBE: 
GBH: 
GBC: 
GBS: 
AMV: 
GDI: 
GDI_0845(cobT)
GDJ: 
GXY: 
GXL: 
APT: 
APW: 
APF: 
APU: 
APG: 
APQ: 
APX: 
APZ: 
APK: 
RRU: 
RRF: 
RCE: 
RC1_2371(cobT)
RPM: 
MAG: 
MGY: 
AZL: 
ALI: 
AZOLI_0359(cobT1)
ABS: 
TMO: 
TMO_3154(cobT)
MGM: 
PGV: 
APB: 
BHA: 
BCG: 
BPF: 
BMQ: 
BMQ_3044(cobT)
BMD: 
BMD_3069(cobT)
BMH: 
BACI: 
GKA: 
GTN: 
GTNG_1683(cobT)
GTH: 
GTE: 
GWC: 
GYC: 
GYA: 
GCT: 
GMC: 
GGH: 
GJF: 
AFL: 
LSP: 
LGY: 
VIR: 
BBE: 
PJD: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPM_1259(cobT)
PPOL: 
PPQ: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PLV: 
PSAB: 
TCO: 
AAC: 
AAD: 
TC41_2055(cobU)
BTS: 
SIV: 
SSA: 
SIP: 
LRE: 
LRF: 
LRU: 
PCE: 
PECL_1386(cobT)
CAC: 
CA_C1372(cobT)
CAE: 
SMB_G1395(cobT)
CAY: 
CEA_G1386(cobT)
CPE: 
CPE1034(cobT)
CPF: 
CPF_1289(cobT)
CPR: 
CPR_1108(cobT)
CTC: 
CTC02290(cobT)
CTET: 
CNO: 
CBK: 
CLL_A2928(cobT)
CBN: 
CbC4_1391(cobT)
CBT: 
CLH_2674(cobT)
CBE: 
Cbei_1262(cobT)
CKL: 
CKL_2908(cobT)
CKR: 
CKR_2578(cobT)
CCE: 
Ccel_0646(cobT)
CLJ: 
CCB: 
CLS: 
CLB: 
CSR: 
CPAS: 
CSB: 
CAH: 
CLT: 
AMT: 
CTH: 
Cthe_1297(cobT)
CTX: 
CCL: 
RUM: 
FPR: 
FPA: 
BFI: 
CLE: 
RHO: 
RIX: 
RIM: 
CCT: 
ROB: 
RTO: 
CPY: 
CSH: 
CAD: 
CDF: 
CDC: 
CDL: 
CDG: 
CST: 
SWO: 
SLP: 
DSY: 
DSY2114(cobT)
DHD: 
DDH: 
DDL: 
DRM: 
DAE: 
DCA: 
DKU: 
DRU: 
DGI: 
PTH: 
PTH_0931(CobT)
DAU: 
TJR: 
SGY: 
DOR: 
DAI: 
DMI: 
DED: 
DEC: 
DRS: 
HMO: 
HM1_2401(cobT)
ERE: 
ERT: 
ERA: 
ELM: 
EAC: 
AWO: 
Awo_c03240(cobT1) Awo_c14620(cobT2)
SAY: 
TPY_1376(cobU)
SAP: 
BPRS: 
CHY: 
CHY_0480(cobT)
TEP: 
TAE: 
MTA: 
ADG: 
TPZ: 
Tph_c05600(cobT1) Tph_c12430(cobT2)
TOC: 
MAS: 
HAS: 
HPK: 
AAR: 
HHL: 
VPR: 
SSG: 
SRI: 
MED: 
MHG: 
PUF: 
MTU: 
Rv2207(cobT)
MTV: 
MTC: 
MT2263(cobT)
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DOI: 
CPI: 
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MOX: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:14253445]
  Authors
FRIEDMANN HC.
  Title
PARTIAL PURIFICATION AND PROPERTIES OF A SINGLE DISPLACEMENT TRANS-N-GLYCOSIDASE.
  Journal
J. Biol. Chem. 240 (1965) 413-8.
Reference
2  [PMID:5780835]
  Authors
Friedmann HC, Fyfe JA.
  Title
Pseudovitamin B 12 biosynthesis. Enzymatic formation of a new adenylic acid, 7-alpha-D-ribofuranosyladenine 5'-phosphate.
  Journal
J. Biol. Chem. 244 (1969) 1667-71.
Reference
3  [PMID:4238408]
  Authors
Fyfe JA, Friedmann HC.
  Title
Vitamin B 12 biosynthesis. Enzyme studies on the formation of the alpha-glycosidic nucleotide precursor.
  Journal
J. Biol. Chem. 244 (1969) 1659-66.
Reference
4  [PMID:1917841]
  Authors
Cameron B, Blanche F, Rouyez MC, Bisch D, Famechon A, Couder M, Cauchois L, Thibaut D, Debussche L, Crouzet J.
  Title
Genetic analysis, nucleotide sequence, and products of two Pseudomonas denitrificans cob genes encoding nicotinate-nucleotide: dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase and cobalamin (5'-phosphate) synthase.
  Journal
J. Bacteriol. 173 (1991) 6066-73.
  Sequence
[up:P29935]
Reference
5  [PMID:11441022]
  Authors
Cheong CG, Escalante-Semerena JC, Rayment I.
  Title
Structural investigation of the biosynthesis of alternative lower ligands for cobamides by nicotinate mononucleotide: 5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase from Salmonella enterica.
  Journal
J. Biol. Chem. 276 (2001) 37612-20.
Reference
6  [PMID:12101181]
  Authors
Cheong CG, Escalante-Semerena JC, Rayment I.
  Title
Capture of a labile substrate by expulsion of water molecules from the active site of nicotinate mononucleotide:5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase (CobT) from Salmonella enterica.
  Journal
J. Biol. Chem. 277 (2002) 41120-7.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
37277-76-2

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