KEGG   ENZYME: 4.2.1.117Help
Entry
EC 4.2.1.117                Enzyme                                 

Name
2-methylcitrate dehydratase (2-methyl-trans-aconitate forming)
Class
Lyases;
Carbon-oxygen lyases;
Hydro-lyases
BRITE hierarchy
Sysname
(2S,3S)-2-hydroxybutane-1,2,3-tricarboxylate hydro-lyase (2-methyl-trans-aconitate forming)
Reaction(IUBMB)
(2S,3S)-2-methylcitrate = 2-methyl-trans-aconitate + H2O [RN:R11263]
Reaction(KEGG)
Substrate
(2S,3S)-2-methylcitrate [CPD:C02225]
Product
2-methyl-trans-aconitate [CPD:C21250];
H2O [CPD:C00001]
Comment
Catalyses the dehydration of (2S,3S)-2-methylcitrate, forming the trans isomer of 2-methyl-aconitate (unlike EC 4.2.1.79, which forms only the cis isomer). Part of a propionate degradation pathway. The enzyme from Shewanella oneidensis can also accept citrate and cis-aconitate, but activity with (2S,3S)-2-methylcitrate was approximately 2.5-fold higher. 2-methylisocitrate and isocitrate were not substrates [1]. An iron-sulfur protein.
History
EC 4.2.1.117 created 2009
Pathway
Propanoate metabolism
Orthology
K20455  
2-methylcitrate dehydratase (2-methyl-trans-aconitate forming)
Genes
MVR: 
GAN: 
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XFL: 
XCC: 
XCC1033(acnA)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCR_1232(acnD)
XCV: 
XCV1158(acnA)
XAC: 
XAC1139(acnA)
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAX: 
XACM_1105(acnA)
XAO: 
XOO: 
XOO0894(acnA)
XOM: 
XOO0819(XOO0819)
XOP: 
PXO_02721(acnD)
XOY: 
XOR: 
XOC_1188(acnD)
XOZ: 
XAL: 
XSA: 
XTN: 
SML: 
Smlt3608(acnA)
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SMD_3180(acnA)
SACZ: 
PSU: 
PSUW: 
PSD: 
DSC_08815(acnA)
DJI: 
DJA: 
DTX: 
VCH: 
VCF: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCQ: 
VCS: 
VCX: 
VCZ: 
VVU: 
VV1_2730(acnD)
VVY: 
VVL: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VAN: 
LAG: 
VAU: 
VCY: 
VCT: 
VTU: 
PGB: 
PAE: 
PAEV: 
N297_821(acnD)
PAEI: 
N296_821(acnD)
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PAEB: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
M802_818(acnD)
PAEO: 
M801_821(acnD)
PMY: 
PMK: 
PRE: 
PPSE: 
BN5_2137(acnC)
PPU: 
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PPUD: 
PFV: 
PMON: 
PMOT: 
PMOS: 
PPJ: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PFL_1863(acnD)
PPRC: 
PPRO: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PFW: 
PFB: 
PFF: 
PPZ: 
PMAN: 
PTV: 
PEN: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
PBM: 
PBA: 
PBC: 
PPUU: 
PDR: 
PSV: 
PSK: 
PKC: 
PKB_4871(acna3)
PCH: 
PCZ: 
PCP: 
PFZ: 
PALK: 
PRH: 
PSW: 
PPV: 
PSES: 
PSEM: 
PSEC: 
PPSY: 
PSOS: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
ACX: 
PBB: 
PAR: 
PCR: 
PRW: 
PSO: 
PUR: 
ACB: 
ABM: 
ABY: 
ABC: 
ABN: 
AB57_0124(acnD)
ABB: 
ABX: 
ABZ: 
ABR: 
ABD: 
ABH: 
ABAD: 
ABJ: 
ABAB: 
ABAJ: 
ABAZ: 
ABK: 
ABAU: 
ABAA: 
ABW: 
ABAL: 
ACC: 
ANO: 
ACD: 
ACI: 
ATT: 
AEI: 
AJO: 
MOS: 
SON: 
SO_0343(acnD)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
SVI_3079(acnA)
ILO: 
ILI: 
CPS: 
COM: 
PHA: 
PSHAa1773(acnA)
PAT: 
PSM: 
PSM_A1293(acnA)
PSEO: 
PIA: 
PPHE: 
PBW: 
PRR: 
PTN: 
MAQ: 
MHC: 
MARHY1632(acnA)
MAD: 
HP15_1930(acnA)
MBS: 
MSR: 
MPQ: 
MARI: 
AMC: 
AMH: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMK: 
ALT: 
AAL: 
ASP: 
GAG: 
GNI: 
GPS: 
LAL: 
PIN: 
FBL: 
MVS: 
CYQ: 
CZA: 
BLEP: 
ALV: 
AEH: 
HHC: 
WMA: 
HCS: 
HAK: 
HAM: 
HHU: 
HCO: 
LOKO_02859(acnA_1)
ABO: 
ABO_1431(acna)
ADI: 
B5T_02360(acnA)
APAC: 
ALN: 
KKO: 
KGE: 
TOL: 
TOR: 
AMED: 
OCE: 
THO: 
PSPI: 
NMA: 
NME: 
NMB0433(acnA)
NMP: 
NMH: 
NMC: 
NMC1729(acnA)
NMN: 
NMCC_1713(acnA)
NMT: 
NMV_0476(acnA)
NMI: 
NMO_1607(acnA)
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMAA_1503(acnA)
NMZ: 
NMX: 
NGK: 
CVI: 
CV_2054(acnA2)
LHK: 
PSE: 
NH8B_1568(acnA)
RSO: 
RSp0120(acnA2)
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
RMN: 
REU: 
REH: 
H16_A1907(acnM)
CNC: 
RME: 
Rmet_1585(acnA1)
CTI: 
CBW: 
CGD: 
CR3_1236(acnA)
BMA: 
BMAA1868(acnM)
BMV: 
BML: 
BMN: 
BMAL: 
DM55_3915(acnD)
BMAE: 
DM78_4834(acnD)
BMAQ: 
DM76_4612(acnD)
BMAI: 
BMAF: 
DM51_3561(acnD)
BMAZ: 
BM44_3873(acnD)
BMAB: 
BM45_4649(acnD)
BPS: 
BPSS0208(acnA)
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPSE: 
BDL_6100(acnD)
BPSM: 
BBQ_6004(acnD)
BPSU: 
BBN_3590(acnD)
BPSD: 
BBX_5270(acnD)
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BBK_5402(acnD)
BPSH: 
DR55_5153(acnD)
BPSA: 
BBU_5923(acnD)
BPSO: 
X996_4921(acnD)
BUT: 
X994_4470(acnD)
BTE: 
BTQ: 
BTQ_5473(acnD)
BTJ: 
BTJ_4129(acnD)
BTZ: 
BTL_4940(acnD)
BTD: 
BTI_4521(acnD)
BTV: 
BTHA_5283(acnD)
BTHE: 
BTN_4597(acnD)
BTHM: 
BTRA_4864(acnD)
BTHA: 
BTHL: 
BG87_4930(acnD)
BOK: 
DM82_4212(acnD)
BOC: 
BG90_3811(acnD)
BVI: 
BVE: 
AK36_3086(acnD)
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCAM2701(acnA)
BCEN: 
DM39_5180(acnD)
BCEW: 
DM40_3288(acnD)
BCEO: 
I35_6587(acnA)
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMK: 
DM80_4669(acnD)
BMUL: 
NP80_3264(acnD)
BCT: 
BCED: 
DM42_5284(acnD)
BDL: 
AK34_3200(acnD)
BPYR: 
BCON: 
BGL: 
BGP: 
BGU: 
KS03_3757(acnD)
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BGD: 
BGO: 
BM43_6616(acnD)
BUK: 
BUL: 
BW21_4044(acnD)
BUB: 
BW23_3900(acnD)
BUQ: 
BPLA: 
BUD: 
BXE: 
BXB: 
DR64_4633(acnD)
BPH: 
BRH: 
BPX: 
BPY: 
BFN: 
OI25_4745(acnD)
BCAI: 
PPK: 
PPNO: 
PPNM: 
PRB: 
PPUL: 
PSPU: 
PAPI: 
PVE: 
POX: 
PFG: 
PNR: 
BPE: 
BP2369(acnA)
BPC: 
BPTD_2326(acnA)
BPER: 
BPET: 
BPEU: 
BPA: 
BPP3235(acnA)
BPAR: 
BBR: 
BB3687(acnA)
BBM: 
BBH: 
BBX: 
BPT: 
Bpet1814(acnA1)
BAV: 
BAV2732(acnA4)
BHO: 
D560_0252(acnD)
BHM: 
D558_0247(acnD)
BHZ: 
ACR54_00997(acnA_2)
AXY: 
AXO: 
AXN: 
AXS: 
ADT: 
PUT: 
AKA: 
AMIM: 
BPSI: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
DAC: 
DEL: 
VPE: 
CTT: 
CTES: 
ADN: 
ADK: 
JAG: 
GJA_2037(acnD)
HSE: 
HHT: 
HRB: 
CARE: 
CPRA: 
MNR: 
MASW: 
PBH: 
GCA: 
ABU: 
Abu_0278(acnA)
ABT: 
ABL: 
ANT: 
ARC: 
SMAG: 
SWI: 
ABS: 
ABQ: 
ATI: 
TPX: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:14702315]
  Authors
Grimek TL, Escalante-Semerena JC
  Title
The acnD genes of Shewenella oneidensis and Vibrio cholerae encode a new Fe/S-dependent 2-methylcitrate dehydratase enzyme that requires prpF function in  vivo.
  Journal
J. Bacteriol. 186 (2004) 454-62.
  Sequence
[son:SO_0343]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 

DBGET integrated database retrieval system