KEGG   ENZYME: 3.1.3.73Help
Entry
EC 3.1.3.73                 Enzyme                                 

Name
adenosylcobalamin/alpha-ribazole phosphatase;
CobC;
adenosylcobalamin phosphatase;
alpha-ribazole phosphatase
Class
Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Phosphoric-monoester hydrolases
BRITE hierarchy
Sysname
adenosylcobalamin/alpha-ribazole-5'-phosphate phosphohydrolase
Reaction(IUBMB)
(1) adenosylcobalamin 5'-phosphate + H2O = coenzyme B12 + phosphate [RN:R11173];
(2) alpha-ribazole 5'-phosphate + H2O = alpha-ribazole + phosphate [RN:R04594]
Reaction(KEGG)
Substrate
adenosylcobalamin 5'-phosphate [CPD:C21153];
H2O [CPD:C00001];
alpha-ribazole 5'-phosphate [CPD:C04778]
Product
coenzyme B12 [CPD:C00194];
phosphate [CPD:C00009];
alpha-ribazole [CPD:C05775]
Comment
This enzyme catalyses the last step in the anaerobic (early cobalt insertion) pathway of adenosylcobalamin biosynthesis, characterized in Salmonella enterica [3].
It also participates in a salvage pathway that recycles cobinamide into adenosylcobalamin [1].
History
EC 3.1.3.73 created 2004, modified 2011
Pathway
ec00860  Porphyrin and chlorophyll metabolism
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K02226  alpha-ribazole phosphatase
K22316  ribonuclease H / adenosylcobalamin/alpha-ribazole phosphatase
Genes
ECO: b0638(cobC)
ECJ: JW0633(cobC)
ECD: ECDH10B_0599(cobC) ECDH10B_0707(cobC)
EBW: BWG_0509(cobC)
ECOK: ECMDS42_0499(cobC)
ECE: Z0785(phpB)
ECS: ECs0676
ECF: ECH74115_0727(cobC)
ETW: ECSP_0691(cobC)
ELX: CDCO157_0663
EOJ: ECO26_0712(cobC)
EOI: ECO111_0668(cobC)
EOH: ECO103_0645(cobC)
ECG: E2348C_0538(cobC)
EOK: G2583_0801(cobC)
ECC: c0729(phpB)
ECP: ECP_0668
ECI: UTI89_C0641(phpB)
ECV: APECO1_1417(phpB)
ECX: EcHS_A0690(cobC)
ECW: EcE24377A_0664(cobC)
ECM: EcSMS35_0658(cobC)
ECY: ECSE_0707
ECR: ECIAI1_0622(phpB)
ECQ: ECED1_0635(phpB)
ECK: EC55989_0630(phpB)
ECT: ECIAI39_0613(phpB)
EOC: CE10_0636(cobC)
EUM: ECUMN_0732(phpB)
ECZ: ECS88_0680(phpB)
ELO: EC042_0673(cobC)
ELH: ETEC_0666
ESE: ECSF_0578
ESO: O3O_06895
ESM: O3M_18380
ESL: O3K_18400
EBR: ECB_00607(phpB)
EBD: ECBD_3013
EKF: KO11_20480(cobC)
EAB: ECABU_c06920(phpB)
EDJ: ECDH1ME8569_0607(cobC)
EIH: ECOK1_0648(cobC)
ENA: ECNA114_0578(phpB)
EUN: UMNK88_674(cobC)
ELW: ECW_m0692(cobC)
ELL: WFL_03440(cobC)
ELC: i14_0698(phpB)
ELD: i02_0698(phpB)
ELP: P12B_c0620(cobC)
EBL: ECD_00607(cobC)
EBE: B21_00596(cobC)
ELF: LF82_0334(cobC)
ECOI: ECOPMV1_00655(cobC_1)
ECOJ: P423_03130
ECOO: ECRM13514_0662(phpB)
ECOH: ECRM13516_0607(phpB)
ECOS: EC958_0757(phpB)
EAL: EAKF1_ch0822(cobC)
STY: STY0694(cobC)
STT: t2224(cobC)
STM: STM0643(cobC)
SEO: STM14_0751(cobC)
SEY: SL1344_0631(cobC)
SEJ: STMUK_0648(cobC)
SEB: STM474_0664(cobC)
SEF: UMN798_0695(cobC)
SENR: STMDT2_06341(cobC)
SEND: DT104_06721(cobC)
SENI: CY43_03505
SPT: SPA2091(cobC)
SEK: SSPA1943
SEI: SPC_0659(cobC)
SEC: SCH_0673(cobC)
SEH: SeHA_C0759(cobC)
SHB: SU5_01334
SEE: SNSL254_A0700(cobC)
SEW: SeSA_A0803(cobC)
SEA: SeAg_B0686(cobC)
SENS: Q786_03150
SED: SeD_A0746(cobC)
SEG: SG0647(cobC)
SEL: SPUL_2317(cobC)
SEGA: SPUCDC_2303(cobC)
SET: SEN0612(cobC)
SENA: AU38_03135
SENO: AU37_03130
SENV: AU39_03135
SENQ: AU40_03455
SENL: IY59_03185
SEEP: I137_10570
SENB: BN855_6370(cobC)
SENE: IA1_03370
SBZ: A464_620
SFL: SF0643(phpB)
SFX: S0665(phpB)
SFV: SFV_0688(phpB)
SFE: SFxv_0710(cobC)
SFN: SFy_0875
SFS: SFyv_0913
SFT: NCTC1_00692(cobC_1)
SSN: SSON_0592(phpB)
CTU: CTU_12710(cobC)
KPN: KPN_00670(phpB)
KPU: KP1_1625(phpB)
KPP: A79E_3569
KPT: VK055_1862(cobC)
KPE: KPK_3903(cobC)
KPR: KPR_3905(cobC)
KPJ: N559_3652
KPX: PMK1_03004(cobC)
KPNU: LI86_18745
KPNK: BN49_1730(cobC)
KVA: Kvar_3696
KOX: KOX_14245
KOE: A225_1668
EAE: EAE_13875
EAR: CCG31196
CKO: CKO_02519
CRO: ROD_06571(cobC)
CAMA: F384_02835
EBT: EBL_c27270(phpB)
EBF: D782_3203
YEN: YE2708(cobC)
YEY: Y11_15911
YEW: CH47_2055(cobC)
YET: CH48_3176(cobC)
YEE: YE5303_31391(cobC)
YAL: AT01_4059(cobC)
YFR: AW19_744(cobC)
YIN: CH53_3391(cobC)
YKR: CH54_918(cobC)
YRO: CH64_104(cobC)
RAA: Q7S_13000
PLU: plu2981(cobC)
PAY: PAU_01617(cobC)
XBV: XBW1_1577(cobC)
XNE: XNC1_1168(cobC)
XNM: XNC2_1148(cobC)
MMK: MU9_996
ETR: ETAE_1547(phpB)
ETD: ETAF_1436
ETE: ETEE_3551(cobC2)
XCC: XCC3058
XCB: XC_1100
XCP: XCR_3395
XCV: XCV3314
XAX: XACM_3100
XAC: XAC3185
XCI: XCAW_03472(gpmB)
XFU: XFF4834R_chr14450(cobC)
XOO: XOO1352(GpmB)
XOM: XOO1242(XOO1242)
XOP: PXO_01925
XOR: XOC_3393
XPH: XppCFBP6546_18120(XppCFBP6546P_18120)
SML: Smlt0586
SMT: Smal_0462
SMZ: SMD_0501
LEZ: GLE_4082
LEM: LEN_1118
VCH: VC1240
VCI: O3Y_05775
VCS: MS6_1024
VVU: VV1_2785(cobC)
VPA: VP1307
VPB: VPBB_1232
VAG: N646_0346
VHR: AL538_01940(cobC)
VSP: VS_1699
VAN: VAA_03081
VAU: VANGNB10_cI1525c(cobC?)
VSC: VSVS12_01608(cobC)
PPR: PBPRB0994(XAC3185)
PAE: PA1280
PAEV: N297_1320
PAEI: N296_1320
PAU: PA14_47660(cobC)
PNC: NCGM2_2164(cobC)
PAEB: NCGM1900_5294(cobC)
PAEP: PA1S_19505
PAEM: U769_19355
PAEL: T223_20600
PAEG: AI22_14455
PAEC: M802_1317
PAEO: M801_1319
PMY: Pmen_1758
PMK: MDS_3104
PPSE: BN5_1591
PCQ: PcP3B5_15520(pspB)
PPU: PP_1680
PPF: Pput_4039
PPT: PPS_1331
PPI: YSA_02423
PPX: T1E_3642
PPUH: B479_06435
PPUT: L483_05955
PPUN: PP4_40910
PMON: X969_04530
PMOT: X970_04505
PSB: Psyr_3673
PSYR: N018_07045
PFL: PFL_4423(cobC)
PPRO: PPC_4532
PFS: PFLU_4482
PFC: PflA506_3788(cobC)
PFW: PF1751_v1c39770(cobC)
PFB: VO64_5052
PMAN: OU5_5269
PEN: PSEEN1386
PSA: PST_1300
PSTT: CH92_07745
PPUU: PputUW4_03767(cobC1)
PKC: PKB_1575
PSES: PSCI_0375
PSEM: TO66_23125
PSOS: POS17_4495
PANR: A7J50_4163
PSET: THL1_1824
PSIL: PMA3_21070
AVN: Avin_33040(cobC)
AVL: AvCA_33040(cobC)
AVD: AvCA6_33040(cobC)
ACX: Achr_16260(cobC)
PALI: A3K91_0984
ACB: A1S_1661
ABM: ABSDF1881(cobC)
ABY: ABAYE1992(cobC)
ABN: AB57_1886
ABX: ABK1_2147
ABH: M3Q_2040
ABAD: ABD1_16470(cobC)
ABAZ: P795_8965
ABAU: IX87_19140
ABAA: IX88_10225
ACC: BDGL_001020(cobC)
SON: SO_1031(cobC)
SFR: Sfri_0873
SAZ: Sama_0759
SBL: Sbal_3367
SLO: Shew_0711
SPL: Spea_3383
SHL: Shal_3461
SWD: Swoo_4087
SWP: swp_0993
SVO: SVI_0653
SPSW: Sps_04790
PHA: PSHAa3000
PAT: Patl_1136
PTN: PTRA_a3571(cobC2)
PSPO: PSPO_a1476(cobC2)
PTU: PTUN_a2170(cobC2)
PNG: PNIG_a3794(cobC2)
MAQ: Maqu_0269
MHC: MARHY0211
GPS: C427_1088
MVS: MVIS_3622
CJA: CJA_2898
SDE: Sde_0632
SAGA: M5M_10520
MEJ: Q7A_1244
AEH: Mlg_2817
HHA: Hhal_1855
TKM: TK90_1453
GAI: IMCC3135_25420(pspA_2)
HCH: HCH_00966
HEL: HELO_1820(dpgm)
HCO: LOKO_03152(gpmA)
ABO: ABO_2379
ADI: B5T_04147
APAC: S7S_16805
AXE: P40_20160
TOL: TOL_0701
TAU: Tola_2006
OCE: GU3_09060
SLIM: SCL_1003
TBN: TBH_C2398
EBH: BSEPE_0207(gpmB)
ENM: EBS_2052
RSO: RSc2395
RSE: F504_2355
RPI: Rpic_2661
RIN: ACS15_2638(cobC)
REH: H16_A2966(cobC)
CNC: CNE_1c29160(cobC2)
RME: Rmet_2783
CTI: RALTA_A2440(cobC)
CGD: CR3_0446(cobC)
BMA: BMA0690
BMN: BMA10247_1634(cobC-2)
BMAL: DM55_2051(cobC)
BMAE: DM78_1270(cobC)
BMAQ: DM76_2026(cobC)
BMAI: DM57_2692
BMAF: DM51_463(cobC)
BMAZ: BM44_1540(cobC)
BMAB: BM45_1103(cobC)
BPS: BPSL0981
BPL: BURPS1106A_1039(cobC)
BPD: BURPS668_1033(cobC)
BPR: GBP346_A1031(cobC)
BPSE: BDL_1055(cobC)
BPSM: BBQ_2465(cobC)
BPSU: BBN_2589(cobC)
BPSD: BBX_2999(cobC)
BPK: BBK_536(cobC)
BPSH: DR55_151(cobC)
BPSA: BBU_1199(cobC)
BPSO: X996_3219(cobC)
BUT: X994_1753(cobC)
BTE: BTH_I0839
BTQ: BTQ_857(cobC)
BTJ: BTJ_1584(cobC)
BTZ: BTL_2853(cobC)
BTD: BTI_2846(cobC) BTI_4931
BTV: BTHA_3069(cobC)
BTHE: BTN_1850(cobC)
BTHM: BTRA_3178(cobC)
BTHA: DR62_2051
BTHL: BG87_3058(cobC)
BOK: DM82_414(cobC) DM82_6372
BOC: BG90_4302 BG90_614(cobC)
BVE: AK36_1457(cobC)
BCN: Bcen_1840
BCJ: BCAL2661
BCEN: DM39_2539(cobC)
BCEW: DM40_88(cobC)
BCEO: I35_2521
BAM: Bamb_2499
BMU: Bmul_0843
BMK: DM80_2513(cobC)
BMUL: NP80_2595(cobC)
BCT: GEM_0978
BCED: DM42_2617(cobC)
BDL: AK34_629(cobC)
BCON: NL30_30500
BUB: BW23_2432(cobC)
BLAT: WK25_11890
BTEI: WS51_22520
BSEM: WJ12_12325
BPSL: WS57_31000
BMEC: WJ16_12605
BSTG: WT74_13125
BGU: KS03_267
BGO: BM43_645(cobC)
BUK: MYA_2222
BUO: BRPE64_ACDS06520(cobC)
BUL: BW21_2983(cobC) BW21_4459
BXE: Bxe_A3497
BXB: DR64_1200(cobC)
BPH: Bphy_2208
BFN: OI25_729(cobC)
PARB: CJU94_01280(cobC)
PHS: C2L64_12400(cobC)
PTER: C2L65_11525(cobC)
PPNO: DA70_10075
PPNM: LV28_21015
PPUL: RO07_15220
PSPU: NA29_21805
PAPI: SG18_24745
RFR: Rfer_2609
POL: Bpro_0739
PNA: Pnap_0640
AAV: Aave_0927
AJS: Ajs_0677
AAA: Acav_0879
ACRA: BSY15_2177
DAC: Daci_5687
CTES: O987_03475
RTA: Rta_16480
HYB: Q5W_08845
CBAA: SRAA_0436
CBAB: SMCB_0334
MPT: Mpe_A2301(gmpB)
HAR: HEAR0956
MMS: mma_1089
HSE: Hsero_1960(gpmB)
HRB: Hrubri_1837(gpmB)
LCH: Lcho_2658
RGE: RGE_15110(cobC)
PBH: AAW51_3241(cobC2)
TBD: Tbd_2711
MFA: Mfla_0100
MMB: Mmol_0266
MEH: M301_0164
MEP: MPQ_0146(gpmB)
EBA: ebA4004(gpmA)
DSU: Dsui_0470
DAR: Daro_0151
AZO: azo3562
AZA: AZKH_0607
AOA: dqs_3705
TCL: Tchl_1230
SUA: Saut_0058
SMUL: SMUL_1550(cobC)
SHAL: SHALO_1514
SULJ: SJPD1_1527
GSU: GSU3007(cobC)
GSK: KN400_2950(cobC)
GME: Gmet_0469(cobC)
GUR: Gura_4185
GLO: Glov_3084
GBM: Gbem_3811(cobC)
GEO: Geob_0541(cobC)
GEM: GM21_3895
GEB: GM18_4241
PCA: Pcar_0488(cobC-3)
DES: DSOUD_0616(cobC)
DEU: DBW_3103
DPS: DP1954
DSF: UWK_02958
SCL: sce6910
CCRO: CMC5_057470(gpm)
BJA: bll327(bluF)
BRA: BRADO4917
BBT: BBta_3134
BRS: S23_47270
AOL: S58_27740(cobC)
BRAD: BF49_1421
RPA: RPA0993
RPC: RPC_1895
RPE: RPE_3847
RPT: Rpal_1185
RVA: Rvan_2220
BVR: BVIR_1994
RBM: TEF_01830
PDE: Pden_3632
MALG: MALG_01219
RSU: NHU_01478
RHC: RGUI_2350
HNE: HNE_1512
HBA: Hbal_2153
NAR: Saro_0327
SPHP: LH20_21875
SPHM: G432_03935
STAX: MC45_17110
SPKC: KC8_18045
SPMI: K663_18336
SPHB: EP837_03446(cobC)
SPHR: BSY17_1672
SINB: SIDU_11715
SPHT: K426_22584
BLAS: BSY18_2564
GOH: B932_2922
GDI: GDI0663
GDJ: Gdia_1343
GXY: GLX_11400
KEU: S101446_01597(cobC)
APK: APA386B_1109(gpmA)
ASZ: ASN_2740
RRU: Rru_A0669
RRF: F11_03425
RCE: RC1_2369
MAG: amb0541
MAGX: XM1_0136
MAGN: WV31_03110
TMO: TMO_3152
TXI: TH3_20670
MGM: Mmc1_0703
BHA: BH1593
BPF: BpOF4_15130(cobC)
BMQ: BMQ_1999(cobC)
BMD: BMD_1955(cobC)
BMEG: BG04_4300
BACO: OXB_1396
BEO: BEH_16925
BKW: BkAM31D_10695(cobC)
BBEV: BBEV_2487(cobC)
GKA: GK2259
GTN: GTNG_2192(cobC)
GEA: GARCT_02231(cobC)
AFL: Aflv_1048(cobC)
ANM: GFC28_91
AAMY: GFC30_2461
LSP: Bsph_2448
BSE: Bsel_2907
LMO: lmo1149
LMF: LMOf2365_1156(cobC)
LMH: LMHCC_1502(cobC)
LMS: LMLG_2820
LMQ: LMM7_1155(cobC)
LML: lmo4a_1132(cobC)
LMP: MUO_05940
LMW: LMOSLCC2755_1141(cobC)
LMX: LMOSLCC2372_1144(cobC)
LMZ: LMOSLCC2482_1187(cobC)
LMON: LMOSLCC2376_1100(cobC)
LMOC: LMOSLCC5850_1138(cobC)
LMOS: LMOSLCC7179_1116(cobC)
LMOO: LMOSLCC2378_1152(cobC)
LMOY: LMOSLCC2479_1145(cobC)
LMOT: LMOSLCC2540_1127(cobC)
LMOA: LMOATCC19117_1148(cobC)
LMOL: LMOL312_1136(cobC)
LMOG: BN389_11680(cobC)
LMOE: BN418_1349
LMOB: BN419_1346
LMOZ: LM1816_01032(cobC)
LMOD: LMON_1142
LMOW: AX10_14250
LMOX: AX24_03110
LMOK: CQ02_05910
LMOM: IJ09_04590
LIN: lin1113
LWE: lwe1107(cobC)
LSG: lse_1027
LIV: LIV_1081
BBE: BBR47_12430(cobC)
PPY: PPE_01284
PPM: PPSC2_06630(cobC)
PPO: PPM_1255(cobC)
PPOL: X809_07085
PPOY: RE92_05255
PRI: PRIO_1522
ASOC: CB4_00865(pspA)
SIV: SSIL_2833
JEO: JMA_30670
LLA: L1889160(cobC)
LLK: LLKF_2013(cobC)
LLT: CVCAS_1755(cobC)
LLS: lilo_1824(cobC)
LLX: NCDO2118_1942(cobC)
LLW: kw2_1879
LLJ: LG36_1777(cobC)
SSA: SSA_0491
SIU: SII_0509
LRE: Lreu_1697
LRF: LAR_1585
PCE: PECL_1409(cobC)
CAC: CA_C1385(cobC)
CAE: SMB_G1408(cobC)
CAY: CEA_G1399(cobC)
CPE: CPE1038
CPF: CPF_1293
CPR: CPR_1112
CTC: CTC_00717
CBO: CBO0819(cobC)
CBA: CLB_0860(cobC)
CBH: CLC_0874(cobC)
CBY: CLM_0961(cobC)
CBL: CLK_0220(cobC)
CBK: CLL_A2920
CBB: CLD_3753(cobC)
CBI: CLJ_B0861(cobC)
CBN: CbC4_1388
CBT: CLH_2663
CBF: CLI_0900(cobC)
CBM: CBF_0871(cobC)
CBE: Cbei_1267
CBZ: Cbs_1267
CBEI: LF65_01399
CKL: CKL_0732(cobC2)
CKR: CKR_0654
CLJ: CLJU_c35540(cobC)
CLS: CXIVA_14000(GpmB)
CPAS: Clopa_4109
CBV: U729_242
CSQ: CSCA_4654
CACE: CACET_c09580(cobC)
CTYK: CTK_C25590(cobC)
AMT: Amet_3620
AOE: Clos_2208
CTH: Cthe_3153
ESR: ES1_17030
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CCEL: CCDG5_0420
RBR: RBR_13240
RCH: RUM_14610
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RUS: RBI_I00516(cobC)
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BPB: bpr_I1985
BFI: CIY_15590
BHU: bhn_I1792
RIX: RO1_12900
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MAO: MAP4_1845
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MMI: MMAR_3304
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MHAD: B586_10000
MVA: Mvan_3618
MGI: Mflv_2892
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ASD: AS9A_1244
CGL: NCgl2155(Cgl2236)
CGB: cg2455
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CEF: CE2133
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CUR: cu1297
CUA: CU7111_1279(rnhA)
CAR: cauri_1744(rnhA)
COP: Cp31_1485
CPSE: CPTA_02082
CPSU: CPTB_01679
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CRD: CRES_0718(rnhA)
CVA: CVAR_1092
CTER: A606_04315
COA: DR71_367
CSX: CSING_09555(rnhA)
CSP: WM42_2214
CPHO: CPHO_03805
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RER: RER_36580
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ROP: ROP_09060
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RHB: NY08_610
RFA: A3L23_03864(pspA_5)
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GBR: Gbro_3094
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GOR: KTR9_3081
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SRN: A4G23_01450(pspA_2)
SMAL: SMALA_2244
SLAU: SLA_1900
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KSK: KSE_24000
AMIN: AUMI_14600
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CFI: Celf_2257
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NDK: I601_3697(pspA_3)
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NAL: B005_5448
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CHZ: CHSO_1488(gpmA2)
FEK: C1H87_19815(cobC)
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CTS: Ctha_0109
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LFI: LFML04_1207(phpB)
CTHI: THC_1028
CDIV: CPM_1151
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:7929373]
  Authors
O'Toole GA, Trzebiatowski JR, Escalante-Semerena JC.
  Title
The cobC gene of Salmonella typhimurium codes for a novel phosphatase involved in the assembly of the nucleotide loop of cobalamin.
  Journal
J. Biol. Chem. 269 (1994) 26503-11.
  Sequence
[stm:STM0643]
Reference
2  [PMID:12195810]
  Authors
Warren MJ, Raux E, Schubert HL, Escalante-Semerena JC.
  Title
The biosynthesis of adenosylcobalamin (vitamin B12).
  Journal
Nat. Prod. Rep. 19 (2002) 390-412.
Reference
3  [PMID:17209023]
  Authors
Zayas CL, Escalante-Semerena JC
  Title
Reassessment of the late steps of coenzyme B12 synthesis in Salmonella enterica:  evidence that dephosphorylation of adenosylcobalamin-5'-phosphate by the CobC phosphatase is the last step of the pathway.
  Journal
J. Bacteriol. 189 (2007) 2210-8.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 3.1.3.73
IUBMB Enzyme Nomenclature: 3.1.3.73
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 3.1.3.73
BRENDA, the Enzyme Database: 3.1.3.73
CAS: 251991-06-7

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