KEGG   ENZYME: 4.2.1.42Help
Entry
EC 4.2.1.42                 Enzyme                                 

Name
galactarate dehydratase;
D-galactarate hydro-lyase;
D-galactarate hydro-lyase (5-dehydro-4-deoxy-D-glucarate-forming);
talrD (gene name)/galrD (gene name);
galactarate dehydratase (L-threo-forming)
Class
Lyases;
Carbon-oxygen lyases;
Hydro-lyases
BRITE hierarchy
Sysname
galactarate hydro-lyase (5-dehydro-4-deoxy-D-glucarate-forming)
Reaction(IUBMB)
galactarate = (2R,3S)-2,3-dihydroxy-5-oxohexanedioate + H2O [RN:R05608]
Reaction(KEGG)
Substrate
galactarate [CPD:C00879]
Product
(2R,3S)-2,3-dihydroxy-5-oxohexanedioate [CPD:C00679];
H2O [CPD:C00001]
Comment
The enzyme from the bacterium Escherichia coli is specific for galactarate [2], while the enzyme from Salmonella typhimurium also has activity with L-talarate (cf. EC 4.2.1.156, L-talarate dehydratase) [3]. cf. EC 4.2.1.158, galactarate dehydratase (D-threo-forming).
History
EC 4.2.1.42 created 1972, modified 2015
Pathway
Ascorbate and aldarate metabolism
Orthology
K01708  
galactarate dehydratase
K20023  
L-talarate/galactarate dehydratase
Genes
PHD: 
ECO: 
b3128(garD)
ECJ: 
JW3097(garD)
ECD: 
EBW: 
BWG_2834(garD)
ECOK: 
ECE: 
Z4480(yhaG)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_4099(garD)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c3883(yhaG)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_3660(garD)
EUM: 
ECZ: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_02993(garD)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m3396(garD)
ELL: 
WFL_16620(garD)
ELC: 
i14_3573(yhaG)
ELD: 
i02_3573(yhaG)
EBL: 
ECD_02993(garD)
EBE: 
B21_02944(garD)
ELF: 
LF82_0803(garD)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOPMV1_01062(garD_1) ECOPMV1_01063(garD_2) ECOPMV1_01064(garD_3) ECOPMV1_03439(garD_5)
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
EAL: 
STY: 
STT: 
t3170(garD) t3822
SEX: 
SENT: 
STM: 
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SENR: 
SEND: 
SENI: 
SEEN: 
SPT: 
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_3326(garD)
SEC: 
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
SENE: 
SENC: 
SES: 
SBG: 
SBG_2886(garD)
SBZ: 
SBV: 
YFR: 
AW19_3716(garD)
YIN: 
CH53_1375(garD)
YKR: 
CH54_2075(garD)
YAK: 
SFL: 
SF3165(yhaG)
SFX: 
S3380(yhaG)
SFE: 
SFxv_3476(garD)
SFN: 
SFS: 
SFT: 
SSN: 
SSON_3283(yhaG)
SSJ: 
ECA: 
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
EBI: 
EbC_35570(garD)
EGE: 
SOD: 
PES: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ECLA: 
ECLC: 
EAS: 
EAU: 
ENR: 
ENX: 
KPN: 
KPN_03540(garD)
KPU: 
KP1_4844(garD)
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPV: 
KPW: 
KPY: 
KPG: 
KPC: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPO: 
KPR: 
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KPB: 
KPNE: 
KPNU: 
KVA: 
KVD: 
KVQ: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOM: 
EAE: 
EAR: 
CKO: 
CRO: 
CFD: 
CAMA: 
CIF: 
SRL: 
SRY: 
SMAF: 
SERR: 
SFW: 
SFO: 
DDA: 
DDD: 
DZE: 
DDC: 
DZC: 
PAM: 
PANA_1262(mdlA) PANA_3087(garD)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_0583(mdlA) PAJ_2361(garD)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_2470(yhaG)
PAO: 
KLN: 
PANT: 
PANP: 
PAGG: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
EBT: 
ROR: 
RON: 
CED: 
KSA: 
KIN: 
PFQ: 
LAX: 
EBF: 
PSTS: 
MSU: 
MS0695(uxaA)
ASU: 
XCC: 
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XFU: 
PMY: 
PMK: 
PRE: 
PPSE: 
BN5_3136(uxaA)
PPU: 
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
T1E_0928(garD)
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_22260(garD)
PPUD: 
PFV: 
PMON: 
PMOT: 
PMOS: 
PPJ: 
POR: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFO: 
PFS: 
PFLU_0852(garD)
PFE: 
PFC: 
PFW: 
PFB: 
PFF: 
PPZ: 
PMAN: 
OU5_2576(garD)
PEN: 
PSEEN2656(garD)
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTT: 
PBA: 
PBC: 
PPUU: 
PSV: 
PSK: 
PCH: 
PCZ: 
PCP: 
PFZ: 
PRH: 
PPV: 
PSES: 
PSEM: 
PSEC: 
PPSY: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
ACX: 
ACB: 
ABM: 
ABSDF1404(garD)
ABN: 
AB57_1181(garD)
ABB: 
ABAB: 
ABAZ: 
ABK: 
ABAU: 
ABAA: 
ABAL: 
ACC: 
ACD: 
ACI: 
ACIAD0126(garD)
GPS: 
HEL: 
HHU: 
GSN: 
TAU: 
GAP: 
RSO: 
RSp0830(garD)
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
REU: 
REH: 
H16_B0965(h16_B0965)
CNC: 
RME: 
Rmet_4734(garD)
CTI: 
CBW: 
CGD: 
BTE: 
BTQ: 
BTQ_215(garD)
BTJ: 
BTJ_2270(garD)
BTZ: 
BTL_185(garD)
BTD: 
BTI_3530(garD)
BTV: 
BTHA_242(garD)
BTHE: 
BTN_1207(garD)
BTHM: 
BTRA_386(garD)
BTHA: 
DR62_1382(garD)
BTHL: 
BG87_349(garD)
BOK: 
DM82_3414(garD)
BOC: 
BG90_1404(garD)
BVI: 
BVE: 
AK36_3199(garD)
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCAM2511(garD)
BCEN: 
DM39_5323(garD)
BCEW: 
DM40_3163(garD)
BCEO: 
I35_6411(garD)
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMK: 
DM80_4793(garD)
BMUL: 
NP80_5140(garD)
BCT: 
BCED: 
DM42_5463(garD)
BDL: 
AK34_3313(garD)
BPYR: 
BCON: 
BGL: 
BGP: 
BGU: 
KS03_5546(garD)
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BGD: 
BGO: 
BYI: 
BUK: 
BUO: 
BUE: 
BUL: 
BW21_16(garD)
BUB: 
BW23_3744(garD)
BUQ: 
BPLA: 
BUD: 
BXE: 
BXB: 
DR64_7107(garD)
BPH: 
BPX: 
BPY: 
BFN: 
OI25_4246(garD)
PPK: 
PPNO: 
PPNM: 
PRB: 
PPUL: 
PSPU: 
PAPI: 
PVE: 
POX: 
PFG: 
PNR: 
BPT: 
AXO: 
AXN: 
AXS: 
ADT: 
PUT: 
AKA: 
AMIM: 
CDN: 
POL: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
AAA: 
ACK: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
VAA: 
CTT: 
CTES: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
Rta_19120(garD)
LIM: 
LIH: 
HSE: 
HHT: 
HRB: 
CFU: 
CFU_0237(yhaG)
CARE: 
CPRA: 
MASW: 
LCH: 
RDP: 
THU: 
ANT: 
MES: 
HOE: 
ATU: 
Atu2822(garD)
ATF: 
ATA: 
AVI: 
Avi_6103(garD)
AGR: 
RLE: 
RLT: 
RLG: 
RLB: 
RLU: 
RTR: 
RIR: 
NGL: 
NGG: 
SHZ: 
BME: 
BMEL: 
BMZ: 
BMG: 
BMW: 
BMEE: 
BMF: 
BMB: 
BMC: 
BAA: 
BABO: 
BABR: 
BABT: 
BABB: 
BABU: 
BABS: 
BABC: 
BMS: 
BSI: 
BSF: 
BSUI: 
BSUP: 
BSUV: 
BSUC: 
BSZ: 
BSV: 
BSW: 
BSG: 
BOV: 
BCS: 
BSK: 
BOL: 
BCAR: 
BCAS: 
BMR: 
BPP: 
BPV: 
BCET: 
BCEE: 
OAN: 
OAH: 
BJA: 
blr5874(garD)
BJU: 
BJP: 
BRA: 
BRADO1562(garD)
BBT: 
BBta_6490(garD)
BRS: 
S23_23750(garD)
AOL: 
BRC: 
BRAD: 
BOP: 
AZC: 
MRD: 
MET: 
MNO: 
MOR: 
MOC_2177(garD)
MAQU: 
PHL: 
MEY: 
AUA: 
PDE: 
PSF: 
OAT: 
CMAR: 
SPHI: 
SSAN: 
AZL: 
BSU: 
BSU02510(garD)
BSR: 
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSUT: 
BSUL: 
BSUS: 
BSS: 
BST: 
GYO_0450(garD)
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSX: 
BSP: 
BLI: 
BL01651(garD)
BLD: 
BLi00289(garD)
BLH: 
BAE: 
BATR: 
BMQ: 
BMQ_1888(galcD)
BJS: 
BACY: 
BACL: 
BALM: 
BEO: 
BEH_09660(garD)
BSJ: 
GGH: 
TAP: 
POW: 
LKO: 
THL: 
TEH_05270(garD)
CLJ: 
CACE: 
PUF: 
PFT: 
AFN: 
AIN: 
Acin_1539(garD)
MSM: 
MSG: 
MSB: 
MSN: 
MSH: 
MGO: 
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RFA: 
SCB: 
SVL: 
SBH: 
SHY: 
SHO: 
SRC: 
SLV: 
SXI: 
STRC: 
MIM: 
MIX: 
ART: 
ARR: 
ARW: 
AAU: 
AAur_0037(clcB)
ACH: 
APN: 
PSUL: 
GAR: 
BLY: 
MPH: 
NDA: 
FRE: 
GOB: 
BSD: 
SEN: 
AMD: 
AMN: 
AMM: 
AMZ: 
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ACTN: 
AFS: 
ASG: 
CGO: 
SBU: 
SGP: 
TRS: 
SUS: 
FHW: 
GBA: 
RSI: 
EOL: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1
  Authors
Blumenthal, H.J. and Jepson, T.
  Title
Galactarate dehydrase.
  Journal
Methods Enzymol. 9 (1966) 665-669.
Reference
2  [PMID:9772162]
  Authors
Hubbard BK, Koch M, Palmer DR, Babbitt PC, Gerlt JA
  Title
Evolution of enzymatic activities in the enolase superfamily: characterization of the (D)-glucarate/galactarate catabolic pathway in Escherichia coli.
  Journal
Biochemistry. 37 (1998) 14369-75.
Reference
3  [PMID:17649980]
  Authors
Yew WS, Fedorov AA, Fedorov EV, Almo SC, Gerlt JA
  Title
Evolution of enzymatic activities in the enolase superfamily: L-talarate/galactarate dehydratase from Salmonella typhimurium LT2.
  Journal
Biochemistry. 46 (2007) 9564-77.
  Sequence
[stm:STM3697]
Reference
4  [PMID:19883118]
  Authors
Rakus JF, Kalyanaraman C, Fedorov AA, Fedorov EV, Mills-Groninger FP, Toro R, Bonanno J, Bain K, Sauder JM, Burley SK, Almo SC, Jacobson MP, Gerlt JA
  Title
Computation-facilitated assignment of the function in the enolase superfamily: a  regiochemically distinct galactarate dehydratase from Oceanobacillus iheyensis .
  Journal
Biochemistry. 48 (2009) 11546-58.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
37290-78-1

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