KEGG   ENZYME: 2.4.2.2Help
Entry
EC 2.4.2.2                  Enzyme                                 

Name
pyrimidine-nucleoside phosphorylase;
Py-NPase;
pdp (gene name)
Class
Transferases;
Glycosyltransferases;
Pentosyltransferases
BRITE hierarchy
Sysname
pyrimidine-nucleoside:phosphate (2'-deoxy)-alpha-D-ribosyltransferase
Reaction(IUBMB)
(1) uridine + phosphate = uracil + alpha-D-ribose 1-phosphate [RN:R01876];
(2) thymidine + phosphate = thymine + 2-deoxy-alpha-D-ribose 1-phosphate [RN:R01570];
(3) 2'-deoxyuridine + phosphate = uracil + 2-deoxy-alpha-D-ribose 1-phosphate [RN:R02484]
Reaction(KEGG)
Substrate
uridine [CPD:C00299];
phosphate [CPD:C00009];
thymidine [CPD:C00214];
2'-deoxyuridine [CPD:C00526]
Product
uracil [CPD:C00106];
alpha-D-ribose 1-phosphate [CPD:C00620];
thymine [CPD:C00178];
2-deoxy-alpha-D-ribose 1-phosphate [CPD:C00672]
Comment
Unlike EC 2.4.2.3, uridine phosphorylase, and EC 2.4.2.4, thymidine phosphorylase, this enzyme can accept both the ribonucleoside uridine and the 2'-deoxyribonucleosides 2'-deoxyuridine and thymidine [3]. The reaction is reversible, and the enzyme does not distinguish between alpha-D-ribose 1-phosphate and 2-deoxy-alpha-D-ribose 1-phosphate in the synthetic direction.
History
EC 2.4.2.2 created 1961
Pathway
Pyrimidine metabolism
Metabolic pathways
Orthology
K00756  
pyrimidine-nucleoside phosphorylase
Genes
GAP: 
BBA: 
Bd3855(pdp)
BBAT: 
BBW: 
BBAC: 
BEX: 
BMX: 
BMS_2719(deoA)
ACP: 
AFW: 
ANK: 
MXA: 
MFU: 
MSD: 
CCX: 
SUR: 
SCL: 
sce2436(pdp)
SCU: 
HOH: 
BSU: 
BSR: 
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSUT: 
BSUL: 
BSS: 
BST: 
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSX: 
BSP: 
BLI: 
BL00227(pdp)
BLD: 
BLH: 
BAO: 
BAY: 
BAQ: 
BYA: 
BAMP: 
BAML: 
BAMA: 
BAMN: 
BAMB: 
BAMT: 
BAZ: 
BQL: 
BXH: 
BQY: 
BAMI: 
BAMC: 
BAMF: 
BAMY: 
BAE: 
BHA: 
BH1533(pdp)
BAN: 
BA_1894(pyn-1) BA_4307(pyn-2)
BAR: 
GBAA_1894(pyn-1) GBAA_4307(pyn-2)
BAT: 
BAH: 
BAI: 
BAA_1962(pyn1) BAA_4328(pyn2)
BAX: 
BANT: 
BANR: 
BANS: 
BANH: 
BAL: 
BCE: 
BCA: 
BCE_1977(pyn) BCE_4154(pyn)
BCZ: 
BCZK1705(pyn) BCZK3842(pdp)
BCR: 
BCB: 
BCU: 
BCG: 
BCQ: 
BCQ_1889(pyn) BCQ_3876(pdp)
BCX: 
BCA_1962(pyn1) BCA_4197(pyn2)
BNC: 
BCF: 
BCER: 
BCEF: 
BCY: 
BTK: 
BTL: 
BTB: 
BTT: 
BTHR: 
BTC: 
BTF: 
BTM: 
BTG: 
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BTN: 
BTHT: 
BTHU: 
BWE: 
BTY: 
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BCL: 
ABC1784(pdp)
BPU: 
BPUM: 
BPF: 
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BMD: 
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BCO: 
BCK: 
BAG: 
BJS: 
BACI: 
BIF: 
BLE: 
BMET: 
BMP: 
OIH: 
OB1844(pdp)
GKA: 
GTN: 
GTH: 
GTE: 
GWC: 
GYC: 
GYA: 
GCT: 
GMC: 
GGH: 
GJF: 
GST: 
AFL: 
AXL: 
LSP: 
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HHD: 
TAP: 
VIR: 
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SAU: 
SA1938(pdp)
SAV: 
SAV2136(pdp)
SAW: 
SAH: 
SAJ: 
SAM: 
MW2060(pdp)
SAS: 
SAR: 
SAR2224(pyn)
SAC: 
SAX: 
SAA: 
SAO: 
SAE: 
SAD: 
SUU: 
SUV: 
SUH: 
SUE: 
SUJ: 
SUK: 
SUC: 
SUT: 
SUQ: 
SUZ: 
SUD: 
SUX: 
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SUG: 
SUF: 
SAUA: 
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SAUN: 
SAUS: 
SAUU: 
SAUZ: 
SAB: 
SUY: 
SAUB: 
SAUM: 
SAUC: 
SAUR: 
SAUI: 
SAUT: 
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SAUK: 
SAUQ: 
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SAUW: 
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SAUY: 
SEP: 
SER: 
SEPP: 
SEPS: 
SHA: 
SH0898(deoA)
SSP: 
SCA: 
SLG: 
SLN: 
SSD: 
SDT: 
SWA: 
SPAS: 
SXY: 
SXL: 
MCL: 
LMO: 
lmo1993(pdp)
LMF: 
LMH: 
LMC: 
LMN: 
LMY: 
LMT: 
LMG: 
LMS: 
LMJ: 
LMQ: 
LML: 
LMP: 
LMW: 
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LMZ: 
LMON: 
LMOC: 
LMOS: 
LMOO: 
LMOY: 
LMOT: 
LMOA: 
LMOL: 
LMOG: 
LMOE: 
LMOB: 
LMOJ: 
LMOZ: 
LMOD: 
LMOW: 
LMOX: 
LMOQ: 
LMR: 
LIN: 
LWE: 
lwe2013(pdp)
LSG: 
LIV: 
LII: 
LIW: 
LIA: 
LIO: 
ESI: 
EAT: 
EAN: 
EXM: 
BBE: 
PJD: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPOL: 
PPQ: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
B2K_24330(deoA)
PTA: 
PLV: 
PSAB: 
PDU: 
PBD: 
PGM: 
POD: 
PAEN: 
PAEF: 
PAEQ: 
PSTE: 
PAEA: 
PAEE: 
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PAEJ: 
TCO: 
AAD: 
BTS: 
SIV: 
LLA: 
L64175(pdp)
LLK: 
LLT: 
LLS: 
LLD: 
LLX: 
LLC: 
LLM: 
LLR: 
LLN: 
LLI: 
LLW: 
LGR: 
LGV: 
SPN: 
SPD: 
SPR: 
spr0744(pdp)
SPW: 
SPX: 
SNE: 
SPV: 
SNM: 
SJJ: 
SPP: 
SNT: 
SNC: 
SNB: 
SNP: 
SNI: 
SNV: 
SNX: 
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SNU: 
SPNG: 
SPNE: 
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SPNM: 
SPNO: 
SPNN: 
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SMJ: 
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STL: 
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STW: 
SSA: 
SSU: 
SSV: 
SSB: 
SSI: 
SSU0937(deoA)
SSS: 
SST: 
SSF: 
SSK: 
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SSW: 
SUI: 
SUO: 
SRP: 
SUP: 
SSUS: 
SSUT: 
TL13_0862(deoA)
SSUI: 
SSUY: 
SGO: 
SEQ: 
SEZ: 
SEZO: 
SEQU: 
SEU: 
SUB: 
SUB0953(deoA)
SDS: 
SDG: 
SDA: 
SDC: 
SDQ: 
SMB: 
smi_0889(deoA)
SOR: 
SOR_0811(deoA)
STK: 
SCP: 
SCF: 
SSR: 
STF: 
STJ: 
STD: 
SIE: 
SIB: 
SIU: 
SANG: 
SANC: 
SCG: 
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SCOS: 
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SIQ: 
SIO: 
SIG: 
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STV: 
LSA: 
LSA0801(pdp)
LBR: 
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LRR: 
LHV: 
LRH: 
LGG_02209(deoA)
LRG: 
LRL: 
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LRO: 
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LBH: 
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EF0173(pyn)
EFL: 
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EFU: 
EFM: 
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CA_C1546(deoA)
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CEA_G1561(deoA)
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CPE1807(deoA)
CPF: 
CPR: 
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CTET: 
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CBO: 
CBO1863(pdp)
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CBH: 
CBY: 
CBL: 
CBK: 
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CBI: 
CBN: 
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CKL: 
CKR: 
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CLJ: 
CCB: 
CLB: 
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AMT: 
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ASF: 
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ASO: 
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FPR: 
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CLE: 
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CDG: 
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HMO: 
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CLO: 
BPRL: 
TTE: 
TTE0464(DeoA)
TEX: 
THX: 
TPD: 
TIT: 
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TWI: 
TKI: 
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TAE: 
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ATE: 
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CHD: 
COW: 
CKI: 
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TTM: 
TTO: 
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TNR: 
MAS: 
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HOR: 
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VPR: 
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SRI: 
MED: 
MHG: 
PUF: 
ERH: 
ERS: 
MGU: 
CM5_00265(deoA)
MGC: 
CM9_00265(deoA)
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CM3_00290(deoA)
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CM1_00255(deoA)
MPM: 
MPNA0640(deoA)
MPJ: 
MPB: 
MGH: 
MGAH_0362(deoA)
MGF: 
MGF_1587(deoA)
MGN: 
MGS: 
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mhp298(deoA)
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MAGa5600(deoA)
MAT: 
MCO: 
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MHO_3340(deoA)
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MCRO_0243(pynP)
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MHR_0565(deoA)
MHH: 
MHM: 
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MFE_03960(deoA)
MFM: 
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Mbov_0589(deoA)
MBQ: 
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MLH: 
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MPUT_0121(deoA-1) MPUT_0178(deoA-2)
MPUT: 
MCY: 
MCYN_0345(MCYN0345)
MBC: 
MYB_01400(pdp) MYB_01530(deoA)
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MGM1_5600(deoA)
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ACL_0683(deoA)
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SMM_0431(deoA)
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TDE2191(pdp)
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STQ: 
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TSA: 
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STR: 
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TAI: 
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TLI: 
AMO: 
RBA: 
RB10231(pyn)
PSL: 
IPA: 
SACI: 
SRU: 
SRM: 
SRM_01344(deoA)
RMR: 
RMG: 
CPI: 
CTS: 
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MRO: 
CAG: 
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ATM: 
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DRA: 
DDR: 
DMR: 
DPT: 
DGO: 
DPD: 
TRA: 
TTS: 
TTL: 
TSC: 
THC: 
TOS: 
OPR: 
MHD: 
TAM: 
TMA: 
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TMI: 
TPT: 
TLE: 
TRQ: 
TNA: 
TNP: 
TTA: 
TME: 
TAF: 
FNO: 
FPE: 
PMO: 
KOL: 
MPZ: 
MPG: 
CCZ: 
FGI: 
CEX: 
DTH: 
DTU: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1
  Authors
Friedkin, M. and Kalckar, H.
  Title
Nucleoside phosphorylases.
  Journal
In: Boyer, P.D., Lardy, H. and Myrback, K. (Eds.), The Enzymes, 2nd ed., vol. 5, Academic Press, New York, 1961, p. 237-255.
Reference
2  [PMID:4978445]
  Authors
Saunders PP, Wilson BA, Saunders GF.
  Title
Purification and comparative properties of a pyrimidine nucleoside phosphorylase from Bacillus stearothermophilus.
  Journal
J. Biol. Chem. 244 (1969) 3691-7.
Reference
3  [PMID:8782414]
  Authors
Hamamoto T, Noguchi T, Midorikawa Y.
  Title
Purification and characterization of purine nucleoside phosphorylase and pyrimidine nucleoside phosphorylase from Bacillus stearothermophilus TH 6-2.
  Journal
Biosci. Biotechnol. Biochem. 60 (1996) 1179-80.
Reference
4  [PMID:8987664]
  Authors
Okuyama K, Hamamoto T, Noguchi T, Midorikawa Y
  Title
Molecular cloning and expression of the pyrimidine nucleoside phosphorylase gene  from Bacillus stearothermophilus TH 6-2.
  Journal
Biosci. Biotechnol. Biochem. 60 (1996) 1655-9.
  Sequence
[up:P77836]
Reference
5  [PMID:9817849]
  Authors
Pugmire MJ, Ealick SE
  Title
The crystal structure of pyrimidine nucleoside phosphorylase in a closed conformation.
  Journal
Structure. 6 (1998) 1467-79.
  Sequence
[up:P77836]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9055-35-0

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