KEGG   ENZYME: 4.1.99.3Help
Entry
EC 4.1.99.3                 Enzyme                                 

Name
deoxyribodipyrimidine photo-lyase;
photoreactivating enzyme;
DNA photolyase;
DNA-photoreactivating enzyme;
DNA cyclobutane dipyrimidine photolyase;
DNA photolyase;
deoxyribonucleic photolyase;
deoxyribodipyrimidine photolyase;
photolyase;
PRE;
PhrB photolyase;
deoxyribonucleic cyclobutane dipyrimidine photolyase;
phr A photolyase;
dipyrimidine photolyase (photosensitive);
deoxyribonucleate pyrimidine dimer lyase (photosensitive)
Class
Lyases;
Carbon-carbon lyases;
Other carbon-carbon lyases
BRITE hierarchy
Sysname
deoxyribocyclobutadipyrimidine pyrimidine-lyase
Reaction(IUBMB)
cyclobutadipyrimidine (in DNA) = 2 pyrimidine residues (in DNA) [RN:R00034]
Reaction(KEGG)
Substrate
cyclobutadipyrimidine (in DNA) [CPD:C03103]
Product
pyrimidine residues (in DNA)
Comment
A flavoprotein (FAD), containing a second chromophore group. The enzyme catalyses the reactivation by light of irradiated DNA. A similar reactivation of irradiated RNA is probably due to a separate enzyme.
History
EC 4.1.99.3 created 1972
Orthology
K01669  
deoxyribodipyrimidine photo-lyase
Genes
MDO: 
554181(POPC1)
SHR: 
GGA: 
MGP: 
TGU: 
FAB: 
PHI: 
APLA: 
FPG: 
FCH: 
CLV: 
ASN: 
AMJ: 
PSS: 
CMY: 
ACS: 
PBI: 
XLA: 
403387(cry-dash) 733427(phr)
XTR: 
DRE: 
394039(phr) 402986(cry-dash)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
BFO: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
551610(phr)
NVI: 
BMOR: 
API: 
BMY: 
LOA: 
TSP: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
AQU: 
ATH: 
AT1G12370(PHR1) AT5G24850(CRY3)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os06t0661800-01(Os06g0661800) Os10t0167600-01(Os10g0167600)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_10g026420(SORBIDRAFT_10g026420)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00025p00168820(AMTR_s00025p00168820) s00041p00085460(AMTR_s00041p00085460)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YOR386W(PHR1)
KLA: 
LTH: 
ZRO: 
TDL: 
TDEL_0A00180(TDEL0A00180)
KAF: 
KAFR_0C04870(KAFR0C04870)
DHA: 
PGU: 
CTEN: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_1104134(AO090102000015)
ANG: 
ANI_1_1276184(An04g08590)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
ABE: 
TVE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
NPA: 
TML: 
TMS: 
PPL: 
DSQ: 
SHS: 
PCO: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT38863(AGABI1DRAFT_38863)
ABV: 
AGABI2DRAFT184735(AGABI2DRAFT_184735)
CPUT: 
SLA: 
UMA: 
PFP: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
NCE: 
MBR: 
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TGO: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
ECO: 
b0708(phr)
ECJ: 
ECD: 
EBW: 
ECOK: 
ECE: 
Z0859(phrB)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c0787(phrB)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_00668(phrB)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ELL: 
ELC: 
i14_0758(phrB)
ELD: 
i02_0758(phrB)
ELP: 
EBL: 
ECD_00668(phrB)
EBE: 
ELF: 
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
STY: 
STY0749(phrB)
STT: 
t2167(phrB)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM0709(phrB)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA2032(phrB)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_0719(phrB)
SEC: 
SC0728(phrB)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG0705(phrB)
SEL: 
SPUL_2253(phrB)
SEGA: 
SET: 
SEN0672(phrB)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_6970(SBOV06561)
SENE: 
SES: 
SBG: 
SBG_0602(phrB)
SBZ: 
YPE: 
YPO2695(phrB)
YPK: 
y1270(phrB)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_2499(phrB)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPZ3_2376(phrB)
YPT: 
YPD: 
YPD4_2336(phrB)
YPX: 
YPD8_2355(phrB)
YPH: 
YPS: 
YPTB2913(phrB)
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YEN: 
YE2957(phr)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YSI: 
SFL: 
SF0589(phrB)
SFX: 
S0602(phrB)
SFV: 
SFV_0627(phrB)
SFE: 
SSN: 
SSON_0657(phrB)
SSJ: 
SBO: 
SBO_0567(phrB)
SBC: 
SDY: 
SDY_0643(phrB)
SDZ: 
ECA: 
ECA1349(phrB)
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
ETA_23180(phrB)
EPY: 
EpC_24520(phrB)
EPR: 
EAY: 
EAM_1160(phrB)
EBI: 
EbC_12840(phrB)
ERJ: 
BUC: 
BU300(phrB)
BAP: 
BAU: 
BAW: 
BAJC: 
BUA: 
BUP: 
BAK: 
BUH: 
BAPF: 
BAPG: 
BAPU: 
BAPW: 
BAB: 
bbp278(phrB)
WBR: 
WGLp182(phrB)
WGL: 
SGL: 
SOD: 
Sant_2780(phrB)
PES: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
ES15_2719(phrB)
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CTU_13170(phrB)
KPN: 
KPN_00719(phrB)
KPU: 
KP1_1672(phrB)
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPK_3850(phrB)
KPO: 
KPI: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
CRO: 
ROD_07071(phrB)
CFD: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SERR: 
SFO: 
PMR: 
PMI3229(phrB)
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETD: 
ETC: 
HDE: 
HDEF_1277(phrB)
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
PAM: 
PANA_1160(phrB)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_0480(phrB)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_0534(phrB)
PAO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
MMK: 
ROR: 
EBF: 
PSTS: 
XCC: 
XCC1435(phr)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XAC: 
XAC1478(phr)
XCI: 
XAX: 
XAO: 
XOO: 
XOO1526(phr)
XOM: 
XOP: 
XOR: 
XAL: 
XALc_1139(phrB)
XFU: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
PSU: 
PSD: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VFI: 
VFM: 
VSA: 
PAE: 
PA4660(phr)
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
PPU: 
PP_0739(phrB)
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_45400(phrB)
PPUU: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PFL_5147(phrB)
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFLU0750(phrB)
PFE: 
PFC: 
PPZ: 
PEN: 
PSEEN0881(phrB)
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PST_1964(phrB)
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSH: 
PBA: 
PBC: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
PKC: 
PKB_0866(phrB)
CJA: 
CJA_1942(phrB)
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PAR: 
Psyc_0430(phrB)
PCR: 
PRW: 
PSO: 
ACI: 
ACIAD1182(phrB)
ACD: 
ACB: 
ABY: 
ABAYE0975(phrB)
ABC: 
ABN: 
ABB: 
ABX: 
ABZ: 
ABR: 
ABD: 
ABH: 
ABAD: 
ABJ: 
ABAB: 
ABAJ: 
ABAZ: 
ACC: 
SON: 
SO_3384(phrB)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SWD: 
ILO: 
IL0122(phrB_2) IL1388(phrB_1)
ILI: 
CPS: 
CPS_1380(phrB)
PHA: 
PAT: 
PSM: 
SDE: 
MAQ: 
MHC: 
MARHY0266(phr) MARHY0885(phrB) MARHY3043(phr)
MAD: 
MBS: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
GAG: 
GNI: 
GNIT_1871(phrB) GNIT_1872(phrB) GNIT_1873(phrB)
GPS: 
PIN: 
TTU: 
FBL: 
CBU: 
CBU_1176(phrB)
CBD: 
CBG: 
CbuG_0835(phrB)
CBC: 
CbuK_1040(phrB)
LPN: 
lpg0212(phrB)
LPH: 
LPO: 
LPU: 
LPM: 
LP6_0214(phrB)
LPF: 
LPP: 
LPC: 
LPC_0287(phrB)
LPA: 
LPE: 
LLO: 
MMT: 
MAH: 
FTU: 
FTF: 
FTW: 
FTW_1173(phrB1) FTW_1339(phrB2)
FTR: 
FTT: 
FTG: 
FTL: 
FTS: 
FTO: 
FTM: 
FTN: 
FCF: 
FCN: 
FPH: 
FRT: 
FNA: 
FNL: 
TCX: 
TCY: 
MEJ: 
MEC: 
CYQ: 
CZA: 
NHL: 
TVI: 
TMB: 
AEH: 
HHA: 
HHC: 
TGR: 
TKM: 
TNI: 
TVNIR_2392(phr_[H])
SSAL: 
SPIU: 
HNA: 
HCH: 
HCH_00062(phrB1) HCH_01735(phrB2)
CSA: 
HEL: 
HELO_1271(phrB)
ABO: 
ABO_0766(phrB)
ADI: 
B5T_00105(phrB)
KKO: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
AHA: 
AHA_1101(phrB)
AHY: 
AHD: 
ASA: 
ASA_3230(phrB)
AVR: 
AMED: 
TAU: 
OCE: 
ACU: 
SAGA: 
NMA: 
NMP: 
NMH: 
NMC: 
NMC1892(phr)
NMN: 
NMT: 
NMI: 
NMO_1749(phrB)
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMZ: 
NGO: 
NGK: 
NGT: 
NLA: 
CVI: 
CV_3481(phrB)
LHK: 
LHK_02646(phrB)
PSE: 
RSC: 
RSN: 
RSE: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
REU: 
REH: 
H16_A1679(h16_A1679)
CNC: 
RME: 
CTI: 
BMA: 
BMA0636(phrB)
BMV: 
BML: 
BMN: 
BPS: 
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
BPSE: 
BPSM: 
BPSU: 
BPSD: 
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BTE: 
BTQ: 
BTJ: 
BTZ: 
BTD: 
BVI: 
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BCT: 
BXE: 
BPH: 
BPY: 
BGL: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BRH: 
BGD: 
BYI: 
BUK: 
BPX: 
BUO: 
PNU: 
PNE: 
PPK: 
PPNO: 
PRB: 
BAV: 
BHO: 
AXY: 
AXO: 
AXN: 
AKA: 
CDN: 
RFR: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
Rta_34120(phrB)
CBX: 
MPT: 
HAR: 
MMS: 
mma_2951(phrB)
JAG: 
GJA_772(phrB)
HSE: 
CFU: 
CFU_0798(phrB)
LCH: 
TIN: 
THI: 
RGE: 
NIT: 
AZO: 
azo3458(phrB)
AZA: 
AZKH_3839(phrB)
DAR: 
TMZ: 
DSU: 
MFA: 
MMB: 
MEH: 
MEI: 
MEP: 
APP: 
GCA: 
SSDC: 
BPRC: 
WSU: 
TDN: 
SKU: 
SULR: 
ABU: 
Abu_0834(phrB)
ABT: 
ABL: 
ANT: 
ARC: 
SDL: 
SBA: 
SMUL: 
SMUL_1368(phrB)
GSU: 
GSK: 
GLO: 
PCA: 
PPD: 
DVU: 
DVL: 
DVM: 
DVG: 
DDE: 
DMA: 
DSA: 
DAS: 
DAF: 
DPI: 
DGG: 
DBA: 
DRT: 
BBA: 
Bd2206(phr)
BBAT: 
BBW: 
BBAC: 
BEX: 
BMX: 
DPS: 
DPR: 
DSF: 
DAL: 
DAT: 
ADE: 
ACP: 
AFW: 
ANK: 
MXA: 
MXAN_4136(phrB)
MFU: 
MSD: 
CCX: 
SUR: 
SCL: 
sce6412(phr)
SCU: 
HOH: 
SAT: 
DAO: 
SFU: 
DBR: 
RBE: 
RBE_0106(phrB)
RBO: 
RAM: 
OTT: 
OTT_1542(phrB)
NRI: 
NRI_0805(phrB)
MLO: 
PLA: 
ATU: 
AVI: 
AGR: 
REC: 
RLE: 
RL1985(phr)
RLT: 
RLG: 
RLU: 
RTR: 
RIR: 
LAS: 
LAA: 
LSO: 
LAR: 
lam_858(phrB)
OAN: 
BJA: 
BJU: 
BRA: 
BBT: 
BRS: 
AOL: 
RPA: 
RPB: 
RPC: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
OCA: 
OCG: 
OCO: 
XAU: 
AZC: 
SNO: 
MEX: 
MEA: 
MDI: 
MCH: 
MRD: 
MET: 
MPO: 
MSL: 
HDN: 
HMC: 
RVA: 
PHL: 
MSC: 
CCR: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
PZU: 
BSB: 
AEX: 
SIL: 
SPO1917(phrB)
SIT: 
RSP: 
RSH: 
RSQ: 
RSK: 
RCP: 
JAN: 
RDE: 
RLI: 
DSH: 
KVU: 
EIO_1612(phrB)
KVL: 
KVU_1083(phrB)
PSF: 
PGA: 
PGL: 
PGD: 
OAT: 
OAR: 
LMD: 
RED: 
MMR: 
HNE: 
HBA: 
ZMO: 
ZMN: 
ZMM: 
ZMI: 
ZMR: 
NAR: 
NPP: 
SAL: 
SJP: 
SCH: 
SSY: 
ELI: 
GOX: 
GOH: 
ACR: 
AMV: 
GDI: 
GDI_0751(phrB)
GDJ: 
GXY: 
GXL: 
APT: 
APW: 
APF: 
APU: 
APG: 
APQ: 
APX: 
APZ: 
APK: 
RRU: 
RRF: 
RCE: 
RPM: 
MGY: 
AZL: 
ALI: 
ABS: 
TMO: 
PBR: 
MGM: 
MAI: 
MAN: 
PGV: 
PUB: 
PEL: 
APC: 
APM: 
APB: 
BSUB: 
BAN: 
BAR: 
BAT: 
BAH: 
BAI: 
BAX: 
BANT: 
BANR: 
BANS: 
BAL: 
BCE: 
BCA: 
BCR: 
BCB: 
BCU: 
BCG: 
BCQ: 
BCQ_2975(phrB)
BCX: 
BNC: 
BCF: 
BCER: 
BTK: 
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BTC: 
BTF: 
BTM: 
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BPUM_1378(phrB)
BPUM: 
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lwe0555(phrB)
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A20_1270c(phrA)
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EF1598(phrB)
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FPS: 
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CT0511(phr)
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SIN: 
SII: 
SIH: 
SIR: 
SIC: 
MSE: 
MCN: 
CSU: 
HAH: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:804322]
  Authors
Eker AP, Fichtinger-Schepman AM.
  Title
Studies on a DNA photoreactivating enzyme from Streptomyces griseus. II. Purification of the enzyme.
  Journal
Biochim. Biophys. Acta. 378 (1975) 54-63.
  Organism
Streptomyces griseus
Reference
2  [PMID:3539939]
  Authors
Sancar GB, Smith FW, Reid R, Payne G, Levy M, Sancar A.
  Title
Action mechanism of Escherichia coli DNA photolyase. I. Formation of the enzyme-substrate complex.
  Journal
J. Biol. Chem. 262 (1987) 478-85.
  Organism
Escherichia coli
Reference
3  [PMID:5649902]
  Authors
Setlow JK, Bollum FJ.
  Title
The minimum size of the substrate for yeast photoreactivating enzyme.
  Journal
Biochim. Biophys. Acta. 157 (1968) 233-7.
  Organism
Saccharomyces cerevisiae
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
37290-70-3

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