KEGG   ENZYME: 5.3.1.28Help
Entry
EC 5.3.1.28                 Enzyme                                 

Name
D-sedoheptulose 7-phosphate isomerase;
sedoheptulose-7-phosphate isomerase;
phosphoheptose isomerase;
gmhA (gene name);
lpcA (gene name)
Class
Isomerases;
Intramolecular oxidoreductases;
Interconverting aldoses and ketoses, and related compounds
BRITE hierarchy
Sysname
D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate aldose-ketose-isomerase
Reaction(IUBMB)
D-sedoheptulose 7-phosphate = D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate [RN:R09768]
Reaction(KEGG)
Substrate
D-sedoheptulose 7-phosphate [CPD:C05382]
Product
D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate [CPD:C19882]
Comment
In Gram-negative bacteria the enzyme is involved in biosynthesis of ADP-L-glycero-beta-D-manno-heptose, which is utilized for assembly of the lipopolysaccharide inner core. In Gram-positive bacteria the enzyme is involved in biosynthesis of GDP-D-glycero-alpha-D-manno-heptose, which is required for assembly of S-layer glycoprotein.
History
EC 5.3.1.28 created 2010
Pathway
Lipopolysaccharide biosynthesis
Metabolic pathways
Orthology
K03271  
D-sedoheptulose 7-phosphate isomerase
Genes
ECO: 
b0222(gmhA)
ECJ: 
JW0212(lpcA)
ECD: 
EBW: 
BWG_0208(lpcA)
ECOK: 
ECE: 
Z0280(gmhA)
ECS: 
ECs0249(gmhA)
ECF: 
ETW: 
ECSP_0254(lpcA)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c0372(gmhA)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_0225(lpcA)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
O3O_05030(gmhA)
ESM: 
O3M_20250(gmhA)
ESL: 
O3K_20350(gmhA)
ECL: 
EBR: 
ECB_00217(lpcA)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m0242(lpcA)
ELL: 
WFL_01170(lpcA)
ELC: 
i14_0352(gmhA)
ELD: 
i02_0352(gmhA)
ELP: 
EBL: 
ECD_00217(gmhA)
EBE: 
B21_00221(lpcA)
ELF: 
LF82_1217(lpcA)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
ECOS: 
EFE: 
EFER_0248(lpcA)
EAL: 
STY: 
STY0355(gmhA)
STT: 
t2540(gmhA)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM0310(gmhA)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SENR: 
SENI: 
SEEN: 
SPT: 
SPA2445(gmhA)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_0321(ghmA)
SEC: 
SCH_0311(ghmA)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SeD_A0340(gmhA)
SEG: 
SG0321(ghmA)
SEL: 
SPUL_2663(ghmA)
SEGA: 
SET: 
SEN0293(ghmA)
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
SENE: 
IA1_01690(gmhA)
SENC: 
SES: 
SBG: 
SBG_0253(gmhA)
SBZ: 
SBV: 
SFL: 
SF0272(gmhA)
SFX: 
S0293(gmhA)
SFV: 
SFV_0306(gmhA)
SFE: 
SFxv_0289(lpcA)
SFN: 
SFS: 
SFT: 
SSN: 
SSON_0264(gmhA)
SBO: 
SBO_0213(gmhA)
SBC: 
SDY: 
SDY_0248(gmhA)
SDZ: 
SHQ: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ECLA: 
ECLC: 
ESC: 
KLE: 
EAS: 
EAU: 
EHM: 
EKB: 
ELG: 
EXF: 
ECLS: 
ENR: 
ENX: 
ENF: 
ESA: 
CSK: 
ES15_3116(gmhA)
CSZ: 
CSI: 
CSJ: 
CCON: 
CDM: 
CMJ: 
CUI: 
CMW: 
CTU: 
CTU_08420(gmhA)
KPN: 
KPN_00236(lpcA)
KPU: 
KP1_1080(lpcA)
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPV: 
KPW: 
KPY: 
KPG: 
KPC: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPK_4496(gmhA)
KPO: 
KPR: 
KPR_1163(gmhA)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KPB: 
KPNE: 
KPNU: 
KVA: 
KVD: 
KVQ: 
KOX: 
KOX_11680(gmhA)
KOE: 
KOY: 
KMI: 
KOK: 
KOC: 
KOM: 
KQU: 
EAE: 
EAE_11875(gmhA)
EAR: 
CKO: 
CRO: 
ROD_02231(gmhA)
CFD: 
CBRA: 
CAMA: 
CAF: 
CIF: 
BFL: 
Bfl226(lpcA)
BPN: 
BPEN_233(gmhA)
BVA: 
BVAF_227(gmhA)
BCHR: 
BEN: 
BED: 
HDE: 
HDEF_2106(lpcA)
SECT: 
SEHC: 
RIP: 
RIG: 
EBT: 
ROR: 
RON: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
CED: 
PGE: 
KSA: 
KOR: 
KRD: 
KCO: 
KIN: 
KGO: 
LAX: 
LAZ: 
SBW: 
HED: 
EBF: 
PSTS: 
YPE: 
YPO3243(gmhA)
YPK: 
y0947(gmhA)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_0689(lpcA)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPZ3_2849(gmhA)
YPT: 
YPD: 
YPD4_2837(gmhA)
YPX: 
YPD8_2831(gmhA)
YPH: 
YPC_3537(gmhA)
YPW: 
CH59_2843(gmhA)
YPJ: 
CH55_1816(gmhA)
YPV: 
BZ15_291(gmhA)
YPL: 
CH46_1864(gmhA)
YPS: 
YPTB0884(lpcA)
YPO: 
BZ17_1662(gmhA)
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
DJ40_1347(gmhA) DJ40_1474(gmhA)
YPU: 
BZ21_129(gmhA) BZ21_255(gmhA)
YPR: 
BZ20_1034(gmhA) BZ20_1163(gmhA)
YPC: 
BZ23_406(gmhA) BZ23_531(gmhA)
YPF: 
BZ19_242(gmhA)
YEN: 
YE3223(gmhA)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YEW: 
CH47_2592(gmhA)
YET: 
CH48_2614(gmhA)
YEF: 
YEE: 
YSI: 
YAL: 
AT01_1534(gmhA)
YFR: 
AW19_2206(gmhA)
YIN: 
CH53_2784(gmhA)
YKR: 
CH54_3580(gmhA)
YRO: 
CH64_3504(gmhA)
YRU: 
BD65_2755(gmhA)
YRB: 
YAK: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SPLY: 
SRS: 
SRA: 
SSZ: 
SCc_228(lpcA)
SMAF: 
SMW: 
SMAR: 
SM39_0254(lpcA)
SMAC: 
SLQ: 
SERF: 
SERS: 
SFW: 
SFG: 
SRZ: 
SFO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
ECA: 
ECA3473(lpcA)
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PCV: 
PWA: 
PPAR: 
PEC: 
PWS: 
SGL: 
SOD: 
Sant_3151(gmhA)
PES: 
DDA: 
DDD: 
DZE: 
DDC: 
DZC: 
DSO: 
ETA: 
ETA_26030(gmhA)
EPY: 
EpC_27250(gmhA)
EPR: 
EAM: 
EAMY_0879(gmhA)
EAY: 
EAM_0891(lpcA)
EBI: 
EbC_08770(gmhA)
ERJ: 
EGE: 
BUC: 
BU250(gmhA)
BAP: 
BAU: 
BAW: 
CWU_01645(gmhA)
BAJC: 
CWS_01305(gmhA)
BUA: 
CWO_01300(gmhA)
BUP: 
CWQ_01335(gmhA)
BAK: 
BAKON_252(lpcA)
BUH: 
BUAMB_233(lpcA)
BAPF: 
BAPG: 
BAPU: 
BAPW: 
BAS: 
BUsg_241(lpcA)
BAPH: 
PAM: 
PANA_0877(gmhA)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_0212(gmhA)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_0270(gmhA)
PAO: 
KLN: 
PANT: 
PANP: 
HHS: 
HHS_08150(gmhA)
PCK: 
PAGG: 
PAGC: 
TCI: 
PLU: 
plu1193(lcpA) plu4823(wblX)
PAY: 
PTT: 
PMR: 
PMI0349(gmhA)
PMIB: 
PVL: 
XBO: 
XBJ1_3329(lpcA)
XBV: 
XBW1_3679(gmhA)
XNE: 
XNC1_3040(lpcA)
XNM: 
XNC2_2922(lpcA)
XDO: 
XDD1_1167(gmhA)
XPO: 
XPG1_2521(gmhA)
XHO: 
PSI: 
PSX: 
DR96_2046(gmhA)
PSTA: 
PRG: 
MMK: 
ASY: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_0780(gmhA)
ETD: 
ETE: 
ETEE_2541(gmhA)
ETC: 
EDW: 
EDL: 
EHO: 
HAV: 
OPO: 
PFQ: 
PSHI: 
HIN: 
HIT: 
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HIA: 
HIH: 
HIW: 
HIC: 
HIX: 
HDU: 
HAP: 
HAPS_0137(gmhA) HAPS_0747(gmhA)
HPAZ: 
HPAS: 
HPAK: 
HPR: 
HSO: 
HSM: 
PMU: 
PMV: 
PUL: 
PMP: 
PMUL: 
MSU: 
MS0218(gmhA) MS1290(gmhA)
MHT: 
MHQ: 
MHAT: 
MHX: 
MHH_c00470(gmhA1) MHH_c18420(gmhA2)
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MHAQ: 
MHAY: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
APL: 
APL_0798(lpcA) APL_1364(gmhA)
APJ: 
APA: 
APP7_0858(lpcA) APP7_1415(gmhA)
ASU: 
ASI: 
ASS: 
AEU: 
AAP: 
AAZ: 
AAT: 
AAO: 
AAN: 
AAH: 
AACN: 
AACT: 
GAN: 
BTO: 
BTRE: 
BTRH: 
BTRA: 
VCH: 
VC2230(gmhA)
VCF: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
O3Y_10725(gmhA)
VCL: 
VCQ: 
VCS: 
VCX: 
VCZ: 
VVU: 
VV1_1897(gmhA)
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VP2288(gmhA)
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VEX: 
VHR: 
VNA: 
VOW: 
VSP: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VAU: 
VCY: 
VCT: 
VTU: 
VFL: 
VMI: 
VBR: 
VSC: 
VGA: 
VSH: 
VFI: 
VF_1931(gmhA)
VFM: 
VSA: 
AWD: 
PPR: 
PBPRA2913(VV2518)
PGB: 
PDS: 
GHO: 
PAE: 
PAEV: 
N297_4570(gmhA)
PAEI: 
N296_4570(gmhA)
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PAEB: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
M802_4568(gmhA)
PAEO: 
M801_4435(gmhA)
PMY: 
PMK: 
PRE: 
PPSE: 
BN5_3127(gmhA1) BN5_3475(gmhA3)
PALC: 
PCQ: 
PPU: 
PP_1323(diaA)
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
T1E_4343(gmhA)
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_08340(gmhA)
PPUD: 
PFV: 
PMON: 
PMOT: 
PMOS: 
PPJ: 
POR: 
PST: 
PSB: 
Psyr_4115(gmhA)
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PFL_5074(gmhA)
PPRC: 
PPRO: 
PFO: 
PFS: 
PFLU_0933(diaA)
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PFW: 
PFB: 
PFF: 
PFX: 
PPZ: 
PMAN: 
OU5_4521(diaA)
PTV: 
PCG: 
PVR: 
PAZO: 
PEN: 
PSEEN4498(gmhA)
PSA: 
PST_1069(gmhA)
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
PBM: 
PBA: 
PBC: 
PPUU: 
PDR: 
PSV: 
PSK: 
PKC: 
PKB_4533(gmhA)
PCH: 
PCZ: 
PCP: 
PFZ: 
PALK: 
PRH: 
PSW: 
PPV: 
PSES: 
PSEM: 
PSEC: 
PPSY: 
PSOS: 
PKR: 
PFK: 
PANR: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
ACX: 
PBB: 
SBB: 
PHA: 
PSM: 
PSEO: 
PIA: 
PPHE: 
PBW: 
PRR: 
PTN: 
PLZ: 
PALN: 
PPIS: 
MAQ: 
MHC: 
MARHY0779(yraO)
MAD: 
HP15_550(gmhA)
MBS: 
MSR: 
MPQ: 
MARI: 
MLQ: 
MSQ: 
AMH: 
AMAG: 
GNI: 
PIN: 
PSY: 
MVS: 
MVIS_0701(gmhA)
CJA: 
CJA_0925(gmhA)
CEB: 
CELL: 
SDE: 
TTU: 
SAGA: 
SPOI: 
ZAL: 
OSG: 
MTHD: 
MICC: 
MAGA: 
HJA: 
CBU: 
CBS: 
CBD: 
CBG: 
CBC: 
CEY: 
LPN: 
lpg2993(gmhA)
LPH: 
LPV_3381(yraO)
LPO: 
LPO_3332(yraO)
LPU: 
LPM: 
LP6_3032(gmhA)
LPF: 
LPP: 
LPC: 
LPA: 
lpa_04384(gmhA)
LPE: 
LLO: 
LLO_3434(yraO)
LFA: 
LFA_3774(yraO)
LHA: 
LHA_3244(gmhA)
LOK: 
TMC: 
LMI_3164(gmhA)
MCA: 
MCA0183(gmhA)
MMT: 
MDN: 
MDH: 
MAH: 
MPSY: 
FTU: 
FTT_1681c(lpcA)
FTQ: 
RO31_1980(gmhA)
FTF: 
FTF1681c(lpcA)
FTW: 
FTW_1936(gmhA)
FTR: 
FTT: 
FTV_1600(lpcA)
FTY: 
CH70_22(gmhA)
FTG: 
FTU_1685(lpcA)
FTL: 
FTH: 
FTH_0064(gmhA)
FTA: 
FTA_0076(gmhA)
FTS: 
FTI: 
FTS_0060(gmhA)
FTO: 
FTC: 
DA46_669(gmhA)
FTV: 
CH67_324(gmhA)
FTZ: 
CH68_61(gmhA)
FTN: 
FTX: 
AW25_96(gmhA)
FTD: 
AS84_610(gmhA)
FCF: 
FCN: 
FPT: 
BZ13_1302(gmhA)
FPI: 
BF30_934(gmhA)
FPM: 
LA56_1445(gmhA)
FPX: 
KU46_621(gmhA)
FPZ: 
LA55_74(gmhA)
FPJ: 
LA02_551(gmhA)
FRT: 
FNA: 
FNL: 
FRF: 
FPER: 
FHI: 
FGU: 
TCX: 
TCY: 
TAO: 
MEJ: 
MEC: 
CYQ: 
CZA: 
PSAL: 
TIG: 
BLEP: 
NOC: 
NHL: 
NWA: 
ALV: 
TVI: 
TMB: 
MPUR: 
TEE: 
AEH: 
HHA: 
HHC: 
TKM: 
TNI: 
TVNIR_2698(gmhA_[H])
TTI: 
SPIU: 
EBS: 
APRS: 
HNA: 
HAZ: 
WOC: 
HCH: 
HCH_01840(gmhA1) HCH_05896(gmhA2) HCH_06182(gmhA3)
CSA: 
HEL: 
HELO_1949(gmhA)
HCS: 
HAK: 
HAM: 
HHU: 
HCO: 
HALO: 
HAA: 
CMAI: 
KUS: 
KMA: 
ABO: 
ABO_0584(gmhA)
ADI: 
B5T_03502(gmhA)
APAC: 
ALN: 
AXE: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
OAI: 
MARS: 
GSN: 
OME: 
AHA: 
AHA_1574(gmhA)
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
AHJ: 
AHH: 
AHI: 
ASA: 
ASA_2783(gmhA)
AVR: 
AVO: 
AMED: 
ASR: 
AAJ: 
TAU: 
OCE: 
OCM: 
OPF: 
DNO: 
DNO_0290(gmhA)
GAP: 
FPP: 
GBI: 
TBN: 
SEDS: 
THO: 
PSPI: 
EBH: 
GPB: 
ENM: 
NMA: 
NME: 
NMB2090(gmhA)
NMP: 
NMBB_2404(gmhA)
NMH: 
NMC: 
NMC2070(lpcA)
NMN: 
NMCC_2055(lpcA)
NMT: 
NMV_2296(gmhA)
NMI: 
NMO_0077(lpcA)
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMAA_0069(gmhA)
NMZ: 
NMX: 
NGO: 
NGK: 
NLA: 
NLA_2330(lpcA)
NEL: 
NWE: 
SALV: 
KKI: 
CVI: 
CV_0357(lpcA) CV_0655(gmhA)
CVC: 
LHK: 
LHK_03022(gmhA)
PSE: 
JEU: 
AQL: 
RPJ: 
REU: 
REH: 
H16_A3578(gmhA2) PHG074(gmhA)
CNC: 
RME: 
Rmet_3429(yraO)
CTI: 
CBW: 
CCUP: 
BMA: 
BMV: 
BML: 
BMN: 
BMAL: 
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BPL: 
BPD: 
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BPSA: 
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BUT: 
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BTH_I3147(gmhA)
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BTZ: 
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BTHE: 
BTHM: 
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BTHA: 
BTHL: 
BOK: 
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BCM: 
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I35_0169(gmhA)
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BMU: 
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BSTL: 
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D558_1807(gmhA)
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MFA: 
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MBAC: 
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HPF: 
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HPT: 
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HPX: 
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HPH: 
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HPD: 
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HPYM: 
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SKU: 
SULR: 
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Cj1149c(gmhA) Cj1424c(gmhA2)
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AMV: 
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MCV: 
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MKI: 
MGO: 
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SCO6186(SC2G5.07)
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SGU: 
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SCX: 
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BPIP: 
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TLI: 
AMO: 
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GPH: 
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BTH: 
BTHO: 
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NIDE4313(gmhA)
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MARC: 
NID: 
NKR: 
NBV: 
AGW: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:11751812]
  Authors
Kneidinger B, Marolda C, Graninger M, Zamyatina A, McArthur F, Kosma P, Valvano MA, Messner P
  Title
Biosynthesis pathway of ADP-L-glycero-beta-D-manno-heptose in Escherichia coli.
  Journal
J. Bacteriol. 184 (2002) 363-9.
  Sequence
[eco:b0222]
Reference
2  [PMID:11279237]
  Authors
Kneidinger B, Graninger M, Puchberger M, Kosma P, Messner P
  Title
Biosynthesis of nucleotide-activated D-glycero-D-manno-heptose.
  Journal
J. Biol. Chem. 276 (2001) 20935-44.
  Sequence
Reference
3  [PMID:12101286]
  Authors
Valvano MA, Messner P, Kosma P
  Title
Novel pathways for biosynthesis of nucleotide-activated glycero-manno-heptose precursors of bacterial glycoproteins and cell surface polysaccharides.
  Journal
Microbiology. 148 (2002) 1979-89.
Reference
4  [PMID:19923728]
  Authors
Kim MS, Shin DH
  Title
A preliminary X-ray study of sedoheptulose-7-phosphate isomerase from Burkholderia pseudomallei.
  Journal
Acta. Crystallogr. Sect. F. Struct. Biol. Cryst. Commun. 65 (2009) 1110-2.
Reference
5  [PMID:18056714]
  Authors
Taylor PL, Blakely KM, de Leon GP, Walker JR, McArthur F, Evdokimova E, Zhang K, Valvano MA, Wright GD, Junop MS
  Title
Structure and function of sedoheptulose-7-phosphate isomerase, a critical enzyme  for lipopolysaccharide biosynthesis and a target for antibiotic adjuvants.
  Journal
J. Biol. Chem. 283 (2008) 2835-45.
  Sequence
[eco:b0222] [pae:PA4425]
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