KEGG   ENZYME: 5.3.1.4Help
Entry
EC 5.3.1.4                  Enzyme                                 

Name
L-arabinose isomerase;
L-arabinose ketol-isomerase;
araA (gene name)
Class
Isomerases;
Intramolecular oxidoreductases;
Interconverting aldoses and ketoses, and related compounds
BRITE hierarchy
Sysname
L-arabinose aldose-ketose-isomerase
Reaction(IUBMB)
L-arabinose = L-ribulose [RN:R01761]
Reaction(KEGG)
Substrate
L-arabinose [CPD:C00259]
Product
L-ribulose [CPD:C00508]
Comment
Requires a divalent metal ion (the enzyme from the bacterium Escherichia coli prefers Mn2+) [2]. The enzyme binds the closed form of the sugar and catalyses ring opening to generate a form of open-chain conformation that facilitates the isomerization reaction, which proceeds via an ene-diol mechanism [5]. The enzyme can also convert D-galactose to D-tagatose with lower efficiency [4].
History
EC 5.3.1.4 created 1961
Pathway
Pentose and glucuronate interconversions
Metabolic pathways
Orthology
K01804  
L-arabinose isomerase
Genes
ECO: 
b0062(araA)
ECJ: 
JW0061(araA)
EBW: 
BWG_0058(araA)
ECOK: 
ECE: 
Z0070(araA)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_0066(araA)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c0074(araA)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_0063(araA)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_00064(araA)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m0060(araA)
ELL: 
WFL_00300(araA)
ELC: 
i14_0064(araA)
ELD: 
i02_0064(araA)
ELP: 
EBL: 
ECD_00064(araA)
EBE: 
B21_00063(araA)
ELF: 
LF82_0105(araA)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
ECOS: 
EFE: 
EFER_0071(araA)
EAL: 
STY: 
STY0119(araA)
STT: 
t0106(araA)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM0102(araA)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SENR: 
SEND: 
SENI: 
SEEN: 
SPT: 
SPA0104(araA)
SEK: 
SPQ: 
SEC: 
SCH_0096(araA)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SeD_A0106(araA)
SEG: 
SG0103(araA)
SEL: 
SPUL_0107(araA)
SEGA: 
SET: 
SEN0103(araA)
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
SENE: 
SENC: 
SES: 
SBG: 
SBG_0088(araA)
SBZ: 
SBV: 
SFX: 
S0059(araA)
SFV: 
SFV_0054(araA)
SFE: 
SFxv_0059(araA)
SFN: 
SFS: 
SFT: 
SSN: 
SSON_0068(araA)
SBO: 
SBO_0049(araA)
SBC: 
SDY: 
SDY_0089(araA)
SDZ: 
SHQ: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ECLA: 
ECLC: 
ESC: 
KLE: 
EAS: 
EAU: 
EHM: 
EKB: 
ELG: 
ENR: 
ENX: 
ENF: 
ESA: 
CSK: 
CSZ: 
CSI: 
CSJ: 
CCON: 
CDM: 
CMJ: 
CUI: 
CMW: 
CTU: 
CTU_06940(araA)
KPN: 
KPN_00061(araA)
KPU: 
KP1_0874(araA)
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPV: 
KPW: 
KPY: 
KPG: 
KPC: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPK_4681(araA)
KPO: 
KPR: 
KPR_0985(araA)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KPB: 
KPNE: 
KPNU: 
KVA: 
KVD: 
KVQ: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOC: 
KOM: 
KQU: 
EAE: 
EAR: 
CKO: 
CRO: 
ROD_00691(araA)
CFD: 
CAMA: 
CAF: 
CIF: 
EBT: 
ROR: 
RON: 
CED: 
PGE: 
KSA: 
KOR: 
KRD: 
KCO: 
KIN: 
LAX: 
LAZ: 
EBF: 
PSTS: 
YPE: 
YPO2253(araA)
YPK: 
y2094(araA)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_2049(araA)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPZ3_1605(araA)
YPT: 
YPD: 
YPD4_1979(araA)
YPX: 
YPH: 
YPC_1884(araA)
YPW: 
YPJ: 
YPV: 
YPL: 
YPS: 
YPTB2172(araA)
YPO: 
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
DJ40_132(araA)
YPU: 
YPR: 
YPC: 
YPF: 
YEN: 
YE2001(araA)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YEW: 
CH47_1437(araA)
YET: 
CH48_3848(araA)
YEF: 
YEE: 
YSI: 
YAL: 
YFR: 
AW19_1205(araA)
YIN: 
CH53_3943(araA)
YKR: 
YRO: 
CH64_547(araA)
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SPLY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SLQ: 
SFW: 
SFG: 
SRZ: 
SFO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
ECA: 
ECA2275(araA)
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PCV: 
PWA: 
PPAR: 
PWS: 
SOD: 
Sant_2021(araA)
DDA: 
DDD: 
DZE: 
DDC: 
DZC: 
DSO: 
ETA: 
ETA_17720(araA)
EPY: 
EpC_18610(araA)
EPR: 
EAM: 
EAMY_1725(araA)
EAY: 
EAM_1696(araA)
EBI: 
EbC_19610(araA)
ERJ: 
EGE: 
PAM: 
PANA_1823(araA)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_1159(araA)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_1249(araA)
PAO: 
KLN: 
PANT: 
PANP: 
PAGG: 
PAGC: 
ETE: 
ETEE_3403(araA)
EDW: 
EDL: 
HAV: 
OPO: 
MSU: 
MS0058(araA)
MHT: 
MHQ: 
MHAT: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
ASU: 
ASI: 
ASS: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VNA: 
VEJ: 
VFU: 
VAN: 
LAG: 
VAU: 
VFL: 
GHO: 
SBP: 
SPC: 
SHP: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
LAL: 
CJA: 
CEB: 
SDE: 
GSN: 
AHA: 
AHA_1900(araA)
AHY: 
AHR: 
AHP: 
AHJ: 
AHH: 
AHI: 
ASA: 
ASA_2399(araA)
AMED: 
AAJ: 
TAU: 
GAP: 
LCH: 
DEJ: 
SUR: 
SCL: 
sce3310(araA)
SCU: 
SME: 
SMQ: 
SMEG: 
SMEL: 
SMER: 
RLE: 
RL0632(araA)
RLG: 
RLB: 
MEY: 
MAAD: 
MMED: 
JAN: 
BSU: 
BSU28800(araA)
BSR: 
I33_2936(araA)
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSUT: 
BSUL: 
BSUS: 
BSS: 
BST: 
GYO_3130(araA)
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSX: 
C663_2725(araA)
BSP: 
BLI: 
BLD: 
BLi02064(araA1) BLi03028(araA2)
BLH: 
BaLi_c21290(araA1) BaLi_c31090(araA2)
BAY: 
BAQ: 
BYA: 
BAMP: 
BAML: 
BAMA: 
RBAU_2723(araA)
BAMN: 
BASU_2529(araA)
BAMB: 
BAMT: 
BAMY: 
BMP: 
BAO: 
BAMF_2685(araA)
BAZ: 
BQL: 
LL3_02969(araA)
BXH: 
BQY: 
MUS_3155(araA)
BAMI: 
BAMC: 
BAMF: 
BAE: 
BATR: 
BHA: 
BH1873(araA)
BCL: 
ABC0408(araA)
BPU: 
BPUM_2327(araA)
BPUM: 
BPUS: 
BMQ: 
BMQ_3540(araA)
BMD: 
BMD_3530(araA)
BMH: 
BMEG: 
BCO: 
BCK: 
BAG: 
BJS: 
BLE: 
BACW: 
BACP: 
BACB: 
BACY: 
BACL: 
BALM: 
BEO: 
BSM: 
BGY: 
BGLY_2278(araA2) BGLY_3416(araA1)
OIH: 
GKA: 
GK1904(araA)
GTE: 
GTN: 
GTNG_1795(araA)
GYC: 
GYA: 
GCT: 
GGH: 
GJF: 
GEJ: 
PTL: 
AFL: 
Aflv_0531(araA)
ANM: 
GFC28_955(araA)
ANL: 
GFC29_671(araA)
AXL: 
AXY_21510(araA)
TAP: 
BSE: 
SXY: 
SXL: 
SXO: 
SEQO: 
LIA: 
LIO: 
PJD: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPM_5001(araA)
PPOL: 
PPQ: 
PPOY: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PBD: 
PGM: 
POD: 
PAEN: 
PAEF: 
PAEQ: 
PSTE: 
PAEA: 
PAEE: 
PAEH: 
PAEJ: 
PRI: 
PRIO_6705(araA2)
PPEO: 
POW: 
PBV: 
PXL: 
TCO: 
AAC: 
AAD: 
TC41_3262(araA)
NTR: 
LLK: 
LLKF_1616(araA)
LLX: 
LLJ: 
LG36_0874(araA)
LPK: 
LPL: 
lp_3554(araA)
LPJ: 
JDM1_2839(araA)
LPS: 
LPB: 
LSA: 
LCA_1856(araA)
LBR: 
LBK: 
LRE: 
LRF: 
LRU: 
LRT: 
LFE: 
LFR: 
LFF: 
LBH: 
LBN: 
LHO: 
LMU: 
LGN: 
LKO: 
LPX: 
LOR: 
LPAR: 
LPD: 
LCU: 
PPE: 
PPEN: 
PACI: 
EFC: 
EFAU: 
EFU: 
EFM: 
EFT: 
ECAS: 
EMU: 
EMQU_1838(araA)
EGA: 
MPS: 
MPX: 
THL: 
TEH_04380(araA)
LME: 
LMM: 
LMK: 
LCI: 
LCK_01185(araA)
LKI: 
LEC: 
LGS: 
LGE: 
LLF: 
WKO: 
WCB: 
WJO: 
CRN: 
CARC: 
CAC: 
CA_C1342(araA) CA_C1346(araA)
CAE: 
SMB_G1365(araA1) SMB_G1369(araA2)
CAY: 
CBE: 
CBZ: 
CBEI: 
CLJ: 
CCB: 
CSR: 
CSB: 
CAH: 
CSQ: 
CCK: 
CBUT: 
RUK: 
CCE: 
ESR: 
CSS: 
CSD: 
Clst_1561(araA)
RUM: 
BFI: 
BHU: 
CLE: 
RHO: 
RIX: 
RIM: 
CCT: 
ROB: 
BYL: 
RTO: 
CPY: 
LACY: 
CSH: 
CSO: 
BPRL: 
HSD: 
SD1D_0125(araA)
DAI: 
OVA: 
OBV_11920(araA)
SAY: 
TPY_1910(araA)
SAP: 
TIT: 
TMT: 
CHD: 
TTM: 
TTO: 
TXY: 
TSH: 
HHL: 
SRI: 
SELE: 
MHG: 
PUF: 
PFT: 
ERL: 
MSM: 
MSG: 
MSB: 
MSN: 
MSH: 
MGO: 
MPHL: 
MVQ: 
MYVA_2122(araA)
ASD: 
RHA: 
ROA: 
RHB: 
RFA: 
A3L23_00426(araA_1)
SGB: 
SCT: 
SCY: 
SBH: 
SVE: 
SALB: 
SVT: 
STRC: 
SCX: 
SRN: 
KSK: 
KSE_74170(araA)
CMI: 
CMM_0878(araA)
CMS: 
CMS0133(araA)
CMC: 
CMN_00838(araA)
CMH: 
MTS: 
MTES_2217(araA)
MIM: 
MIO: 
MIX: 
MCW: 
MPAL: 
RTN: 
CUM: 
CUB: 
MVD: 
FRP: 
AGY: 
CART: 
ART: 
ARR: 
ARM: 
ARE: 
AAQ: 
ARH: 
ARY: 
ARW: 
ARZ: 
AAU: 
AAur_3711(araA)
ACH: 
APN: 
PSUL: 
AAI: 
GAR: 
BCV: 
BFA: 
BRX: 
JDE: 
XCE: 
IVA: 
IDO: 
I598_1470(araA)
SKE: 
CFL: 
CFI: 
CGA: 
PRA: 
PFR: 
PFRE: 
PBO: 
AACI: 
MPH: 
MLP_15140(araA)
TFL: 
TFA: 
TES: 
TEZ: 
NCA: 
KFL: 
AER: 
NDA: 
SRO: 
NOA: 
FRI: 
ACE: 
GOB: 
MMAR: 
AMD: 
AMED_4404(araA) AMED_4546(araA)
AMN: 
AMM: 
AMES_4350(araA) AMES_4491(araA)
AMZ: 
B737_4350(araA) B737_4491(araA)
AOI: 
AORI_4313(araA)
AJA: 
AMQ: 
ALU: 
PSEA: 
PSEH: 
AMI: 
LED: 
MAU: 
MIL: 
VMA: 
AMS: 
ASE: 
ACPL_5120(araA) ACPL_5441(araA)
ACTN: 
L083_4938(araA)
AFS: 
CAI: 
SNA: 
ASG: 
BLO: 
BL0272(araA)
BLJ: 
BLD_1018(araA)
BLF: 
BLL: 
BLJ_0403(araA)
BLB: 
BLM: 
BLK: 
BLG: 
BLZ: 
BLX: 
BAD: 
BAD_1410(araA)
BADL: 
BADO: 
BLA: 
BLA_0058(araA)
BLC: 
BLT: 
BBB: 
BBC: 
BNM: 
BLV: 
BLW: 
BLS: 
BANI: 
BANL: 
BNI: 
BANM: 
BDE: 
BDP_1922(araA)
BDN: 
BAST: 
BCOR: 
BKA: 
BKS: 
BPSP: 
BII: 
BANG: 
BCAT: 
BPSC: 
BSCA: 
BACT: 
GVG: 
GVH: 
PDO: 
CWO: 
CGO: 
HAU: 
ATM: 
ABAO: 
DMR: 
DPD: 
TRA: 
FGI: 
TTR: 
OTE: 
OBG: 
OBT: 
VBA: 
PHM: 
PBU: 
SCD: 
SSM: 
STA: 
STQ: 
SBU: 
SCC: 
SGP: 
ABA: 
ACM: 
GMA: 
TSA: 
TRS: 
GBA: 
BTH: 
BTHO: 
BVU: 
BSA: 
BXY: 
BDO: 
BDH: 
BOA: 
BCEL: 
BACC: 
PPN: 
PMUC: 
PSAC: 
OSP: 
PRU: 
PRU_0420(araA)
PDT: 
DOI: 
CPI: 
NKO: 
NSO: 
NIA: 
HHY: 
PHE: 
PCM: 
PSTY: 
PSN: 
SHG: 
SHT: 
SPHN: 
MUP: 
CMR: 
CAMU: 
BBD: 
EVI: 
DFE: 
SLI: 
SRD: 
LBY: 
RSI: 
EOL: 
FAE: 
HSW: 
HYD: 
HYG: 
HYP: 
RUF: 
RTI: 
FBT: 
GFO: 
GFO_0699(araA)
GFL: 
FJO: 
FJG: 
FGL: 
RBI: 
ZPR: 
ZGA: 
MRS: 
POB: 
PRN: 
POLA: 
EEN: 
CHZ: 
CHSO_3292(araA)
CIH: 
SZE: 
SALT: 
SEON: 
MRO: 
TMA: 
TMM: 
TMI: 
TMW: 
TMQ: 
TMX: 
TPT: 
TRQ: 
TNA: 
TNP: 
THQ: 
THZ: 
THR: 
TTA: 
DTN: 
DTL3_0424(araA)
MPG: 
HUT: 
HTI: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:13539034]
  Authors
HEATH EC, HORECKER BL, SMYRNIOTIS PZ, TAKAGI Y.
  Title
Pentose fermentation by Lactobacillus plantarum. II. L-arabinose isomerase.
  Journal
J. Biol. Chem. 231 (1958) 1031-7.
Reference
2  [PMID:4878429]
  Authors
Patrick JW, Lee N
  Title
Purification and properties of an L-arabinose isomerase from Escherichia coli.
  Journal
J. Biol. Chem. 243 (1968) 4312-8.
Reference
3  [PMID:5773448]
  Authors
Nakamatu T, Yamanaka K.
  Title
Crystallization and properties of L-arabinose isomerase from Lactobacillus gayonii.
  Journal
Biochim. Biophys. Acta. 178 (1969) 156-65.
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4
  Authors
Cheetham, P.S.J. and Wootton, A.N.
  Title
Bioconversion of D-galactose into D-tagatose.
  Journal
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  Authors
Banerjee S, Anderson F, Farber GK
  Title
The evolution of sugar isomerases.
  Journal
Protein. Eng. 8 (1995) 1189-95.
Reference
6  [PMID:16756997]
  Authors
Manjasetty BA, Chance MR
  Title
Crystal structure of Escherichia coli L-arabinose isomerase (ECAI), the putative  target of biological tagatose production.
  Journal
J. Mol. Biol. 360 (2006) 297-309.
  Sequence
[eco:b0062]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9023-80-7

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