KEGG   ENZYME: 5.3.1.17Help
Entry
EC 5.3.1.17                 Enzyme                                 

Name
5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate isomerase;
4-deoxy-L-threo-5-hexulose uronate isomerase;
4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase;
kduI (gene name)
Class
Isomerases;
Intramolecular oxidoreductases;
Interconverting aldoses and ketoses, and related compounds
BRITE hierarchy
Sysname
5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate aldose-ketose-isomerase
Reaction(IUBMB)
5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate = 3-deoxy-D-glycero-2,5-hexodiulosonate [RN:R04383]
Reaction(KEGG)
Substrate
5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate [CPD:C04053]
Product
3-deoxy-D-glycero-2,5-hexodiulosonate [CPD:C04349]
Comment
The enzyme is involved in the degradation of polygalacturonate, a later stage in the degradation of pectin by many microorganisms.
History
EC 5.3.1.17 created 1972, modified 2012
Pathway
Pentose and glucuronate interconversions
Orthology
K01815  
4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase
Genes
ECO: 
b2843(kduI)
ECJ: 
JW2811(kduI)
ECD: 
EBW: 
BWG_2579(kduI)
ECOK: 
ECE: 
Z4163(kduI)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_3796(kduI)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c3440(kduI)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_3271(kduI)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_02691(kduI)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m3088(kduI)
ELL: 
WFL_15070(kduI)
ELC: 
i14_3159(kduI)
ELD: 
i02_3159(kduI)
ELP: 
EBL: 
ECD_02691(kduI)
EBE: 
B21_02654(kduI)
ELF: 
LF82_1155(kduI)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
ECOS: 
STY: 
STY3163(kduI)
STT: 
t2928(kduI)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM3018(kduI)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SENR: 
SEND: 
SENI: 
SEEN: 
SPT: 
SPA2885(kduI)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_3077(kduI)
SEC: 
SCH_2957(kduI)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SeD_A3350(kduI)
SEG: 
SG2927(kduI)
SEL: 
SPUL_3031(kduI)
SET: 
SEN2861(kduI)
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SENB: 
SENE: 
SENC: 
SES: 
SBG: 
SBG_2623(kduI)
SBZ: 
SBV: 
YPE: 
YPO1725(kduI)
YPK: 
y1887(kduI)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_1750(kduI)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPZ3_1980(kduI)
YPT: 
YPD: 
YPD4_1535(kduI)
YPX: 
YPD8_2017(kduI)
YPH: 
YPC_2091(kduI)
YPW: 
CH59_109(kduI)
YPJ: 
CH55_523(kduI)
YPV: 
BZ15_1824(kduI)
YPL: 
CH46_3398(kduI)
YPS: 
YPTB2356(kduI)
YPO: 
BZ17_100(kduI)
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
DJ40_4217(kduI)
YPU: 
BZ21_1642(kduI)
YPR: 
BZ20_3851(kduI)
YPC: 
BZ23_1928(kduI)
YPF: 
YEN: 
YE1888(kduI)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YEW: 
CH47_1322(kduI)
YET: 
CH48_3595(kduI)
YEF: 
YEE: 
YSI: 
YFR: 
AW19_1429(kduI)
YIN: 
CH53_4260(kduI)
YKR: 
YRO: 
CH64_773(kduI)
YRU: 
BD65_2443(kduI)
YRB: 
SFL: 
SF2853(kduI)
SFX: 
S3051(kduI)
SFV: 
SFV_2921(kduI)
SFE: 
SFxv_3127(kduI)
SFN: 
SFS: 
SFT: 
SSN: 
SSON_3003(kduI)
SSJ: 
SBO: 
SBO_2735(kduI)
SBC: 
SHQ: 
ECA: 
ECA2400(kduI1) ECA4125(kduI2)
PATR: 
PATO: 
GZ59_21570(kduI1) GZ59_41800(kduI2)
PCT: 
PCC: 
PCV: 
PWA: 
PEC: 
EGE: 
SOD: 
Sant_2090(kduI)
ENT: 
ENC: 
ENO: 
EEC: 
ENL: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ECLA: 
ECLC: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
ENR: 
ENX: 
ENF: 
ESA: 
CSK: 
ES15_0450(kduI)
CSZ: 
CSI: 
CSJ: 
CCON: 
CDM: 
CMJ: 
CUI: 
CMW: 
CTU: 
CTU_37240(kduI)
KLE: 
EAE: 
EAR: 
CKO: 
CRO: 
ROD_28921(kduI)
CFD: 
CAMA: 
CIF: 
SMAF: 
SERR: 
SFO: 
PMR: 
PMI2133(kduI)
PMIB: 
PVL: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_1898(kduI)
ETD: 
ETE: 
ETEE_3941(kduI)
ETC: 
EDW: 
EDL: 
DDA: 
DDD: 
DZE: 
DDC: 
DZC: 
DSO: 
PAM: 
PANA_0582(kduI)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_3723(kduI)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_1129(kduI)
PAO: 
KLN: 
PANP: 
PAGG: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
EBT: 
CEM: 
CEN: 
CED: 
PGE: 
HAV: 
KSA: 
KIN: 
LAX: 
OPO: 
LAZ: 
EBF: 
XCC: 
XCC0151(kduI)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XCV0152(kduI)
XAC: 
XAC0168(kduI)
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAX: 
XACM_0153(kduI)
XAO: 
XOM: 
XOO0167(XOO0167) XOO0168(XOO0168)
XOP: 
XOY: 
XOR: 
XSA: 
XTN: 
PSU: 
PSUW: 
LAB: 
LCP: 
LGU: 
VHR: 
VFU: 
VNI: 
VMI: 
VFI: 
VF_A0998(kduI)
VFM: 
PPR: 
PGB: 
PBW: 
AMH: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMK: 
AAL: 
AAUS: 
ASP: 
AAW: 
LAL: 
PSY: 
CJA: 
SDE: 
TTU: 
SAGA: 
MTHD: 
HEL: 
HELO_2960(kduI)
HHU: 
GSN: 
AVR: 
TAU: 
BCJ: 
BCAM0154(kduI)
BCEO: 
I35_4135(kduI)
BCED: 
DM42_5025(kduI)
BPYR: 
BCON: 
BGP: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BGD: 
BGO: 
BM43_123(kduI)
BUQ: 
BPLA: 
BPH: 
BPX: 
BPY: 
BFN: 
BCAI: 
RGE: 
RGE_05460(kduI)
RBN: 
RDP: 
MIU: 
SCU: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
HOE: 
AAK: 
SME: 
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
BN406_04964(kduI1) BN406_05736(kduI2)
SMEG: 
SMEL: 
SMER: 
SMD: 
RHI: 
SFH: 
SFD: 
EAD: 
ATU: 
Atu3142(kduI)
ATF: 
ATA: 
AVI: 
AGR: 
RET: 
REC: 
REL: 
REI: 
REP: 
RLE: 
RLT: 
RLG: 
RLB: 
RLU: 
RIR: 
RHL: 
RGA: 
NGL: 
NGG: 
SHZ: 
BOP: 
AZC: 
SNO: 
MET: 
CHEL: 
PHL: 
MEY: 
MAAD: 
CCR: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
CHQ: 
PZU: 
PHZ_c2451(kduI)
BRD: 
BRG: 
AEX: 
RSP: 
RSP_0482(kduI)
RSH: 
RSQ: 
RSK: 
PSF: 
PSE_2878(kduI)
OAT: 
OTM: 
OSB_21270(kduI)
CMAR: 
MALG: 
PPHR: 
HAT: 
LAP: 
DAA: 
HBC: 
SPHK: 
SKP52_01825(kduI1) SKP52_19515(kduI2)
SPHP: 
SMAG: 
STER: 
SPHI: 
SSAN: 
SCH: 
AZL: 
ALI: 
ABS: 
ABQ: 
ATI: 
TXI: 
BSU: 
BSU22130(kduI)
BSR: 
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSUT: 
BSUL: 
BSUS: 
BSS: 
BST: 
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSX: 
C663_2086(kduI)
BSP: 
BLD: 
BLi03829(kduI)
BLH: 
BAE: 
BATR: 
BHA: 
BH2166(kduI)
BCZ: 
BCL: 
ABC0994(kduI)
BPU: 
BPUM_3246(kduI)
BPUM: 
BAG: 
BCOA: 
BF29_1332(kduI1)
BJS: 
BACI: 
BIF: 
BLE: 
BACW: 
BBY: 
BACY: 
BACL: 
BALM: 
BEO: 
OIH: 
TAP: 
BSE: 
PJD: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPM_4786(kduI)
PPOL: 
PPQ: 
PPOY: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PLV: 
PBD: 
PGM: 
POD: 
PAEN: 
PAEF: 
PAEQ: 
PSTE: 
PAEA: 
PAEE: 
PAEH: 
PAEJ: 
PBJ: 
PRI: 
PRIO_3971(kduI)
PPEO: 
PNP: 
POW: 
PBV: 
TCO: 
SIV: 
SSIL_2364(kduI)
SUB: 
SUB1606(kduI)
STK: 
LBR: 
LBK: 
LCA: 
LPI: 
LPQ: 
LCB: 
LCZ: 
LCS: 
LCE: 
LCW: 
LCL: 
LCX: 
LRL: 
LRA: 
LRHK_2800(kduI1)
LRO: 
LRC: 
LHO: 
LKO: 
EFA: 
EF0425(kduI-1) EF2264(kduI-2)
EFL: 
EFI: 
EFD: 
EFS: 
EFS1_0306(kduI)
EFN: 
EFQ: 
DR75_2418(kduI1)
EFC: 
EFAU: 
EFU: 
EFM: 
EFT: 
ENE: 
ECAS: 
EMU: 
EMQU_0236(kduI)
EDU: 
EGA: 
ESS: 
MPS: 
MPX: 
CPF: 
CPF_0395(kduI) CPF_0399(kduI)
CPR: 
CPR_0391(kduI_1) CPR_0395(kduI_2)
CBN: 
CBE: 
CBZ: 
CCB: 
CSR: 
CBV: 
U729_2509(kduI1) U729_2959(kduI1)
CBUT: 
AMT: 
CSS: 
CSD: 
RAL: 
FPR: 
FPA: 
BPB: 
bpr_I0929(kduI)
CLE: 
RHO: 
RIX: 
RIM: 
CPY: 
CSH: 
EEL: 
OVA: 
OBV_11520(kduI)
BPRS: 
TIT: 
TEP: 
TAE: 
CSC: 
ATE: 
COB: 
CHD: 
COW: 
CKI: 
CKN: 
CLC: 
TTM: 
TTO: 
TXY: 
TSH: 
SRI: 
PUF: 
PFT: 
MCD: 
MCRO_0401(kduI)
MFR: 
MFE_04680(kduI)
MFM: 
MFP: 
ABRA: 
APAL: 
AOC: 
MTS: 
SATK: 
BCV: 
XCE: 
IDO: 
I598_2660(kduI1)
CFI: 
KFL: 
KRA: 
KAL: 
KPHY: 
OTE: 
CAA: 
VBA: 
VBL: 
TBE: 
SCD: 
STA: 
STQ: 
SBU: 
SCC: 
SGP: 
ACM: 
GMA: 
TSA: 
IPO: 
STR: 
SMF: 
GBA: 
BTH: 
BFR: 
BFS: 
BFG: 
BFB: 
BVU: 
BHL: 
BSA: 
BXY: 
BDO: 
BDH: 
BOA: 
BCEL: 
TFO: 
PBT: 
PRU: 
PRU_1290(kduI)
PDT: 
PEO: 
ASH: 
DOI: 
RMR: 
RMG: 
CPI: 
NKO: 
NSO: 
FLA: 
ARB: 
HHY: 
PHE: 
PEP: 
PCM: 
PSN: 
SHG: 
SHT: 
MUP: 
BBD: 
EVI: 
DFE: 
SLI: 
SRD: 
LBY: 
RSI: 
EOL: 
FAE: 
HSW: 
HYG: 
HYP: 
PKO: 
RUF: 
RTI: 
FBT: 
FJO: 
FBR: 
ZPR: 
FBC: 
CBAL: 
CBAT: 
ZGA: 
ORH: 
ORI: 
NDO: 
EAO: 
EMN: 
ELB: 
CIH: 
SZE: 
AHZ: 
FBA: 
MRO: 
TTA: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1
  Authors
Preiss, J.
  Title
4-Deoxy-L-threo-5-hexosulose uronic acid isomerase.
  Journal
Methods Enzymol. 9 (1966) 602-604.
Reference
2  [PMID:1766386]
  Authors
Condemine G, Robert-Baudouy J
  Title
Analysis of an Erwinia chrysanthemi gene cluster involved in pectin degradation.
  Journal
Mol. Microbiol. 5 (1991) 2191-202.
  Sequence
Reference
3  [PMID:9761873]
  Authors
Dunten P, Jaffe H, Aksamit RR
  Title
Crystallization of 5-keto-4-deoxyuronate isomerase from Escherichia coli.
  Journal
Acta. Crystallogr. D. Biol. Crystallogr. 54 (1998) 678-80.
  Sequence
[eco:b2843]
Reference
4  [PMID:16152643]
  Authors
Crowther RL, Georgiadis MM
  Title
The crystal structure of 5-keto-4-deoxyuronate isomerase from Escherichia coli.
  Journal
Proteins. 61 (2005) 680-4.
  Sequence
[eco:b2843]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
37318-44-8

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