KEGG   ENZYME: 4.1.3.6Help
Entry
EC 4.1.3.6                  Enzyme                                 

Name
citrate (pro-3S)-lyase;
citrase;
citratase;
citritase;
citridesmolase;
citrate aldolase;
citric aldolase;
citrate lyase;
citrate oxaloacetate-lyase;
citrate oxaloacetate-lyase [(pro-3S)-CH2COO-->acetate]
Class
Lyases;
Carbon-carbon lyases;
Oxo-acid-lyases
BRITE hierarchy
Sysname
citrate oxaloacetate-lyase (forming acetate from the pro-S carboxymethyl group of citrate)
Reaction(IUBMB)
citrate = acetate + oxaloacetate [RN:R00362]
Reaction(KEGG)
Substrate
citrate [CPD:C00158]
Product
acetate [CPD:C00033];
oxaloacetate [CPD:C00036]
Comment
The enzyme can be dissociated into components, two of which are identical with EC 2.8.3.10 (citrate CoA-transferase) and EC 4.1.3.34 (citryl-CoA lyase). EC 3.1.2.16, citrate lyase deacetylase, deacetylates and inactivates the enzyme.
History
EC 4.1.3.6 created 1961
Pathway
Citrate cycle (TCA cycle)
Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K01643  
citrate lyase subunit alpha / citrate CoA-transferase
K01644  
citrate lyase subunit beta / citryl-CoA lyase
K01646  
citrate lyase subunit gamma
Genes
ECO: 
b0615(citF) b0616(citE) b0617(citD)
ECJ: 
Y75_p0604(citF) Y75_p0605(citE) Y75_p0606(citD)
ECD: 
EBW: 
BWG_0488(citF) BWG_0489(citE) BWG_0490(citD)
ECOK: 
ECE: 
Z0759(citF) Z0760(citE) Z0761(citD)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_0669(citF) ECSP_0670(citE) ECSP_0671(citD)
ELX: 
EOJ: 
ECO26_0690(citF) ECO26_0691(citE) ECO26_0692(citD)
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
G2583_0779(citF) G2583_0780(citE) G2583_0781(citD)
ELR: 
ECC: 
c0704(citF) c0706(citE)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
EcHS_A0666(citF) EcHS_A0667(citE) EcHS_A0668(citD)
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECED1_0612(citF) ECED1_0613(citE) ECED1_0614(citD)
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_0614(citF) CE10_0615(citE) CE10_0616(citD)
EUM: 
ECUMN_0708(citF) ECUMN_0709(citE) ECUMN_0710(citD)
ECZ: 
ECS88_0656(citF) ECS88_0657(citE) ECS88_0658(citD)
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_00583(citF) ECB_00584(citE) ECB_00585(citD)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
KO11_20580(citD) KO11_20585(citE) KO11_20590(citF)
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ECOK1_0626(citF) ECOK1_0627(citE) ECOK1_0628(citD)
ENA: 
ELU: 
EUN: 
UMNK88_651(citF) UMNK88_652(citE) UMNK88_653(citD)
ELW: 
ECW_m0670(citF) ECW_m0671(citE) ECW_m0672(citD)
ELL: 
WFL_03330(citF) WFL_03335(citE) WFL_03340(citD)
ELC: 
i14_0675(citF) i14_0676(citE)
ELD: 
i02_0675(citF) i02_0676(citE)
ELP: 
P12B_c0599(citF) P12B_c0600(citE) P12B_c0601(citD)
EBL: 
ECD_00583(citF) ECD_00584(citE) ECD_00585(citD)
EBE: 
B21_00572(citF) B21_00573(citE) B21_00574(citD)
ELF: 
LF82_0308(citD) LF82_0309(citE) LF82_0310(citF)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
EFE: 
EFER_0033(citD) EFER_0034(citE) EFER_0035(citF)
EBT: 
EBL_c06520(citD) EBL_c06530(citE) EBL_c06540(citF)
STY: 
STY0068(citD2) STY0069(citE2) STY0070(citF2) STY0670(citF) STY0671(citE) STY0672(citD)
STT: 
t0061(citD) t0062(citE) t0063(citF) t2244(citD) t2245(citE) t2246(citF)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM0059(citD2) STM0060(citE2) STM0061(citF2) STM0621(citF) STM0622(citE) STM0623(citD) STM3120
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA0060(citD) SPA0061(citE) SPA0062(citF) SPA2111(citD) SPA2112(citE) SPA2113(citF)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_0063(citD2) SPC_0064(citE2) SPC_0065(citF2) SPC_0634(citF) SPC_0635(citE) SPC_0636(citD) SPC_3187
SEC: 
SC0053(citD2) SC0054(citE2) SC0055(citF2) SC0650(citF) SC0651(citE) SC0652(citD) SC3060(cilB)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SeAg_B0066(citD) SeAg_B0067(citE) SeAg_B0068(citF) SeAg_B0661(citF) SeAg_B0662(citE) SeAg_B0663(citD)
SENS: 
SED: 
SeD_A0064(citD) SeD_A0065(citE) SeD_A0066(citF) SeD_A0721(citF) SeD_A0722(citE) SeD_A0723(citD) SeD_A3464
SEG: 
SG0063(citD2) SG0064(citE2) SG0065(citF2) SG0625(citF) SG0626(citE) SG0627(citD) SG3014
SEL: 
SPUL_0063(citD2) SPUL_0065(citF2) SPUL_2341(citD) SPUL_2342(citE) SPUL_2343(citF) SPUL_3123
SEGA: 
SET: 
SEN0060(citD2) SEN0061(citE2) SEN0062(citF2) SEN0590(citF) SEN0591(citE) SEN0592(citD) SEN2963
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_31920(SBOV31801) BN855_600(SBOV00041) BN855_610(SBOV00051) BN855_6140(SBOV05721) BN855_6150(SBOV05731) BN855_6160(SBOV05741) BN855_620(SBOV00061)
SENE: 
SES: 
SBG: 
SBG_0529(citF) SBG_0530(citE) SBG_0531(citD)
SBZ: 
YPE: 
YPK: 
YPA: 
YPM: 
YP_1670(citE2)
YPP: 
YPG: 
YPD: 
YPX: 
YPS: 
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YEN: 
YE2650(citF) YE2651(citE) YE2652(citD)
YEP: 
YEY: 
SFL: 
SF0532(citF) SF0533(citE) SF0534(citD)
SFX: 
S0539(citF) S0540(citE) S0541(citD)
SFV: 
SFV_0568(citF) SFV_0569(citE) SFV_0570(citD)
SFE: 
SFxv_0588(citF) SFxv_0589(citE) SFxv_0590(citD)
SSN: 
SSON_0567(citF) SSON_0568(citE) SSON_0569(citD)
SSJ: 
SBO: 
SBO_0480(citF) SBO_0481(citE) SBO_0482(citD)
SBC: 
ECA: 
ECA2571(citF) ECA2572(citE) ECA2573(citD) ECA4117
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
ESC: 
EEC: 
ENL: 
EAS: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
ES15_0598(citD) ES15_0599(citE) ES15_0600(citF)
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CTU_35630(citF) CTU_35640(citE) CTU_35650(citD)
KPN: 
KPN_00035(citD2) KPN_00036(citE2) KPN_00037(citF2)
KPM: 
KPE: 
KPK_4712(citF) KPK_4713(citE) KPK_4714(citD)
KPO: 
KPJ: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
CKO: 
CRO: 
ROD_06301(citF) ROD_06311(citE) ROD_06321(citD)
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SOD_c30530(citF) SOD_c30540(citE) SOD_c30550(citD)
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SERR: 
SFO: 
PMR: 
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_0224(citF) ETAE_0225(citE) ETAE_0226(citD)
ETD: 
ETC: 
DDA: 
DDC: 
DDD: 
Dda3937_00476(citF_1) Dda3937_04526(citD_2) Dda3937_04527(citE_2) Dda3937_04528(citF_2) Dda3937_04562(citD_1)
DZE: 
PAO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
ROR: 
EBF: 
HIN: 
HI0022(citF) HI0023(citE) HI0024(citD)
HIT: 
NTHI0029(citF) NTHI0030(citE) NTHI0031(citD)
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
R2846_0623(citD) R2846_0624(citE) R2846_0625(citF)
HIZ: 
R2866_0681(citD) R2866_0682(citE) R2866_0683(citF)
HIK: 
HDU: 
HD1241(citD) HD1242(citE) HD1243(citF)
ASU: 
ASI: 
AAP: 
AAT: 
AAO: 
AAN: 
BTO: 
XOR: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VC395_0814(citD) VC395_0815(citE) VC395_0816(citF)
VCM: 
VCM66_0755(citD) VCM66_0756(citE) VCM66_0757(citF)
VCI: 
VCL: 
VPK: 
VEJ: 
PPR: 
VAN: 
LAG: 
PAE: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PPW: 
PPI: 
PPUN: 
PPUU: 
PSB: 
PFL: 
PPRC: 
PFS: 
PFC: 
PMK: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PFV: 
PDR: 
PSK: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PCR: 
PRW: 
PSO: 
MCT: 
PAT: 
GAG: 
CBD: 
CBG: 
CBC: 
LLO: 
MMT: 
MAH: 
MEALZ_3217(mclA1)
FNA: 
FNL: 
CYQ: 
CZA: 
TMB: 
HCH: 
CSA: 
ADI: 
B5T_02014(citE)
KKO: 
OCE: 
RSO: 
RSC: 
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPI: 
RPF: 
REU: 
REH: 
H16_A2635(citE1) H16_B0353(citE2) H16_B0680(citE3) H16_B2113(citE4)
RME: 
CTI: 
CNC: 
BMA: 
BMV: 
BML: 
BMN: 
BPS: 
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPSE: 
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BTE: 
BTD: 
BVI: 
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BCT: 
BXE: 
BPH: 
BPY: 
BGL: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BRH: 
BGD: 
BYI: 
BUK: 
BPX: 
BUO: 
PNU: 
PNE: 
PPK: 
PRB: 
BPE: 
BP1348(citE) BP1861(citE)
BPC: 
BPTD_1334(citE) BPTD_1837(citE)
BPER: 
BN118_1262(citE) BN118_1499(citE) BN118_2005(citE)
BPA: 
BPAR: 
BBR: 
BBM: 
BBH: 
BPT: 
BAV: 
BAV0715(citE)
AXY: 
AXO: 
AXN: 
TEQ: 
TEA: 
TEG: 
TAS: 
TAT: 
PUT: 
AKA: 
RFR: 
POL: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
MPT: 
HAR: 
MMS: 
mma_1503(citE)
HSE: 
CFU: 
CFU_1742(citE)
LCH: 
RGE: 
NEU: 
NET: 
NIT: 
NII: 
NMU: 
EBA: 
ebA6697(citE)
AZO: 
azo1546(citE)
AZA: 
DAR: 
TMZ: 
DSU: 
MMB: 
MEH: 
APP: 
GCA: 
BPRC: 
TDN: 
SUA: 
SKU: 
SULR: 
CCC: 
CCQ: 
ABU: 
ABT: 
ABL: 
ANT: 
ARC: 
SBA: 
NSA: 
NIS: 
NIS_0713(citE)
SUN: 
SUN_0980(citE)
NAM: 
GBM: 
Gbem_3858(citF) Gbem_3859(citE) Gbem_3861(citD)
GEM: 
GEB: 
PPD: 
DPR: 
ADE: 
ACP: 
AFW: 
ANK: 
MFU: 
MSD: 
HOH: 
DTI: 
SFU: 
MLO: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
MES: 
PLA: 
SME: 
SMc03793(citE)
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
SMEG: 
SMEL: 
SMD: 
RHI: 
SFH: 
SFD: 
ATU: 
Atu2788(citE)
ARA: 
Arad_4903(citEch)
AVI: 
Avi_4356(citE)
AGR: 
RET: 
RHE_CH04088(citEch) RHE_PC00060(citEc)
REC: 
REL: 
RLE: 
RLT: 
RLG: 
RTR: 
RIR: 
BME: 
BMI: 
BMZ: 
BMG: 
BMW: 
BMF: 
BMB: 
BMC: 
BAA: 
BMS: 
BSI: 
BMT: 
BSV: 
BOV: 
BCS: 
BSK: 
BMR: 
BPP: 
BCET: 
BCEE: 
OAN: 
BJA: 
BJU: 
BRA: 
BBT: 
BRS: 
RPA: 
RPB: 
RPC: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
NWI: 
NHA: 
OCA: 
OCG: 
OCO: 
AOL: 
XAU: 
AZC: 
SNO: 
MEX: 
MEA: 
MDI: 
MCH: 
MRD: 
MET: 
MPO: 
MNO: 
BID: 
MSL: 
HDN: 
HDT: 
HMC: 
HNI: 
RVA: 
PHL: 
MSC: 
CCR: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
PZU: 
BSB: 
AEX: 
RSQ: 
PDE: 
DSH: 
PSF: 
PSE_0238(citE) PSE_3167(clybl)
OAR: 
MMR: 
HNE: 
HBA: 
ZMO: 
ZMN: 
ZMM: 
ZMB: 
ZMI: 
ZMP: 
NAR: 
NPP: 
SAL: 
SWI: 
SPHM: 
SJP: 
SCH: 
SSY: 
ELI: 
ACR: 
AMV: 
RRU: 
RRF: 
RCE: 
RC1_3930(citE)
RPM: 
MAG: 
MGY: 
AZL: 
AZL_008940(citE) AZL_a08480(citF) AZL_a08490(citE) AZL_a08500(citD)
ALI: 
ABS: 
TMO: 
MGM: 
PGV: 
APB: 
BACI: 
PPY: 
PTA: 
LLA: 
L0039(citD) L0040(citE) L0041(citF)
SPY: 
SPy_1186(citD) SPy_1188(citE) SPy_1189(citF)
SPZ: 
SPYM: 
SPM: 
SPG: 
SpyM3_0832(citD) SpyM3_0833(citE) SpyM3_0834(citF)
SPS: 
SPH: 
SPI: 
SPF: 
SpyM50890(citF) SpyM50891(citE) SpyM50892(citD)
SPA: 
SPB: 
STG: 
SOZ: 
Spy49_0934(citD) Spy49_0936(citE) Spy49_0937(citF)
STZ: 
STX: 
SPYA: 
A20_0942(citD) A20_0943(citE) A20_0944(citF)
SPYH: 
SMU: 
SMU_1019(cilG) SMU_1020(cilB) SMU_1021(cilA)
SMC: 
SMJ: 
SMUT: 
SEQ: 
SEZ: 
Sez_0994(citD) Sez_0995(citE) Sez_0996(citF)
SEZO: 
SEU: 
SUB: 
SUB1586(citF) SUB1589(citD)
SDS: 
SDEG_0985(citF) SDEG_0986(citE) SDEG_0987(citD)
SDG: 
SDC: 
SDSE_1014(citF) SDSE_1015(citE) SDSE_1016(citD)
STK: 
SIK: 
LPL: 
lp_1107(citD) lp_1108(citE) lp_1109(citF)
LPJ: 
JDM1_0913(citD) JDM1_0914(citE) JDM1_0915(citF)
LPT: 
zj316_1138(citD) zj316_1139(citE) zj316_1140(citF)
LPS: 
LPST_C0887(citD) LPST_C0888(citE) LPST_C0889(citF)
LPR: 
LBP_cg0857(citD) LBP_cg0858(citE) LBP_cg0859(citF)
LPZ: 
LAC: 
LBA0915(citD) LBA0916(citE) LBA0917(citF)
LAD: 
LSA: 
LSA1224(citF) LSA1225(citE) LSA1226(citD)
LCA: 
LCB: 
LCZ: 
LCS: 
LCE: 
LCW: 
LCL: 
LRU: 
LRT: 
LRR: 
LHE: 
LHL: 
LHR: 
LHV: 
LFF: 
LRH: 
LGG_01914(citF) LGG_01915(citE) LGG_01916(citD)
LRG: 
LRL: 
LRA: 
LRO: 
LRC: 
LCR: 
LKE: 
WANG_0745(citF) WANG_0746(citE) WANG_0747(citD)
LSN: 
LSA_12980(citF) LSA_12990(citE) LSA_13000(citD)
LPI: 
PCE: 
PECL_254(citD) PECL_255(citE) PECL_256(citF)
EFA: 
EF3319(citF) EF3320(citE) EF3321(citD)
EFL: 
EF62_0378(citF) EF62_0379(citE) EF62_0380(citD)
EFI: 
EFD: 
EFS: 
EFS1_2719(citF) EFS1_2720(citE) EFS1_2721(citD)
EFAU: 
EFM: 
ENE: 
ECAS: 
EMU: 
EMQU_1783(citF) EMQU_1784(citE) EMQU_1785(citD)
MPS: 
MPX: 
THL: 
TEH_07970(citD) TEH_07980(citE) TEH_07990(citF)
OOE: 
LCI: 
LCK_00108(citD) LCK_00109(citE) LCK_00110(cilA)
LKI: 
LGS: 
LEGAS_0214(citD) LEGAS_0215(citE) LEGAS_0216(citF)
LGE: 
CPE: 
CPE1147(cilG) CPE1148(cilB) CPE1149(cilA)
CPR: 
CPR_1163(citD) CPR_1164(citE) CPR_1165(citF)
CTC: 
CTET: 
CLJ: 
CSO: 
CSR: 
Cspa_c37390(citF1) Cspa_c37400(citE2) Cspa_c37410(citD1) Cspa_c44180(citF2) Cspa_c44190(citE3) Cspa_c44200(citD2)
CSB: 
CAH: 
AMT: 
DSY: 
DHD: 
DDH: 
DDL: 
DKU: 
DGI: 
PTH: 
PTH_1335(CitE)
SGY: 
DOR: 
DAI: 
DMI: 
DED: 
DEC: 
DRS: 
FPR: 
BPRM: 
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TEP: 
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Acin_0571(citF) Acin_0572(citE) Acin_0573(citD)
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ERH_0751(citD) ERH_0752(citE) ERH_0753(citF)
ERS: 
MGZ: 
MSY: 
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MTF: 
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MSA: 
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MUL_3451(citE_2) MUL_3776(citE) MUL_4021(citE_1)
MVA: 
MGI: 
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MAB: 
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MMV: 
MYCMA_0723(mcl1) MYCMA_2431(citE) MYCMA_2601(citE)
MMC: 
MKM: 
MJL: 
MJD: 
JDM601_1203(citE_1) JDM601_1407(citE) JDM601_2343(citE_1)
MMI: 
MMAR_1583(citE_2) MMAR_3845(citE) MMAR_4158(citE_1)
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MMM: 
MCB: 
MLI: 
MULP_01718(citE_2) MULP_04091(citE) MULP_04326(citE_1)
MKN: 
MNE: 
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NCgl0828(Cgl0862)
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cg0985(citE)
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WA5_0828(CitE)
CGT: 
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CDH: 
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CDR: 
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CDS: 
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CJK: 
jk1547(citE)
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CPU: 
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CPZ: 
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CRES_1676(citE)
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CVAR_2088(citE)
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RHA: 
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GOR: 
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SRT: 
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SCO2033(SC4G6.02) SCO6471(SC9C7.07c) SCP1.302 SCP1.52c
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SAV_1913(citE2) SAV_6181(citE1)
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AMED_0078(citE) AMED_7131(citE)
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B737_0076(citE) B737_7022(citE)
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AORI_0067(citE) AORI_4917(citE)
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TREPR_1286(citD_2) TREPR_1287 TREPR_1288(citF_2) TREPR_3314(citD_1) TREPR_3315(citE) TREPR_3316(citF_1)
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VNG0627G(citE)
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SIM: 
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VDI: 
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NMR: 
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CSY: 
NGA: 
HAH: 
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:13239657]
  Authors
DAGLEY S, DAWES EA.
  Title
Citridesmolase: its properties and mode of action.
  Journal
Biochim. Biophys. Acta. 17 (1955) 177-84.
  Organism
Escherichia coli [GN:eco], Aerobacter aerogenes
Reference
2  [PMID:336371]
  Authors
Dimroth P, Loyal R, Eggerer H.
  Title
Characterization of the isolated transferase subunit of citrate lyase as a CoA-Transferase. Evidence against a covalent enzyme-substrate intermediate.
  Journal
Eur. J. Biochem. 80 (1977) 479-88.
  Organism
Klebsiella aerogenes
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9012-83-3

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