KEGG   ENZYME: 3.1.27.9Help
Entry
EC 3.1.27.9                 Enzyme                                 
Name
tRNA-intron endonuclease;
transfer ribonucleate intron endoribonuclease;
tRNA splicing endonuclease;
splicing endonuclease;
tRNATRPintron endonuclease;
transfer splicing endonuclease
Class
Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Endoribonucleases producing 3'-phosphomonoesters
BRITE hierarchy
Reaction(IUBMB)
Endonucleolytic cleavage of pre-tRNA, producing 5'-hydroxy and 2',3'-cyclic phosphate termini, and specifically removing the intron
Comment
The enzyme catalyses the final stage in the maturation of tRNA molecules.
Orthology
K01170  
tRNA-intron endonuclease, archaea type
K15322  
tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2
K15323  
tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34
Genes
HSA: 
79042(TSEN34) 80746(TSEN2)
PTR: 
456281(TSEN34) 460179(TSEN2)
PPS: 
100973820(TSEN2)
PON: 
100441887(TSEN2) 100458036(TSEN34)
MCC: 
693919(TSEN34) 695083(TSEN2)
MMU: 
381802(Tsen2) 66078(Tsen34)
RNO: 
100909510 292534(Tsen34) 312649(Tsen2)
CFA: 
484651(TSEN2) 611457(TSEN34)
AML: 
FCA: 
101095562(TSEN2)
BTA: 
505571(TSEN34) 515511(TSEN2)
SSC: 
100518973 100525362(TSEN2)
ECB: 
100051185(TSEN2) 100052851
MDO: 
100015319
SHR: 
100934412(TSEN2)
OAA: 
100082384 100084471
GGA: 
100859368 415965(TSEN2)
MGP: 
100541113
TGU: 
100225007(TSEN2)
ACS: 
100557220
XLA: 
444131(tsen2)
XTR: 
100380139(tsen34) 496636(tsen2)
DRE: 
565995(tsen34) 767713(tsen2)
TRU: 
101064951
OLA: 
101158936
BFO: 
BRAFLDRAFT_239658 BRAFLDRAFT_88756
CIN: 
100185533 100186340
SPU: 
578976 581891
DME: 
Dmel_CG31812 Dmel_CG33260
DPO: 
Dpse_GA16496 Dpse_GA23655
DAN: 
Dana_GF20864 Dana_GF25183
DER: 
Dere_GG13711 Dere_GG22764
DPE: 
Dper_GL18779
DSE: 
Dsec_GM17198 Dsec_GM24532
DSI: 
Dsim_GD12603 Dsim_GD24075
DWI: 
Dwil_GK10584 Dwil_GK15008
DYA: 
Dyak_GE12758 Dyak_GE20005
DGR: 
Dgri_GH11377 Dgri_GH16791
DMO: 
Dmoj_GI13805 Dmoj_GI18082
DVI: 
Dvir_GJ11671 Dvir_GJ16733
AGA: 
AgaP_AGAP009485 AgaP_AGAP011885
AAG: 
AaeL_AAEL006508 AaeL_AAEL008576
CQU: 
CpipJ_CPIJ002417 CpipJ_CPIJ013589
AME: 
100576272 100576366
NVI: 
100119674(NV11373) 100121189(NV14910)
TCA: 
100142167
API: 
100163505 100568704
PHU: 
Phum_PHUM473000 Phum_PHUM534200
ISC: 
IscW_ISCW013300 IscW_ISCW023352
CEL: 
CELE_K08D10.12(K08D10.12) CELE_Y56A3A.11(Y56A3A.11)
CBR: 
CBG13974
BMY: 
Bm1_23520 Bm1_51080
SMM: 
Smp_033140
NVE: 
NEMVE_v1g108482 NEMVE_v1g134862
HMG: 
100197875
TAD: 
TRIADDRAFT_58307
ATH: 
AT3G45577 AT3G45590(SEN1) AT5G60230(SEN2)
ALY: 
ARALYDRAFT_484942 ARALYDRAFT_685704
GMX: 
100807021 100810335
MTR: 
MTR_7g092500
CSV: 
101217688
RCU: 
RCOM_1398820
POP: 
POPTR_557107
VVI: 
100255233
OSA: 
4341203 4350867
DOSA: 
Os06t0530700-01(Os06g0530700) Os11t0602400-01(Os11g0602400)
ZMA: 
100216584 100282606
PPP: 
PHYPADRAFT_125452
CRE: 
CHLREDRAFT_166960 CHLREDRAFT_172997
OLU: 
OSTLU_26883 OSTLU_92995
OTA: 
Ot07g01010 Ot12g02300
CME: 
CMH233C CMN231C
SCE: 
YAR008W(SEN34) YLR105C(SEN2)
AGO: 
AGOS_AFL012C AGOS_AGR073C
ERC: 
Ecym_4274
KLA: 
KLLA0A08932g KLLA0F19866g
LTH: 
KLTH0E08030g KLTH0G12936g
PPA: 
PAS_chr2-2_0157 PAS_chr2-2_0460
VPO: 
Kpol_1061p40 Kpol_543p52
ZRO: 
ZYRO0D06424g ZYRO0G10340g
CGR: 
CAGL0G00748g CAGL0M11594g
NCS: 
NCAS_0C03440(NCAS0C03440)
NDI: 
NDAI_0G02770(NDAI0G02770)
TPF: 
TPHA_0A01660(TPHA0A01660)
TBL: 
TBLA_0D03980(TBLA0D03980)
TDL: 
TDEL_0F04210(TDEL0F04210)
KAF: 
KAFR_0B02910(KAFR0B02910)
DHA: 
DEHA2C15356g DEHA2E16170g
PIC: 
PICST_31261 PICST_38031
PGU: 
PGUG_01010 PGUG_03205
LEL: 
LELG_00990 LELG_04171
CAL: 
CaO19.10249(SEN2) CaO19.14168(SEN34) CaO19.2735(SEN2) CaO19.6879(SEN34)
CTP: 
CTRG_00252 CTRG_01540 CTRG_01554
CDU: 
CD36_20110 CD36_42500
COT: 
CORT_0E00240
YLI: 
YALI0B07293g YALI0E28600g
CLU: 
CLUG_00033 CLUG_01975
NCR: 
NCU01115 NCU08032
SMP: 
SMAC_03190
PAN: 
PODANSg7322 PODANSg8582 PODANSg8583
TTT: 
THITE_2107870
MTM: 
MYCTH_2301666
MGR: 
MGG_07082
FGR: 
FG04275.1 FG05954.1
NHE: 
NECHADRAFT_63731
VAL: 
VDBG_07643
SSL: 
SS1G_01524 SS1G_08479
BFU: 
BC1G_03174 BC1G_05568
ANI: 
AN0190.2 AN8255.2
NFI: 
NFIA_038100 NFIA_076120
AFM: 
AFUA_5G04010 AFUA_5G11140
AOR: 
AOR_1_1010134(AO090102000604) AOR_1_1306014(AO090026000731)
ANG: 
ANI_1_1532084(An09g06160) ANI_1_292014(An01g02220)
AFV: 
AFLA_006790 AFLA_132310
ACT: 
ACLA_001160 ACLA_014190
PCS: 
Pc21g06030 Pc22g14000
CIM: 
CIMG_00664 CIMG_06639
CPW: 
CPC735_030950 CPC735_056050
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UREG_00662 UREG_03799
ABE: 
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TVE: 
TRV_00338
AJE: 
HCAG_00606
PNO: 
SNOG_08633 SNOG_10957
PTE: 
PTT_15116
ZTR: 
MYCGRDRAFT_46254
TML: 
GSTUM_00009827001 GSTUM_00011690001
SPO: 
SPAPB17E12.07c(sen2) SPBC19C7.07c(sen34)
CNE: 
CNC01760 CNC05820
CNB: 
CNBC1360 CNBC5490
CGI: 
CGB_C8390C
PPL: 
POSPLDRAFT_23519 POSPLDRAFT_23547 POSPLDRAFT_94306 POSPLDRAFT_95717
LBC: 
LACBIDRAFT_294801 LACBIDRAFT_315989
MPR: 
MPER_05692 MPER_06018
CCI: 
CC1G_03911 CC1G_05745
SCM: 
SCHCODRAFT_15250 SCHCODRAFT_81346
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UM00485.1 UM02403.1
MGL: 
MGL_1162 MGL_4187
PGR: 
PGTG_08763
MBR: 
MONBRDRAFT_33176 MONBRDRAFT_33205
NGR: 
NAEGRDRAFT_70083
DDI: 
DDB_G0273343 DDB_G0273777 DDB_G0282855
DPP: 
DICPUDRAFT_147816
EHI: 
EHI_042160(26.t00017) EHI_092410(11.t00018)
EDI: 
EDI_165900 EDI_256930
PFA: 
PF14_0514
PFD: 
PFDG_02256
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PC001224.02.0
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cgd4_1260
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GL50803_90125
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TVAG_096360 TVAG_474080
PIF: 
PITG_04879
MJA: 
MJ_1424
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Mefer_1397
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Metvu_0737
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MFS40622_0629
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MMP: 
MMP1132(endA)
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MmarC5_0452
MMX: 
MmarC6_1535
MMZ: 
MmarC7_0384
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MAE: 
Maeo_1014
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Mvol_0825
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Metok_0545
MAC: 
MA3624(endA)
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Mbar_A0349
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MM_0512
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Mbur_1040
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Mmah_1415
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MTP: 
Mthe_0700
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MCON_2907(endA)
MHI: 
Mhar_1241
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Mhun_1733
MLA: 
Mlab_1368
MEM: 
Memar_0641
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BN140_1711(endA)
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Mpet_2568
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Mboo_0655
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Metfor_2552
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Mpal_0572
MPD: 
MCP_1408(endA)
MEZ: 
Mtc_1791(endA)
RCI: 
RRC215(endA)
MTH: 
MTH250
MMG: 
MTBMA_c07000(endA)
MST: 
Msp_0652(endA)
MSI: 
Msm_0217
MRU: 
mru_1495(endA)
MEL: 
Metbo_0616
MEW: 
MSWAN_1745
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Mfer_1195
MKA: 
MK0341(SEN2_1)
AFU: 
AF0900(endA)
APO: 
Arcpr_1556
AVE: 
Arcve_0201
FPL: 
Ferp_1234
HAL: 
VNG2210G(endA)
HSL: 
OE4102R(endA)
HMA: 
rrnAC2964(endA)
HHI: 
HAH_0224(endA)
HWA: 
HQ1047A(endA)
HWC: 
Hqrw_1053(endA)
NPH: 
NP0444A(endA)
NMO: 
Nmlp_3562(endA)
HLA: 
Hlac_2070
HUT: 
Huta_1669
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Hmuk_0666
HTU: 
Htur_3615
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Nmag_1687
HVO: 
HVO_2952(endA)
HME: 
HFX_2946(endA)
HJE: 
HacjB3_00090
HBO: 
Hbor_03050
HXA: 
Halxa_1143
NAT: 
NJ7G_0061
NPE: 
Natpe_0205
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Natgr_1362
HRU: 
Halru_0150
NOU: 
Natoc_2511
TAC: 
Ta1191
TVO: 
TVN0400
PTO: 
PTO0518
TAR: 
TALC_00029
PHO: 
PH0295
PAB: 
PAB1099(endA)
PFU: 
PF0266
PFI: 
PFC_00385
PYN: 
PNA2_0910
PYA: 
PYCH_13450
PYS: 
Py04_0418
TKO: 
TK2215
TON: 
TON_1417
TGA: 
TGAM_2056(endA)
TSI: 
TSIB_0099
TBA: 
TERMP_00921
THE: 
GQS_08490
THA: 
TAM4_257
THM: 
CL1_1310
ABI: 
Aboo_0572
ACF: 
AciM339_0474
MAX: 
MMALV_00300
APE: 
APE_0685 APE_1646.1(endA)
SMR: 
Smar_0987
SHC: 
Shell_1338 Shell_1474
IHO: 
Igni_0004 Igni_0120
DKA: 
DKAM_0047 DKAM_1212
DMU: 
Desmu_0232 Desmu_1199
DFD: 
Desfe_1315
TAG: 
Tagg_0817
IAG: 
Igag_0060 Igag_1376
THG: 
TCELL_0165 TCELL_0300
HBU: 
Hbut_0045 Hbut_0955
PFM: 
Pyrfu_1299 Pyrfu_1605
SSO: 
SSO0281 SSO0439
SOL: 
Ssol_1256 Ssol_1416
STO: 
ST0358 STS047
SAI: 
Saci_0664 Saci_0858
SACN: 
SacN8_03210 SacN8_04165
SACR: 
SacRon12I_03200 SacRon12I_04155
SIS: 
LS215_1794 LS215_1961
SIA: 
M1425_1666 M1425_1852
SIM: 
M1627_1782 M1627_1939
SID: 
M164_1714 M164_1869
SIY: 
YG5714_1783 YG5714_1938
SIN: 
YN1551_0984 YN1551_1144
SII: 
LD85_1924 LD85_2081
SIH: 
SiH_1641 SiH_1798
SIR: 
SiRe_1563 SiRe_1718
SIC: 
SiL_1554 SiL_1712
MSE: 
Msed_2217 Msed_2266
MCN: 
Mcup_0089 Mcup_2013
AHO: 
Ahos_0689 Ahos_0798
PAI: 
PAE0789 PAE2269
PIS: 
Pisl_0893 Pisl_1079
PCL: 
Pcal_1630 Pcal_2142
PAS: 
Pars_0040 Pars_1819
PYR: 
P186_0538 P186_2267
POG: 
Pogu_0311 Pogu_2450
CMA: 
Cmaq_0348
TNE: 
Tneu_0037 Tneu_1435
TUZ: 
TUZN_1599 TUZN_1944
TTN: 
TTX_1594(endA) TTX_1893
VDI: 
Vdis_0625 Vdis_1417
VMO: 
VMUT_1447 VMUT_2226
TPE: 
Tpen_0311 Tpen_0619
ASC: 
ASAC_0034 ASAC_0215
CLG: 
Calag_1044 Calag_1386
FFO: 
FFONT_0775 FFONT_1149
NMR: 
Nmar_0450 Nmar_1039
NIR: 
NSED_02330 NSED_06115
NKR: 
NKOR_02240 NKOR_05795
CSY: 
CENSYa_1037 CENSYa_1136
NGA: 
Ngar_c17700(endA1) Ngar_c18600(endA2)
NEQ: 
NEQ205
KCR: 
Kcr_1478
HAH: 
Halar_2843
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:3937725]
  Authors
Attardi DG, Margarit I, Tocchini-Valentini GP.
  Title
Structural alterations in mutant precursors of the yeast tRNALeu3 gene which behave as defective substrates for a highly purified splicing endoribonuclease.
  Journal
EMBO. J. 4 (1985) 3289-97.
  Organism
Xenopus laevis [GN:xla]
Reference
2  [PMID:6186398]
  Authors
Peebles CL, Gegenheimer P, Abelson J.
  Title
Precise excision of intervening sequences from precursor tRNAs by a membrane-associated yeast endonuclease.
  Journal
Cell. 32 (1983) 525-36.
  Organism
Saccharomyces cerevisiae [GN:sce]
Reference
3  [PMID:2470486]
  Authors
Thompson LD, Brandon LD, Nieuwlandt DT, Daniels CJ.
  Title
Transfer RNA intron processing in the halophilic archaebacteria.
  Journal
Can. J. Microbiol. 35 (1989) 36-42.
  Organism
Halobacterium volcanii
Reference
4  [PMID:3192521]
  Authors
Thompson LD, Daniels CJ.
  Title
A tRNA(Trp) intron endonuclease from Halobacterium volcanii. Unique substrate recognition properties.
  Journal
J. Biol. Chem. 263 (1988) 17951-9.
  Organism
Halobacterium volcanii
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
117444-13-0
DBGET integrated database retrieval system