KEGG   ENZYME: 3.4.19.12Help
Entry
EC 3.4.19.12                Enzyme                                 

Name
ubiquitinyl hydrolase 1;
ubiquitin C-terminal hydrolase;
yeast ubiquitin hydrolase
Class
Hydrolases;
Acting on peptide bonds (peptidases);
Omega peptidases
BRITE hierarchy
Reaction(IUBMB)
Thiol-dependent hydrolysis of ester, thioester, amide, peptide and isopeptide bonds formed by the C-terminal Gly of ubiquitin (a 76-residue protein attached to proteins as an intracellular targeting signal)
Comment
Links to polypeptides smaller than 60 residues are hydrolysed more readily than those to larger polypeptides. Isoforms exist with quantitatively different specificities, amongst the best known being UCH-L1 and UCH-L3, which are major proteins of the brain of mammals [1]. Inhibited by ubiquitin aldehyde (in which Gly76 is replaced by aminoacetaldehyde). Ubiquitinyl hydrolase 1 is the type example of peptidase family C12, with a similar protein fold to papain and catalytic amino acids Cys, His and Asp. There is a separate family (C19) of enzymes that also hydrolyse ubiquitinyl bonds, and it is thought that all the ubiquitinyl hydrolases are also ubiquitin thiolesterases (EC 3.1.2.15)
History
EC 3.4.19.12 created 2000
Orthology
K05609  
ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L3
K05610  
ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L5
K05611  
ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L1
K08588  
ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1
K09602  
ubiquitin thioesterase protein OTUB1
K09603  
ubiquitin thioesterase protein OTUB2
K11859  
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
K11860  
OTU domain-containing protein 7
K11861  
deubiquitinating protein VCIP135
K11862  
ubiquitin thioesterase ZRANB1
K12655  
OTU domain-containing protein 5
K13716  
OTU domain-containing protein 1
K13717  
OTU domain-containing protein 3
K13718  
OTU domain-containing protein 4
K15235  
josephin
K18342  
OTU domain-containing protein 6
K18343  
ubiquitin thioesterase otulin
Genes
HSA: 
126119(JOSD2) 139562(OTUD6A) 161725(OTUD7A) 220213(OTUD1) 23252(OTUD3) 51377(UCHL5) 51633(OTUD6B) 54726(OTUD4) 54764(ZRANB1) 55593(OTUD5) 55611(OTUB1) 56957(OTUD7B) 7128(TNFAIP3) 7345(UCHL1) 7347(UCHL3) 78990(OTUB2) 80124(VCPIP1) 8314(BAP1) 90268(OTULIN) 9929(JOSD1)
PTR: 
100609286(OTUD6A) 100611316(UCHL3) 450809(ZRANB1) 453287(OTUD7A) 456482(OTUD3) 457596(UCHL5) 458834(JOSD1) 460426(BAP1) 461185(UCHL1) 461733(FAM105B) 464282(OTUD6B) 466024(OTUD1) 466922(OTUD4) 467539(OTUB2) 472136(TNFAIP3) 472782(VCPIP1) 737927(OTUD5) 742797(OTUB1) 747924(JOSD2) 749087(OTUD7B)
PPS: 
100967683(UCHL5) 100969397(OTUD6A) 100973287(ZRANB1) 100973818(OTUD7A) 100974018(FAM105B) 100976531 100978798(UCHL1) 100980786(JOSD1) 100983014(OTUD5) 100983324(OTUD6B) 100983504(OTUB1) 100983795(OTUD1) 100984445(OTUD7B) 100985439(BAP1) 100986757(VCPIP1) 100988131(OTUB2) 100990144(OTUD4) 100990675 100991032(JOSD2) 100992171(OTUD3) 100994797(TNFAIP3)
GGO: 
101123735(FAM105B) 101125016(UCHL5) 101125045(BAP1) 101127042(OTUD3) 101127919(OTUB1) 101128527(OTUD7B) 101129990(OTUD7A) 101130166(OTUD6B) 101131709(JOSD1) 101133445(VCPIP1) 101133813(OTUD1) 101136267(JOSD2) 101138427(UCHL3) 101143810(OTUB2) 101144509(ZRANB1) 101149274(TNFAIP3) 101150793(UCHL1) 101153212(OTUD4) 101154346(OTUD6A)
PON: 
100173411(JOSD1) 100173431(OTUD6B) 100174635(UCHL5) 100431477(OTUD4) 100440914(UCHL1) 100445074(OTUD6A) 100445717(VCPIP1) 100446150(OTUD7B) 100451119(ZRANB1) 100452766(UCHL3) 100456651(OTUB2) 100458886(FAM105B) 100458998(ASPDH) 100459093(OTUD3) 100459145(TNFAIP3) 100460247(OTUD5) 100462322(BAP1) 100936578(JOSD2) 100939512
MCC: 
694498(OTUD6A) 697015(OTUD6B) 697221(BAP1) 697276(UCHL3) 697541(ZRANB1) 698991(FAM105B) 701426(JOSD1) 701579 701837(OTUD4) 703582(VCPIP1) 704130(TNFAIP3) 705608(OTUD1) 705774(OTUD7B) 706795(OTUB2) 712473 716815(OTUD3) 717989(OTUB1) 719609 720680(OTUD7A)
MCF: 
101867027 101867362(TNFAIP3) 101867495 101925979 101926668 101926732 102116075(OTUD6B) 102116210(ZRANB1) 102117041(FAM105B) 102117209(UCHL3) 102117932(BAP1) 102121573(OTUD1) 102125403(UCHL5) 102128408(JOSD2) 102129576(OTUD6A) 102129756(OTUB2) 102133043(UCHL1) 102136786(OTUD7B) 102137405(OTUD7A) 102142674(VCPIP1)
MMU: 
100043771(Gm10651) 104416(Bap1) 107260(Otub1) 170711(Otud7a) 21929(Tnfaip3) 22223(Uchl1) 229603(Otud7b) 360216(Zranb1) 408193(Otud6a) 432940(Otulin) 50933(Uchl3) 54644(Otud5) 56207(Uchl5) 66124(Josd2) 68149(Otub2) 70675(Vcpip1) 71198(Otud1) 72201(Otud6b) 73162(Otud3) 73945(Otud4) 74158(Josd1) 93841(Uchl4)
RNO: 
100360606 100362554(Otulin) 286761(Vcpip1) 292876(Josd2) 293705(Otub1) 29545(Uchl1) 297911(Otud6b) 302426(Otud6a) 306257(Bap1) 307774(Otud4) 309252(Otud7a) 310677(Otud7b) 314405(Otub2) 314660(RGD1565010) 315134(Josd1) 360853(Uchl5) 363452(Otud5) 498560(Uchl3) 498803(Otud1) 500572(Otud3) 683206(Tnfaip3)
CGE: 
100755386(Uchl3) 100755892(Josd2) 100756131(Otud1) 100756165(Otud3) 100758975(Otub1) 100760086(Otud7b) 100761947(Otud5) 100763244(Vcpip1) 100763787(Otud7a) 100764676(Otub2) 100765297(Bap1) 100765837(Uchl5) 100766373(Uchl1) 100768059(Otud6b) 100768651(Otud6a) 100769882(Zranb1) 100771576(Otud4) 100771931(Tnfaip3) 100772832(Otulin) 100773825(Josd1)
HGL: 
101696695(Uchl5) 101699541(Fam105b) 101702603(Otud1) 101702892(Uchl1) 101703932(Bap1) 101704183(Josd1) 101706252(Otud4) 101706271(Otub1) 101706786(Otub2) 101707725 101710572(Otud3) 101712863(Otud5) 101713492(Otud7b) 101714013(Vcpip1) 101717495(Otud6b) 101718538(Uchl3) 101720899(Otud7a) 101723409(Zranb1) 101723776 101725004(Josephin-2) 101727905
TUP: 
102477224(TNFAIP3) 102478017(UCHL1) 102478912(UCHL3) 102484066(OTUD7B) 102485260(JOSD2) 102487857 102488642(OTUD5) 102489700(OTUD6B) 102490175(OTUB1) 102493123(VCPIP1) 102493129(OTUD7A) 102493601(OTUD4) 102497298(JOSD1) 102497774(UCHL5) 102498304(OTUD3) 102498644(BAP1) 102498890(FAM105B) 102499537(ZRANB1) 102499922 102502079(OTUB2) 102502551(OTUD6A)
CFA: 
100687506(OTUD3) 100855636 475455(OTUD4) 476947(UCHL3) 478958(UCHL5) 479098(UCHL1) 480420(OTUB2) 480911(OTUD5) 481251(JOSD1) 483178(OTUD7B) 484006(TNFAIP3) 484737(BAP1) 486931(ZRANB1) 486980(VCPIP1) 487042(OTUD6B) 487102(OTUD1) 488697(OTUD7A) 491937(OTUD6A) 606770(FAM105B) 611228(OTUB1) 611845(JOSD2)
AML: 
FCA: 
101081646(JOSD1) 101083135(UCHL3) 101083682(TNFAIP3) 101085218(OTUD1) 101085935(JOSD2) 101086908(OTUD7A) 101087134(OTUD6A) 101087295 101088171(OTUB2) 101088209(UCHL5) 101089203(OTUD7B) 101089918(VCPIP1) 101090671(FAM105B) 101091543(OTUD3) 101092671(BAP1) 101093604(UCHL1) 101096147(OTUD4) 101096843(OTUB1) 101098283(OTUD5) 101098896(ZRANB1) 101101613(OTUD6B)
PTG: 
102949487(UCHL1) 102953016(OTUD6B) 102955101(OTUD6A) 102955492(OTUD7A) 102956851(OTUD3) 102957243(OTUD4) 102958897(TNFAIP3) 102958964(UCHL5) 102959124(OTUD7B) 102959486(BAP1) 102961717(JOSD2) 102965643(UCHL3) 102965933(OTUB2) 102969060(OTUD1) 102969397(FAM105B) 102970403(JOSD1) 102970821(OTUD5) 102970985(ZRANB1) 102972665(VCPIP1) 102973017
BTA: 
100124510(BAP1) 100847538(OTUD6B) 100848343 282110(UCHL5) 504880(OTUB2) 508105(TNFAIP3) 508963(FAM105B) 510781(JOSD1) 514394(UCHL1) 514809(OTUD3) 520170(UCHL3) 523338(ZRANB1) 525579(OTUD7B) 528907(OTUD4) 530173(OTUD1) 532172(OTUD6A) 539145(OTUD5) 539643(VCPIP1) 540984(OTUB1) 789946(OTUD7A)
BOM: 
102264734(UCHL3) 102264871(JOSD1) 102265618(OTUD4) 102266726(TNFAIP3) 102267549(OTUD5) 102268561(ZRANB1) 102272096(BAP1) 102272289(UCHL5) 102273927(OTUD1) 102275840(OTUD6B) 102276270(OTUD6A) 102276503 102278220(VCPIP1) 102278232(OTUB2) 102278517(OTUD7B) 102279069(OTUB1) 102279594(OTUD3) 102281099(FAM105B) 102282378(UCHL1) 102284088(OTUD7A) 102288102(JOSD2)
PHD: 
102317147(UCHL3) 102324402(ZRANB1) 102325635(UCHL1) 102325910 102326883(OTUB1) 102327172(TNFAIP3) 102327175(OTUD6B) 102327814(BAP1) 102330534(OTUD5) 102331590(OTUD6A) 102333379(OTUD4) 102334216(VCPIP1) 102336506(JOSD2) 102337001(FAM105B) 102339601(UCHL5) 102340619(OTUB2) 102342375(JOSD1) 102344515(OTUD3) 102345066(OTUD7B)
CHX: 
102168647(VCPIP1) 102169927(OTUD7B) 102171046(OTUD5) 102171201(OTUD3) 102175982(JOSD2) 102176829(FAM105B) 102176866(OTUD6A) 102177268(OTUD4) 102177539(OTUD1) 102178714(UCHL1) 102178799(OTUB1) 102180372(ZRANB1) 102182142(UCHL3) 102182955(JOSD1) 102182977(TNFAIP3) 102183466(BAP1) 102184847(OTUB2) 102186634 102190532(OTUD6B) 102191821(UCHL5)
OAS: 
101104383(OTUD3) 101105383 101105900(JOSD1) 101106912(OTUD5) 101110355(JOSD2) 101110451(OTUD4) 101110917 101111666(BAP1) 101113156(TNFAIP3) 101114028(OTUD6B) 101114127(OTUD1) 101114561(OTUB2) 101114991(ZRANB1) 101116276(OTUD7B) 101117250(UCHL1) 101120357(FAM105B) 101120609(OTUD7A) 101121496(OTUD6A) 101121952(UCHL5) 101122063(OTUB1) 101122196(VCPIP1) 101123568(UCHL3)
SSC: 
100144472(UCHL5) 100151873(OTUB2) 100152569(OTUD7B) 100154798(BAP1) 100155662(ZRANB1) 100157831(OTUD6B) 100302092(OTUB1) 100511033 100517870(OTUD6A) 100519060(FAM105B) 100520958(JOSD1) 100524693(OTUD4) 100524801 100525093(OTUD7A) 100622156(TNFAIP3) 100624053(OTUD5) 100627842(JOSD2) 100738624(OTUD1) 396637(UCHL1) 768115(UCHL3)
CFR: 
102503512(OTUD7B) 102504572(OTUD6B) 102505955(OTUD5) 102507883(UCHL5) 102510272(FAM105B) 102510412(JOSD1) 102514082(OTUD4) 102514352(UCHL1) 102514794(BAP1) 102515830(OTUD6A) 102515926 102516165(VCPIP1) 102517235(JOSD2) 102517499(OTUD7A) 102518193(OTUB2) 102519331(ZRANB1) 102520058(OTUD1) 102520136(OTUD3) 102520877(OTUB1) 102522547(UCHL3) 102523266(TNFAIP3)
BACU: 
102997407(OTUD7B) 103000254(OTUD3) 103001161(TNFAIP3) 103001857(UCHL3) 103002604(OTUD4) 103003433(OTULIN) 103005510(ZRANB1) 103005592(OTUD1) 103006967(OTUD6B) 103007566(UCHL1) 103008565(OTUD6A) 103008744(OTUD5) 103009222(JOSD2) 103010559(OTUB1) 103010698(VCPIP1) 103011398(JOSD1) 103011497(UCHL5) 103011999(OTUD7A) 103013242(BAP1) 103015130(OTUB2)
LVE: 
103069363(UCHL1) 103069594(UCHL3) 103069716(OTUD6A) 103070502(UCHL5) 103072308(OTUD3) 103077060(OTUD5) 103080662(OTULIN) 103081298(TNFAIP3) 103081901(OTUD4) 103082267(VCPIP1) 103083971(JOSD2) 103083972(OTUD7B) 103084376 103085516(OTUD6B) 103085760(ZRANB1) 103086050(OTUD7A) 103086519(OTUD1) 103086992(BAP1) 103087631(JOSD1) 103087759(OTUB1) 103089039(OTUB2)
ECB: 
100033838(UCHL1) 100050133(ZRANB1) 100050355 100051934(BAP1) 100052000(UCHL3) 100052090(VCPIP1) 100052944(OTUD6B) 100054396(OTUD7B) 100054829(OTUB1) 100055255(JOSD1) 100056237 100059547(UCHL5) 100060048(OTUD7A) 100062519(OTUD5) 100064732(OTUB2) 100070204(FAM105B) 100070999(OTUD4) 100071874(OTUD3) 100073197(TNFAIP3) 100146692 102149894(OTUD1)
MYB: 
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:9233788]
  Authors
Johnston SC, Larsen CN, Cook WJ, Wilkinson KD, Hill CP.
  Title
Crystal structure of a deubiquitinating enzyme (human UCH-L3) at 1.8 A resolution.
  Journal
EMBO. J. 16 (1997) 3787-96.
  Sequence
[hsa:7347]
Reference
2
  Authors
Wilkinson, K.D.
  Title
Ubiquitin C-terminal hydrolase.
  Journal
In: Barrett, A.J., Rawlings, N.D. and Woessner, J.F. (Eds.), Handbook of Proteolytic Enzymes, Academic Press, London, 1998, p. 470-472.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
86480-67-3 189642-63-5

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