KEGG   ENZYME: 2.5.1.114Help
Entry
EC 2.5.1.114                Enzyme                                 

Name
tRNAPhe (4-demethylwyosine37-C7) aminocarboxypropyltransferase;
TYW2;
tRNA-yW synthesizing enzyme-2;
TRM12 (gene name);
taw2 (gene name)
Class
Transferases;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
BRITE hierarchy
Sysname
S-adenosyl-L-methionine:tRNAPhe (4-demethylwyosine37-C7)-[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]transferase
Reaction(IUBMB)
S-adenosyl-L-methionine + 4-demethylwyosine37 in tRNAPhe = S-methyl-5'-thioadenosine + 7-[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]-4-demethylwyosine37 in tRNAPhe [RN:R10611]
Reaction(KEGG)
Substrate
S-adenosyl-L-methionine [CPD:C00019];
4-demethylwyosine37 in tRNAPhe
Product
S-methyl-5'-thioadenosine [CPD:C00170];
7-[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]-4-demethylwyosine37 in tRNAPhe
Comment
The enzyme, which is found in all eukaryotes and in the majority of Euryarchaeota (but not in the Crenarchaeota), is involved in the hypermodification of the guanine nucleoside at position 37 of tRNA leading to formation of assorted wye bases. This modification is essential for translational reading-frame maintenance. The eukaryotic enzyme is involved in biosynthesis of the tricyclic base wybutosine, which is found only in tRNAPhe.
History
EC 2.5.1.114 created 2013
Orthology
K07055  
tRNA wybutosine-synthesizing protein 2
Genes
HSA: 
55039(TRMT12)
PTR: 
464377(TRMT12)
PPS: 
100979722(TRMT12)
GGO: 
101124627(TRMT12)
PON: 
100447332(TRMT12)
NLE: 
100582652(TRMT12)
MCC: 
705848(TRMT12)
CSAB: 
103237404(TRMT12)
RRO: 
104662794(TRMT12)
CJC: 
100385176(TRMT12)
SBQ: 
101029907(TRMT12)
MMU: 
68260(Trmt12)
RNO: 
314999(Trmt12)
CGE: 
100772520(Trmt12)
NGI: 
103743903(Trmt12)
HGL: 
101715645(Trmt12)
OCU: 
100352397(TRMT12)
TUP: 
102500902(TRMT12)
CFA: 
609411(TRMT12)
AML: 
100468536(TRMT12)
UMR: 
103661618(TRMT12)
FCA: 
101085181(TRMT12)
PTG: 
102970870(TRMT12)
BTA: 
516516(TRMT12)
BOM: 
102277834(TRMT12)
PHD: 
102315090(TRMT12)
CHX: 
102189221(TRMT12)
OAS: 
101106695(TRMT12)
SSC: 
CFR: 
102519623(TRMT12)
BACU: 
103011113(TRMT12)
LVE: 
103086079(TRMT12)
ECB: 
100067346(TRMT12)
MYB: 
106723536(TRMT12)
MYD: 
102770501(TRMT12)
PALE: 
102896712(TRMT12)
LAV: 
100658475(TRMT12)
MDO: 
SHR: 
100926005(TRMT12)
OAA: 
100087951(TRMT12)
GGA: 
422259(TRMT12)
MGP: 
100538997(TRMT12)
CJO: 
107312716(TRMT12)
APLA: 
TGU: 
100226909(TRMT12)
FAB: 
101812632(TRMT12)
PHI: 
102114676(TRMT12)
CCW: 
104691361(TRMT12)
FPG: 
101916683(TRMT12)
FCH: 
102054438(TRMT12)
CLV: 
102096517(TRMT12)
AAM: 
106484769(TRMT12)
ASN: 
102382316(TRMT12)
AMJ: 
102563349(TRMT12)
PSS: 
102456684(TRMT12)
CMY: 
ACS: 
107982969(trmt12)
PBI: 
103062147(TRMT12)
GJA: 
107124532(TRMT12)
XTR: 
100380191(trmt12)
DRE: 
564925(trmt12)
TRU: 
101061055(trmt12)
TNG: 
MZE: 
101477717(trmt12)
OLA: 
101163092(trmt12)
XMA: 
102227936(trmt12)
SASA: 
LCM: 
102350688(TRMT12)
CMK: 
103177199(trmt12)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
SKO: 
PHU: 
DPX: 
ISC: 
CEL: 
CELE_F40F9.10(F40F9.10)
CBR: 
BMY: 
LOA: 
TSP: 
HRO: 
LGI: 
CRG: 
OBI: 
NVE: 
ADF: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
SMO: 
VCN: 
OLU: 
SCE: 
YML005W(TRM12)
AGO: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0G03740(NCAS0G03740)
NDI: 
NDAI_0G00730(NDAI0G00730)
TPF: 
TPHA_0G00810(TPHA0G00810)
TBL: 
TBLA_0B06040(TBLA0B06040)
TDL: 
TDEL_0G02320(TDEL0G02320)
KAF: 
KAFR_0H03230(KAFR0H03230)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NTE: 
NEUTE1DRAFT14617(NEUTE1DRAFT_14617)
SMP: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
FGR: 
FPU: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
VDA: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_492094(AO090120000283)
ANG: 
ANI_1_1248164(An18g03090)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
PBN: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
TML: 
SPO: 
PGR: 
MLR: 
MBR: 
SRE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TGO: 
TPS: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
MJA: 
MFE: 
MVU: 
MFS: 
MIF: 
MJH: 
MIG: 
MMP: 
MMQ: 
MMX: 
MMZ: 
MMD: 
MMAK: 
MMAO: 
MAE: 
MVN: 
MVO: 
MOK: 
MAC: 
MBA: 
MBY: 
MBW: 
MBAR: 
MMA: 
MMAZ: 
MVC: 
MEK: 
MLS: 
METM: 
MEF: 
MEQ: 
MSJ: 
MSZ: 
MSW: 
MTHE: 
MTHR: 
MHOR: 
MBU: 
MMET: 
MMH: 
MEV: 
MZH: 
MPY: 
MHZ: 
MTP: 
MCJ: 
MHI: 
MEM: 
MBG: 
MEMA: 
MPI: 
MBN: 
MFO: 
MPL: 
MPD: 
MEZ: 
RCI: 
MTH: 
MMG: 
METC: 
MST: 
MSI: 
MRU: 
MEB: 
MMIL: 
MEYE: 
MOL: 
MEL: 
MEW: 
METH: 
MFC: 
MFI: 
MFV: 
MKA: 
AFU: 
AFG: 
APO: 
AVE: 
AST: 
FPL: 
GAC: 
GAH: 
HAL: 
HSL: 
OE_4468F(taw2)
HDL: 
HHB: 
Hhub_3706(taw2)
HMA: 
HHI: 
HHN: 
HAB: 
NPH: 
NP_1360A(taw2)
NMO: 
Nmlp_1176(taw2)
HUT: 
HTI: 
HMU: 
HJE: 
HSU: 
HSF: 
HTU: 
NMG: 
HXA: 
NAT: 
NPE: 
NGE: 
HRU: 
NOU: 
SALI: 
HLR: 
TAC: 
TVO: 
TVG1132799(TVG1132799)
PTO: 
FAC: 
TAR: 
MAX: 
MER: 
MEAR: 
MARC: 
PHO: 
PH0793(PH0793)
PAB: 
PFU: 
PFI: 
PYN: 
PYA: 
PYS: 
PYC: 
TKO: 
TON: 
TGA: 
TSI: 
TBA: 
THE: 
THA: 
THM: 
TLT: 
THS: 
TNU: 
TEU: 
TGY: 
THV: 
PPAC: 
ABI: 
ACF: 
SSO: 
SOL: 
SSOA: 
SSOL: 
SSOF: 
STO: 
SAI: 
SACN: 
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SACS: 
SIS: 
SIA: 
SIM: 
SID: 
SIY: 
SIN: 
SII: 
SIH: 
SIR: 
SIC: 
MSE: 
MCN: 
AHO: 
CSU: 
LOKI: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:19717466]
  Authors
Umitsu M, Nishimasu H, Noma A, Suzuki T, Ishitani R, Nureki O
  Title
Structural basis of AdoMet-dependent aminocarboxypropyl transfer reaction catalyzed by tRNA-wybutosine synthesizing enzyme, TYW2.
  Journal
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 106 (2009) 15616-21.
  Sequence
[mja:MJ_1557]
Reference
2  [PMID:22761755]
  Authors
Rodriguez V, Vasudevan S, Noma A, Carlson BA, Green JE, Suzuki T, Chandrasekharappa SC
  Title
Structure-function analysis of human TYW2 enzyme required for the biosynthesis of a highly modified Wybutosine (yW) base in phenylalanine-tRNA.
  Journal
PLoS. One. 7 (2012) e39297.
Reference
3  [PMID:20382657]
  Authors
de Crecy-Lagard V, Brochier-Armanet C, Urbonavicius J, Fernandez B, Phillips G, Lyons B, Noma A, Alvarez S, Droogmans L, Armengaud J, Grosjean H
  Title
Biosynthesis of wyosine derivatives in tRNA: an ancient and highly diverse pathway in Archaea.
  Journal
Mol. Biol. Evol. 27 (2010) 2062-77.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 

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