KEGG   ENZYME: 2.5.1.68Help
Entry
EC 2.5.1.68                 Enzyme                                 

Name
(2Z,6E)-farnesyl diphosphate synthase;
(Z)-farnesyl diphosphate synthase;
Z-farnesyl diphosphate synthase
Class
Transferases;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
BRITE hierarchy
Sysname
geranyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate geranylcistransferase
Reaction(IUBMB)
geranyl diphosphate + isopentenyl diphosphate = diphosphate + (2Z,6E)-farnesyl diphosphate [RN:R08528]
Reaction(KEGG)
Substrate
geranyl diphosphate [CPD:C00341];
isopentenyl diphosphate [CPD:C00129]
Product
diphosphate [CPD:C00013];
(2Z,6E)-farnesyl diphosphate [CPD:C16826]
Comment
Requires Mg2+ or Mn2+ for activity. The product of this reaction is an intermediate in the synthesis of decaprenyl phosphate, which plays a central role in the biosynthesis of most features of the mycobacterial cell wall, including peptidoglycan, linker unit galactan and arabinan. Neryl diphosphate can also act as substrate.
History
EC 2.5.1.68 created 2007, modified 2010
Pathway
Terpenoid backbone biosynthesis
Orthology
K12503  
short-chain Z-isoprenyl diphosphate synthase
Genes
BCJ: 
BCAM2067(uppS)
BCEO: 
I35_5903(uppS)
BCED: 
DM42_5933(uppS)
BDL: 
AK34_3632(uppS)
BCON: 
REL: 
HDT: 
ACR: 
AMV: 
MTU: 
MTV: 
MTC: 
MT1118(uppS-1)
MRA: 
MTF: 
MTB: 
MTK: 
MTZ: 
MTG: 
MTI: 
MTE: 
MTUR: 
MTL: 
MTO: 
MTD: 
MTN: 
MTJ: 
MTUB: 
MTUC: 
MTUE: 
MTX: 
MTUH: 
MTUL: 
MTUT: 
MTUU: 
MTQ: 
MBO: 
MBB: 
MBT: 
MBM: 
MBK: 
MBX: 
MBZ: 
MAF: 
MCE: 
MCQ: 
MCV: 
MCX: 
MCZ: 
MMIC: 
MLE: 
MLB: 
MPA: 
MAO: 
MAVI: 
MAVU: 
MAV: 
MAVD: 
MAVR: 
MAVA: 
MIT: 
MIR: 
MIA: 
MIE: 
MID: 
MYO: 
MSM: 
MSG: 
MSB: 
MSN: 
MSH: 
MSA: 
MUL: 
MUL_0193(uppS)
MVA: 
MGI: 
MSP: 
MAB: 
MABB: 
MMV: 
MAY: 
MABO: 
MABL: 
MAZ: 
MAK: 
MYS: 
MYC: 
MMC: 
MKM: 
MJL: 
MJD: 
MMI: 
MMAR_4380(uppS)
MRH: 
MMM: 
MCB: 
MLI: 
MULP_04595(uppS_1)
MKN: 
MKS: 
MKI: 
MNE: 
MYV: 
MYE: 
MGO: 
MFT: 
MHAD: 
MPHL: 
ASD: 
CGL: 
NCgl0951(Cgl0991)
CGB: 
cg1130(uppS1)
CGU: 
WA5_0951(UppS1)
CGT: 
CGS: 
CGG: 
CGM: 
cgp_1130(uppS1)
CGJ: 
CGQ: 
CGX: 
CEF: 
CDI: 
CDP: 
CD241_0835(uppS1)
CDH: 
CDT: 
CDE: 
CDR: 
CDA: 
CDZ: 
CD31A_0933(uppS1)
CDB: 
CDBH8_0880(uppS1)
CDS: 
CDC7B_0844(uppS1)
CDD: 
CDW: 
CDPW8_0895(uppS1)
CDV: 
CJK: 
jk1467(uppS1)
CUR: 
CUA: 
CAR: 
cauri_0927(uppS1)
CKP: 
CPU: 
CPL: 
CPG: 
Cp316_0751(uppS1)
CPP: 
CPK: 
CPQ: 
CPX: 
CpI19_0724(uppS1)
CPZ: 
COR: 
Cp267_0759(uppS1)
COP: 
Cp31_0731(uppS1)
COD: 
Cp106_0709(uppS1)
COS: 
COI: 
COE: 
Cp258_0730(uppS1)
COU: 
Cp162_0724(uppS1)
CPSE: 
CPSU: 
CPSF: 
CRD: 
CRES_1604(uppS1)
CUL: 
CUC: 
CUE: 
CUN: 
CUS: 
CUQ: 
CUZ: 
CUJ: 
CVA: 
CHN: 
CCN: 
CTER: 
CMD: 
CAZ: 
CFN: 
CCG: 
CVT: 
CGY: 
CGLY_06150(uppS1)
CAX: 
CII: 
CUV: 
COA: 
DR71_505(uppS)
CDO: 
CHM: 
CSX: 
CMQ: 
B840_03885(uppS1)
CKU: 
UL82_08070(uppS1)
CCJ: 
UL81_04280(uppS1)
CMV: 
CEI: 
CTED: 
CUT: 
CLW: 
CDX: 
CDES_04840(uppS1)
NFA: 
NCY: 
NBR: 
NNO: 
RHA: 
RER: 
REY: 
REB: 
ROP: 
ROA: 
REQ: 
RPY: 
RHB: 
RAV: 
GBR: 
GPO: 
GOR: 
GOQ: 
TPR: 
SRT: 
CBQ: 
SCO: 
SCO3858(SCH69.28c)
SMA: 
SAV_3237(uppS1)
SGR: 
SGB: 
SCB: 
SCAB_33671(uppS1)
SSX: 
SVL: 
SCT: 
SCAT_3893(uppS)
SCY: 
SFA: 
SBH: 
SHY: 
SHO: 
SVE: 
SDV: 
BN159_3370(uppS1) BN159_7965(uppS2)
SALB: 
SALS: 
STRP: 
SFI: 
SCI: 
SRC: 
SALU: 
SALL: 
SLV: 
SLIV_18980(uppS2)
SGU: 
SVT: 
STRE: 
SCW: 
SLD: 
SXI: 
STRM: 
STRC: 
SAMB: 
SPRI: 
SCZ: 
SCX: 
SRW: 
STRF: 
KSK: 
KSE_47670(uppS2) KSE_73590(uppS3)
TWH: 
TWS: 
TW440(uppS1)
LXX: 
Lxx16850(uppS)
LXY: 
CMI: 
CMM_2236(uppS2)
CMS: 
CMS2423(uppS)
CMC: 
CMN_02210(uppS2)
CMH: 
MTS: 
MTES_3009(uppS)
MIM: 
MIO: 
MIX: 
RLA: 
RTX: 
RTC: 
CUM: 
MVD: 
FRP: 
ART: 
ARR: 
ARM: 
ARI: 
ARL: 
ARE: 
AAQ: 
ARH: 
ARY: 
ARW: 
AAU: 
AAur_1291(uppS)
ACH: 
APN: 
PSUL: 
AAI: 
AARI_07540(uppS1)
GAR: 
RSA: 
KRH: 
KPL: 
KFV: 
MLU: 
RMU: 
RDN: 
SATK: 
BCV: 
BFA: 
JDE: 
KSE: 
DNI: 
LMOI: 
XCE: 
IVA: 
SKE: 
CFL: 
CFI: 
CGA: 
ICA: 
ARS: 
PAC: 
PAK: 
PAV: 
PAX: 
PAZ: 
PAW: 
PAZ_c05990(uppS1)
PAD: 
PCN: 
PACC: 
PACH: 
PACN: 
PFR: 
PFRE: 
PPC: 
PBO: 
PRA: 
MPH: 
NCA: 
KFL: 
PSIM: 
AER: 
TFU: 
NDA: 
NAL: 
B005_2900(uppS)
TCU: 
SRO: 
FRA: 
FRE: 
FAL: 
FRAAL3564(uppS)
ACE: 
NML: 
GOB: 
BSD: 
MMAR: 
KRA: 
SEN: 
SACE_0919(uppS1)
SVI: 
AMD: 
AMED_8075(uppS)
AMN: 
AMM: 
AMES_7953(uppS)
AMZ: 
B737_7954(uppS)
AOI: 
AJA: 
AJAP_04605(uppS1)
AMQ: 
ALU: 
PDX: 
PSEE: 
PSEH: 
PSEQ: 
PECQ: 
AMI: 
SESP: 
BN6_07920(uppS1)
KAL: 
KPHY: 
STP: 
SAQ: 
MAU: 
MIL: 
VMA: 
AMS: 
ASE: 
ACTN: 
AFS: 
CAI: 
SNA: 
AHE: 
MCU: 
TPY: 
TPYO: 
ASG: 
AMY: 
ACQ: 
AOS: 
ARD: 
TBI: 
DRA: 
DGE: 
DDR: 
DMR: 
DPT: 
DGO: 
DPD: 
DSW: 
DCH: 
DAB: 
TRA: 
TTH: 
TTJ: 
TTS: 
TTL: 
TSC: 
THC: 
TOS: 
TAQ: 
TPAR: 
MRB: 
MRE: 
MSV: 
MOX: 
DAMO_2077(ispU)
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:11152452]
  Authors
Schulbach MC, Mahapatra S, Macchia M, Barontini S, Papi C, Minutolo F, Bertini S, Brennan PJ, Crick DC.
  Title
Purification, enzymatic characterization, and inhibition of the Z-farnesyl diphosphate synthase from Mycobacterium tuberculosis.
  Journal
J. Biol. Chem. 276 (2001) 11624-30.
  Sequence
[mtu:Rv1086]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 

DBGET integrated database retrieval system