KEGG   ENZYME: 4.3.99.3Help
Entry
EC 4.3.99.3                 Enzyme                                 

Name
7-carboxy-7-deazaguanine synthase;
7-carboxy-7-carbaguanine synthase;
queE (gene name)
Class
Lyases;
Carbon-nitrogen lyases;
Other carbon-nitrogen lyases
BRITE hierarchy
Sysname
6-carboxy-5,6,7,8-tetrahydropterin ammonia-lyase
Reaction(IUBMB)
6-carboxy-5,6,7,8-tetrahydropterin = 7-carboxy-7-carbaguanine + NH3 [RN:R10002]
Reaction(KEGG)
Substrate
6-carboxy-5,6,7,8-tetrahydropterin [CPD:C20239]
Product
7-carboxy-7-carbaguanine [CPD:C20248];
NH3 [CPD:C00014]
Comment
Requires Mg2+. The enzyme is a member of the superfamily of S-adenosyl-L-methionine-dependent radical (radical AdoMet) enzymes. Binds a [4Fe-4S] cluster that is coordinated by 3 cysteines and an exchangeable S-adenosyl-L-methionine molecule. The S-adenosyl-L-methionine is catalytic as it is regenerated at the end of the reaction. The reaction is part of the biosynthesis pathway of queuosine.
History
EC 4.3.99.3 created 2012
Pathway
ec00790  Folate biosynthesis
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K10026  7-carboxy-7-deazaguanine synthase
Genes
CME: CYME_CMD090C
GSL: Gasu_00310 Gasu_64340
CCP: CHC_T00001801001
ECO: b2777(queE)
ECJ: JW2748(ygcF)
ECD: ECDH10B_2944(ygcF)
EBW: BWG_2512(ygcF)
ECOK: ECMDS42_2281(ygcF)
ECE: Z4089(ygcF)
ECS: ECs3633
ETW: ECSP_3726(ygcF)
EOJ: ECO26_3847(ygcF)
EOI: ECO111_3501(ygcF)
EOH: ECO103_3320(ygcF)
ECG: E2348C_3044(ygcF)
EOK: G2583_3426(ygcF)
ECC: c3335(ygcF)
ECP: ECP_2755
ECI: UTI89_C3140(ygcF)
ECY: ECSE_3034
ECR: ECIAI1_2883(ygcF)
ECQ: ECED1_3225(ygcF)
ECK: EC55989_3051(ygcF)
ECT: ECIAI39_2968(ygcF)
EOC: CE10_3200(ygcF)
EUM: ECUMN_3104(ygcF)
ECZ: ECS88_3041(ygcF)
ELH: ETEC_2970
ESE: ECSF_2570
ESO: O3O_20015
ESM: O3M_05680
ESL: O3K_05635
EBR: ECB_02622(ygcF)
EBD: ECBD_0953
EAB: ECABU_c30430(ygcF)
EDJ: ECDH1ME8569_2686(ygcF)
ELW: ECW_m2985(ygcF)
ELL: WFL_14570
ELC: i14_3062(ygcF)
ELD: i02_3062(ygcF)
EBL: ECD_02622(queE)
EBE: B21_02584(ygcF)
ELF: LF82_3145(ygcF)
ECOI: ECOPMV1_03030(queE)
ECOJ: P423_15195
ECOO: ECRM13514_3633(ygcF)
ECOH: ECRM13516_3498(ygcF)
ECOS: EC958_3046(ygcF)
EFE: EFER_0293(ygcF)
STY: STY3080
STT: t2852
STM: STM2951(ygcF)
SEO: STM14_3556(ygcF)
SEY: SL1344_2930(ygcF)
SEJ: STMUK_2940(ygcF)
SENI: CY43_15395
SPT: SPA2807(ygcF)
SEK: SSPA2615
SEI: SPC_3001(ygcF)
SEC: SCH_2884(ygcF)
SHB: SU5_03432
SENS: Q786_14225
SED: SeD_A3265
SEG: SG2855(ygcF)
SEL: SPUL_2953
SET: SEN2790(ygcF)
SENA: AU38_14170
SENO: AU37_14180
SENV: AU39_14180
SENQ: AU40_15955
SENL: IY59_14775
SEEP: I137_14050
SENB: BN855_30050(ygcF)
SENE: IA1_14150
SBG: SBG_2566
SBZ: A464_2976
SFL: SF2790(ygcF)
SFX: S2984(ygcF)
SFV: SFV_2678(ygcF)
SFE: SFxv_3060
SFN: SFy_3969
SFS: SFyv_4046
SFT: NCTC1_03070(queE)
SSN: SSON_2930(ygcF)
SBO: SBO_2656(ygcF)
SDY: SDY_2981(ygcF)
ENC: ECL_04108
ECLO: ENC_30180
EEC: EcWSU1_03582(ygcF)
ECLX: LI66_17915
ECLY: LI62_19375
ECLZ: LI64_16825
ESA: ESA_00531
CSK: ES15_0788
CTU: CTU_33320(ygcF)
KPN: KPN_03121(ygcF)
KPU: KP1_4391(ygcF)
KPP: A79E_0977
KPE: KPK_1002
KPR: KPR_4130(ygcF)
KPJ: N559_1110
KPX: PMK1_00602(queE)
KPNU: LI86_05485
KPNK: BN49_0993(ygcF)
KVA: Kvar_0934
KOX: KOX_01130
KOE: A225_4688
EAE: EAE_01940
EAR: CCG33605
CKO: CKO_04133
CRO: ROD_30371
CAMA: F384_15065
HDE: HDEF_0210
SECT: A359_01530
SEHC: A35E_00416
SBW: TGUWTKB_3050(queE)
GED: FVIR_GE00217(queE)
EBF: D782_0936
PSTS: E05_46120
YPE: YPO3374
YPK: y0816
YPA: YPA_2872
YPN: YPN_0718
YPM: YP_0312(nrdG1)
YPZ: YPZ3_2972
YPD: YPD4_2958
YPX: YPD8_2956
YPH: YPC_3696(ygcF)
YPW: CH59_2673
YPJ: CH55_1955
YPV: BZ15_147
YPL: CH46_1715
YPS: YPTB0757(ygcF)
YPO: BZ17_1799
YPY: YPK_3444
YPB: YPTS_0790
YPQ: DJ40_1616
YPU: BZ21_4140
YPR: BZ20_1329
YPC: BZ23_233
YPF: BZ19_106
YEN: YE0753
YEY: Y11_22971
YEW: CH47_2733
YET: CH48_2460
YAL: AT01_3278
YFR: AW19_4089
YIN: CH53_947
YKR: CH54_1701
YRO: CH64_3368
YRU: BD65_2621
SPE: Spro_0808
SRL: SOD_c06770(queE)
SPLY: Q5A_003550(queE)
SSZ: SCc_152
SMAF: D781_0764
SMW: SMWW4_v1c07900(queE)
SMAR: SM39_0118
SERF: L085_00310
RAA: Q7S_03070
ECA: ECA3554
PATR: EV46_17635
PATO: GZ59_35760
PCT: PC1_3374
PEC: W5S_3672
SGL: SG0514
SOD: Sant_3260
PES: SOPEG_1013(ygcF)
DDD: Dda3937_00204(ygcF)
DDQ: DDI_3282
ETA: ETA_27180
EPY: EpC_28370
EPR: EPYR_03071(ygcF)
EAM: EAMY_0740(ygcF)
EAY: EAM_2701
EBI: EbC_35410
ERJ: EJP617_19000(ygcF)
EGE: EM595_2817(queE)
BAPF: BUMPF009_CDS00183(ygcf)
BAPG: BUMPG002_CDS00183(ygcf)
BAPU: BUMPUSDA_CDS00183(ygcf)
BAPW: BUMPW106_CDS00183(ygcf)
BAS: BUsg_401(ygcF)
BAPH: IX46_02155
PAM: PANA_3070(ygcF)
PLF: PANA5342_0963(ygcF)
PAJ: PAJ_2345(ygcF)
PVA: Pvag_2457(ygcF)
HHS: HHS_01660(ygcF)
PSTW: DSJ_05150
PLU: plu0701
PAY: PAU_00675(ygcF)
PMR: PMI2252
XBO: XBJ1_3614(ygcF)
XBV: XBW1_4054(ygcF)
XNE: XNC1_3862(ygcF)
XNM: XNC2_3716(ygcF)
XDO: XDD1_3176(ygcF)
XPO: XPG1_2785(ygcF)
PSI: S70_05710
PSX: DR96_246
PRG: RB151_035030(queE)
MMK: MU9_965
ETR: ETAE_1044
ETD: ETAF_0972
ETE: ETEE_2988(queE)
PSHI: SAMEA2665130_1261(queE)
HIN: HI1189
HIT: NTHI1360
HIU: HIB_13440
HIE: R2846_1155(queE)
HIZ: R2866_1214(queE)
HIA: H733_1266(queE)
HIW: NTHI477_00549(queE)
HIC: NTHIC486_01556(queE)
HIX: NTHI723_00458(queE)
HDU: HD_0556
HAP: HAPS_1385(nrdG)
HPAZ: K756_08200
HPAS: JL26_07140
HPAK: JT17_05125
PMU: PM0184
PMP: Pmu_11290
PMUL: DR93_1882
MSU: MS1857(nrdG)
MHQ: D650_7900
MHAT: B824_18310
MHX: MHH_c26800(queE)
MHAE: F382_04140
MHAM: J450_03155
MHAO: J451_04380
MHAL: N220_10250
MHAQ: WC39_03955
MHAY: VK67_03955
MVR: X781_5900
MVE: X875_5420
APL: APL_1099
APJ: APJL_1113
APA: APP7_1155
ASU: Asuc_2019
AAT: D11S_1078
AAN: D7S_00550
AACN: AANUM_1355
BTO: WQG_7690
BTRE: F542_14360
BTRH: F543_16020
BTRA: F544_8040
XFA: XF_1894
XFT: PD_0897
XCC: XCC3015
XCB: XC_1144
XCP: XCR_3337
XCV: XCV3269
XAX: XACM_3058
XAC: XAC3139
XCI: XCAW_03424(nrdG)
XOO: XOO1671(NrdG)
XOM: XOO1555(XOO1555)
XOP: PXO_01567
XOR: XOC_3348
XAL: XALC_2420(NrdG)
XPH: XppCFBP6546_03305(XppCFBP6546P_03305)
SML: Smlt3701
SMT: Smal_3116
SMZ: SMD_3307
PSUW: WQ53_11685
PSD: DSC_04910
LEZ: GLE_4049
LEM: LEN_1152
DKO: I596_2988
VCH: VC1365
VCI: O3Y_06345
VCS: MS6_1140
VVU: VV1_2721
VVY: VV1540
VPA: VP1639
VPB: VPBB_1499
VAG: N646_0704
VSP: VS_1353
VAN: VAA_02066
VSC: VSVS12_01635(queE)
VFI: VF_A0495(ygcF)
PPR: PBPRA2333(STY3080)
PAE: PA0975
PAEV: N297_1009
PAEI: N296_1009
PAEP: PA1S_21535
PAEM: U769_20905
PAEL: T223_22170
PAEG: AI22_12405
PAEC: M802_1005
PAEO: M801_1009
PMY: Pmen_1280
PMK: MDS_1314
PPSE: BN5_3077
PCQ: PcP3B5_17300(queE)
PPU: PP_1225(queE)
PPF: Pput_1254
PPT: PPS_3992
PPI: YSA_07532
PPX: T1E_5734
PPUH: B479_20265
PPUT: L483_25300
PPUN: PP4_11640
PPUD: DW66_4431
PMON: X969_19520
PMOT: X970_19155
PSB: Psyr_1418
PSYR: N018_18570
PFL: PFL_4755
PPRO: PPC_4763
PFS: PFLU_4905
PFE: PSF113_4607(queE)
PFB: VO64_1758
PMAN: OU5_4885
PSA: PST_2800
PKC: PKB_1395
PSES: PSCI_3272
PSEM: TO66_24325
PSOS: POS17_4730
PANR: A7J50_4675
PAR: Psyc_0736
PALI: A3K91_1873
PSYA: AOT82_878
ACB: A1S_2540
ABM: ABSDF0932
ABY: ABAYE0922
ABN: AB57_2981
ABX: ABK1_2869
ABH: M3Q_3049
ABAD: ABD1_25260
ABAZ: P795_4265
ABAU: IX87_09365
ABAA: IX88_15895
ACC: BDGL_002008(queE)
ACI: ACIAD2600
ASJ: AsACE_CH01920(queE)
MCT: MCR_0358
MCS: DR90_1549
MCAT: MC25239_00378(queE)
SON: SO_2501(queE)
SDN: Sden_2014
SFR: Sfri_1877
SAZ: Sama_1825
SLO: Shew_2061
SPL: Spea_2348
SHL: Shal_1936
SWD: Swoo_2551
SWP: swp_2376
SVO: SVI_2330
SPSW: Sps_01138
ILO: IL0913
PHA: PSHAa1117(queC)
PAT: Patl_2960
PSM: PSM_A1911(queC)
PSEO: OM33_08705
PTN: PTRA_a1306(queE)
PEA: PESP_a2504(queE)
PSPO: PSPO_a1190(queE)
PART: PARC_a1363(queE)
PTU: PTUN_a1596(queE)
PNG: PNIG_a1387(queE)
PTD: PTET_a2190(queE)
MAQ: Maqu_0107
MHC: MARHY0096
MAD: HP15_3815
AMAL: I607_05830
AMAE: I876_06120
AMAO: I634_06155
AMAD: I636_06585
AMAI: I635_06530
AMAG: I533_06190
AMAC: MASE_05680
AAUS: EP12_06205
GNI: GNIT_2237(queE)
GPS: C427_1712
PIN: Ping_1100
MVS: MVIS_2374
CJA: CJA_2836
SDE: Sde_2526
SAGA: M5M_19140
MICC: AUP74_00180(queE)
CBU: CBU_0093(queE)
CBD: CBUD_2016(queE)
CBG: CbuG_1924(queE)
CBC: CbuK_1963(queE)
LPN: lpg2041
LPH: LPV_2345
LPO: LPO_2144
LPM: LP6_2021(queE)
LPF: lpl2019
LPP: lpp2024
LPC: LPC_1527
LPA: lpa_02978(nrdG)
LPE: lp12_1982
LFA: LFA_2248(queE)
LHA: LHA_2678
LOK: Loa_02643
LCD: clem_02870(queE)
TMC: LMI_2747
MCA: MCA1232
TCX: Tcr_0794
MEJ: Q7A_3
MEC: Q7C_1725
CYQ: Q91_0477
TIG: THII_0931
NOC: Noc_0148
NHL: Nhal_0186
NWA: Nwat_0138
TEE: Tel_13210
NTT: TAO_0104
AEH: Mlg_0017
HHA: Hhal_1115
TGR: Tgr7_2226
TKM: TK90_0569
TNI: TVNIR_3366(queE_[H])
TVR: TVD_10375
HCH: HCH_06643
CSA: Csal_2039
HEL: HELO_2443
HAM: HALO2261
HCO: LOKO_01589(queE)
HHH: CLM76_14505(queE)
HBE: BEI_1994
ABO: ABO_0761
ADI: B5T_03223
APAC: S7S_06350
AXE: P40_15065
KKO: Kkor_1845
KGE: TQ33_1531
TOL: TOL_2457
BSAN: CHH28_18570(queE)
AHA: AHA_1817
ASA: ASA_1776
AVR: B565_2302
AMED: B224_1865
ASR: WL1483_2052(queE)
ACAV: VI35_12010
TAU: Tola_2496
OCE: GU3_12040
SLIM: SCL_2246
SVA: SVA_3310
TBN: TBH_C2236
RMA: Rmag_0427
VOK: COSY_0397
EBH: BSEPE_0714(queE)
BCI: BCI_0220
BCIB: IM45_509
ENM: EBS_1656(queE)
NMA: NMA0707
NME: NMB0529
NMP: NMBB_0569
NMC: NMC0468
NMN: NMCC_0466
NMT: NMV_1899
NMI: NMO_0411
NMW: NMAA_0372
NGO: NGO0132
NGK: NGK_0179
NLA: NLA_17110
NWE: SAMEA3174300_1289(queE)
KKI: KKKWG1_1195(queE)
CVI: CV_3509
CHRO: CXB49_03990(queE)
PSE: NH8B_0866
RSO: RSc1449
RSN: RSPO_c01904(nrdG)
RSE: F504_1491
RPI: Rpic_1329
REH: H16_A1925(h16_A1925)
RME: Rmet_1571
CGD: CR3_1226(nrdG)
BMA: BMA0153
BMAL: DM55_1558
BMAE: DM78_435
BMAQ: DM76_1537
BMAI: DM57_2054
BMAF: DM51_3130
BMAZ: BM44_922
BMAB: BM45_481
BPS: BPSL0178
BPSE: BDL_1815
BPSM: BBQ_3254
BPSU: BBN_3376
BPSD: BBX_205
BPK: BBK_1293
BPSH: DR55_914
BPSA: BBU_1967
BPSO: X996_534
BUT: X994_2524
BTE: BTH_I0138
BTQ: BTQ_163
BTJ: BTJ_2321
BTZ: BTL_236
BTD: BTI_3581
BTV: BTHA_293
BTHE: BTN_1156
BTHM: BTRA_437
BTHA: DR62_1331
BTHL: BG87_400
BOK: DM82_3363
BOC: BG90_1455
BVE: AK36_799
BCN: Bcen_2504
BCJ: BCAL0474
BCEN: DM39_3217
BCEW: DM40_719
BCEO: I35_3191
BAM: Bamb_3173
BMU: Bmul_3115
BMK: DM80_1792
BMUL: NP80_41
BCT: GEM_0317
BCED: DM42_1893
BDL: AK34_3130
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NBV: T478_0842
NDV: NDEV_0053(queE)
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Reference
1  [PMID:19354300]
  Authors
McCarty RM, Somogyi A, Lin G, Jacobsen NE, Bandarian V
  Title
The deazapurine biosynthetic pathway revealed: in vitro enzymatic synthesis of PreQ(0) from guanosine 5'-triphosphate in four steps.
  Journal
Biochemistry. 48 (2009) 3847-52.
  Sequence
[bsu:BSU13740]
Reference
2  [PMID:23194065]
  Authors
McCarty RM, Krebs C, Bandarian V
  Title
Spectroscopic, steady-state kinetic, and mechanistic characterization of the radical SAM enzyme QueE, which catalyzes a complex cyclization reaction in the biosynthesis of 7-deazapurines.
  Journal
Biochemistry. 52 (2013) 188-98.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 4.3.99.3
IUBMB Enzyme Nomenclature: 4.3.99.3
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 4.3.99.3
BRENDA, the Enzyme Database: 4.3.99.3

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