KEGG   ENZYME: 3.1.21.2Help
Entry
EC 3.1.21.2                 Enzyme                                 

Name
deoxyribonuclease IV;
deoxyribonuclease IV (phage-T4-induced) (misleading);
endodeoxyribonuclease IV (phage T4-induced) (misleading);
E. coli endonuclease IV;
endodeoxyribonuclease (misleading);
redoxyendonuclease;
deoxriboendonuclease (misleading);
endonuclease II;
endonuclease IV;
DNA-adenine-transferase;
nfo (gene name)
Class
Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
BRITE hierarchy
Reaction(IUBMB)
Endonucleolytic cleavage of ssDNA at apurinic/apyrimidinic sites to 5'-phosphooligonucleotide end-products
Comment
The enzyme is an apurinic/apyrimidinic (AP) site endonuclease that primes DNA repair synthesis at AP sites. It specifically cleaves the DNA backbone at AP sites and also removes 3' DNA-blocking groups such as 3' phosphates, 3' phosphoglycolates, and 3' alpha,beta-unsaturated aldehydes that arise from oxidative base damage and the activity of combined glycosylase/lyase enzymes. It is also the only known repair enzyme that is able to cleave the DNA backbone 5' of the oxidative lesion alpha-deoxyadenosine. The enzyme has a strong preference for single-stranded DNA.
History
EC 3.1.21.2 created 1972 as EC 3.1.4.30, transferred 1978 to EC 3.1.21.2, modified 2014
Orthology
K01151  deoxyribonuclease IV
K21525  endonuclease I
Genes
ECU: ECU11_1550i
EIN: Eint_111440
EHE: EHEL_111440
ERO: EROM_111440
NCE: NCER_100092
ECO: b2159(nfo)
ECJ: JW2146(nfo)
ECD: ECDH10B_2316(nfo)
EBW: BWG_1941(nfo)
ECOK: ECMDS42_1728(nfo)
ECE: Z3416(nfo)
ECS: ECs3051
ECF: ECH74115_3295(nfo)
ETW: ECSP_3037(nfo)
EOJ: ECO26_3071(nfo)
EOI: ECO111_2876(nfo)
EOH: ECO103_2634(nfo)
ECG: E2348C_2305(nfo)
EOK: G2583_2702(nfo)
ECC: c2694(nfo)
ECP: ECP_2199
ECI: UTI89_C2434(nfo)
ECV: APECO1_4393(yeiH)
ECX: EcHS_A2295(nfo)
ECW: EcE24377A_2456(nfo)
ECM: EcSMS35_2306(nfo)
ECY: ECSE_2427
ECR: ECIAI1_2239(nfo)
ECQ: ECED1_2608(nfo)
ECK: EC55989_2412(nfo)
ECT: ECIAI39_2299(nfo)
EOC: CE10_2531(nfo)
EUM: ECUMN_2495(nfo)
ECZ: ECS88_2308(nfo)
ELO: EC042_2392(nfo)
ELH: ETEC_2294
ESE: ECSF_2041
ESO: O3O_16985
ESM: O3M_08600
ESL: O3K_08650
EBR: ECB_02088(nfo)
EBD: ECBD_1499
EKF: KO11_11835(nfo)
EAB: ECABU_c24900(nfo)
EDJ: ECDH1ME8569_2095(nfo)
EIH: ECOK1_2391(nfo)
ENA: ECNA114_2250(nfo)
ELW: ECW_m2360(nfo)
ELL: WFL_11545(nfo)
ELC: i14_2493(nfo)
ELD: i02_2493(nfo)
EBL: ECD_02088(nfo)
EBE: B21_02047(nfo)
ELF: LF82_1479(nfo)
ECOI: ECOPMV1_02320(nfo)
ECOJ: P423_12145
ECOO: ECRM13514_2921(nfo)
ECOH: ECRM13516_2861(nfo)
ECOS: EC958_2496
EFE: EFER_2244(nfo)
EAL: EAKF1_ch3832c(nfo)
STY: STY2438(nfo)
STT: t0652(nfo)
STM: STM2203(nfo)
SEO: STM14_2720(nfo)
SEY: SL1344_2180(nfo)
SEJ: STMUK_2233(nfo)
SEB: STM474_2294(nfo)
SEF: UMN798_2379(nfo)
SENR: STMDT2_21801(nfo)
SEND: DT104_22631(nfo)
SENI: CY43_11840
SPT: SPA0648(nfo)
SEK: SSPA0609
SEI: SPC_1498(nfo)
SEC: SCH_2219(nfo)
SHB: SU5_02795
SENS: Q786_10935
SED: SeD_A2553
SEG: SG2240(nfo)
SEL: SPUL_0683(nfo)
SEGA: SPUCDC_0684(nfo)
SET: SEN2196(nfo)
SENA: AU38_11100
SENO: AU37_11110
SENV: AU39_11110
SENQ: AU40_12435
SENL: IY59_11405
SEEP: I137_03110
SENB: BN855_22940(nfo)
SENE: IA1_11025
SBG: SBG_2016(nfo)
SBZ: A464_2332
SFL: SF2244(nfo)
SFX: S2373(nfo)
SFV: SFV_2234(nfo)
SFE: SFxv_2477(nfo)
SFN: SFy_3187
SFS: SFyv_3263
SFT: NCTC1_02467(nfo)
SSN: SSON_2215(nfo)
SBO: SBO_2168(nfo)
SBC: SbBS512_E0807(nfo)
SDY: SDY_2107(nfo)
ENC: ECL_03469
EEC: EcWSU1_03074(nfo)
ECLX: LI66_14960
ECLY: LI62_16460
ECLZ: LI64_14395
ESA: ESA_01078
CSK: ES15_1321(nfo)
CTU: CTU_28290(nfo)
KPN: KPN_02597(nfo)
KPU: KP1_3825(nfo)
KPP: A79E_1506
KPE: KPK_1569(nfo)
KPR: KPR_1495(nfo)
KPJ: N559_1657
KPX: PMK1_00084(nfo)
KPNU: LI86_08105
KPNK: BN49_3814(nfo)
KVA: Kvar_1466
KOX: KOX_25785
KOE: A225_4056
EAE: EAE_24010
EAR: CCG29074
CKO: CKO_00625
CRO: ROD_22891(nfo)
CAMA: F384_11530
SECT: A359_01140
EBT: EBL_c13520(nfo)
EBF: D782_1461
PSTS: E05_24050
YPE: YPO1306(nfo)
YPK: y2879(nfo)
YPA: YPA_1023
YPN: YPN_2673
YPM: YP_1286(nfo)
YPG: YpAngola_A1532(nfo)
YPZ: YPZ3_1194(nfo)
YPD: YPD4_1155(nfo)
YPX: YPD8_0990(nfo)
YPH: YPC_2886(nfo)
YPW: CH59_538
YPJ: CH55_1242
YPV: BZ15_2249
YPL: CH46_3824
YPS: YPTB1337(nfo)
YPO: BZ17_1184
YPI: YpsIP31758_2675(nfo)
YPY: YPK_2756
YPB: YPTS_1432
YPQ: DJ40_892
YPU: BZ21_612
YPR: BZ20_643
YPC: BZ23_944
YPF: BZ19_744
YEN: YE1455(nfo)
YEY: Y11_03341
YEW: CH47_872
YET: CH48_195
YEE: YE5303_13041(nfo)
YAL: AT01_1048
YFR: AW19_1771
YIN: CH53_231
YKR: CH54_4015
YRO: CH64_1117
YRU: BD65_768
SPE: Spro_3227
SRL: SOD_c31410(nfo)
SPLY: Q5A_017060(nfo)
SSZ: SCc_623(nfo)
SMAF: D781_2979
SMW: SMWW4_v1c33250(nfo)
SMAR: SM39_2793(nfo)
SMAC: SMDB11_2556(nfo)
SERF: L085_12045
RAA: Q7S_06450
ECA: ECA2726(nfo)
PATR: EV46_13320
PATO: GZ59_18340(nfo)
PCT: PC1_1655
PEC: W5S_1873
SOD: Sant_1417(nfo)
PES: SOPEG_2765(nfo)
DDD: Dda3937_03621(nfo)
DDQ: DDI_1624
ETA: ETA_12770(nfo)
EPY: EpC_13390(nfo)
EPR: EPYR_01427(nfo)
EAM: EAMY_2302(nfo)
EAY: EAM_2220(nfo)
EBI: EbC_29990(nfo)
ERJ: EJP617_33580(nfo)
EGE: EM595_2444(nfo)
BUC: BU137(nfo)
BAP: BUAP5A_135(nfo)
BAU: BUAPTUC7_136(nfo)
BAW: CWU_00880
BAJC: CWS_00720
BUA: CWO_00680
BUP: CWQ_00730
BAK: BAKON_136(nfo)
BUH: BUAMB_125(nfo)
BAPF: BUMPF009_CDS00458(nfo)
BAPG: BUMPG002_CDS00459(nfo)
BAPU: BUMPUSDA_CDS00457(nfo)
BAPW: BUMPW106_CDS00458(nfo)
BAS: BUsg_130(nfo)
BAB: bbp_128(nfo)
BCC: BCc_087(nfo)
BAJ: BCTU_089(nfo)
BAPH: IX46_00715
PAM: PANA_2556(nfo)
PLF: PANA5342_1520(nfo)
PAJ: PAJ_1849(nfo)
PVA: Pvag_2040(nfo)
HHS: HHS_05610
PSTW: DSJ_16400
PLU: plu2857(nfo)
PAY: PAU_01679(nfo)
PMR: PMI0838(nfo)
PMIB: BB2000_0954(nfo)
XBO: XBJ1_2883(nfo)
XBV: XBW1_2513(nfo)
XNE: XNC1_2765(nfo)
XNM: XNC2_2662(nfo)
XDO: XDD1_2525(nfo)
XPO: XPG1_1292(nfo)
PSI: S70_01790
PSX: DR96_3522
PRG: RB151_025890(nfo)
MMK: MU9_2752
ETR: ETAE_1180
ETD: ETAF_1100
ETE: ETEE_3123(nfo)
PSHI: SAMEA2665130_1071(nfo)
HDU: HD_1062(nfo)
HAP: HAPS_1703(nfo)
HPAZ: K756_11470
HPAS: JL26_09995
HPAK: JT17_08335
MHT: D648_8190
MHAT: B824_8860
MHX: MHH_c14220(nfo)
MHAE: F382_12175
MHAM: J450_11140
MHAO: J451_12295
MHAL: N220_04315
MHAQ: WC39_09585
MHAY: VK67_09585
MVI: X808_7780
MVG: X874_7890
APL: APL_0358(nfo)
APJ: APJL_0375(nfo)
APA: APP7_0380(nfo)
BTO: WQG_16200
BTRE: F542_5870
BTRH: F543_7040
BTRA: F544_16600
VCH: VC2360
VCE: Vch1786_I1849(nfo)
VCO: VC0395_A1939(nfo)
VCR: VC395_2475(nfo)
VCM: VCM66_2283(nfo)
VCI: O3Y_11305
VCS: MS6_2094
VVU: VV1_0541
VVY: VV0654
VPA: VP0498
VPB: VPBB_0476
VAG: N646_2652
VSP: VS_0499
VNI: VIBNI_A0292(nfo)
VAN: VAA_03680
VAU: VANGNB10_cI2136c(nfo)
VFI: VF_2114(nfo)
VSA: VSAL_I2552(nfo)
AWD: AWOD_I_2194(nfo)
PPR: PBPRA0557
SLO: Shew_1083
SSE: Ssed_1179
SPL: Spea_1070
SHL: Shal_1118
SWD: Swoo_1274
SWP: swp_3746
SVO: SVI_0978(nfo)
SPSW: Sps_02403
FBL: Fbal_0769
MVS: MVIS_0654(nfo)
TEE: Tel_10030
AEH: Mlg_1735
HHA: Hhal_1668
HAM: HALO2747
HCO: LOKO_01522(nfo)
AHA: AHA_2097
ASA: ASA_2200(nfo)
AVR: B565_1722
AMED: B224_2087
ASR: WL1483_2217(nfo)
ACAV: VI35_10150
TAU: Tola_2991
BCI: BCI_0392(nfo)
BCIB: IM45_880
BCIG: AB162_342(nfo)
OFO: BRW83_1259(nfo)
WSU: WS1754
SUA: Saut_1838
SULR: B649_01115
CFT: CFF04554_1672(nfo)
CFV: CFVI03293_1694(nfo)
CFX: CFV97608_1797(nfo)
CFZ: CSG_18050
CAMP: CFT03427_1622(nfo)
CCV: CCV52592_1487(nfo)
CCOC: CCON33237_0176(nfo)
CAJ: CIG1485E_1567(nfo)
CGRA: CGRAC_1932(nfo)
CURE: CUREO_1519(nfo)
CHYO: CHH_1642(nfo)
CSPF: CSF_1232(nfo)
CPIN: CPIN18020_1577(nfo)
CLX: CLAN_0008(nfo)
ABU: Abu_2221(nfo)
ABT: ABED_2031
ABL: A7H1H_2167(nfo)
ARC: ABLL_2723
SDL: Sdel_0134
SMUL: SMUL_0191(nfo)
SHAL: SHALO_0178
SULJ: SJPD1_0166
NIS: NIS_0286(nfo)
SUN: SUN_2249(nfo)
NAM: NAMH_0905
GSU: GSU0529(nfo)
GSK: KN400_0518(nfo)
GME: Gmet_2994(nfo)
GUR: Gura_3914
GLO: Glov_3584
GBM: Gbem_0356(nfo)
GEO: Geob_1397(nfo)
GEM: GM21_0337
GEB: GM18_0434
PCA: Pcar_3071(nfo)
PPD: Ppro_0453
DES: DSOUD_3153(nfo)
DEU: DBW_3496
DVU: DVU1224(nfo)
DVL: Dvul_1834
DVM: DvMF_0897
DDE: Dde_2402
DMA: DMR_37530(nfo)
DHY: DESAM_21519(nfo)
DAS: Daes_3292
DPI: BN4_12154(nfo)
PPRF: DPRO_1669(nfo)
DBA: Dbac_2857
DRT: Dret_1286
DPS: DP0053
DSF: UWK_01245
DOL: Dole_1880
DML: Dmul_35800(nfo)
DAT: HRM2_34030(nfo)
DTO: TOL2_C00490(nfo)
ADE: Adeh_1050
CCX: COCOR_05073(nfo)
SCL: sce8011(nfo)
SFU: Sfum_0659
DBR: Deba_2003
DPB: BABL1_gene_326(nfo)
BMX: BMS_3385
BJA: blr3667
RPC: RPC_2669
MGM: Mmc1_1936
BSU: BSU25130(yqfS)
BSR: I33_2595
BSL: A7A1_3528
BSH: BSU6051_25130(nfo)
BSUT: BSUB_02690(nfo)
BSUL: BSUA_02690(nfo)
BSUS: Q433_13745
BSS: BSUW23_12455(nfo)
BST: GYO_2777
BSO: BSNT_08954(yqfS)
BSQ: B657_25130(nfo)
BSX: C663_2395(nfo)
BLI: BL03699(nfo)
BLD: BLi02692(nfo)
BLH: BaLi_c27790(nfo)
BAY: RBAM_023440(yqfS)
BAQ: BACAU_2355(yqfS)
BYA: BANAU_2494(yqfS)
BAMP: B938_12105
BAML: BAM5036_2263(nfo)
BAMA: RBAU_2476(nfo)
BAMN: BASU_2266(nfo)
BAMB: BAPNAU_1239(yqfS)
BAMT: AJ82_13250
BAMY: V529_26160(yqfS)
BMP: NG74_02448(nfo)
BAO: BAMF_2411(nvfo)
BAZ: BAMTA208_12895(nvfo)
BQL: LL3_02708(nvfO)
BXH: BAXH7_02633(yqfS)
BQY: MUS_2808(yqfS)
BAMI: KSO_007670
BAMC: U471_24250
BAMF: U722_12730
BATR: TD68_09960
BHA: BH1386
BAN: BA_4508(nfo)
BAR: GBAA_4508(nfo)
BAT: BAS4186
BAH: BAMEG_4546(nfo)
BAI: BAA_4528(nfo)
BANT: A16_45040
BANR: A16R_45610
BANS: BAPAT_4325
BANV: DJ46_3192
BCE: BC4282
BCA: BCE_4364
BCZ: BCE33L4034(nfo)
BCR: BCAH187_A4418(nfo)
BCB: BCB4264_A4402(nfo)
BCU: BCAH820_4306(nfo)
BCG: BCG9842_B0834(nfo)
BCQ: BCQ_4072(nfo)
BCX: BCA_4396(nfo)
BAL: BACI_c42550(nfo)
BNC: BCN_4197
BCF: bcf_21305
BCER: BCK_13750
BTK: BT9727_4024(nfo)
BTL: BALH_3877(nfo)
BTB: BMB171_C3950(nfo)
BTT: HD73_4590
BTHI: BTK_22610
BTC: CT43_CH4301(nfo)
BTM: MC28_3576(nfo)
BTG: BTB_c44280(nfo)
BTI: BTG_27710
BTW: BF38_42
BWW: bwei_0649(yqfS)
BMYC: DJ92_1389
BMYO: BG05_1733
BCL: ABC1698
BPU: BPUM_2246
BPUM: BW16_12160
BPUS: UP12_11395
BMQ: BMQ_4534(nfo)
BMD: BMD_4520(nfo)
BMH: BMWSH_0707(yqfS)
BMEG: BG04_1525
BAG: Bcoa_2792
BCOA: BF29_770
BJS: MY9_2536
BMET: BMMGA3_11850(nfo)
BACW: QR42_11340
BACP: SB24_17020
BACB: OY17_14975
BACO: OXB_2916
BACY: QF06_10750
BACL: BS34A_27540(yqfS)
BALM: BsLM_2470
BEO: BEH_19980
BGY: BGLY_2965(nfo)
BKW: BkAM31D_05495(nfo_1) BkAM31D_06710(nfo_2)
BBEV: BBEV_1241(nfo)
OIH: OB1938(nfo)
GKA: GK2474
GTN: GTNG_2411
GGH: GHH_c25490(nfo)
GEA: GARCT_02456(nfo)
AFL: Aflv_0864
AAMY: GFC30_2669
AXL: AXY_11270(nfo)
LSP: Bsph_3676
HHD: HBHAL_3541(nfo)
VPN: A21D_03210(nfo)
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ExplorEnz - The Enzyme Database: 3.1.21.2
IUBMB Enzyme Nomenclature: 3.1.21.2
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 3.1.21.2
BRENDA, the Enzyme Database: 3.1.21.2
CAS: 63363-78-0

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