KEGG   ENZYME: 3.2.1.172Help
Entry
EC 3.2.1.172                Enzyme                                 

Name
unsaturated rhamnogalacturonyl hydrolase;
YteR;
YesR
Class
Hydrolases;
Glycosylases;
Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
BRITE hierarchy
Sysname
2-O-(4-deoxy-beta-L-threo-hex-4-enopyranuronosyl)-alpha-L-rhamnopyranose hydrolase
Reaction(IUBMB)
2-O-(4-deoxy-beta-L-threo-hex-4-enopyranuronosyl)-alpha-L-rhamnopyranose + H2O = 5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate + L-rhamnopyranose
Substrate
2-O-(4-deoxy-beta-L-threo-hex-4-enopyranuronosyl)-alpha-L-rhamnopyranose;
H2O [CPD:C00001]
Product
5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate [CPD:C04053];
L-rhamnopyranose [CPD:C00507]
Comment
The enzyme is part of the degradation system for rhamnogalacturonan I in Bacillus subtilis strain 168.
History
EC 3.2.1.172 created 2011, modified 2012
Orthology
K15532  
unsaturated rhamnogalacturonyl hydrolase
Genes
PPP: 
PPA: 
DHA: 
CTEN: 
NCR: 
NTE: 
NEUTE1DRAFT91897(NEUTE1DRAFT_91897)
SMP: 
TTT: 
MTM: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
FPU: 
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ELA: 
SSL: 
BFU: 
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ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_300164(AO090001000174)
ANG: 
ANI_1_1288124(An14g02920)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
PNO: 
PTE: 
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SHS: 
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AGABI1DRAFT120228(AGABI1DRAFT_120228)
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AGABI2DRAFT184682(AGABI2DRAFT_184682)
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STY: 
STT: 
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SEM: 
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SEND: 
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SEE: 
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SEG: 
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PANA_0580(yteR)
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PAJ_3721(yteR)
PAQ: 
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Pvag_0903(rhiN)
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PGE: 
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AMB: 
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HELO_2964(rhiN)
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BSU: 
BSU07000(yesR) BSU30120(yteR)
BSR: 
BSL: 
BSH: 
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BSUT: 
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BSS: 
BST: 
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BSN: 
BSQ: 
BSX: 
C663_0727(yesR) C663_2858(yteR)
BSP: 
BLI: 
BL00024(yteR) BL03791(yesR)
BLD: 
BLi01371(yesR) BLi03165(yteR)
BLH: 
BAE: 
BATR: 
BHA: 
BMYC: 
BMYO: 
BCL: 
BPU: 
BPUM_2659(yteR)
BPUM: 
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BIF: 
BACW: 
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BACL: 
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PJD: 
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PPM: 
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PPM_0757(yesR1) PPM_0843(yesR3) PPM_4874(yteR)
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PPOY: 
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PTA: 
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POD: 
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EGA: 
MPS: 
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SMB_G0367(yteR)
CAY: 
CBE: 
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CSS: 
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FPR: 
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bpr_I0233(gh105A) bpr_I2500(gh105B)
CLE: 
RHO: 
RIX: 
RIM: 
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MRO: 
TTA: 
HDL: 
HHI: 
HHN: 
HAB: 
HGI: 
HLR: 
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:16781735]
  Authors
Itoh T, Ochiai A, Mikami B, Hashimoto W, Murata K
  Title
A novel glycoside hydrolase family 105: the structure of family 105 unsaturated rhamnogalacturonyl hydrolase complexed with a disaccharide in comparison with family 88 enzyme complexed with the disaccharide.
  Journal
J. Mol. Biol. 360 (2006) 573-85.
  Sequence
Reference
2  [PMID:15906318]
  Authors
Zhang R, Minh T, Lezondra L, Korolev S, Moy SF, Collart F, Joachimiak A
  Title
1.6 A crystal structure of YteR protein from Bacillus subtilis, a predicted lyase.
  Journal
Proteins. 60 (2005) 561-5.
  Sequence
[bsu:BSU30120]
Reference
3  [PMID:16870154]
  Authors
Itoh T, Ochiai A, Mikami B, Hashimoto W, Murata K
  Title
Structure of unsaturated rhamnogalacturonyl hydrolase complexed with substrate.
  Journal
Biochem. Biophys. Res. Commun. 347 (2006) 1021-9.
  Sequence
[bsu:BSU30120]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 

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