KEGG   ENZYME: 4.3.99.3Help
Entry
EC 4.3.99.3                 Enzyme                                 

Name
7-carboxy-7-deazaguanine synthase;
7-carboxy-7-carbaguanine synthase;
queE (gene name)
Class
Lyases;
Carbon-nitrogen lyases;
Other carbon-nitrogen lyases
BRITE hierarchy
Sysname
6-carboxy-5,6,7,8-tetrahydropterin ammonia-lyase
Reaction(IUBMB)
6-carboxy-5,6,7,8-tetrahydropterin = 7-carboxy-7-carbaguanine + NH3 [RN:R10002]
Reaction(KEGG)
Substrate
6-carboxy-5,6,7,8-tetrahydropterin [CPD:C20239]
Product
7-carboxy-7-carbaguanine [CPD:C20248];
NH3 [CPD:C00014]
Comment
Requires Mg2+. The enzyme is a member of the superfamily of S-adenosyl-L-methionine-dependent radical (radical AdoMet) enzymes. Binds a [4Fe-4S] cluster that is coordinated by 3 cysteines and an exchangeable S-adenosyl-L-methionine molecule. The S-adenosyl-L-methionine is catalytic as it is regenerated at the end of the reaction. The reaction is part of the biosynthesis pathway of queuosine.
History
EC 4.3.99.3 created 2012
Pathway
Folate biosynthesis
Metabolic pathways
Orthology
K10026  
7-carboxy-7-deazaguanine synthase
Genes
ECO: 
b2777(queE)
ECJ: 
JW2748(ygcF)
ECD: 
EBW: 
BWG_2512(ygcF)
ECOK: 
ECE: 
Z4089(ygcF)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_3726(ygcF)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c3335(ygcF)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_3200(ygcF)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_02622(ygcF)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m2985(ygcF)
ELL: 
ELC: 
i14_3062(ygcF)
ELD: 
i02_3062(ygcF)
ELP: 
EBL: 
ECD_02622(ygcF)
EBE: 
B21_02584(ygcF)
ELF: 
LF82_3145(ygcF)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
ECOS: 
EFE: 
EFER_0293(ygcF)
EAL: 
STY: 
STT: 
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM2951(ygcF)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SENR: 
SEND: 
SENI: 
SEEN: 
SPT: 
SPA2807(ygcF)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_3001(ygcF)
SEC: 
SCH_2884(ygcF)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG2855(ygcF)
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SEN2790(ygcF)
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
SENE: 
SENC: 
SES: 
SBG: 
SBZ: 
SBV: 
SFL: 
SF2790(ygcF)
SFX: 
S2984(ygcF)
SFV: 
SFV_2678(ygcF)
SFE: 
SFN: 
SFS: 
SFT: 
SSN: 
SSON_2930(ygcF)
SSJ: 
SBO: 
SBO_2656(ygcF)
SBC: 
SDY: 
SDY_2981(ygcF)
SDZ: 
SHQ: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ECLA: 
ECLC: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
ENR: 
ENX: 
ENF: 
ESA: 
CSK: 
CSZ: 
CSI: 
CSJ: 
CCON: 
CDM: 
CMJ: 
CUI: 
CMW: 
CTU: 
CTU_33320(ygcF)
KPN: 
KPN_03121(ygcF)
KPU: 
KP1_4391(ygcF)
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPV: 
KPW: 
KPY: 
KPG: 
KPC: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPO: 
KPR: 
KPR_4130(ygcF)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KPB: 
KPNE: 
KPNU: 
KVA: 
KVD: 
KVQ: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOC: 
KOM: 
KMI: 
KLE: 
KQU: 
EAE: 
EAR: 
CKO: 
CRO: 
CFD: 
CAMA: 
CIF: 
HDE: 
SECT: 
SEHC: 
EBT: 
ROR: 
RON: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
CED: 
PGE: 
KSA: 
KOR: 
KIN: 
LAX: 
LAZ: 
SBW: 
GED: 
EBF: 
PSTS: 
YPE: 
YPK: 
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_0312(nrdG1)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPT: 
YPD: 
YPX: 
YPH: 
YPC_3696(ygcF)
YPW: 
YPJ: 
YPV: 
YPL: 
YPS: 
YPTB0757(ygcF)
YPO: 
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
YPU: 
YPR: 
YPC: 
YPF: 
YEN: 
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YEW: 
YET: 
YEF: 
YEE: 
YSI: 
YAL: 
YFR: 
YIN: 
YKR: 
YRO: 
YRU: 
YRB: 
YAK: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SSZ: 
SMAF: 
SMW: 
SMAR: 
SMAC: 
SLQ: 
SERR: 
SERF: 
SERS: 
SFW: 
SRZ: 
SFO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
ECA: 
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PCV: 
PWA: 
PPAR: 
PEC: 
PWS: 
SGL: 
SOD: 
PES: 
DDA: 
DDD: 
DZE: 
DDC: 
DZC: 
DSO: 
ETA: 
EPY: 
EPR: 
EAM: 
EAMY_0740(ygcF)
EAY: 
EBI: 
ERJ: 
EGE: 
BAPF: 
BAPG: 
BAPU: 
BAPW: 
BAS: 
BUsg_401(ygcF)
PAM: 
PANA_3070(ygcF)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_2345(ygcF)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_2457(ygcF)
PAO: 
KLN: 
PANT: 
PANP: 
HHS: 
HHS_01660(ygcF)
PCK: 
PAGG: 
PLU: 
PAY: 
PAU_00675(ygcF)
PTT: 
PMR: 
PMIB: 
PVL: 
XBO: 
XBJ1_3614(ygcF)
XBV: 
XBW1_4054(ygcF)
XNE: 
XNC1_3862(ygcF)
XNM: 
XNC2_3716(ygcF)
XDO: 
XDD1_3176(ygcF)
XPO: 
XPG1_2785(ygcF)
PSI: 
PSX: 
MMK: 
EIC: 
ETR: 
ETD: 
ETE: 
ETEE_2988(queE)
ETC: 
EDW: 
EDL: 
EHO: 
HAV: 
OPO: 
PFQ: 
PSHI: 
XFA: 
XFT: 
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XFL: 
XFS: 
XCC: 
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XAC: 
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAX: 
XAO: 
XOO: 
XOO1671(NrdG)
XOM: 
XOO1555(XOO1555)
XOP: 
XOY: 
XOR: 
XOZ: 
XAL: 
XALC_2420(NrdG)
XSA: 
XTN: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SACZ: 
STEK: 
SRH: 
PSU: 
PSUW: 
PSD: 
LAB: 
LAQ: 
LCP: 
LGU: 
LEZ: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
DTX: 
DKO: 
VCH: 
VCF: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VCQ: 
VCS: 
VCX: 
VCZ: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VEX: 
VHR: 
VSP: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VAU: 
VCY: 
VCT: 
VTU: 
VFL: 
VMI: 
VFI: 
VF_A0495(ygcF)
VFM: 
VSA: 
AWD: 
PPR: 
PBPRA2333(STY3080)
PGB: 
GHO: 
PAE: 
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PAEB: 
PDK: 
PSG: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
PMY: 
PMK: 
PRE: 
PPSE: 
PALC: 
PPU: 
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PPUD: 
PFV: 
PMON: 
PMOT: 
PMOS: 
PPJ: 
POR: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PPRC: 
PPRO: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PFW: 
PFB: 
PFF: 
PPZ: 
PMAN: 
PTV: 
PEN: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PBM: 
PBA: 
PBC: 
PPUU: 
PDR: 
PSV: 
PSK: 
PKC: 
PCH: 
PCZ: 
PCP: 
PFZ: 
PALK: 
PRH: 
PSW: 
PPV: 
PSES: 
PSEM: 
PSEC: 
PPSY: 
PSOS: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
ACX: 
PAR: 
PCR: 
PRW: 
PSO: 
PUR: 
PALI: 
PSPG: 
PSYG: 
ACB: 
ABM: 
ABY: 
ABC: 
ABN: 
ABB: 
ABX: 
ABZ: 
ABR: 
ABD: 
ABH: 
ABAD: 
ABJ: 
ABAB: 
ABAJ: 
ABAZ: 
ABK: 
ABAU: 
ABAA: 
ABW: 
ABAL: 
ACC: 
ANO: 
ACD: 
ACI: 
ATT: 
AEI: 
AJO: 
ACW: 
ACV: 
MCT: 
MCS: 
MCAT: 
MOI: 
MOS: 
MBL: 
SON: 
SO_2501(queE)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
ILO: 
ILI: 
CPS: 
COM: 
COZ: 
PHA: 
PSHAa1117(queC)
PAT: 
PSM: 
PSM_A1911(queC)
PSEO: 
PIA: 
PPHE: 
PBW: 
PRR: 
PTN: 
AMC: 
AMH: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMK: 
ALT: 
AAL: 
AAUS: 
ASP: 
AAW: 
GAG: 
GNI: 
GNIT_2237(queE)
GPS: 
LAL: 
PIN: 
PSY: 
FBL: 
MVS: 
CJA: 
SDE: 
TTU: 
SAGA: 
SPOI: 
ZAL: 
MTHD: 
CBU: 
CBU_0093(queE)
CBS: 
CBD: 
CBUD_2016(queE)
CBG: 
CbuG_1924(queE)
CBC: 
CbuK_1963(queE)
LPN: 
LPH: 
LPO: 
LPU: 
LPM: 
LP6_2021(queE)
LPF: 
LPP: 
LPC: 
LPA: 
lpa_02978(nrdG)
LPE: 
LFA: 
LFA_2248(queE)
LHA: 
LOK: 
TMC: 
MCA: 
MMT: 
MDN: 
MDH: 
MAH: 
MEJ: 
MEC: 
CYQ: 
CZA: 
PSAL: 
NOC: 
NHL: 
NWA: 
TMB: 
TEE: 
HHC: 
TGR: 
TKM: 
TNI: 
TVNIR_3366(queE_[H])
TTI: 
TVR: 
EBS: 
APRS: 
HNA: 
HAZ: 
WMA: 
ABO: 
ADI: 
APAC: 
ALN: 
KKO: 
KGE: 
KSD: 
AHA: 
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
AHJ: 
AHH: 
AHI: 
ASA: 
AVR: 
AVO: 
AMED: 
ASR: 
TAU: 
OCE: 
SDF: 
BCI: 
BCIB: 
RMA: 
GPB: 
TBN: 
SEDS: 
THO: 
PSPI: 
GBI: 
ENM: 
EBS_1656(queE)
BPH: 
BPX: 
JAB: 
NEU: 
NET: 
NIT: 
NII: 
NCO: 
NUR: 
NMU: 
EBA: 
ebA2656(queE)
AZO: 
AZA: 
AZI: 
TMZ: 
THU: 
DSU: 
SHD: 
RBU: 
TBD: 
SDR: 
MFA: 
MMB: 
MEH: 
MEI: 
MEP: 
MPQ_2333(nrdG)
MBAC: 
MBAT: 
MEU: 
APP: 
SLT: 
GCA: 
BEB: 
DMA: 
BBAT: 
BBW: 
BBAC: 
BEX: 
BMX: 
DPS: 
DAK: 
DPR: 
DSF: 
DOL: 
DAL: 
DTO: 
ACP: 
AFW: 
ANK: 
MXA: 
MFU: 
MSD: 
MYM: 
CCX: 
SUR: 
AGE: 
VIN: 
SCL: 
SCU: 
LLU: 
SAT: 
DAO: 
DTI: 
SFU: 
DBR: 
DAV: 
MLO: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
MAMO: 
MES: 
SME: 
SM_b20938(exsD)
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
SMEG: 
SMEL: 
SMER: 
SMD: 
RHI: 
SFH: 
SFD: 
EAD: 
EAH: 
ATU: 
Atu3344(exsD)
ARA: 
Arad_9732(exsD)
ATF: 
ATA: 
AVI: 
Avi_3716(exsD)
AGR: 
RET: 
REC: 
REL: 
REI: 
REP: 
RLE: 
RL4256(exsD)
RLT: 
RLG: 
RLB: 
RLU: 
RTR: 
RIR: 
RHL: 
RGA: 
RHN: 
BME: 
BMEL: 
DK63_1339(queE)
BMI: 
BMZ: 
BMG: 
BMW: 
BMEE: 
DK62_1607(queE)
BMF: 
BMB: 
BMC: 
BAA: 
BABO: 
DK55_1910(queE)
BABR: 
DO74_2065(queE)
BABT: 
DK49_1667(queE)
BABB: 
DK48_209(queE)
BABU: 
DK53_1895(queE)
BABS: 
DK51_1647(queE)
BABC: 
DO78_1814(queE)
BMS: 
BSI: 
BSF: 
BSUI: 
BSUP: 
BSUV: 
BSUC: 
BMT: 
BSZ: 
DK67_389(queE)
BSV: 
BSW: 
BSG: 
BOV: 
BOV_1899(queE)
BCS: 
BSK: 
BOL: 
BCAR: 
DK60_1951(queE)
BCAS: 
BMR: 
BMI_I1997(queE)
BPP: 
BPI_I2034(queE)
BPV: 
DK65_1556(queE)
BCET: 
BCEE: 
BVL: 
OAN: 
OAH: 
DR92_550(queE)
OPS: 
MNO: 
RHZ: 
AUA: 
SIL: 
SIT: 
RMB: 
PDE: 
PSF: 
PGA: 
PGL: 
PGD: 
LMD: 
MALG: 
PPHR: 
LAP: 
YAN: 
PNS: 
TXI: 
MGM: 
AFE: 
AFR: 
ACU: 
ACZ: 
AFI: 
BSU: 
BSU13740(queE)
BSR: 
I33_1545(queE)
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSUT: 
BSUL: 
BSUS: 
BSS: 
BST: 
GYO_1703(queE)
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSX: 
C663_1415(queE)
BSP: 
BLI: 
BL03548(queE)
BLD: 
BLi01529(queE)
BLH: 
BAY: 
BAQ: 
BYA: 
BAMP: 
BAML: 
BAMA: 
RBAU_1330(queE)
BAMN: 
BASU_1309(queE)
BAMB: 
BAMT: 
BAMY: 
BMP: 
NG74_01407(queE_2)
BAO: 
BAMF_1454(queE)
BAZ: 
BQL: 
LL3_01478(queE)
BXH: 
BQY: 
MUS_1459(ykvL)
BAMI: 
BAMC: 
BAMF: 
BAE: 
BATR: 
BHA: 
BAN: 
BAR: 
BAT: 
BAH: 
BAI: 
BAA_1429(queE)
BAX: 
BANT: 
BANR: 
BANS: 
BANH: 
BANV: 
DJ46_186(queE)
BCE: 
BCA: 
BCZ: 
BCR: 
BCB: 
BCU: 
BCG: 
BCQ: 
BCX: 
BCA_1397(queE)
BAL: 
BNC: 
BCF: 
BCER: 
BCEF: 
BCY: 
BTK: 
BTL: 
BTB: 
BTT: 
BTHR: 
BTHI: 
BTC: 
BTF: 
BTM: 
BTG: 
BTI: 
BTN: 
BTHT: 
BTHU: 
BTW: 
BF38_2563(queE)
BWE: 
BWW: 
bwei_3663(queE)
BTY: 
BMYC: 
DJ92_3984(queE) DJ92_771(queE)
BMYO: 
BG05_4555(queE)
BCL: 
BPU: 
BPUM_1265(queE)
BPUM: 
BPF: 
BMQ: 
BMQ_1276(queE)
BMD: 
BMD_1257(queE)
BMH: 
BMEG: 
BG04_3572(queE)
BCO: 
BCK: 
BAG: 
BCOA: 
BF29_102(queE)
BJS: 
BACI: 
BIF: 
BLE: 
BMET: 
GST: 
BACW: 
BACP: 
BACB: 
BBY: 
BACY: 
BACL: 
BALM: 
BEO: 
BSM: 
BSJ: 
BON: 
OIH: 
GKA: 
GTE: 
GTN: 
GWC: 
GYC: 
GYA: 
GCT: 
GMC: 
GGH: 
GJF: 
GEA: 
GARCT_00988(queE_2)
GEL: 
GSE: 
GSR: 
GEJ: 
GTH: 
PTL: 
AFL: 
AGN: 
ANM: 
AAMY: 
ANL: 
GFC29_173(queE)
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Reference
1  [PMID:19354300]
  Authors
McCarty RM, Somogyi A, Lin G, Jacobsen NE, Bandarian V
  Title
The deazapurine biosynthetic pathway revealed: in vitro enzymatic synthesis of PreQ(0) from guanosine 5'-triphosphate in four steps.
  Journal
Biochemistry. 48 (2009) 3847-52.
  Sequence
[bsu:BSU13740]
Reference
2  [PMID:23194065]
  Authors
McCarty RM, Krebs C, Bandarian V
  Title
Spectroscopic, steady-state kinetic, and mechanistic characterization of the radical SAM enzyme QueE, which catalyzes a complex cyclization reaction in the biosynthesis of 7-deazapurines.
  Journal
Biochemistry. 52 (2013) 188-98.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 

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