KEGG   ENZYME: 2.3.1.50Help
Entry
EC 2.3.1.50                 Enzyme                                 

Name
serine C-palmitoyltransferase;
serine palmitoyltransferase;
SPT;
3-oxosphinganine synthetase;
acyl-CoA:serine C-2 acyltransferase decarboxylating
Class
Transferases;
Acyltransferases;
Transferring groups other than aminoacyl groups
BRITE hierarchy
Sysname
palmitoyl-CoA:L-serine C-palmitoyltransferase (decarboxylating)
Reaction(IUBMB)
palmitoyl-CoA + L-serine = CoA + 3-dehydro-D-sphinganine + CO2 [RN:R01281]
Reaction(KEGG)
Substrate
palmitoyl-CoA [CPD:C00154];
L-serine [CPD:C00065]
Product
CoA [CPD:C00010];
3-dehydro-D-sphinganine [CPD:C02934];
CO2 [CPD:C00011]
Comment
A pyridoxal-phosphate protein.
History
EC 2.3.1.50 created 1976, modified 1982
Pathway
Sphingolipid metabolism
Metabolic pathways
Orthology
K00654  
serine palmitoyltransferase
Genes
HSA: 
10558(SPTLC1) 55304(SPTLC3) 9517(SPTLC2)
PTR: 
453071(SPTLC2) 464590(SPTLC1) 735328(SPTLC3)
PPS: 
GGO: 
101134241 101135062(SPTLC3) 101145241(SPTLC1) 101148765(SPTLC2)
PON: 
100173375(SPTLC1) 100438231(SPTLC3) 100446763(SPTLC2)
NLE: 
100588472(SPTLC1) 100601824(SPTLC2) 100603561(SPTLC3) 101176191
MCC: 
693775(SPTLC3) 705324(SPTLC1) 707625
MCF: 
101864870 102123629(SPTLC3) 102141632(SPTLC2)
CJC: 
100394661(SPTLC1) 100403226(SPTLC2) 100404513(SPTLC3) 103791106
MMU: 
20773(Sptlc2) 228677(Sptlc3) 268656(Sptlc1)
RNO: 
296188(Sptlc3) 361213(Sptlc1) 366697(Sptlc2)
CGE: 
100689326(Sptlc1) 100689415(Sptlc2) 100770263(Sptlc3)
HGL: 
101702355(Sptlc2) 101702482(Sptlc3) 101716616(Sptlc1)
TUP: 
102474294(SPTLC2) 102503311(SPTLC3)
CFA: 
480403(SPTLC2) 484192(SPTLC1) 485766(SPTLC3)
AML: 
100464437(SPTLC2) 100474286 100481338(SPTLC3)
UMR: 
103663198(SPTLC1) 103674021(SPTLC2) 103674441(SPTLC3)
FCA: 
101081055(SPTLC2) 101087947(SPTLC1) 101094257(SPTLC3)
PTG: 
102956963(SPTLC3) 102957170(SPTLC2) 102960457(SPTLC1)
BTA: 
100336940(SPTLC3) 537972(SPTLC2) 614165(SPTLC1)
BOM: 
102266630(SPTLC3) 102270429 102273673(SPTLC2)
PHD: 
102316440(SPTLC2) 102339296(SPTLC3) 102343441(SPTLC1)
CHX: 
102173567(SPTLC1) 102178736 102184072(SPTLC3)
OAS: 
101105721(SPTLC1) 101110257(SPTLC3) 101115373(SPTLC2)
SSC: 
100158010(SPTLC2) 100519280(SPTLC3) 100739638(SPTLC1)
CFR: 
BACU: 
LVE: 
103068541(SPTLC2) 103083497 103088252(SPTLC3)
ECB: 
100051200(SPTLC3) 100059392(SPTLC2) 100063025(SPTLC1)
MYB: 
102253057 102260066(SPTLC3) 102260758(SPTLC2)
MYD: 
102756738(SPTLC3) 102764240(SPTLC2) 102766198
PALE: 
102882430(SPTLC3) 102889080(SPTLC1) 102898066(SPTLC2)
MDO: 
100022019(SPTLC2) 100027691(SPTLC1) 100031613(SPTLC3)
SHR: 
OAA: 
100078603(SPTLC3)
GGA: 
423379(SPTLC2) 426145(SPTLC1) 768538(SPTLC3)
MGP: 
100546649(SPTLC2) 100546896(SPTLC3) 100549855
APLA: 
101791744(SPTLC1) 101802374(SPTLC3) 101804192(SPTLC2)
TGU: 
100217964(SPTLC1) 100219990(SPTLC2) 100226142(SPTLC3)
FAB: 
101806032(SPTLC3) 101812538(SPTLC1) 101815595(SPTLC2)
PHI: 
102108467(SPTLC1) 102114223(SPTLC2) 102114737(SPTLC3)
FPG: 
101915013(SPTLC2) 101915694(SPTLC1) 101918113(SPTLC3)
FCH: 
102051646(SPTLC2) 102053433(SPTLC3) 102057729(SPTLC1)
CLV: 
102090568(SPTLC2) 102093122(SPTLC1) 102097238(SPTLC3)
ASN: 
102370752(SPTLC3) 102372764(SPTLC2) 102387546(SPTLC1)
AMJ: 
102563460(SPTLC3) 102570237(SPTLC2) 102572193(SPTLC1)
PSS: 
102446068(SPTLC1) 102446973(SPTLC3) 102451002(SPTLC2) 102461604
CMY: 
102940812(SPTLC1) 102945751(SPTLC2) 102946340(SPTLC3)
ACS: 
100553356(sptlc3) 100553895(sptlc1) 100566142(sptlc2)
PBI: 
103049823(SPTLC2) 103054067(SPTLC3) 103067129
XLA: 
432022(sptlc1) 444190(sptlc2) 734997(sptlc3)
XTR: 
100380000(sptlc2) 100487030(sptlc3) 779626(sptlc1)
DRE: 
445168(sptlc3) 553646(sptlc2a) 553981(sptlc1) 557286(sptlc2b)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102354750(SPTLC2) 102363858 102365737(SPTLC3)
CMK: 
103177917(sptlc3) 103182864(sptlc1) 103186785(sptlc2)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
411447(GB10698) 552392(Spt-I)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CELE_C23H3.4(sptl-1) CELE_F43H9.2(sptl-2)
CBR: 
CBG06999(Cbr-sptl-1) CBG11388(Cbr-sptl-2) CBG11447(Cbr-sptl-3)
BMY: 
LOA: 
TSP: 
HRO: 
LGI: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0012s04080g(POPTRDRAFT_772231) POPTR_0012s10630g(POPTRDRAFT_834365) POPTR_0015s05020g POPTR_0015s11500g(POPTRDRAFT_733741)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os01t0928600-01(Os01g0928600) Os01t0928700-00(Os01g0928700) Os01t0928800-01(Os01g0928800) Os02t0806900-01(Os02g0806900) Os03t0252800-01(Os03g0252800) Os10t0189600-01(Os10g0189600) Os11t0516000-01(Os11g0516000)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_01g040920(SORBIDRAFT_01g040920) SORBI_03g044700(SORBIDRAFT_03g044700) SORBI_05g018870(SORBIDRAFT_05g018870) SORBI_05g018880(SORBIDRAFT_05g018880)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00001p00112910(AMTR_s00001p00112910) s00168p00017970(AMTR_s00168p00017970)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YDR062W(LCB2) YMR296C(LCB1)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0B04340(NCAS0B04340) NCAS_0F02130(NCAS0F02130)
NDI: 
NDAI_0A03740(NDAI0A03740) NDAI_0C03660(NDAI0C03660)
TPF: 
TPHA_0A05510(TPHA0A05510) TPHA_0D04270(TPHA0D04270)
TBL: 
TBLA_0A08710(TBLA0A08710) TBLA_0C06910(TBLA0C06910)
TDL: 
TDEL_0B04330(TDEL0B04330) TDEL_0G00530(TDEL0G00530)
KAF: 
KAFR_0C02730(KAFR0C02730) KAFR_0D01860(KAFR0D01860)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_294184 AOR_1_646164(AO090001000375)
ANG: 
ANI_1_186054(An06g01540) ANI_1_596074(An08g04100)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
NPA: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
DSQ: 
SHS: 
PCO: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
LBC: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT114647(AGABI1DRAFT_114647) AGABI1DRAFT75784(AGABI1DRAFT_75784)
ABV: 
AGABI2DRAFT194831(AGABI2DRAFT_194831) AGABI2DRAFT209409(AGABI2DRAFT_209409)
CPUT: 
SLA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
NCE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_00623(sptA) DFA_01989(sptB)
EHI: 
EHI_069310(32.t00018) EHI_152280(6.t00099)
EDI: 
ACAN: 
PTI: 
TPS: 
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TBR: 
Tb10.70.3220 Tb927.4.1020(Tb04.5E12.470)
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
GOX: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:4388074]
  Authors
Brady RN, Di Mari SJ, Snell EE.
  Title
Biosynthesis of sphingolipid bases. 3. Isolation and characterization of ketonic intermediates in the synthesis of sphingosine and dihydrosphingosine by cell-free extracts of Hansenula ciferri.
  Journal
J. Biol. Chem. 244 (1969) 491-6.
Reference
2  [PMID:4386961]
  Authors
Stoffel W, LeKim D, Sticht G.
  Title
Biosynthesis of dihydrosphingosine in vitro.
  Journal
Hoppe. Seylers. Z. Physiol. Chem. 349 (1968) 664-70.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
62213-50-7

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