KEGG   ENZYME: 2.5.1.99Help
Entry
EC 2.5.1.99                 Enzyme                                 

Name
all-trans-phytoene synthase;
prephytoene-diphosphate synthase (ambiguous);
phytoene synthetase (ambiguous);
PSase (ambiguous);
geranylgeranyl-diphosphate geranylgeranyltransferase (ambiguous);
15-trans-phytoene synthase
Class
Transferases;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
BRITE hierarchy
Sysname
geranylgeranyl-diphosphate:geranylgeranyl-diphosphate geranylgeranyltransferase (all-trans-phytoene forming)
Reaction(IUBMB)
2 geranylgeranyl diphosphate = all-trans-phytoene + 2 diphosphate (overall reaction) [RN:R07916];
(1a) 2 geranylgeranyl diphosphate = diphosphate + prephytoene diphosphate [RN:R02065];
(1b) prephytoene diphosphate = all-trans-phytoene + diphosphate [RN:R07270]
Reaction(KEGG)
Substrate
geranylgeranyl diphosphate [CPD:C00353];
prephytoene diphosphate [CPD:C03427]
Product
all-trans-phytoene [CPD:C05413];
diphosphate [CPD:C00013];
prephytoene diphosphate [CPD:C03427]
Comment
Requires Mn2+ for activity. The enzyme from the bacterium Pantoea agglomerans (previously known as Erwinia herbicola) produces the all-trans isomer of phytoene. cf. EC 2.5.1.32, 15-cis-phytoene synthase.
History
EC 2.5.1.99 created 2012
Pathway
Carotenoid biosynthesis
Metabolic pathways
Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K02291  
15-cis-phytoene/all-trans-phytoene synthase
Genes
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
BRP: 
103846262(PSY) 103851090(BraA.PSY.c) 103856237
BNA: 
106354425(BnaA.PSY.d) 106371962(BnaA.PSY.b) 106386282(BnaC.PSY.e) 106387714(BnaC.PSY.a)
THJ: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GRA: 
GHI: 
EGR: 
GMX: 
PVU: 
VRA: 
VAR: 
CCAJ: 
MTR: 
CAM: 
ADU: 
AIP: 
LJA: 
Lj0g3v0184729.1(Lj0g3v0184729.1) Lj0g3v0184729.2(Lj0g3v0184729.2) Lj0g3v0278879.1(Lj0g3v0278879.1) Lj0g3v0278879.2(Lj0g3v0278879.2) Lj2g3v2507910.1(Lj2g3v2507910.1) Lj2g3v2507910.2(Lj2g3v2507910.2) Lj2g3v2507920.1(Lj2g3v2507920.1)
LANG: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
PXB: 
ZJU: 
CSV: 
CMO: 
103491584(PSY2) 103493000(PSY3) 103501375(PSY)
RCU: 
JCU: 
POP: 
POPTR_0001s04490g(POPTRDRAFT_177947) POPTR_0002s05780g(POPTRDRAFT_754353) POPTR_0003s21300g(POPTRDRAFT_831025) POPTR_0003s21310g POPTR_0005s22740g(POPTRDRAFT_859793) POPTR_0017s02080g
VVI: 
SLY: 
101267734(PSY3) 543964(PSY2) 543988(Psy1)
SPEN: 
SOT: 
CANN: 
NTA: 
INI: 
SIND: 
BVG: 
NNU: 
OSA: 
DOSA: 
Os06t0729000-01(Os06g0729000) Os09t0555500-01(Os09g0555500) Os12t0626400-01(Os12g0626400)
OBR: 
BDI: 
ATS: 
SBI: 
ZMA: 
SITA: 
PDA: 
EGU: 
MUS: 
ATR: 
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
SMIN: 
v1.2.018838.t1(symbB.v1.2.018838.t1)
PTI: 
FCY: 
TPS: 
AAF: 
EHX: 
GTT: 
ESA: 
CSK: 
ES15_0617(crtB)
CSZ: 
CSI: 
CSJ: 
CCON: 
CDM: 
CMJ: 
CUI: 
CMW: 
CTU: 
CTU_35440(crtB)
KCO: 
LAX: 
PSTS: 
EGE: 
PAM: 
PANA_4162(crtB)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_p0122(crtB)
PAQ: 
PVA: 
PAO: 
PANT: 
PANP: 
PAGG: 
PAGC: 
PLU: 
plu4343(crtB)
SNJ: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
DTX: 
DKO: 
LRZ: 
VHA: 
VCA: 
PFV: 
POR: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
ACX: 
MBS: 
MPQ: 
GNI: 
GNIT_0399(crtB)
GPS: 
C427_1922(crtB)
HJA: 
LFA: 
LHA: 
TCY: 
MEJ: 
MEC: 
BLEP: 
NOC: 
NHL: 
NWA: 
ALV: 
TVI: 
TMB: 
MPUR: 
TEE: 
AEH: 
HHA: 
HHC: 
TGR: 
TKM: 
TNI: 
TVNIR_1519(crtB_[H])
TTI: 
TVR: 
SSAL: 
SPIU: 
EBS: 
APRS: 
HNA: 
HAZ: 
WMA: 
PLD: 
PalTV_230(crtB)
PLB: 
PTV_230(crtB)
HAA: 
KUS: 
KMA: 
SDF: 
GBI: 
ENM: 
EBS_1316(crtB)
NMA: 
NME: 
NMP: 
NMH: 
NMC: 
NMN: 
NMT: 
NMV_1261(crtB)
NMI: 
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMAA_0897(crtB)
NMZ: 
NMX: 
NGO: 
NGK: 
NLA: 
NEL: 
NWE: 
SALV: 
KKI: 
CVI: 
CVC: 
LHK: 
PSE: 
NH8B_3078(hpnD)
JEU: 
AQL: 
RSO: 
RSc1652(crtB)
RSC: 
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
RMN: 
RIN: 
REU: 
REH: 
H16_A1466(h16_A1466)
CNC: 
RME: 
CTI: 
CBW: 
CGD: 
CR3_1543(crtB)
CCUP: 
BMA: 
BMV: 
BML: 
BMN: 
BMAL: 
DM55_134(hpnD)
BMAE: 
DM78_1799(hpnD)
BMAQ: 
DM76_114(hpnD)
BMAI: 
BMAF: 
DM51_1186(hpnD)
BMAZ: 
BM44_1867(hpnD)
BMAB: 
BM45_1429(hpnD)
BPS: 
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
GBP346_A2460(hpnD_1)
BPSE: 
BDL_3460(hpnD)
BPSM: 
BBQ_1248(hpnD)
BPSU: 
BBN_1375(hpnD)
BPSD: 
BBX_1861(hpnD)
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BBK_2878(hpnD)
BPSH: 
DR55_2497(hpnD)
BPSA: 
BBU_78(hpnD)
BPSO: 
X996_2087(hpnD)
BUT: 
X994_513(hpnD)
BTE: 
BTQ: 
BTQ_1813(hpnD)
BTJ: 
BTJ_542(hpnD)
BTZ: 
BTL_1781(hpnD)
BTD: 
BTI_1549(hpnD)
BTV: 
BTHA_1935(hpnD)
BTHE: 
BTN_2986(hpnD)
BTHM: 
BTRA_2062(hpnD)
BTHA: 
BTHL: 
BG87_2006(hpnD)
BOK: 
DM82_1640(hpnD)
BOC: 
BG90_3069(hpnD)
BVI: 
BVE: 
AK36_1944(hpnD)
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCEN: 
DM39_1905(hpnD)
BCEW: 
DM40_2589(hpnD)
BCEO: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BMK: 
DM80_3038(hpnD)
BMUL: 
NP80_1999(hpnD)
BCT: 
BCED: 
DM42_3163(hpnD)
BCEP: 
BDL: 
AK34_1187(hpnD)
BPYR: 
BCON: 
BUB: 
BW23_3051(hpnD)
BDF: 
BLAT: 
BTEI: 
BSEM: 
BPSL: 
BMEC: 
BSTG: 
BSTL: 
BGL: 
BGP: 
BGU: 
KS03_2299(hpnD)
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BGD: 
BGO: 
BM43_3730(hpnD)
BYI: 
BUK: 
BUO: 
BUE: 
BUL: 
BW21_1688(hpnD)
BUQ: 
BPLA: 
BUD: 
BXE: 
BXB: 
BPH: 
BRH: 
BPX: 
BPY: 
BFN: 
BCAI: 
PSPW: 
PDQ: 
PPK: 
PPNO: 
PRB: 
PSPU: 
PAPI: 
PVE: 
POX: 
PTX: 
PNR: 
BPE: 
BPC: 
BPER: 
BPET: 
BPEU: 
BPA: 
BPAR: 
BBR: 
BBM: 
BBH: 
BBX: 
BPT: 
Bpet3164(crtB)
BAV: 
BHO: 
D560_2908(hpnD)
BHM: 
D558_2884(hpnD)
BHZ: 
ACR54_01345(crtB_1)
BTRM: 
BBRO: 
BFZ: 
BPDZ: 
AXY: 
AXO: 
AXN: 
AXS: 
AXX: 
ADT: 
AIS: 
TEQ: 
TEA: 
TEG: 
TAS: 
TAT: 
PUT: 
AMIM: 
CDN: 
AFA: 
RFR: 
RSB: 
RAC: 
RHY: 
POL: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
ACRA: 
BSY15_69(hpnD)
ACID: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
DTS: 
DHK: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
VAA: 
CTT: 
CTES: 
CKE: 
CSER: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
CBX: 
OTO: 
LIM: 
LIH: 
HYR: 
HYB: 
HYL: 
DPY: 
CBAA: 
CBAB: 
MPT: 
HAR: 
MMS: 
mma_1528(crtb)
JAG: 
GJA_2381(hpnD)
JAB: 
JAZ: 
JAL: 
HSE: 
HSZ: 
HHT: 
HRB: 
CFU: 
CARE: 
CPRA: 
MNR: 
MASW: 
OFO: 
BRW83_1189(crtB_1)
LCH: 
TIN: 
THI: 
RGE: 
RBN: 
RDP: 
PKT: 
MIU: 
RGU: 
BBAG: 
PBH: 
NMU: 
NLC: 
SHD: 
METR: 
TBD: 
MFA: 
MMB: 
MEH: 
MEI: 
MEP: 
MBAC: 
MBAT: 
MEU: 
SLT: 
GCA: 
SDR: 
SULF: 
EBA: 
DSU: 
RBU: 
DAR: 
AZO: 
azo1883(crtB1) azo1884(crtB2)
AZA: 
AZI: 
TMZ: 
THU: 
TCL: 
APP: 
KCI: 
KCT: 
KBL: 
KBT: 
KDE: 
KGA: 
KON: 
SSDC: 
BEB: 
BEBA: 
AFW: 
MXA: 
MXAN_0896(crtB)
MFU: 
MSD: 
MYM: 
CCX: 
SUR: 
AGE: 
SCL: 
sce0581(crtB)
SCU: 
CCRO: 
SAMY: 
MRM: 
HOH: 
BBA: 
Bd1725(pys)
BBAC: 
MLO: 
MLN: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
MAMO: 
MESO: 
MESW: 
MES: 
HOE: 
AAK: 
PLA: 
SME: 
SMc02055(crtB)
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
SMEG: 
SMEL: 
SMER: 
SMD: 
RHI: 
SFH: 
SFD: 
SIX: 
SAME: 
EAD: 
EAH: 
ATU: 
Atu1560(crtB)
ARA: 
Arad_2139(crtB)
ATF: 
ATA: 
AVI: 
Avi_2656(crtB)
AGR: 
AGC: 
ARO: 
RET: 
REC: 
REL: 
REI: 
REP: 
RLE: 
RLT: 
RLG: 
RLB: 
RLU: 
RTR: 
RIR: 
RHL: 
RGA: 
RHN: 
RPHA: 
RHT: 
NT26_1586(crtB)
RHX: 
NGL: 
NGG: 
LAS: 
LAA: 
LAT: 
LSO: 
LCC: 
LAR: 
lam_971(eRG9)
LAU: 
SHZ: 
BME: 
BMEL: 
BMI: 
BMZ: 
BMW: 
BMEE: 
BMF: 
BMB: 
BMC: 
BAA: 
BABO: 
BABR: 
BABT: 
BABB: 
BABU: 
BABS: 
BABC: 
BMS: 
BSI: 
BSF: 
BSUI: 
BSUP: 
BSUV: 
BSUC: 
BMT: 
BSZ: 
BSV: 
BSW: 
BSG: 
BOV: 
BCS: 
BSK: 
BOL: 
BCAR: 
BCAS: 
BMR: 
BPP: 
BPI_I932(crtB)
BPV: 
BCET: 
BCEE: 
BVL: 
OAN: 
OAH: 
OPS: 
BJA: 
BJU: 
BJP: 
BRA: 
BBT: 
BRS: 
AOL: 
BRC: 
BRAD: 
BIC: 
BRO: 
RPA: 
RPB: 
RPC: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
NWI: 
NHA: 
OCA: 
OCG: 
OCO: 
BOP: 
BOS: 
BVV: 
BHE: 
BHN: 
BHS: 
BQU: 
BQR: 
BBK: 
BTR: 
BT_0850(crtB)
BTX: 
BGR: 
BCD: 
BAUS: 
BVN: 
BANC: 
XAU: 
AZC: 
SNO: 
MEX: 
MEA: 
MDI: 
MCH: 
MRD: 
MET: 
MPO: 
MNO: 
MOR: 
META: 
MAQU: 
BID: 
MSL: 
CHEL: 
CDQ: 
HDN: 
HDT: 
HMC: 
HNI: 
RVA: 
PHL: 
FIL: 
FIY: 
DEQ: 
BVR: 
RHZ: 
MSC: 
MBRY: 
MEY: 
MAAD: 
MMED: 
AUA: 
MCG: 
THD: 
PSIN: 
RBM: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
CHQ: 
PZU: 
PHZ_c1950(crtB)
BSB: 
BRD: 
BNE: 
BRG: 
BRL: 
BVC: 
AEX: 
CBOT: 
RSP: 
RSP_0270(crtB)
RSH: 
RSQ: 
RSK: 
RCP: 
JAN: 
Jann_0142(crtB)
RDE: 
RLI: 
PYE: 
DSH: 
Dshi_3509(crtB)
PSF: 
OAT: 
OAR: 
RED: 
PTP: 
RSU: 
NHU_00229(crtB)
RHM: 
RHC: 
PPHR: 
LAP: 
LAGG: 
SUAM: 
TOM: 
RMM: 
LVS: 
HBA: 
HBC: 
NAR: 
NPP: 
NPN: 
NRE: 
SAL: 
SPHK: 
SPHP: 
SMAG: 
SMAZ: 
STER: 
SGI: 
SPHL: 
SPHQ: 
SWI: 
SPHM: 
STAX: 
SPHI: 
SSAN: 
SMY: 
SPAN: 
SKR: 
SPLM: 
SPLK: 
SJP: 
SCH: 
SSY: 
SLG_31750(crtB)
SYB: 
SBD: 
SPMI: 
SPHB: 
SPHR: 
SINB: 
CIJ: 
SPHG: 
SFLA: 
BLAS: 
ELI: 
ELQ: 
ERY: 
EGN: 
AAY: 
AMX: 
AEP: 
ANH: 
ADO: 
CNA: 
CMAN: 
PNS: 
PORL: 
GBE: 
GBH: 
GBC: 
GBS: 
ACR: 
AMV: 
GDI: 
GDJ: 
GXY: 
GXL: 
KNA: 
KEU: 
APT: 
APW: 
APF: 
APU: 
APG: 
APQ: 
APX: 
APZ: 
APK: 
ASZ: 
ASV: 
AACE: 
APER: 
RGI: 
RRU: 
RRF: 
RCE: 
RPM: 
MAG: 
MGY: 
MAGX: 
MAGN: 
AZL: 
ALI: 
ABS: 
ABQ: 
ABF: 
ATI: 
AHU: 
TMO: 
THAL: 
EFK: 
TXI: 
MAGQ: 
HJO: 
NAO: 
PBR: 
MGM: 
MAI: 
MAN: 
PGV: 
PUB: 
PEL: 
APC: 
APM: 
APB: 
BSU: 
BSU10810(yisP)
BSR: 
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSUT: 
BSUL: 
BSUS: 
BSS: 
BST: 
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSX: 
C663_1104(yisP)
BSP: 
BAY: 
BAQ: 
BYA: 
BAMP: 
BAML: 
BAMA: 
RBAU_1056(yisP)
BAMN: 
BASU_1033(yisP)
BAMB: 
BAMT: 
BAMY: 
BMP: 
BAO: 
BAMF_1165(yisP)
BAZ: 
BQL: 
LL3_01168(yisP)
BXH: 
BQY: 
MUS_1128(yisP)
BAMI: 
BAMC: 
BAMF: 
BAE: 
BATR: 
BVM: 
BPU: 
BPUM: 
BPUS: 
BPF: 
BMQ: 
BMD: 
BMEG: 
BCO: 
BJS: 
BIF: 
BLE: 
BACW: 
BACP: 
BACB: 
BACY: 
BACL: 
BALM: 
BGI: 
BWH: 
BXI: 
BHK: 
OIH: 
AFL: 
AGN: 
HHD: 
HMN: 
VHL: 
FPN: 
SJE: 
BSE: 
SPET: 
ESI: 
EAT: 
EAN: 
EXM: 
EXU: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PBD: 
PAEN: 
PAEQ: 
PAEA: 
PAEE: 
PBV: 
PXL: 
PSWU: 
AAC: 
AAD: 
TC41_2731(crtB) TC41_3165(crtB)
PLN: 
PKU: 
PRT: 
PLL: 
PANA: 
PDG: 
PHC: 
PPLA: 
PFAE: 
JEO: 
SPOR: 
SPOP: 
SURE: 
LPL: 
lp_3263(crtM)
LPJ: 
JDM1_2617(crtM)
LPT: 
LPS: 
LPR: 
LPZ: 
LPB: 
LFE: 
LLE: 
EHR: 
ECAS: 
EMU: 
EDU: 
EGA: 
THL: 
OOE: 
LME: 
LCI: 
LCK_00789(crtM)
LEC: 
LLF: 
LGC: 
AUI: 
AUH: 
CRN: 
CAW: 
MARR: 
JEP: 
JDA: 
ELM: 
ACL: 
ABRA: 
APAL: 
AOC: 
MTU: 
Rv3397c(phyA)
MTV: 
MTC: 
MT3505(crtB)
MRA: 
MRA_3437(phyA)
MTF: 
MTB: 
MTK: 
MTZ: 
MTG: 
MTI: 
MTE: 
MTUR: 
CFBS_3601(phyA)
MTL: 
MTO: 
MTD: 
UDA_3397c(phyA)
MTN: 
MTJ: 
MTUB: 
MTUC: 
MTUE: 
MTX: 
MTUH: 
MTUL: 
MTUT: 
MTUU: 
MTQ: 
MBO: 
Mb3430c(phyA)
MBB: 
BCG_3467c(phyA)
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PAS: 
POG: 
PYW: 
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HAH: 
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:4819767]
  Authors
Gregonis DE, Rilling HC.
  Title
The stereochemistry of trans-phytoene synthesis. Some observations on lycopersene as a carotene precursor and a mechanism for the synthesis of cis- and trans-phytoene.
  Journal
Biochemistry. 13 (1974) 1538-42.
Reference
2  [PMID:12641468]
  Authors
Iwata-Reuyl D, Math SK, Desai SB, Poulter CD.
  Title
Bacterial phytoene synthase: molecular cloning, expression, and characterization of Erwinia herbicola phytoene synthase.
  Journal
Biochemistry. 42 (2003) 3359-65.
  Sequence
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
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