KEGG   ENZYME: 3.6.4.12Help
Entry
EC 3.6.4.12                 Enzyme                                 

Name
DNA helicase;
3' to 5' DNA helicase;
3'-5' DNA helicase;
3'-5' PfDH;
5' to 3' DNA helicase;
AvDH1;
BACH1 helicase;
BcMCM;
BLM protein;
BRCA1-associated C-terminal helicase;
CeWRN-1;
Dbp9p;
DmRECQ5;
DNA helicase 120;
DNA helicase A;
DNA helicase E;
DNA helicase II;
DNA helicase III;
DNA helicase RECQL5beta;
DNA helicase VI;
dnaB;
DnaB helicase E1;
helicase HDH IV;
Hel E;
helicase DnaB;
helicase domain of bacteriophage T7 gene 4 protein helicase;
PcrA helicase;
UvrD;
hHcsA;
Hmi1p;
hPif1;
MCM helicase;
MCM protein;
MER3 helicase;
MER3 protein;
MPH1;
PcrA;
PcrA helicase;
PDH120;
PfDH A;
Pfh1p;
PIF1
Class
Hydrolases;
Acting on acid anhydrides;
Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
BRITE hierarchy
Sysname
ATP phosphohydrolase (DNA helix unwinding)
Reaction(IUBMB)
ATP + H2O = ADP + phosphate [RN:R00086]
Reaction(KEGG)
Substrate
ATP [CPD:C00002];
H2O [CPD:C00001]
Product
ADP [CPD:C00008];
phosphate [CPD:C00009]
Comment
DNA helicases utilize the energy from ATP hydrolysis to unwind double-stranded DNA. Some of them unwind duplex DNA with a 3' to 5' polarity [1,3,5,8], others show 5' to 3' polarity [10,11,12,13] or unwind DNA in both directions [14,15]. Some helicases unwind DNA as well as RNA [9,10]. May be identical with EC 3.6.4.13 (RNA helicase).
History
EC 3.6.4.12 created 2009
Orthology
K02209  
DNA replication licensing factor MCM5
K02210  
DNA replication licensing factor MCM7
K02212  
DNA replication licensing factor MCM4
K02314  
replicative DNA helicase
K02540  
DNA replication licensing factor MCM2
K02541  
DNA replication licensing factor MCM3
K02542  
DNA replication licensing factor MCM6
K03139  
transcription initiation factor TFIIF subunit beta
K03170  
reverse gyrase
K03550  
holliday junction DNA helicase RuvA
K03551  
holliday junction DNA helicase RuvB
K03654  
ATP-dependent DNA helicase RecQ
K03655  
ATP-dependent DNA helicase RecG
K03656  
ATP-dependent DNA helicase Rep
K03657  
DNA helicase II / ATP-dependent DNA helicase PcrA
K03658  
DNA helicase IV
K03722  
ATP-dependent DNA helicase DinG
K04494  
chromodomain helicase DNA binding protein 8
K10300  
F-box protein, helicase, 18
K10730  
ATP-dependent DNA helicase Q4
K10737  
DNA helicase MCM8
K10738  
DNA helicase MCM9
K10742  
DNA replication ATP-dependent helicase Dna2
K10779  
transcriptional regulator ATRX
K10843  
DNA excision repair protein ERCC-3
K10844  
DNA excision repair protein ERCC-2
K10876  
RAD54-like protein 2
K10899  
ATP-dependent DNA helicase Q1
K10900  
werner syndrome ATP-dependent helicase
K10901  
bloom syndrome protein
K10902  
ATP-dependent DNA helicase Q5
K11136  
regulator of telomere elongation helicase 1
K11338  
RuvB-like protein 2
K11367  
chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1
K11642  
chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3
K11643  
chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4
K11665  
DNA helicase INO80
K11681  
helicase SWR1
K14433  
ATP-dependent RNA helicase DQX1
K14435  
chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5
K14436  
chromodomain-helicase-DNA-binding protein 6
K14437  
chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7
K14438  
chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9
K14439  
SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1
K14440  
SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1
K14635  
ATP-dependent DNA helicase MPH1
K15254  
DNA helicase B
K15255  
ATP-dependent DNA helicase PIF1
K15271  
ATP-dependent DNA helicase HFM1/MER3
K15362  
fanconi anemia group J protein
K16898  
ATP-dependent helicase/nuclease subunit A
K16899  
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B
K17265  
Ras GTPase-activating protein-binding protein 1
K17680  
twinkle protein
Genes
HSA: 
10146(G3BP1) 10856(RUVBL2) 1105(CHD1) 1106(CHD2) 1107(CHD3) 1108(CHD4) 164045(HFM1) 165545(DQX1) 1763(DNA2) 2068(ERCC2) 2071(ERCC3) 23132(RAD54L2) 254394(MCM9) 26038(CHD5) 2963(GTF2F2) 4171(MCM2) 4172(MCM3) 4173(MCM4) 4174(MCM5) 4175(MCM6) 4176(MCM7) 50485(SMARCAL1) 51750(RTEL1) 546(ATRX) 54617(INO80) 55636(CHD7) 56652(C10orf2) 56916(SMARCAD1) 57680(CHD8) 5965(RECQL) 641(BLM) 7486(WRN) 80119(PIF1) 80205(CHD9) 83990(BRIP1) 84181(CHD6) 84515(MCM8) 84893(FBXO18) 92797(HELB) 9400(RECQL5) 9401(RECQL4)
PTR: 
101057134(CHD2) 449625(ATRX) 450285(FBXO18) 450496(DNA2) 451788(CHD4) 452058(HELB) 453346(INO80) 453508(PIF1) 453650(BLM) 453666(CHD2) 454088(CHD9) 454796(BRIP1) 454885(RECQL5) 455278(CHD3) 456124(ERCC2) 458415(RTEL1) 458790(MCM5) 459930(SMARCAL1) 460668(MCM2) 461384(SMARCAD1) 461968(CHD1) 462763(MCM3) 462969(MCM9) 464198(CHD7) 464469(RECQL4) 465334(RECQL) 468949(RUVBL2) 469233(HFM1) 469781(CHD5) 469942(CHD6) 470409(DQX1) 470526(ERCC3) 471711(G3BP1) 472460(MCM7) 472732(WRN) 472757(MCM4) 739837(CHD8) 741695(MCM6) 741868(GTF2F2) 745279(C10H10orf2) 745605(RAD54L2) 747729(MCM8)
PPS: 
100967616(CHD6) 100970763(BRIP1) 100971581(SMARCAL1) 100972158(CHD1) 100972543 100973175(CHD2) 100974044(HFM1) 100974069(ERCC3) 100974624(RECQL) 100975088(WRN) 100975393(RTEL1) 100975400(MCM9) 100976472(CHD4) 100976848(CHD3) 100978163(MCM5) 100978179(MCM4) 100978506(CHD9) 100979185(BLM) 100979623(CHD5) 100980176(MCM3) 100981957(DNA2) 100982350(HELB) 100982488(INO80) 100984954(DQX1) 100985598(ATRX) 100985652(MCM7) 100986478(GTF2F2) 100987865(G3BP1) 100987913(RECQL4) 100989681(SMARCAD1) 100989790(RECQL5) 100990291(CHD8) 100990628(ERCC2) 100990812(RUVBL2) 100992270(PIF1) 100993548(FBXO18) 100993730(MCM8) 100995160(MCM2) 100995302(RAD54L2) 100995909(MCM6) 100996036(CHD7)
GGO: 
101125121(CHD5) 101125713(MCM5) 101125794(SMARCAD1) 101125820(ERCC2) 101126846(CHD8) 101126909(WRN) 101128616(MCM4) 101129472(FBXO18) 101129848(RECQL) 101133138(INO80) 101134205(BLM) 101136201(MCM6) 101136515(CHD6) 101137448(CHD3) 101137561(RECQL5) 101138196 101138609(CHD7) 101138905(RAD54L2) 101141326 101142622 101142876 101142963(MCM2) 101143545(SMARCAL1) 101143608(RTEL1) 101143965(MCM3) 101144092(CHD1) 101144164(CHD4) 101144314(CHD2) 101144386(C10H10orf2) 101144785(GTF2F2) 101146065(MCM8) 101146498(PIF1) 101146817(HELB) 101146846 101148821(ATRX) 101149062(RECQL4) 101151258(ERCC3) 101152708(DQX1) 101152809(DNA2) 101153954(RUVBL2) 101154598(MCM7)
PON: 
100171554(RECQL) 100171800(RTEL1) 100172476(G3BP1) 100172725(ERCC3) 100173085(MCM3) 100173533(SMARCAD1) 100173649(RECQL5) 100174351(CHD2) 100188896(WRN) 100431671(C10H10orf2) 100432206(MCM7) 100439223 100439266(HELB) 100439513(CHD8) 100439521(INO80) 100439632(CHD4) 100440358 100441837 100442048(MCM7) 100442073(FBXO18) 100442759(CHD1) 100443449(CHD9) 100444674(CHD3) 100445923(RAD54L2) 100446818(MCM5) 100447986(GTF2F2) 100450665(MCM6) 100451016(BLM) 100451813(RUVBL2) 100453188(CHD6) 100454019(SMARCAL1) 100455265(ATRX) 100456535(HFM1) 100456857(RECQL4) 100456938 100458971(CHD5) 100459002(MCM8) 100460525(BRIP1) 100460767(MCM4) 100460818(PIF1) 100461260(CHD7) 100461569(DQX1) 100461848(MCM9)
MCC: 
100428794(RUVBL2) 694401(DNA2) 695678(WRN) 695741(SMARCAL1) 696091 696367 698829(ERCC3) 700482(RAD54L2) 701668(GTF2F2) 702070(CHD1) 702951(RECQL5) 703460(BLM) 704516 705111(INO80) 705735(ATRX) 705871(RECQL) 706310(CHD2) 706471(CHD7) 707651(MCM6) 707914(PIF1) 708169(CHD8) 708320(MCM3) 708691(SMARCAD1) 709749(DQX1) 710766(MCM7) 710888(MCM2) 710958(C9H10orf2) 712408 713162(CHD4) 713884(G3BP1) 714686(MCM4) 714711(MCM9) 715485 716508(CHD3) 717548(MCM5) 717860(HELB) 718247(MCM8) 719519 720797(FBXO18) 722539
MCF: 
MMU: 
107932(Chd4) 109151(Chd9) 117599(Helb) 12144(Blm) 12648(Chd1) 13871(Ercc2) 13872(Ercc3) 13990(Smarcad1) 170472(Recql5) 17215(Mcm3) 17216(Mcm2) 17217(Mcm4) 17218(Mcm5) 17219(Mcm6) 17220(Mcm7) 19691(Recql) 20174(Ruvbl2) 208084(Pif1) 216848(Chd3) 22427(Wrn) 22589(Atrx) 226153(Peo1) 237911(Brip1) 244059(Chd2) 269400(Rtel1) 269610(Chd5) 27041(G3bp1) 320790(Chd7) 327762(Dna2) 330149(Hfm1) 50755(Fbxo18) 54380(Smarcal1) 66634(Mcm8) 67772(Chd8) 68142(Ino80) 68705(Gtf2f2) 71389(Chd6) 71567(Mcm9) 79456(Recql4) 81000(Rad54l2) 93838(Dqx1)
RNO: 
117535(Chd4) 171092(G3bp1) 246284(Atrx) 287834(Recql5) 288532(Mcm7) 290805(RGD1564788) 291293(Fbxo18) 291703(Ercc3) 291885(Mcm5) 292907(Ruvbl2) 296084(Ino80) 296178(Mcm8) 29685(Mcm6) 29728(Mcm4) 300057(Recql4) 303241(Chd3) 307726(Chd9) 308215(Chd1) 308415(Ercc2) 308738(Chd2) 308755(Blm) 309441(Peo1) 309762(Dna2) 311607(Chd6) 312398(Smarcad1) 312538(Mcm2) 312824(Recql) 312974(Chd7) 316273(Mcm3) 316477(Smarcal1) 360588(Brip1) 362288(Rtel1) 363135(Rad54l2) 364767 367645(Pif1) 499437(Mcm9) 500837(Helb) 65027(Chd8) 680434(Dqx1) 690161(Hfm1) 691589(Chd5) 81674(Gtf2f2)
CGE: 
HGL: 
101696790(G3bp1) 101696944(Chd7) 101696954(Dqx1) 101697378(Ercc2) 101698140(Mcm6) 101698921(Mcm9) 101698950(Chd8) 101700455(Pif1) 101700497(Hfm1) 101701240(Recql) 101702180(Chd9) 101702298(Dna2) 101704051(Helb) 101704396(Chd3) 101705766(Atrx) 101705896(Smarcad1) 101707353(Chd4) 101708511(Mcm5) 101708745(Chd5) 101710862(Recql4) 101710978(Mcm2) 101711246(Rtel1) 101711291(Ruvbl2) 101713414(Chd1) 101716468(Gtf2f2) 101716733(Brip1) 101717324(Chd2) 101717735(Smarcal1) 101719015(Mcm3) 101719260(Blm) 101719798(Mcm8) 101719932 101719984(Fbxo18) 101721296(Chd6) 101721409(Mcm4) 101721867(Rad54l2) 101722270(Ino80) 101724469(Wrn) 101724967(Mcm7) 101724970(Recql5) 101725837(Ercc3)
TUP: 
102468821(CHD8) 102468962(RUVBL2) 102470572(FBXO18) 102470583(WRN) 102471145(BLM) 102473300(RECQL) 102474920(MCM8) 102475444(SMARCAL1) 102475886(CHD9) 102476641(MCM2) 102476915(CHD4) 102477051 102477845(RECQL4) 102478018(RAD54L2) 102478027(CHD7) 102478395(HELB) 102480481(INO80) 102482756(CHD5) 102483088 102484672(PIF1) 102485345(MCM5) 102485589(RTEL1) 102485719(SMARCAD1) 102485907(ERCC3) 102488173(CHD2) 102488241(MCM7) 102490123(CHD6) 102491958(RECQL5) 102492421(BRIP1) 102493166(HFM1) 102493420(MCM3) 102493875(ERCC2) 102496583(MCM4) 102498213(G3BP1) 102498626(CHD3) 102499579(DNA2) 102500225(MCM9) 102501231 102502274(CHD1) 102502665(DQX1) 102503380
CFA: 
100685609(BLM) 100856284(SMARCAD1) 100856387(PIF1) 475401(CHD8) 475784(DQX1) 476105(ERCC3) 476131(MCM6) 476418(RUVBL2) 476608(RAD54L2) 477163(MCM8) 477230(CHD6) 477714(CHD4) 477871(MCM4) 478128(CHD9) 478262(INO80) 478903(SMARCAL1) 479028(CHD2) 479322(G3BP1) 479489(CHD3) 479737(MCM7) 479956(HFM1) 480963(ATRX) 481839(MCM3) 482101(RECQL4) 483317(RECQL5) 484104(MCM9) 484622(MCM2) 485976(RTEL1) 486641(RECQL) 486845(C28H10orf2) 486968(CHD7) 487142(FBXO18) 488891(CHD1) 489015(DNA2) 489627(CHD5) 491122(BRIP1) 493995(ERCC2) 493997(WRN) 608595(HELB) 609164(GTF2F2) 610519(MCM5)
AML: 
FCA: 
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BTA: 
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BOM: 
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PHD: 
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SSC: 
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CFR: 
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ECB: 
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MYB: 
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MYD: 
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PALE: 
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MDO: 
SHR: 
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OAA: 
GGA: 
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EpC_00400(recG) EpC_01780(rep) EpC_02070(uvrD) EpC_02110(recQ) EpC_15640(ruvA) EpC_15650(ruvB) EpC_22310(helD) EpC_23600(dinG) EpC_33140(dnaB)
EPR: 
EPYR_00040(recG) EPYR_00187(rep) EPYR_00217(uvrD) EPYR_00221(recQ) EPYR_01685(ruvA) EPYR_01686(ruvB) EPYR_02407(helD) EPYR_02550(dinG) EPYR_03569(dnaB)
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EAM_0041(recG) EAM_0159(rep) EAM_0187(uvrD) EAM_0191(recQ) EAM_0296(dnaB) EAM_1250(dinG) EAM_1382 EAM_2003(ruvB) EAM_2004(ruvA)
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BU546(dnaB) BU598(rep)
BAS: 
BUsg528(dnaB) BUsg574(rep)
BAB: 
bbp489(dnaB) bbp540(rep)
BCC: 
BCc_359(dnaB) BCc_387(rep)
BAP: 
BAU: 
BAK: 
BAKON_554(dnaB) BAKON_606(rep)
BAW: 
BAJC: 
BUA: 
BUP: 
BUH: 
BUAMB_521(dnaB) BUAMB_570(rep)
BAJ: 
BCTU_370(dnaB) BCTU_394(rep)
WBR: 
WGLp272(uvrD) WGLp499(dnaB)
WGL: 
SGL: 
SG0916(dinG) SG1031(helD) SG1261(ruvA) SG1262(ruvB) SG2132 SG2224 SG2337 SG2342(uvrD) SG2390
SOD: 
Sant_0284(rep) Sant_0334(uvrD) Sant_0340(recQ) Sant_1068 Sant_1686(ruvA) Sant_1687(ruvB) Sant_2589(helD) Sant_2694(dinG) Sant_3865(dnaB) Sant_4065(recG)
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ENC: 
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ECLO: 
ESC: 
EEC: 
ENL: 
EAS: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
ES15_0054(recG) ES15_0417(dnaB) ES15_1593(ruvA) ES15_1594(ruvB) ES15_2484(helD) ES15_2637(dinG) ES15_3669(recQ) ES15_3676(uvrD) ES15_3704(rep)
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CTU_02150(rep) CTU_02450(uvrD) CTU_02530(recQ) CTU_11450(12) CTU_13980(dinG) CTU_15710(helD) CTU_25430(ruvB) CTU_25440(ruvA) CTU_37630(dnaB) CTU_41570(recG)
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KPN_00831(dinG) KPN_00991(helD) KPN_02375(ruvB) KPN_02376(ruvA) KPN_04000(recG) KPN_04276(rep) KPN_04312(uvrD) KPN_04317(recQ) KPN_04439(dnaB)
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KPR: 
KPR_0230(rep) KPR_0262(uvrD) KPR_0267(recQ) KPR_0357(recG) KPR_0421(dnaB) KPR_1675(helD) KPR_3288(ruvB) KPR_3289(ruvA) KPR_3356 KPR_3757(dinG) KPR_4251
KPJ: 
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KVA: 
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SPE: 
SRR: 
SRL: 
SOD_c01120(rep) SOD_c01450(uvrD) SOD_c01520(recQ) SOD_c13540(dinG) SOD_c16230(helD) SOD_c26180(ruvB) SOD_c26190(ruvA) SOD_c42600(dnaB) SOD_c46710(recG)
SRY: 
SRS: 
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SSZ: 
SCc_686(uvrD) SCc_708(dnaB)
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SERR: 
SFO: 
PMR: 
PMI0483 PMI0630(dinG) PMI0789(helD) PMI1115(ruvA) PMI1116(ruvB) PMI2640 PMI2741(dnaB) PMI2866(recG) PMI3310(rep) PMI3340(uvrD) PMI3345(recQ)
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_0027(recG) ETAE_0096(rep) ETAE_0126(uvrD) ETAE_0131(recQ) ETAE_0237(dnaB) ETAE_1175(dinG) ETAE_1274(helD) ETAE_1439(ruvA) ETAE_1440(ruvB)
ETD: 
ETC: 
BFL: 
Bfl027(dnaB)
BPN: 
BPEN_027(dnaB)
BVA: 
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BCHR: 
HDE: 
HDEF_0627(recG) HDEF_0678(dnaB) HDEF_0700(uvrD) HDEF_1939(ruvB) HDEF_1940(ruvA) HDEF_2303(rep)
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
XBO: 
XNE: 
PAM: 
PANA_0142(rep) PANA_0169(uvrD) PANA_0177(recQ) PANA_0264(dnaB) PANA_1258(dinG) PANA_1398(helD) PANA_2200(ruvB) PANA_2201(ruvA) PANA_3940(recG)
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PAJ_0579(dinG) PAJ_0721(helD) PAJ_1514(ruvB) PAJ_1515(ruvA) PAJ_3144(recG) PAJ_3302(rep) PAJ_3329(uvrD) PAJ_3337(recQ) PAJ_3424(dnaB)
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PVA: 
Pvag_0641(dinG) Pvag_0784(helD) Pvag_1665(ruvB) Pvag_1666(ruvA) Pvag_2706(recg1) Pvag_3215(recg3) Pvag_3378(rep) Pvag_3408(uvrD) Pvag_3414(recQ) Pvag_3522(dnaB)
PAO: 
RIP: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
MEN: 
MEPCIT_024(dnaB) MEPCIT_028(uvrD) MEPCIT_122(ruvB) MEPCIT_123(ruvA) MEPCIT_188(recG)
MEO: 
MPC_017(recG) MPC_331(dnaB) MPC_335(uvrD) MPC_433(ruvB) MPC_434(ruvA)
PSI: 
MMK: 
ROR: 
SECT: 
SEHC: 
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HIN: 
HI0312(ruvB) HI0313(ruvA) HI0387(dinG) HI0649(rep) HI0728(recQ) HI1188(uvrD) HI1574(dnaB) HI1740(recG)
HIT: 
NTHI0102(dnaB2) NTHI0190 NTHI0430(ruvB) NTHI0431(ruvA) NTHI0507(dinG) NTHI0769(rep) NTHI0887(recQ) NTHI1359(uvrD) NTHI1477(dnaB) NTHI2051(recG)
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HDU: 
HD0475(recQ) HD0571(rep) HD0973(dnaB1) HD1032(uvrD) HD1287 HD1372(dnaB2) HD1757(ruvB) HD1758(ruvA) HD1921(recG)
HAP: 
HAPS_0012(recQ) HAPS_0170(dnaB) HAPS_0995(ruvB) HAPS_1014 HAPS_1067(uvrD) HAPS_1346(ruvA) HAPS_1492(recG) HAPS_2018(rep)
HPAZ: 
HPR: 
HSO: 
HS_0269(ruvA) HS_0270(ruvB) HS_0497(uvrD) HS_0719(rep) HS_0733(dinG) HS_0940(dnaB) HS_1347(dnaB) HS_1454(recG) HS_1711(recQ) HS_1720(dnaB)
HSM: 
PMU: 
PM0411(uvrD) PM0412(dnaB) PM0710(dnt) PM0919(recG) PM0976(ruvB) PM0977(ruvA) PM1059(rep) PM1427(recQ)
PMV: 
PUL: 
PMP: 
Pmu_00970(rep) Pmu_01910(ruvA) Pmu_01920(ruvB) Pmu_02580(recG) Pmu_03600(dnaB1) Pmu_04730(uvrD) Pmu_04740(dnaB2) Pmu_07760 Pmu_16790(recQ)
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MS0413(uvrD) MS0712(ruvA) MS0713(ruvB) MS1183(dnaB) MS1361(dinG) MS1368(uvrD) MS1735(recG) MS2081(recQ)
MHT: 
MHQ: 
MHX: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
APL: 
APL_0279(rep) APL_0283(ruvA) APL_0284(ruvB) APL_0713(dnaB) APL_0781 APL_1116(recQ) APL_1326(uvrD) APL_1827(recG)
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APJL_0289(rep) APJL_0295(ruvB) APJL_0713(dnaB2) APJL_0784 APJL_1135(recQ) APJL_1340(uvrD) APJL_1863(recG)
APA: 
ASU: 
ASI: 
AAP: 
AAT: 
AAO: 
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GAN: 
BTO: 
XFA: 
XFT: 
PD0037(uvrD) PD0617(recQ) PD0887(ruvA) PD0889(ruvB) PD1701(dnaB) PD1705(recG) PD1798(yoaA) PD2041(rep)
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XCC: 
XCC1434(dnaB) XCC2930(yoaA) XCC2947(recQ) XCC3023(ruvB) XCC3025(ruvA) XCC3238(recG) XCC3950(dinG) XCC4026(uvrD) XCC4139(rep)
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XCA: 
XCV: 
XCV0225 XCV1535(dnaB) XCV2169(recG) XCV3239(yoaA) XCV3255(recQ) XCV3277(ruvB) XCV3280(ruvA) XCV3508(recG) XCV4123(dinG) XCV4248(uvrD) XCV4383(rep) XCVd0049
XCP: 
XCR_0234(uvrD) XCR_0322 XCR_1706(dnaB) XCR_3301 XCR_3319(recQ) XCR_3345(ruvB) XCR_3348(ruvA) XCR_3578(recG) XCR_4474(rep)
XAC: 
XAC1477(dnaB) XAC2265(helD) XAC3107(yoaA) XAC3124(recQ) XAC3147(ruvB) XAC3149(ruvA) XAC3391(recG) XAC4031(dinG) XAC4151(uvrD) XAC4281(rep)
XAX: 
XACM_1466(dnaB) XACM_3027(yoaA) XACM_3044(recQ) XACM_3066(ruvB) XACM_3069(ruvA) XACM_3165 XACM_3279(recG) XACM_3901(dinG) XACM_4020(uvrD) XACM_4152(rep)
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XOO: 
XOO0242(rep) XOO0412(dinG) XOO1151(recG) XOO1525(dnaB) XOO1661(ruvA) XOO1663(ruvB) XOO1723(recQ) XOO1741(yoaA) XOO4570(uvrD)
XOM: 
XOP: 
XOR: 
XOC_0391(uvrD) XOC_2997(dnaB) XOC_3312 XOC_3331(recQ) XOC_3356(ruvB) XOC_3358(ruvA) XOC_3648(recG) XOC_4329 XOC_4650(rep)
XAL: 
XALc_0113(uvrD) XALc_0801(recG) XALc_1138(DNAB) XALc_2247(DinG) XALc_2257(RecQ) XALc_2428(RuvB) XALc_2430(RuvA) XALc_2992(dinG) XALc_3164(rep)
XCI: 
XCAW_00148(uvrD) XCAW_00270(dinG) XCAW_00393(uvrD) XCAW_01923(uvrD) XCAW_02866(dnaB) XCAW_03394(dinG) XCAW_03410(recQ) XCAW_03432(ruvB) XCAW_03435(ruvA) XCAW_04083(recG)
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SMD_0046(rep) SMD_2671 SMD_2781(dnaB) SMD_3245(yoaA) SMD_3255(recQ) SMD_3315(ruvB) SMD_3317(ruvA) SMD_3441(recG) SMD_4039(dinG) SMD_4127(uvrD)
PSU: 
PSD: 
FAU: 
RHD: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCM66_0166(rep) VCM66_0178(uvrD) VCM66_0184(recQ) VCM66_0355(dnaB) VCM66_1768(ruvB) VCM66_1769(ruvA) VCM66_1778(dinG) VCM66_2631(recG) VCM66_A0675(helD)
VCI: 
VCL: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VFI: 
VF_0068(uvrD) VF_0070(recQ) VF_0301(dnaB) VF_0951(ruvA) VF_0952(ruvB) VF_1009(dinG) VF_1354 VF_1465 VF_1622(helD) VF_1713(yoaA) VF_2460(recG) VF_2521(rep) VF_A1156
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VSA: 
VSAL_I0092(rep) VSAL_I0222(uvrD) VSAL_I0224(recQ) VSAL_I0382(dnaB) VSAL_I1129(dinG) VSAL_I1888(ruvA) VSAL_I1889(ruvB) VSAL_I2134(helD) VSAL_I2910(recG) VSAL_II0011(recQ)
PPR: 
VAN: 
LAG: 
PAE: 
PA0966(ruvA) PA0967(ruvB) PA1045 PA3344(recQ) PA4931(dnaB) PA5296(rep) PA5345(recG) PA5443(uvrD)
PAU: 
PAP: 
PSPA7_1786(recQ) PSPA7_4334(dinG) PSPA7_4444(dnaB2) PSPA7_4541(ruvB) PSPA7_4542(ruvA) PSPA7_5658(dnaB1) PSPA7_6070(rep) PSPA7_6122(recG) PSPA7_6233(uvrD)
PAG: 
PAF: 
PAM18_1621(recQ) PAM18_4000(dinG) PAM18_4070(ruvB) PAM18_4071(ruvA) PAM18_5042(dnaB) PAM18_5416(rep) PAM18_5465(recG) PAM18_5565(uvrD)
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PPU: 
PP_1125(dinG) PP_1216(ruvA) PP_1217(ruvB) PP_2270 PP_3893 PP_4516(recQ) PP_4873(dnaB) PP_5264(rep) PP_5310(recG) PP_5352(uvrD)
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
T1E_1862(dinG) T1E_2614(dnaB) T1E_2774(rep) T1E_3961(uvrD) T1E_4003(recG) T1E_4084(recQ) T1E_5725(ruvA) T1E_5726(ruvB)
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_10660 PP4_11550(ruvA) PP4_11560(ruvB) PP4_13040(recQ) PP4_49440(dnaB) PP4_53290(rep) PP4_53710(recG) PP4_54140(uvrD)
PPUU: 
PST: 
PSB: 
PSP: 
PSPPH_0080(rep) PSPPH_0189(recG) PSPPH_0580(dnaB) PSPPH_1406(dinG) PSPPH_1518(recQ) PSPPH_3772(ruvB) PSPPH_3773(ruvA) PSPPH_5147(uvrD)
PCI: 
PFL: 
PFL_0289 PFL_0583(dnaB_2) PFL_1279(dinG) PFL_1579(recQ) PFL_4663(dnaB_1) PFL_4763(ruvB) PFL_4764(ruvA) PFL_6031(rep) PFL_6071(recG) PFL_6162(uvrD)
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFLU0274 PFLU0537(dnaB) PFLU1324(dinG) PFLU4468 PFLU4913(ruvB) PFLU4914(ruvA) PFLU5961(rep) PFLU6003(recG) PFLU6075(uvrD)
PFE: 
PFC: 
PPZ: 
PEN: 
PSEEN1273(dinG) PSEEN1997 PSEEN3922(recQ) PSEEN4092(ruvB) PSEEN4093(ruvA) PSEEN4926(dnaB) PSEEN5410(rep) PSEEN5455(recG) PSEEN5504(uvrD)
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PST_0135(recG) PST_0173(uvrD) PST_0249 PST_0296 PST_0497(rep) PST_1523(dinG) PST_2467(recQ) PST_2808(ruvB) PST_2809(ruvA) PST_3652(dnaB)
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PBA: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
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CJA: 
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Avin_00520(uvrD) Avin_07680(dnaB) Avin_19450(dinG) Avin_32800(recQ) Avin_36690(ruvB) Avin_36700(ruvA) Avin_47860(rep) Avin_48450(recG)
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AvCA_00520(uvrD) AvCA_07680(dnaB) AvCA_19450(dinG) AvCA_32800(recQ) AvCA_36690(ruvB) AvCA_36700(ruvA) AvCA_47860(rep) AvCA_48450(recG)
AVD: 
PAR: 
PCR: 
PRW: 
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ACI: 
ACD: 
ACB: 
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ABY: 
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ABN: 
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ABAB: 
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ACC: 
MCT: 
MCR_0098(recG) MCR_0458(ruvB) MCR_1027(ruvA) MCR_1035(dnaB) MCR_1262(uvrD)
SON: 
SO_0467(uvrD) SO_1819(dinG) SO_2380 SO_2429(ruvB) SO_2430(ruvA) SO_3917(dnaB) SO_4241(recQ) SO_4325(rep) SO_4364(recG)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
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SVO: 
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CJB: 
CJJ: 
CJU: 
CJN: 
CJI: 
CJM: 
CJS: 
CJP: 
CJEJ: 
CJEU: 
CJEN: 
CJEI: 
CJR: 
CJE0514(recG) CJE0667(dnaB) CJE0868 CJE0890(ruvA) CJE1244 CJE1554(ruvB)
CJD: 
CJZ: 
CJX: 
CFF: 
CFV: 
CCV: 
CHA: 
CCO: 
CLA: 
Cla_0633(ruvA) Cla_0688(recG) Cla_0782(rep) Cla_1056(uvrD) Cla_1223(dnaB) Cla_1275(ruvB)
CCOL: 
CCC: 
CCQ: 
CAMP: 
ABU: 
Abu_0563(rep) Abu_0658(dnaB) Abu_0744(ruvA) Abu_1776(ruvB) Abu_2085
ABT: 
ABL: 
ANT: 
ARC: 
SDL: 
SBA: 
NSA: 
NIS: 
SUN: 
NAM: 
GSU: 
GSU0363(dinG) GSU0898(recQ) GSU0998(dnaB) GSU1076(ruvA) GSU1077(ruvB) GSU1326(recG) GSU3411(pcrA)
GSK: 
KN400_0331(dinG) KN400_0874(rep) KN400_0881(recQ) KN400_0978(dnaB) KN400_1054(ruvA) KN400_1055(ruvB) KN400_1299(recG) KN400_3356(pcrA)
GME: 
Gmet_0089(pcrA) Gmet_0745(ruvA) Gmet_0746(ruvB) Gmet_1777(recG) Gmet_2568(dnaB) Gmet_2717(recQ) Gmet_2724(rep) Gmet_3167(dinG)
GUR: 
GLO: 
GBM: 
GEO: 
GEM: 
GEB: 
PCA: 
PPD: 
DVU: 
DVU0156 DVU0959(dnaB) DVU2255(ruvB) DVU2256(ruvA)
DVL: 
DVM: 
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DHY: 
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DGG: 
LIP: 
LI0354(recQ) LI0672(pcrA) LI1186(ruvA) LI1187(ruvB) LIC081(recQ)
LIR: 
DBA: 
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BBA: 
Bd0038(dnaB) Bd0988(recQ) Bd1321(pcrA) Bd2324(recG) Bd2487(ruvB) Bd2488(ruvA) Bd3210(recQ) Bd3339(pcrA)
BBAT: 
Bdt_0035(dnaB) Bdt_0933(recQ) Bdt_1297(pcrA) Bdt_2276(recG) Bdt_2428(ruvB) Bdt_2429(ruvA) Bdt_3140(recQ) Bdt_3260(pcrA)
BEX: 
BMX: 
DPS: 
DAK: