KEGG   ENZYME: 4.99.1.3Help
Entry
EC 4.99.1.3                 Enzyme                                 

Name
sirohydrochlorin cobaltochelatase;
CbiK;
CbiX;
CbiXS;
anaerobic cobalt chelatase;
cobaltochelatase [ambiguous];
sirohydrochlorin cobalt-lyase (incorrect)
Class
Lyases;
Other lyases;
Sole sub-subclass for lyases that do not belong in the other subclasses
BRITE hierarchy
Sysname
cobalt-sirohydrochlorin cobalt-lyase (sirohydrochlorin-forming)
Reaction(IUBMB)
cobalt-sirohydrochlorin + 2 H+ = sirohydrochlorin + Co2+ [RN:R05807]
Reaction(KEGG)
Substrate
cobalt-sirohydrochlorin [CPD:C11538];
H+ [CPD:C00080]
Product
sirohydrochlorin [CPD:C05778];
Co2+ [CPD:C00175]
Comment
This enzyme is a type II chelatase, being either a monomer (CbiX) or a homodimer (CibK) and being ATP-independent. CbiK from Salmonella enterica uses precorrin-2 as the substrate to yield cobalt-precorrin-2. The enzyme contains two histidines at the active site that are thought to be involved in the deprotonation of the tetrapyrrole substrate as well as in metal binding. CbiX from Bacillus megaterium inserts cobalt at the level of sirohydrochlorin (factor-II) rather than precorrin-2.
History
EC 4.99.1.3 created 2004
Pathway
Porphyrin and chlorophyll metabolism
Metabolic pathways
Orthology
K02190  
sirohydrochlorin cobaltochelatase
K03795  
sirohydrochlorin cobaltochelatase
Genes
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM2025(cbiK)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SENR: 
SEND: 
SENI: 
SEEN: 
SPT: 
SPA0846(cbiK)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_1690(cbiK)
SEC: 
SCH_2033(cbiK)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG2050(cbiK)
SEL: 
SPUL_0875(cbiK)
SEGA: 
SET: 
SEN2023(cbiK)
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
SENE: 
SENC: 
SES: 
YEN: 
YE2716(cbiK)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YEW: 
CH47_2064(cbiK)
YET: 
CH48_3167(cbiK)
YEF: 
YEE: 
YAL: 
AT01_4050(cbiK)
YFR: 
AW19_735(cbiK)
YIN: 
CH53_3382(cbiK)
YKR: 
YRO: 
CH64_95(cbiK)
YAK: 
PLU: 
plu2989(cbiK)
PAY: 
PAU_01611(cbiK)
PTT: 
ESC: 
ENR: 
KPN: 
KPN_03190(cbiK)
KPU: 
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPV: 
KPW: 
KPY: 
KPG: 
KPC: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPK_0926(cbiK)
KPO: 
KPR: 
KPR_1844(cbiK)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KPB: 
KPNE: 
KPNU: 
KVA: 
KVD: 
KVQ: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOM: 
KLE: 
CKO: 
CRO: 
ROD_21101(cbiK)
CFD: 
CAMA: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_1994(cbiK)
ETD: 
ETAF_1803(cbiK)
ETE: 
ETEE_4050(cbiK)
ETC: 
EDW: 
XBO: 
XBV: 
XBW1_1568(cbiK)
XNE: 
XNM: 
EBT: 
MMK: 
PGE: 
HAV: 
KSA: 
KIN: 
OPO: 
EBF: 
VSP: 
VNI: 
SSE: 
MAQ: 
MHC: 
MAD: 
MSR: 
MSX: 
MARI: 
MVS: 
MCA: 
MDN: 
MAH: 
HHA: 
HCH: 
CSA: 
HEL: 
HHU: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
OAI: 
GSN: 
TAU: 
RSO: 
RSC: 
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
RMN: 
REU: 
REH: 
H16_A2993(cbiX)
CNC: 
RME: 
Rmet_2810(cbiX)
CTI: 
CBW: 
CGD: 
CR3_0413(cbiX)
BMA: 
BMV: 
BML: 
BMN: 
BMAL: 
BMAE: 
BMAQ: 
BMAI: 
BMAF: 
BMAZ: 
BMAB: 
BPS: 
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
BPSE: 
BPSM: 
BPSU: 
BPSD: 
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BPSH: 
BPSA: 
BPSO: 
BUT: 
BTE: 
BTQ: 
BTJ: 
BTZ: 
BTD: 
BTV: 
BTHE: 
BTHM: 
BTHA: 
BTHL: 
BOK: 
BOC: 
BVI: 
BVE: 
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCEN: 
BCEW: 
BCEO: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BMK: 
BMUL: 
BCT: 
BCED: 
BDL: 
BPYR: 
BCON: 
BGL: 
BGP: 
BGU: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BGD: 
BGO: 
BYI: 
BUK: 
BUO: 
BUE: 
BUL: 
BUB: 
BUQ: 
BPLA: 
BUD: 
BXE: 
BXB: 
BPH: 
BRH: 
BPX: 
BPY: 
BFN: 
BCAI: 
PNU: 
PDQ: 
PPK: 
PPNO: 
PPNM: 
PRB: 
PPUL: 
PSPU: 
PAPI: 
PVE: 
POX: 
PTX: 
PFG: 
PNR: 
RFR: 
POL: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
CTES: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
OTO: 
LIM: 
LIH: 
CBAA: 
CBAB: 
MPT: 
HAR: 
MMS: 
JAG: 
HSE: 
HHT: 
HRB: 
ZIN: 
CFU: 
CFU_3517(cbiX)
CARE: 
CPRA: 
MNR: 
MASW: 
LCH: 
THI: 
RGE: 
RGE_29170(cbiX)
RBN: 
RDP: 
PKT: 
BBAG: 
PBH: 
EBA: 
AZO: 
AZA: 
AZKH_3941(cbiX) AZKH_4156(cbiX)
AZI: 
DAR: 
TMZ: 
THU: 
DSU: 
SHD: 
RBU: 
APP: 
SSDC: 
BPRC: 
TDN: 
ABU: 
ABT: 
ABL: 
ANT: 
SBA: 
SMUL: 
SMUL_1551(cbiK)
GLO: 
GSB: 
PCA: 
Pcar_0478(cbiK)
DVU: 
DVL: 
DVM: 
DVG: 
DDE: 
DDS: 
DDN: 
DMA: 
DMR_00730(cbiK) DMR_15530(cbiK)
DSA: 
DAS: 
DAF: 
DHY: 
DPI: 
DGG: 
DFI: 
LIP: 
LIR: 
DBA: 
DRT: 
DPS: 
DAK: 
DPR: 
DSF: 
DAL: 
DAT: 
HRM2_07680(cbiK1) HRM2_07700(cbiK2) HRM2_45790(cbiK3)
DTO: 
HOH: 
DAO: 
SFU: 
DBR: 
HMR: 
HOE: 
AVI: 
AUA: 
HCI: 
HCT: 
HCD: 
DSH: 
Dshi_0171(cbiX2)
PSF: 
OAT: 
OAR: 
OTM: 
OSB_01900(cbiX)
PTP: 
CMAR: 
HAT: 
LAP: 
MAG: 
MGY: 
MAGX: 
TMO: 
TMO_2777(cbiX)
TXI: 
MAGQ: 
MGM: 
PGV: 
APB: 
AFE: 
AFR: 
AFI: 
BPF: 
BMQ: 
BMQ_2618(cbiX)
BMD: 
BMD_2605(cbiX)
BMEG: 
BG04_5074(cbiX)
BACI: 
BACO: 
BEO: 
BSJ: 
GKA: 
GTN: 
GTNG_1693(cbiX)
GTH: 
GTE: 
GWC: 
GYC: 
GYA: 
GCT: 
GMC: 
GGH: 
GJF: 
GEA: 
GEL: 
GSE: 
AFL: 
AGN: 
LSP: 
LGY: 
LFU: 
LMO: 
lmo1202(cbiK)
LMF: 
LMH: 
LMC: 
LMN: 
LMY: 
LMT: 
LMG: 
LMS: 
LMJ: 
LMQ: 
LMM7_1207(cbiK)
LML: 
LMP: 
LMW: 
LMX: 
LMZ: 
LMON: 
LMOC: 
LMOS: 
LMOO: 
LMOY: 
LMOT: 
LMOA: 
LMOL: 
LMOG: 
LMOE: 
LMOB: 
LMOJ: 
LMOZ: 
LMOD: 
LMON_1195(cbiK)
LMOW: 
LMOX: 
LMOQ: 
LMR: 
LMOK: 
LMV: 
LMOM: 
LIN: 
LWE: 
lwe1159(cbiK)
LSG: 
lse_1081(cbiK)
LIV: 
LIV_1133(cbiK)
LII: 
LIW: 
LIA: 
LIO: 
BBE: 
BLR: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPM_4708(cbiX)
PPOL: 
PPQ: 
PPOY: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PLV: 
PSAB: 
PDU: 
PBJ: 
PPEO: 
PNP: 
ANX: 
BTS: 
SIV: 
KUR: 
SSA: 
SIP: 
LRE: 
LRF: 
LRU: 
LGN: 
PCE: 
PECL_1389(cbiK) PECL_1391(cbiK)
AUR: 
CAC: 
CA_C1373(cbiK)
CAE: 
CAY: 
CPE: 
CPF: 
CPF_1436(cbiK)
CPR: 
CPR_1242(cbiK)
CTC: 
CTC_00743(cbiK)
CTET: 
CNO: 
CBO: 
CBO0952(cbiK)
CBA: 
CLB_0994(cbiK)
CBH: 
CLC_1008(cbiK)
CBY: 
CLM_1103(cbiK)
CBL: 
CLK_0390(cbiK)
CBK: 
CBB: 
CLD_3608(cbiK)
CBI: 
CLJ_B1003(cbiK)
CBN: 
CbC4_2306(cbiK)
CBT: 
CBF: 
CLI_1042(cbiK)
CBM: 
CBF_1011(cbiK)
CBJ: 
CBE: 
CBZ: 
CKL: 
CKL_0720(cbiK)
CKR: 
CLJ: 
CCB: 
CLS: 
CSR: 
CPAS: 
CPAT: 
CPAE: 
CSB: 
CAH: 
CLT: 
CBV: 
CSQ: 
CLD: 
CCK: 
CBUT: 
AOE: 
RUM: 
CLE: 
RHO: 
CCT: 
ROB: 
CPY: 
CSH: 
CSO: 
CDF: 
PDC: 
CDC: 
CDL: 
CDG: 
PDF: 
CST: 
SLP: 
DRM: 
DAE: 
DCA: 
DRU: 
DGI: 
SGY: 
HMO: 
HM1_0528(cbiK)
EEL: 
ELM: 
AWO: 
SAY: 
TPY_1364(cbiX)
SAP: 
EUU: 
BPRS: 
IBU: 
TEX: 
THX: 
TPD: 
TIT: 
TMT: 
TWI: 
TKI: 
TOC: 
TTM: 
TSH: 
VPR: 
MED: 
SSG: 
SRI: 
SELE: 
MHG: 
PUF: 
PFT: 
TUR: 
SCO: 
SCO1858(SCI39.05)
SMA: 
SAV_6405(cbiX)
SCB: 
SVL: 
SCT: 
SCAT_1055(cbiX)
SCY: 
SBH: 
SHY: 
SHO: 
SDV: 
SCI: 
SRC: 
SALU: 
SALL: 
SLV: 
SGU: 
STRE: 
SCW: 
SLD: 
STRC: 
SAMB: 
SCX: 
SRW: 
TUE45_02337(cbiX_1)
STRF: 
PPC: 
TCU: 
SRO: 
FRE: 
FAL: 
FSY: 
STP: 
SAQ: 
CAI: 
TBI: 
RXY: 
RRD: 
AFO: 
SHI: 
GPA: 
OLO: 
CBAC: 
SYN: 
SYZ: 
SYY: 
SYNGTS_2831(sll0037)
SYT: 
SYNGTI_2830(sll0037)
SYS: 
SYNPCCN_2829(sll0037)
SYQ: 
SYNPCCP_2829(sll0037)
SYJ: 
SYW: 
SYD: 
SYG: 
sync_1195(cbiX)
SYR: 
SYX: 
CYA: 
CYA_2373(cbiX)
CYB: 
CYB_2347(cbiX)
SYNK: 
SYNR: 
SYND: 
SYH: 
TEL: 
THN: 
CYT: 
CYP: 
CYC: 
CYN: 
CYH: 
CYJ: 
AMR: 
CGC: 
CAN: 
CSN: 
DSL: 
HAO: 
GLP: 
CYU: 
GEN: 
TER: 
LET: 
GEI: 
PSEU: 
CEP: 
MIC: 
GVI: 
RIV: 
PMA: 
PMT: 
PMN: 
PMC: 
PMF: 
PMG: 
PMH: 
PMJ: 
PME: 
PRM: 
CTHE: 
PLP: 
SCS: 
DEW: 
RRS: 
RCA: 
CAU: 
CAG: 
CHL: 
HAU: 
CAP: 
DGE: 
DDR: 
DMR: 
DGO: 
DPD: 
DSW: 
DCH: 
DAB: 
CCZ: 
XII: 
MIN: 
TDE: 
TDE2656(cbiK)
TPI: 
TPED: 
TPE_1168(cbiK)
TPK: 
SSM: 
FNU: 
FNC: 
FNT: 
FUS: 
FNE: 
FHW: 
IPO: 
LBA: 
LEO: 
TAI: 
SBR: 
PSL: 
SACI: 
BFR: 
BFS: 
BFG: 
BFB: 
BVU: 
BHL: 
BDO: 
BDH: 
BCEL: 
PGI: 
PG_0669(fetB)
PGN: 
PGT: 
PAH: 
PDI: 
PPN: 
TFO: 
OSP: 
PRU: 
CPI: 
FCO: 
TDI: 
CTE: 
CPC: 
CLI: 
PAA: 
CTS: 
TTK: 
TST_0126(cbiK)
TME: 
TAF: 
THA_1066(cbiX)
DIN: 
DDF: 
DAP: 
CNI: 
NMV: 
LFC: 
LFE_1750(cbiX)
LFI: 
LFP: 
LEG: 
TID: 
MJA: 
MFE: 
MVU: 
MFS: 
MIF: 
MJH: 
MIG: 
MMP: 
MMP0164(cbiX(s))
MMQ: 
MMX: 
MMZ: 
MMD: 
MMAK: 
MMAO: 
MAE: 
MVN: 
MVO: 
MOK: 
MAC: 
MA_3631(cbiX)
MBA: 
MBY: 
MBW: 
MBAR: 
MMA: 
MMAZ: 
MVC: 
MEK: 
MLS: 
METM: 
MEF: 
MEQ: 
MSJ: 
MSZ: 
MSW: 
MTHE: 
MTHR: 
MHOR: 
MBU: 
Mbur_1035(cbiXS)
MMET: 
MMH: 
MEV: 
MZH: 
MPY: 
MHZ: 
MTP: 
MCJ: 
MCON_0747(cbiK) MCON_1928(cbiX) MCON_2896(cbiK)
MHI: 
MHU: 
MLA: 
MEM: 
MBG: 
MPI: 
MBN: 
MFO: 
MPL: 
MPD: 
MCP_0361(cbiX-1) MCP_2528(cbiX-2)
MEZ: 
Mtc_0061(cbiX)
RCI: 
RCIX2006(cbiX-1) RCIX98(cbiX-2)
MTH: 
MMG: 
METC: 
MST: 
MSI: 
MRU: 
mru_0895(cbiK) mru_2200(cbiX)
MEB: 
Abm4_0618(cbiX1) Abm4_0619(cbiX2)
MMIL: 
sm9_2307(cbiX1) sm9_2308(cbiX2)
MEYE: 
MEL: 
MEW: 
METH: 
MFC: 
MFI: 
MFV: 
MKA: 
AFU: 
AFG: 
APO: 
AST: 
FPL: 
GAC: 
GAH: 
HAL: 
HSL: 
OE_2585R(cbiX2)
HDL: 
HHB: 
Hhub_2298(cbiX2)
HMA: 
HHI: 
HAH_1880(cbiX2)
HHN: 
NPH: 
NP_1588A(cbiX2)
NMO: 
Nmlp_3060(cbiX2)
HUT: 
HTI: 
HMU: 
HJE: 
HWA: 
HQ_1656A(cbiX2)
HWC: 
Hqrw_1771(cbiX2)
HLA: 
HVO: 
HVO_1128(cbiX2)
HME: 
HFX_1136(cbiX)
HGI: 
HBO: 
HTU: 
NMG: 
HXA: 
NAT: 
NPE: 
NOU: 
SALI: 
HLR: 
TAR: 
MAX: 
MER: 
MEAR: 
Mpt1_c07010(cbiX1) Mpt1_c08040(cbiX2) Mpt1_c08050(cbiX3)
MARC: 
IHO: 
IIS: 
SSO: 
SOL: 
SSOA: 
SSOL: 
SSOF: 
STO: 
STK_03830(cbiXS)
SAI: 
SACN: 
SACR: 
SACS: 
SIS: 
SIA: 
SIM: 
SID: 
SIY: 
SIN: 
SII: 
SIH: 
SIR: 
SIC: 
MSE: 
MCN: 
AHO: 
CSY: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:10451360]
  Authors
Schubert HL, Raux E, Wilson KS, Warren MJ.
  Title
Common chelatase design in the branched tetrapyrrole pathways of heme and anaerobic cobalamin synthesis.
  Journal
Biochemistry. 38 (1999) 10660-9.
  Sequence
[stm:STM2025]
Reference
2  [PMID:12686546]
  Authors
Brindley AA, Raux E, Leech HK, Schubert HL, Warren MJ.
  Title
A story of chelatase evolution: identification and characterization of a small 13-15-kDa "ancestral" cobaltochelatase (CbiXS) in the archaea.
  Journal
J. Biol. Chem. 278 (2003) 22388-95.
  Sequence
[mba:Mbar_A0344] [mth:MTH_1397]
Reference
3  [PMID:12195810]
  Authors
Warren MJ, Raux E, Schubert HL, Escalante-Semerena JC.
  Title
The biosynthesis of adenosylcobalamin (vitamin B12).
  Journal
Nat. Prod. Rep. 19 (2002) 390-412.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 

DBGET integrated database retrieval system