KEGG   ENZYME: 4.1.1.87Help
Entry
EC 4.1.1.87                 Enzyme                                 

Name
malonyl-S-ACP decarboxylase;
malonyl-S-acyl-carrier protein decarboxylase;
MdcD/MdcE;
MdcD,E
Class
Lyases;
Carbon-carbon lyases;
Carboxy-lyases
BRITE hierarchy
Sysname
malonyl-[acyl-carrier-protein] carboxy-lyase
Reaction(IUBMB)
a malonyl-[acyl-carrier protein] + H+ = an acetyl-[acyl-carrier protein] + CO2 [RN:R09482]
Reaction(KEGG)
Substrate
malonyl-[acyl-carrier protein] [CPD:C01209];
H+ [CPD:C00080]
Product
acetyl-[acyl-carrier protein] [CPD:C03939];
CO2 [CPD:C00011]
Comment
This enzyme comprises the beta and gamma subunits of EC 4.1.1.88 (biotin-independent malonate decarboxylase) but is not present in EC 4.1.1.89 (biotin-dependent malonate decarboxylase). It follows on from EC 2.3.1.187, acetyl-S-ACP:malonate ACP transferase, and results in the regeneration of the acetylated form of the acyl-carrier-protein subunit of malonate decarboxylase [5]. The carboxy group is lost with retention of configuration [3].
History
EC 4.1.1.87 created 2008
Orthology
K13932  
malonate decarboxylase beta subunit
K13933  
malonate decarboxylase gamma subunit
Genes
SES: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ECLA: 
ECLC: 
EAS: 
ENR: 
CSI: 
CCON: 
CDM: 
CMJ: 
CUI: 
CMW: 
CTU: 
KPN: 
KPU: 
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPV: 
KPW: 
KPY: 
KPG: 
KPC: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPK_2897(mdcD) KPK_2898(mdcE)
KPO: 
KPR: 
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KPB: 
KPNE: 
KPNU: 
KVA: 
KVD: 
KVQ: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOM: 
EAE: 
EAR: 
CKO: 
CRO: 
ROD_44601(mdcD) ROD_44611(mdcE)
CFD: 
SMAF: 
SERR: 
SFW: 
DDA: 
DDD: 
DZE: 
DDC: 
PVA: 
Pvag_2971(mdcD) Pvag_2972(mdcE)
PAO: 
PANP: 
PAGG: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
EBT: 
ROR: 
RON: 
CNT: 
CEM: 
CED: 
PGE: 
HAV: 
KSA: 
KIN: 
LAX: 
OPO: 
EBF: 
XCC: 
XCC3611(mdcB) XCC3612(mdcC)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XCV0596(mdcD) XCV0597(mdcE)
XAC: 
XAC0562(mdcB) XAC0563(mdcC)
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAX: 
XACM_0553(mdcD) XACM_0554(mdcE)
XAO: 
XTN: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
VEJ: 
PAE: 
PA0211(mdcD) PA0212(mdcE)
PAEV: 
N297_217(mdcD) N297_218(mdcE)
PAEI: 
N296_217(mdcD) N296_218(mdcE)
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PAEB: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
M802_216(mdcD) M802_217(mdcE)
PAEO: 
M801_217(mdcD) M801_218(mdcE)
PMK: 
PRE: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_23650(mdcD) PP4_23660(mdcE)
PPUD: 
PFV: 
PMON: 
PMOT: 
PPJ: 
POR: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PFL_5816(mdcE) PFL_5817(mdcD)
PPRC: 
PPRO: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PFW: 
PFB: 
PFF: 
PPZ: 
PMAN: 
OU5_3877(mdcD) OU5_3878(mdcE)
PTV: 
PSA: 
PST_4116(mdcE) PST_4117(mdcD)
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
PBM: 
PBA: 
PBC: 
PPUU: 
PSV: 
PSK: 
PCH: 
PCZ: 
PCP: 
PSW: 
PPV: 
PSES: 
PSEM: 
PSOS: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
ACX: 
PAR: 
Psyc_1143(mdcC) Psyc_1144(mdcB)
PSO: 
PALI: 
ACB: 
ABY: 
ABAYE2229(mdcE) ABAYE2230(mdcD)
ABC: 
ABN: 
AB57_1657(mdcD) AB57_1658(mdcE)
ABB: 
ABX: 
ABZ: 
ABR: 
ABD: 
ABH: 
ABAD: 
ABJ: 
ABAB: 
ABAJ: 
ABAZ: 
ABK: 
ABAU: 
ABAA: 
ABW: 
ABAL: 
ACC: 
ANO: 
ACD: 
ACI: 
ACIAD1756(mdcD) ACIAD1757(mdcE)
ACW: 
PIN: 
LPN: 
lpg2427(mdcB) lpg2428(mdcC)
LPH: 
LPV_2748(mdcB) LPV_2749(mdcC)
LPO: 
LPO_2617(mdcB) LPO_2618(mdcC)
LPU: 
LPM: 
LP6_2455(mdcB) LP6_2456(mdcC)
LPP: 
LPC: 
LPC_2048(mdcC) LPC_2049(mdcB)
LPA: 
LPE: 
LLO: 
LFA: 
LOK: 
TMC: 
FPP: 
PSE: 
NH8B_2981(mdcB) NH8B_2982(mdcD)
RSC: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
RMN: 
REU: 
CNC: 
CBW: 
BMA: 
BMA3034(mdcC) BMA3035(mdcB)
BMV: 
BML: 
BMN: 
BMAL: 
DM55_2720(mdcD) DM55_2721(mdcE)
BMAE: 
DM78_2263(mdcE) DM78_2264(mdcD)
BMAQ: 
DM76_2704(mdcD) DM76_2705(mdcE)
BMAI: 
BMAF: 
DM51_2638(mdcE) DM51_2639(mdcD)
BMAZ: 
BM44_2488(mdcE) BM44_2489(mdcD)
BMAB: 
BM45_2053(mdcE) BM45_2054(mdcD)
BPS: 
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
BPSE: 
BDL_684(mdcE) BDL_685(mdcD)
BPSM: 
BBQ_2111(mdcE) BBQ_2112(mdcD)
BPSU: 
BBN_2237(mdcE) BBN_2238(mdcD)
BPSD: 
BBX_2625(mdcE) BBX_2626(mdcD)
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BBK_188(mdcE) BBK_189(mdcD)
BPSH: 
DR55_3266(mdcE) DR55_3267(mdcD)
BPSA: 
BBU_861(mdcE) BBU_862(mdcD)
BPSO: 
X996_2873(mdcE) X996_2874(mdcD)
BUT: 
X994_1333(mdcE) X994_1334(mdcD)
BTE: 
BTQ: 
BTQ_1218(mdcD) BTQ_1219(mdcE)
BTJ: 
BTJ_1214(mdcE) BTJ_1215(mdcD)
BTZ: 
BTL_2449(mdcE) BTL_2450(mdcD)
BTD: 
BTI_2498(mdcE) BTI_2499(mdcD)
BTV: 
BTHA_2635(mdcE) BTHA_2636(mdcD)
BTHE: 
BTN_2208(mdcD) BTN_2209(mdcE)
BTHM: 
BTRA_2806(mdcE) BTRA_2807(mdcD)
BTHA: 
BTHL: 
BG87_2697(mdcE) BG87_2698(mdcD)
BOK: 
DM82_773(mdcD) DM82_774(mdcE)
BOC: 
BG90_243(mdcE) BG90_244(mdcD)
BVI: 
BVE: 
AK36_2676(mdcE) AK36_2677(mdcD)
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCEN: 
DM39_1149(mdcD) DM39_1150(mdcE)
BCEW: 
DM40_1925(mdcD) DM40_1926(mdcE)
BCEO: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BMK: 
DM80_380(mdcE) DM80_381(mdcD)
BMUL: 
NP80_1359(mdcD) NP80_1360(mdcE)
BCT: 
BCED: 
DM42_448(mdcE) DM42_449(mdcD)
BDL: 
AK34_1895(mdcE) AK34_1896(mdcD)
BPYR: 
BCON: 
BGL: 
BGP: 
BGU: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BGD: 
BGO: 
BM43_2651(mdcD) BM43_2652(mdcE)
BYI: 
BUK: 
BUO: 
BUE: 
BUL: 
BW21_2514(mdcE) BW21_2515(mdcD)
BUB: 
BW23_467(mdcE) BW23_468(mdcD)
BUQ: 
BPLA: 
BUD: 
BXE: 
BXB: 
DR64_7154(mdcD) DR64_7155(mdcE)
BPH: 
BPX: 
BPY: 
BFN: 
OI25_4299(mdcD) OI25_4300(mdcE)
BCAI: 
PTX: 
AKA: 
AMIM: 
AFA: 
RFR: 
PNA: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
MPT: 
HAR: 
HEAR1471(mdcB) HEAR1472(mdcE)
MMS: 
mma_0106(mdcD1) mma_0107(mdcE1) mma_2560(mdcE2) mma_2561(mdcD2)
JAG: 
GJA_2733(mdcE) GJA_2734(mdcD)
HSE: 
HHT: 
HRB: 
CFU: 
CFU_1710(mdcB) CFU_1711(mdcC)
CARE: 
CPRA: 
MASW: 
LCH: 
RDP: 
AZA: 
AZKH_1587(mdcD) AZKH_1588(mdcB)
DAR: 
BEB: 
DES: 
CCRO: 
BJA: 
bll0267(mdcE) bll0268(mdcD) bll1274(mdcE) bll1275(mdcD)
BJU: 
BJP: 
BRS: 
S23_13490(mdcD) S23_13500(mdcE)
BRC: 
RPC: 
OCA: 
OCG: 
OCO: 
SNO: 
MEX: 
MEA: 
MDI: 
METDI0026(mdcD) METDI0027(mdcE)
MCH: 
MRD: 
MET: 
MPO: 
MNO: 
MOR: 
MOC_0176(mdcD) MOC_0177(mdcE)
META: 
MSL: 
SWI: 
STAX: 
AZL: 
ATI: 
BPF: 
BMQ: 
BMQ_0799(mdcD)
BMD: 
BMD_0800(mdcD)
BMEG: 
BG04_3094(mdcD)
BEO: 
PPOL: 
PTA: 
PAEH: 
PPEO: 
SIV: 
LCR: 
LHI: 
PDM: 
EFC: 
EFAU: 
EFU: 
EFM: 
EFT: 
ECAS: 
EDU: 
EGA: 
CCK: 
MSM: 
MSG: 
MSB: 
MSN: 
MSH: 
CGT: 
CGS: 
CGG: 
CHN: 
CMH: 
GMA: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:8620876]
  Authors
Schmid M, Berg M, Hilbi H, Dimroth P
  Title
Malonate decarboxylase of Klebsiella pneumoniae catalyses the turnover of acetyl and malonyl thioester residues on a coenzyme-A-like prosthetic group.
  Journal
Eur. J. Biochem. 237 (1996) 221-8.
Reference
2  [PMID:10561613]
  Authors
Koo JH, Kim YS
  Title
Functional evaluation of the genes involved in malonate decarboxylation by Acinetobacter calcoaceticus.
  Journal
Eur. J. Biochem. 266 (1999) 683-90.
Reference
3  [PMID:10496981]
  Authors
Handa S, Koo JH, Kim YS, Floss HG
  Title
Stereochemical course of biotin-independent malonate decarboxylase catalysis.
  Journal
Arch. Biochem. Biophys. 370 (1999) 93-6.
Reference
4  [PMID:12619701]
  Authors
Chohnan S, Akagi K, Takamura Y
  Title
Functions of malonate decarboxylase subunits from Pseudomonas putida.
  Journal
Biosci. Biotechnol. Biochem. 67 (2003) 214-7.
Reference
5  [PMID:11902724]
  Authors
Dimroth P, Hilbi H
  Title
Enzymic and genetic basis for bacterial growth on malonate.
  Journal
Mol. Microbiol. 25 (1997) 3-10.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 

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