KEGG   ENZYME: 2.5.1.55Help
Entry
EC 2.5.1.55                 Enzyme                                 

Name
3-deoxy-8-phosphooctulonate synthase;
2-dehydro-3-deoxy-D-octonate-8-phosphate D-arabinose-5-phosphate-lyase (pyruvate-phosphorylating);
2-dehydro-3-deoxy-phosphooctonate aldolase;
2-keto-3-deoxy-8-phosphooctonic synthetase;
3-deoxy-D-manno-octulosonate-8-phosphate synthase;
3-deoxy-D-mannooctulosonate-8-phosphate synthetase;
3-deoxyoctulosonic 8-phosphate synthetase;
KDOP synthase;
phospho-2-keto-3-deoxyoctonate aldolase
Class
Transferases;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
BRITE hierarchy
Sysname
phosphoenolpyruvate:D-arabinose-5-phosphate C-(1-carboxyvinyl)transferase (phosphate-hydrolysing, 2-carboxy-2-oxoethyl-forming)
Reaction(IUBMB)
phosphoenolpyruvate + D-arabinose 5-phosphate + H2O = 2-dehydro-3-deoxy-D-octonate 8-phosphate + phosphate [RN:R03254]
Reaction(KEGG)
Substrate
phosphoenolpyruvate [CPD:C00074];
D-arabinose 5-phosphate [CPD:C01112];
H2O [CPD:C00001]
Product
2-dehydro-3-deoxy-D-octonate 8-phosphate [CPD:C04478];
phosphate [CPD:C00009]
History
EC 2.5.1.55 created 1965 as EC 4.1.2.16, transferred 2002 to EC 2.5.1.55
Pathway
Lipopolysaccharide biosynthesis
Metabolic pathways
Orthology
K01627  
2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase (KDO 8-P synthase)
Genes
ATH: 
AT1G16340(ATKDSA2) AT1G79500(AtkdsA1)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0002s06270g(POPTRDRAFT_816192) POPTR_0005s22100g(POPTRDRAFT_818614)
VVI: 
SLY: 
543766(kdsA)
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os12t0210800-01(Os12g0210800)
OBR: 
BDI: 
ZMA: 
SITA: 
PDA: 
ATR: 
s00013p00172160(AMTR_s00013p00172160) s00066p00102280(AMTR_s00066p00102280)
SMO: 
PPP: 
OLU: 
BPG: 
CSL: 
CVR: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
ECO: 
b1215(kdsA)
ECJ: 
Y75_p1187(kdsA)
ECD: 
EBW: 
BWG_1040(kdsA)
ECOK: 
ECE: 
Z1986(kdsA)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_1605(kdsA)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c1674(kdsA)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_1391(kdsA)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_01190(kdsA)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m1301(kdsA)
ELL: 
WFL_06375(kdsA)
ELC: 
i14_1503(kdsA)
ELD: 
i02_1503(kdsA)
ELP: 
EBL: 
ECD_01190(kdsA)
EBE: 
B21_01200(kdsA)
ELF: 
LF82_1150(kdsA)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
EFER_1746(kdsA)
STY: 
STY1897(kdsA)
STT: 
t1104(kdsA)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM1772(kdsA)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA1101(kdsA)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_1959(kdsA)
SEC: 
SC1766(kdsA)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SeD_A1551(kdsA)
SEG: 
SG1345(kdsA)
SEL: 
SPUL_1584(kdsA)
SEGA: 
SET: 
SEN1267(kdsA)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_18260(SBOV17931)
SENE: 
SES: 
SBG: 
SBG_1631(kdsA)
SBZ: 
SBV: 
YPE: 
YPO2021(kdsA)
YPK: 
y2286(kdsA)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_1869(kdsA)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPZ3_1798(kdsA)
YPT: 
YPD: 
YPD4_1784(kdsA)
YPX: 
YPD8_1764(kdsA)
YPH: 
YPC_2298(kdsA)
YPS: 
YPTB2009(kdsA)
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
DJ40_302(kdsA)
YEN: 
YE2427(kdsA)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YSI: 
SFL: 
SF1218(kdsA)
SFX: 
S1302(kdsA)
SFV: 
SFV_1229(kdsA)
SFE: 
SFxv_1390(kdsA)
SFN: 
SFS: 
SSN: 
SSON_1963(kdsA)
SSJ: 
SBO: 
SBO_1852(kdsA)
SBC: 
SDY: 
SDY_1264(kdsA)
SDZ: 
ECA: 
ECA2194(kdsA)
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PCV: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
ETA_18750(kdsA)
EPY: 
EpC_19640(kdsA)
EPR: 
EAM: 
EAMY_1611(kdsA)
EAY: 
EAM_1590(kdsA)
EBI: 
EbC_18310(kdsA)
ERJ: 
PLU: 
plu2073(kdsA)
PAY: 
PAU_02522(kdsA)
WBR: 
WGLp343(kdsA)
WGL: 
SGL: 
SOD: 
Sant_2109(kdsA)
PES: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
EEC: 
ENL: 
ECLA: 
ECLC: 
ECLG: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
ES15_1733(kdsA)
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CTU_24190(kdsA)
KPN: 
KPN_02230(kdsA)
KPU: 
KP1_3345(kdsA)
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPK_2073(kdsA)
KPO: 
KPR: 
KPR_3151(kdsA)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOM: 
CKO: 
CRO: 
ROD_17981(kdsA)
CFD: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SSZ: 
SCc_414(kdsA)
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SERR: 
SFO: 
SERF: 
SERS: 
PMR: 
PMI1090(kdsA)
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_1409(kdsA)
ETD: 
ETE: 
ETEE_3399(kdsA)
ETC: 
BFL: 
Bfl350(kdsA)
BPN: 
BPEN_361(kdsA)
BVA: 
BVAF_353(kdsA)
BCHR: 
HDE: 
HDEF_0386(kdsA)
SECT: 
SEHC: 
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
XBO: 
XBJ1_2205(kdsA)
XNE: 
XNC1_2115(kdsA)
PAM: 
PANA_1646(kdsA)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_0996(kdsA)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_1078(kdsA)
PAO: 
KLN: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
PSX: 
DR96_2917(kdsA)
EBT: 
MMK: 
ROR: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
CED: 
PGE: 
HAV: 
EBF: 
PSTS: 
E05_14280(kdsA)
HIN: 
HI1557(kdsA)
HIT: 
NTHI1576(kdsA)
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HDU: 
HD0857(kdsA)
HAP: 
HAPS_0787(kdsA)
HPAZ: 
HPAS: 
HPAK: 
HPR: 
HSO: 
HS_0946(kdsA)
HSM: 
PMU: 
PM0558(kdsA)
PMV: 
PUL: 
PMP: 
Pmu_06240(kdsA)
PMUL: 
DR93_1336(kdsA)
MSU: 
MS1189(kdsA)
MHT: 
MHQ: 
MHX: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
APL: 
APL_1578(kdsA) APL_2040(kdsA)
APJ: 
APJL_2091(kdsA)
APA: 
ASU: 
ASI: 
ASS: 
AAP: 
AAT: 
AAO: 
AAN: 
AAH: 
GAN: 
BTO: 
BTRE: 
BTRH: 
BTRA: 
XFA: 
XFT: 
PD0542(kdsA)
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XFL: 
XFS: 
XCC: 
XCC1698(kdsA)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCR_1934(kdsA)
XCV: 
XAC: 
XAC1717(kdsA)
XCI: 
XAX: 
XACM_1738(kdsA)
XAO: 
XOO: 
XOO2966(kdsA)
XOM: 
XOP: 
PXO_00173(kdsA)
XOR: 
XOC_2796(kdsA)
XAL: 
XALc_1150(kdsA)
XFU: 
SML: 
Smlt1712(kdsA)
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SMD_1652(kdsA)
PSU: 
PSD: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VCQ: 
VVU: 
VV1_0249(kdsA)
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VFI: 
VFM: 
VSA: 
PPR: 
PAE: 
PA3636(kdsA)
PAEV: 
N297_3760(kdsA)
PAEI: 
N296_3760(kdsA)
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
M802_3757(kdsA)
PAEO: 
M801_3625(kdsA)
PPU: 
PP_1611(kdsA-1) PP_1807(kdsA-2)
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
T1E_3066(kdsA-2) T1E_4962(kdsA-1)
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_41570(kdsA)
PMOS: 
PPUU: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PFL_1195(kdsA)
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFLU1290(kdsA)
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PPZ: 
PEN: 
PSEEN4201(kdsA)
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PST_1556(kdsA)
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
PBA: 
PBC: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
PKC: 
PKB_1237(kdsA)
PCH: 
PCP: 
PALK: 
PRH: 
PSW: 
CJA: 
CJA_2226(kdsA)
AVN: 
AVL: 
AvCA_24680(kdsA) AvCA_38800(kdsA2)
AVD: 
PAR: 
Psyc_1640(kdsA)
PCR: 
PRW: 
PSO: 
ACI: 
ACIAD2002(kdsA)
ACD: 
ACB: 
ABM: 
ABSDF2033(kdsA)
ABY: 
ABAYE1668(kdsA)
ABC: 
ABN: 
ABB: 
ABX: 
ABZ: 
ABR: 
ABD: 
ABH: 
ABAD: 
ABJ: 
ABAB: 
ABAJ: 
ABAZ: 
ABK: 
ABAU: 
ABAA: 
ABW: 
ACC: 
MCT: 
MCR_1318(kdsA)
MCS: 
DR90_602(kdsA)
MCAT: 
SON: 
SO_3827(kdsA)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
SVI_3363(kdsA)
ILO: 
IL0920(kdsA)
ILI: 
CPS: 
CPS_3547(kdsA)
PHA: 
PSHAa1063(kdsA)
PAT: 
PSM: 
SDE: 
MAQ: 
MHC: 
MARHY2368(kdsA)
MAD: 
HP15_1273(kdsA)
MBS: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
AAL: 
GAG: 
GNI: 
GNIT_2138(kdsA)
GPS: 
PIN: 
PSY: 
TTU: 
FBL: 
CBU: 
CBU_1675(kdsA)
CBS: 
CBD: 
CBUD_0326(kdsA)
CBG: 
CbuG_0346(kdsA)
CBC: 
CbuK_0335(kdsA)
LPN: 
lpg1182(kdsA)
LPH: 
LPV_1339(kdsA)
LPO: 
LPO_1198(kdsA)
LPU: 
LPM: 
LP6_1164(kdsA)
LPF: 
lpl1191(kdsA)
LPP: 
lpp1185(kdsA)
LPC: 
LPC_0649(kdsA)
LPA: 
lpa_01838(kdsA)
LPE: 
LLO: 
LLO_1040(kdsA)
MCA: 
MCA2514(kdsA)
MMT: 
MAH: 
FTU: 
FTT_0701(kdsA)
FTF: 
FTF0701(kdsA)
FTW: 
FTW_1542(kdsA)
FTR: 
FTT: 
FTV_0659(kdsA)
FTG: 
FTU_0743(kdsA)
FTL: 
FTH: 
FTH_1485(kdsA)
FTA: 
FTA_1619(kdsA)
FTS: 
FTI: 
FTS_1499(kdsA)
FTO: 
FTM: 
FTM_1383(kdsA)
FTN: 
FTN_0611(kdsA)
FCF: 
FCN: 
FPH: 
FRT: 
FNA: 
FNL: 
FRF: 
TCX: 
TCY: 
MEJ: 
MEC: 
CYQ: 
Q91_1029(kdsA)
CZA: 
NOC: 
NHL: 
NWA: 
ALV: 
TVI: 
TMB: 
AEH: 
HHA: 
HHC: 
TGR: 
TKM: 
TNI: 
TVNIR_1889(kdsA_[H])
SSAL: 
SPIU: 
HNA: 
HCH: 
HCH_01866(kdsA)
CSA: 
HEL: 
HELO_3750(kdsA)
HCS: 
ABO: 
ABO_1163(kdsA-1)
ADI: 
B5T_01942(kdsA-1)
KKO: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
AHA: 
AHA_3145(kdsA)
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
ASA: 
ASA_1179(kdsA)
AVR: 
AMED: 
TAU: 
OCE: 
DNO: 
DNO_0361(kdsA)
AFE: 
AFR: 
AFE_0848(kdsA)
ACU: 
AFI: 
GAP: 
SAGA: 
RMA: 
VOK: 
COSY_0755(kdsA)
GPB: 
NMA: 
NMA1493(kdsA)
NME: 
NMB1283(kdsA)
NMP: 
NMH: 
NMC: 
NMC1218(kdsA)
NMN: 
NMCC_1196(kdsA)
NMT: 
NMV_1113(kdsA)
NMI: 
NMO_1126(kdsA)
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMAA_1016(kdsA)
NMZ: 
NGO: 
NGK: 
NGT: 
NLA: 
NLA_11200(kdsA)
SALV: 
CVI: 
CV_2747(kdsA)
LHK: 
LHK_00546(kdsA)
PSE: 
RSO: 
RSc1127(kdsA)
RSC: 
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
REU: 
REH: 
H16_A1186(kdsA)
CNC: 
RME: 
Rmet_1053(kdsA) Rmet_5733(kdsA)
CTI: 
BMA: 
BMA1690(kdsA)
BMV: 
BML: 
BMN: 
BMAL: 
DM55_328(kdsA)
BPS: 
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
GBP346_A2757(kdsA_1) GBP346_A3392(kdsA_2)
BPSE: 
BDL_2674(kdsA) BDL_3218(kdsA)
BPSM: 
BBQ_1042(kdsA) BBQ_538(kdsA)
BPSU: 
BBN_1169(kdsA) BBN_666(kdsA)
BPSD: 
BBX_1072(kdsA) BBX_1619(kdsA)
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BBK_2160(kdsA) BBK_2687(kdsA)
BPSH: 
DR55_1746(kdsA) DR55_2250(kdsA)
BTE: 
BTH_I1360(kdsA-1) BTH_I1893(kdsA-2)
BTQ: 
BTQ_2021(kdsA) BTQ_2574(kdsA)
BTJ: 
BTJ_298(kdsA) BTJ_3121(kdsA)
BTZ: 
BTL_1052(kdsA) BTL_1598(kdsA)
BTD: 
BTI_1366(kdsA) BTI_831(kdsA)
BTV: 
BTHA_1144(kdsA) BTHA_1697(kdsA)
BTHE: 
BTN_3171(kdsA) BTN_336(kdsA)
BTHM: 
BTRA_1259(kdsA) BTRA_1818(kdsA)
BOK: 
DM82_1875(kdsA) DM82_2441(kdsA)
BUT: 
X994_166(kdsA) X994_3386(kdsA)
BVI: 
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCEN: 
DM39_2181(kdsA)
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BMK: 
DM80_2859(kdsA)
BCT: 
BCED: 
DM42_2980(kdsA)
BXE: 
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DR64_3733(kdsA)
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BP2388(kdsA)
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BME: 
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BR1133(kdsA)
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bll4800(kdsA)
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ZMC: 
ZMR: 
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PUF: 
AFN: 
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Acin_0629(kdsA)
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CTA_0711(kdsA)
CTY: 
CTR_6601(kdsA)
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CTL: 
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CTLN: 
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FSW4_6671(kdsA)
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CTCH: 
CTN: 
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CTRI: 
CTRA: 
CTRH: 
CTRJ: 
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CTFS: 
CTHF: 
CTCJ: 
CTHJ: 
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CTTJ: 
CTJS: 
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PMT1925(kdsA)
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PGI: 
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PRU_0445(kdsA_1) PRU_1626(kdsA_2)
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CPI: 
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CHU_2589(kdsA)
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FAES_0824(kdsA)
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FP0501(kdsA)
FPC: 
FPY: 
FPO: 
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FCO: 
FIN: 
KQS_07905(kdsA)
COC: 
CCM: 
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ZPR: 
CAT: 
RAN: 
RAI: 
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RAG: 
RAE: 
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FBC: 
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ZGA: 
MRS: 
ASL: 
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DDD_0308(kdsA)
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CT0088(kdsA)
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HTE: 
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TID: 
TOP: 
TCM: 
MOX: 
DAMO_0269(kdsA)
HHS: 
HHS_05900(kdsA)
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:14416200]
  Authors
LEVIN DH, RACKER E.
  Title
Condensation of arabinose 5-phosphate and phosphorylenol pyruvate by 2-keto-3-deoxy-8-phosphooctonic acid synthetase.
  Journal
J. Biol. Chem. 234 (1959) 2532-9.
Reference
2  [PMID:11904225]
  Authors
Krosky DJ, Alm R, Berg M, Carmel G, Tummino PJ, Xu B, Yang W.
  Title
Helicobacter pylori 3-deoxy-D-manno-octulosonate-8-phosphate (KDO-8-P) synthase is a zinc-metalloenzyme.
  Journal
Biochim. Biophys. Acta. 1594 (2002) 297-306.
Reference
3  [PMID:11371194]
  Authors
Asojo O, Friedman J, Adir N, Belakhov V, Shoham Y, Baasov T.
  Title
Crystal structures of KDOP synthase in its binary complexes with the substrate phosphoenolpyruvate and with a mechanism-based inhibitor.
  Journal
Biochemistry. 40 (2001) 6326-34.
  Sequence
[eco:b1215]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9026-96-4

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