KEGG   ENZYME: 4.6.1.16Help
Entry
EC 4.6.1.16                 Enzyme                                 

Name
tRNA-intron lyase;
transfer ribonucleate intron endoribonuclease;
tRNA splicing endonuclease;
splicing endonuclease;
tRNATRPintron endonuclease;
transfer splicing endonuclease
Class
Lyases;
Phosphorus-oxygen lyases;
Phosphorus-oxygen lyases (only sub-subclass identified to date)
BRITE hierarchy
Sysname
pretRNA lyase (intron-removing; cyclic-2',3'-phosphate-forming)
Reaction(IUBMB)
pretRNA = a 3'-half-tRNA molecule with a 5'-OH end + a 5'-half-tRNA molecule with a 2',3'-cyclic phosphate end + an intron with a 2',3'-cyclic phosphate and a 5'-hydroxyl terminus
Substrate
pretRNA
Product
3'-half-tRNA molecule with a 5'-OH end;
5'-half-tRNA molecule with a 2',3'-cyclic phosphate end;
intron with a 2',3'-cyclic phosphate-hydroxyl terminus;
a 5'-hydroxyl terminus
Comment
The enzyme catalyses the final stage in the maturation of tRNA molecules.
History
EC 4.6.1.16 created 1992 as EC 3.1.27.9, transferred 2014 to EC 4.6.1.16
Orthology
K01170  
tRNA-intron endonuclease, archaea type
Genes
PFA: 
PFD: 
PCB: 
PCHAS_132110(PC001224.02.0)
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
MJA: 
MFE: 
MVU: 
MFS: 
MIF: 
MJH: 
MIG: 
MMP: 
MMP1132(endA)
MMQ: 
MMX: 
MMZ: 
MMD: 
MMAK: 
MMAO: 
MAE: 
MVN: 
MVO: 
MOK: 
MAC: 
MA_3624(endA)
MBA: 
MBY: 
MBW: 
MBAR: 
MBAK: 
MMA: 
MMJ: 
MMAC: 
MVC: 
MEK: 
MLS: 
METM: 
MEF: 
MEQ: 
MSJ: 
MSZ: 
MSW: 
MTHE: 
MTHR: 
MHOR: 
MBU: 
Mbur_1040(endA)
MMET: 
MMH: 
MHAZ: 
MEV: 
MZH: 
MPY: 
MHZ: 
MTP: 
MCJ: 
MCON_2907(endA)
MHI: 
MHU: 
MLA: 
MEM: 
MBG: 
MEMA: 
MPI: 
MBN: 
MFO: 
MPL: 
MPD: 
MCP_1408(endA)
MEZ: 
Mtc_1791(endA)
RCI: 
RRC215(endA)
MTH: 
MMG: 
METC: 
MWO: 
MST: 
Msp_0652(endA)
MSI: 
MRU: 
mru_1495(endA)
MEB: 
Abm4_0704(endA)
MMIL: 
sm9_0833(endA)
MEYE: 
MOL: 
MEL: 
MEW: 
METH: 
MFC: 
BRM9_0594(endA)
MFI: 
MCUB: 
MCBB_1609(endA)
MFV: 
MKA: 
MK0341(sen2_1)
AFU: 
AFG: 
APO: 
AVE: 
AST: 
FPL: 
GAC: 
GAH: 
HAL: 
VNG_2210G(endA)
HSL: 
OE_4102R(endA)
HDL: 
HHB: 
Hhub_1024(endA)
HJE: 
HALH: 
HHSR: 
HSR6_0183(endA)
HSU: 
HSF: 
HMA: 
rrnAC2964(endA)
HHI: 
HAH_0224(endA)
HHN: 
HAB: 
NPH: 
NP_0444A(endA)
NMO: 
Nmlp_3562(endA)
HUT: 
HTI: 
HMU: 
HALI: 
HWA: 
HQ_1047A(endA)
HWC: 
Hqrw_1053(endA)
HVO: 
HVO_2952(endA)
HME: 
HFX_2946(endA)
HGI: 
HBO: 
HLA: 
HTU: 
HDA: 
NMG: 
HXA: 
NAT: 
NPE: 
NGE: 
HRU: 
NOU: 
SALI: 
HLR: 
HLC: 
NAJ: 
TAC: 
TVO: 
TVG0390826(TVG0390826)
PTO: 
FAC: 
FAI: 
CDIV: 
TAR: 
MAX: 
MER: 
MEAR: 
MARC: 
PHO: 
PH0295(PH0295)
PAB: 
PAB1099(endA)
PFU: 
PFI: 
PYN: 
PYA: 
PYS: 
PYC: 
TKO: 
TON: 
TGA: 
TGAM_2056(endA)
TSI: 
TBA: 
THE: 
THA: 
THM: 
TLT: 
THS: 
TNU: 
TEU: 
TGY: 
THV: 
TCH: 
TPEP: 
TPIE: 
TGG: 
TCE: 
PPAC: 
ABI: 
ACF: 
APE: 
ACJ: 
SMR: 
SHC: 
IHO: 
IIS: 
DKA: 
DFD: 
DMU: 
TAG: 
IAG: 
THG: 
HBU: 
PFM: 
PDL: 
SSO: 
SOL: 
SSOA: 
SSOL: 
SSOF: 
STO: 
SAI: 
SACN: 
SACR: 
SACS: 
SIS: 
SIA: 
SIM: 
SID: 
SIY: 
SIN: 
SII: 
SIH: 
SIR: 
SIC: 
SULA: 
MSE: 
MCN: 
AHO: 
AMAN: 
PAI: 
PIS: 
PCL: 
PAS: 
PYR: 
POG: 
TNE: 
PYW: 
CMA: 
TUZ: 
TTN: 
VDI: 
VMO: 
TPE: 
THB: 
TCB: 
THF: 
ASC: 
CLG: 
FFO: 
NMR: 
NIR: 
NID: 
NIN: 
NKR: 
NCT: 
NMSP_0593(endA_1) NMSP_1275(endA_2)
CSY: 
NGA: 
Ngar_c17700(endA1) Ngar_c18600(endA2)
NVN: 
NVIE_0359(endA1) NVIE_0473(endA2)
NEV: 
TAA: 
CSU: 
NBV: 
T478_0428(endA) T478_0867(endA)
TAH: 
NDV: 
NEQ: 
NAA: 
NAC: 
MARH: 
KCR: 
BARC: 
AOA65_0349(endA_1) AOA65_0846(endA_2)
BARB: 
AOA66_0074(endA_1) AOA66_0677(endA_2)
LOKI: 
HAH: 
AGW: 
ARG: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:3937725]
  Authors
Attardi DG, Margarit I, Tocchini-Valentini GP.
  Title
Structural alterations in mutant precursors of the yeast tRNALeu3 gene which behave as defective substrates for a highly purified splicing endoribonuclease.
  Journal
EMBO. J. 4 (1985) 3289-97.
Reference
2  [PMID:6186398]
  Authors
Peebles CL, Gegenheimer P, Abelson J.
  Title
Precise excision of intervening sequences from precursor tRNAs by a membrane-associated yeast endonuclease.
  Journal
Cell. 32 (1983) 525-36.
Reference
3  [PMID:2470486]
  Authors
Thompson LD, Brandon LD, Nieuwlandt DT, Daniels CJ.
  Title
Transfer RNA intron processing in the halophilic archaebacteria.
  Journal
Can. J. Microbiol. 35 (1989) 36-42.
Reference
4  [PMID:3192521]
  Authors
Thompson LD, Daniels CJ.
  Title
A tRNA(Trp) intron endonuclease from Halobacterium volcanii. Unique substrate recognition properties.
  Journal
J. Biol. Chem. 263 (1988) 17951-9.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
117444-13-0

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