KEGG   ENZYME: 4.2.1.47Help
Entry
EC 4.2.1.47                 Enzyme                                 

Name
GDP-mannose 4,6-dehydratase;
guanosine 5'-diphosphate-D-mannose oxidoreductase;
guanosine diphosphomannose oxidoreductase;
guanosine diphosphomannose 4,6-dehydratase;
GDP-D-mannose dehydratase;
GDP-D-mannose 4,6-dehydratase;
Gmd;
GDP-mannose 4,6-hydro-lyase;
GDP-mannose 4,6-hydro-lyase (GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose-forming)
Class
Lyases;
Carbon-oxygen lyases;
Hydro-lyases
BRITE hierarchy
Sysname
GDP-alpha-D-mannose 4,6-hydro-lyase (GDP-4-dehydro-alpha-D-rhamnose-forming)
Reaction(IUBMB)
GDP-alpha-D-mannose = GDP-4-dehydro-alpha-D-rhamnose + H2O [RN:R00888]
Reaction(KEGG)
Substrate
GDP-alpha-D-mannose [CPD:C00096]
Product
GDP-4-dehydro-alpha-D-rhamnose [CPD:C01222];
H2O [CPD:C00001]
Comment
The bacterial enzyme requires bound NAD+. This enzyme forms the first step in the biosynthesis of GDP-alpha-D-rhamnose and GDP-beta-L-fucose. In Aneurinibacillus thermoaerophilus L420-91T, this enzyme acts as a bifunctional enzyme, catalysing the above reaction as well as the reaction catalysed by EC 1.1.1.281, GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose reductase [5]. Belongs to the short-chain dehydrogenase/reductase enzyme family, having homologous structures and a conserved catalytic triad of Lys, Tyr and Ser/Thr residues [6].
History
EC 4.2.1.47 created 1972, modified 2004
Pathway
Fructose and mannose metabolism
Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
Metabolic pathways
Orthology
K01711  
GDPmannose 4,6-dehydratase
Genes
HSA: 
2762(GMDS)
PTR: 
462390(GMDS)
PPS: 
100967696(GMDS)
GGO: 
101148060(GMDS)
PON: 
100443256(GMDS)
MCC: 
707051(GMDS)
MCF: 
MMU: 
218138(Gmds)
RNO: 
291095(Gmds)
CGE: 
HGL: 
101703718(Gmds)
TUP: 
102478947(GMDS)
CFA: 
488189(GMDS)
AML: 
100473193(GMDS)
FCA: 
101086651(GMDS)
BTA: 
617688(GMDS)
BOM: 
102288149(GMDS)
PHD: 
102337594(GMDS)
CHX: 
SSC: 
100520846(GMDS)
CFR: 
102515381(GMDS)
ECB: 
100057325(GMDS)
MYB: 
102241965(GMDS)
MYD: 
102765829(GMDS)
PALE: 
102893624(GMDS)
MDO: 
100028966(GMDS)
SHR: 
OAA: 
100079151(GMDS)
GGA: 
420890(GMDS)
MGP: 
TGU: 
100229558(GMDS)
FAB: 
101820206(GMDS)
PHI: 
102110907(GMDS)
APLA: 
101802870(GMDS)
FPG: 
101916371(GMDS)
FCH: 
102055124(GMDS)
CLV: 
102095339(GMDS)
ASN: 
102370873(GMDS)
PSS: 
102461704(GMDS)
CMY: 
102943492(GMDS)
ACS: 
XLA: 
XTR: 
394693(gmds)
DRE: 
393461(gmds)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102360672(GMDS)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
411696(GB19686)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
CEL: 
CBR: 
BMY: 
LOA: 
TSP: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
AT3G51160(MUR1) AT5G66280(GMD1)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os06t0137700-01(Os06g0137700)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_01g034920(SORBIDRAFT_01g034920) SORBI_03g005000(SORBIDRAFT_03g005000) SORBI_03g027065(SORBIDRAFT_03g027065) SORBI_09g004980(SORBIDRAFT_09g004980) SORBI_10g002550(SORBIDRAFT_10g002550) SORBI_10g002560(SORBIDRAFT_10g002560)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00185p00036890(AMTR_s00185p00036890) s00449p00011300(AMTR_s00449p00011300)
SMO: 
PPP: 
OLU: 
OTA: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
AFM: 
CIM: 
LBC: 
CCI: 
SCM: 
PGR: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TGO: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
TCR: 
NGR: 
ECO: 
b2053(gmd)
ECJ: 
ECD: 
EBW: 
ECE: 
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_2789(gmd1) ECSP_2808(gmd2)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c2579(gmd)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ELL: 
ELC: 
ELD: 
ELP: 
EBL: 
EBE: 
ELF: 
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
EFE: 
STY: 
STY2321(gmd)
STT: 
t0763(gmd)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM2109(gmd)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA0757(gmd)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SEC: 
SC2110(gmd)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG2141(gmd)
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SEN2105(gmd)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_21980(SBOV21751)
SENE: 
SES: 
SBG: 
SBZ: 
YPA: 
YPN: 
YPP: 
YPZ: 
YPT: 
YPD: 
YPX: 
YPS: 
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YEN: 
YE3075(gmd)
YEP: 
YSI: 
SFL: 
SF2116(gmd)
SFX: 
S2239(gmd)
SFV: 
SFE: 
SSN: 
SSJ: 
SBO: 
SBC: 
PCT: 
PCC: 
SGL: 
SOD: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
EEC: 
ENL: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
KPU: 
KPP: 
CKO: 
CRO: 
CFD: 
SLQ: 
SERR: 
DDA: 
DDD: 
PAM: 
PLF: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
EBF: 
AAN: 
XFA: 
XFT: 
PD1545(gmd)
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XCC: 
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XCV3718(gmd)
XAX: 
XAL: 
PSD: 
DJI: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VVY: 
VPB: 
PAE: 
PA5453(gmd)
PAU: 
PAP: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PPU: 
PP_1799(gmd)
PPW: 
PPT: 
PPI: 
PPX: 
PPUT: 
PPUU: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PSJ: 
PSH: 
PBA: 
PFV: 
PDR: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
PKC: 
PKB_5493(bre-1)
SVO: 
SVI_1471(gmd-1)
CPS: 
SDE: 
AMAC: 
AMB: 
AMH: 
AMK: 
AMAG: 
GPS: 
PIN: 
CBU: 
CBS: 
CBD: 
CBG: 
CBC: 
LLO: 
MCA: 
MCA1146(gmd)
MMT: 
MAH: 
FCN: 
FPH: 
FRT: 
FNA: 
FNL: 
TCX: 
MEJ: 
MEC: 
CYQ: 
CZA: 
NOC: 
NHL: 
NWA: 
TGR: 
TNI: 
TVNIR_0680(gmd_[H])
HNA: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
AHA: 
AHY: 
TAU: 
AFE: 
AFR: 
AFE_2977(gmd-1) AFE_3292(gmd-2)
ACU: 
AFI: 
SAGA: 
RMA: 
PSE: 
RSL: 
RPI: 
REU: 
REH: 
H16_A2900(h16_A2900)
CNC: 
RME: 
CTI: 
BMA: 
BMV: 
BML: 
BMN: 
BPS: 
BPSL2797(wcbK) BPSS1688(gca)
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
BPSE: 
BPSU: 
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BTE: 
BTH_I1331(gmd-1) BTH_II0690(gmd-2)
BTD: 
BTI_4200(gmd) BTI_802(gmd)
BVI: 
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BCT: 
BXE: 
BPH: 
BPY: 
BGL: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BGD: 
BUK: 
BPX: 
BUO: 
PNU: 
AXY: 
AXO: 
AXN: 
PUT: 
AMIM: 
RFR: 
POL: 
PNA: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CBX: 
MPT: 
CFU: 
LCH: 
RGE: 
NET: 
AZO: 
azo3587(gmd)
AZA: 
DSU: 
TBD: 
SDR: 
MFA: 
MMB: 
MEP: 
SLT: 
GCA: 
BPRC: 
HPY: 
HEO: 
HPJ: 
jhp0038(gmd)
HPA: 
HPS: 
HHP: 
HHQ: 
HHR: 
HPG: 
HPP: 
HPB: 
HPL: 
HPC: 
HCA: 
HPM: 
HPE: 
HPO: 
HPI: 
HPQ: 
HPW: 
HPU: 
HEF: 
HPF: 
HEQ: 
HEX: 
HPT: 
HPZ: 
HPV: 
HPX: 
HEN: 
HPH: 
HEG: 
HPN: 
HEP: 
HEU: 
HES: 
HPYS: 
HCN: 
HPD: 
HEY: 
HER: 
HEI: 
HPYA: 
HPYK: 
HPYO: 
HPYL: 
HPYR: 
HPYI: 
HPYU: 
HPYM: 
HEM: 
HEB: 
HEZ: 
HHE: 
HH0172(gmd)
HAC: 
HMS: 
HFE: 
HBI: 
HCE: 
HCM: 
HCP: 
HCB: 
HHM: 
TDN: 
SUA: 
SKU: 
SULR: 
CJJ: 
CJN: 
CJS: 
CJS3_1519(wcbK)
CJR: 
CJE1611(wcbK)
CJD: 
CJZ: 
CJX: 
CCC: 
CCQ: 
SDL: 
SMUL: 
NIS: 
SUN: 
NAM: 
GSU: 
GSU0626(gmd)
GSK: 
GME: 
Gmet_1311(gmd-1) Gmet_1488(gmd-2)
GUR: 
GLO: 
GBM: 
GEO: 
GEM: 
GEB: 
PPD: 
DVU: 
DVU0448(gmd)
DVL: 
DVM: 
DVG: 
DDE: 
DDS: 
DMA: 
DAF: 
DGG: 
LIP: 
LIC082(gmd)
LIR: 
DBA: 
DPS: 
DAK: 
DPR: 
DSF: 
DOL: 
DTO: 
ADE: 
ACP: 
AFW: 
ANK: 
MXA: 
MFU: 
MSD: 
CCX: 
SUR: 
SAT: 
DTI: 
SFU: 
DPB: 
MLO: 
MOP: 
MAM: 
PLA: 
RHI: 
SFH: 
SFD: 
ATU: 
Atu4789(gmd)
AGR: 
RET: 
RHE_CH00762(noeL1) RHE_CH01350(noeL2)
REC: 
REL: 
RLE: 
RLT: 
RLG: 
RLB: 
RLU: 
RTR: 
RIR: 
BME: 
BMI: 
BMZ: 
BMG: 
BMW: 
BMF: 
BMB: 
BMC: 
BAA: 
BMS: 
BSI: 
BMT: 
BSV: 
BOV: 
BOV_0526(gmd-2) BOV_A0362(gmd-1)
BCS: 
BSK: 
BOL: 
BMR: 
BPP: 
BCET: 
BCEE: 
OAN: 
BJA: 
bll1631(noeL) bll5465(gmd)
BJU: 
BRA: 
BBT: 
BRS: 
AOL: 
RPA: 
RPA3951(gmd)
RPB: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
NWI: 
NHA: 
AZC: 
SNO: 
MRD: 
MET: 
MNO: 
MSL: 
HDN: 
HDT: 
HMC: 
RVA: 
MSC: 
CCR: 
CCS: 
CSE: 
BSB: 
SIT: 
RSP: 
JAN: 
RLI: 
PDE: 
DSH: 
KVU: 
KVL: 
PSF: 
PSE_p0272(noeL)
PGA: 
PGL: 
PGD: 
RED: 
HNE: 
HBA: 
ZMN: 
ZMI: 
ZMP: 
NPP: 
SJP: 
SSY: 
ELI: 
GOX: 
GBE: 
GBH: 
ACR: 
AMV: 
RRU: 
RRF: 
RCE: 
MAG: 
AZL: 
ALI: 
ABS: 
PBR: 
MGM: 
MAI: 
MAN: 
PGV: 
PUB: 
APM: 
APB: 
BSUB: 
BBE: 
PJD: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPOL: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PLV: 
EFAU: 
EFU: 
CAW: 
CAC: 
CAE: 
SMB_G2213(rfbD)
CAY: 
CCE: 
CLB: 
CSS: 
CSD: 
EHA: 
RCH: 
BPB: 
CLE: 
RHO: 
RIX: 
RIM: 
DRM: 
DAE: 
DKU: 
DRU: 
DAI: 
DED: 
DEC: 
SAY: 
SAP: 
CKI: 
CKN: 
TOC: 
TTO: 
SSG: 
SRI: 
MTU: 
Rv0112(gca) Rv1511(gmdA)
MTV: 
MTC: 
MRA: 
MTF: 
MTB: 
MTK: 
MTZ: 
MTG: 
MTI: 
MTE: 
MTUR: 
MTL: 
MTO: 
MTD: 
MTN: 
MTJ: 
MTUB: 
MTUC: 
MTUE: 
MTX: 
MTUH: 
MTUL: 
MBO: 
Mb0116(gca)
MBB: 
MBT: 
MBM: 
MBK: 
MAF: 
MCE: 
MCQ: 
MCV: 
MCX: 
MCZ: 
MPA: 
MAP1231(gmdA)
MAO: 
MIT: 
MIR: 
MIA: 
MID: 
MYO: 
MSA: 
MGI: 
MMC: 
MKM: 
MRH: 
MMM: 
MKN: 
RHA: 
RER: 
REY: 
ROP: 
GOR: 
TPR: 
SGR: 
SSX: 
SFA: 
SBH: 
SALB: 
STRP: 
SFI: 
SALU: 
CMI: 
CMM_1600(gmdA)
CMS: 
CMC: 
CMN_01578(gmdA)
MTS: 
AAU: 
ARR: 
RSA: 
KRH: 
CFL: 
NCA: 
KFL: 
TCU: 
SRO: 
FRA: 
FRE: 
FRI: 
FAL: 
ACE: 
KRA: 
SVI: 
TBI: 
AMD: 
AMN: 
AMM: 
AMZ: 
SESP: 
RXY: 
CWO: 
AFO: 
AYM: 
EYY: 
OTE: 
CAA: 
AMU: 
TBE: 
TPI: 
SSM: 
STA: 
STQ: 
SGP: 
LIL: 
LA_3964(gmd)
LIE: 
LIC: 
LBJ: 
LBL: 
LBI: 
LBF: 
BHY: 
BPO: 
BPJ: 
BPIP: 
BPW: 
BIP: 
ABA: 
TSA: 
TRS: 
SUS: 
CTM: 
IPO: 
GAU: 
GBA: 
TAI: 
ACO: 
TLI: 
AMO: 
SBR: 
RBA: 
PLM: 
PBS: 
IPA: 
SACI: 
PHM: 
SYN: 
sll1212(rfbD) slr1072(yefA)
SYZ: 
MYO_13520(yefA) MYO_170(rfbD)
SYY: 
SYT: 
SYS: 
SYQ: 
SYW: 
SYC: 
SYF: 
SYE: 
SYG: 
SYR: 
SYX: 
SYP: 
CYA: 
CYB: 
SYNE: 
SYNP: 
TEL: 
THN: 
MAR: 
CYT: 
CYP: 
CYC: 
CYN: 
CYH: 
CYJ: 
AMR: 
CGC: 
CAN: 
CSN: 
DSL: 
HAO: 
GLP: 
CMP: 
TER: 
LEP: 
GEI: 
OAC: 
ONI: 
PSEU: 
CEP: 
MIC: 
ARP: 
GVI: 
GLJ: 
ANA: 
NPU: 
NOS: 
NOP: 
AVA: 
ANB: 
ACY: 
NAZ: 
CSG: 
CALO: 
CALT: 
RIV: 
PMA: 
PMM: 
PMM1208(gmd)
PMN: 
PMI: 
PMB: 
PMC: 
PMG: 
PMH: 
PME: 
CTHE: 
PLP: 
SCS: 
BTH: 
BFR: 
BFS: 
BFG: 
BVU: 
BHL: 
BSA: 
BXY: 
PGI: 
PG1288(gmd)
PGN: 
PGT: 
PAH: 
PDI: 
PPN: 
TFO: 
BVS: 
PRU: 
PMZ: 
PDN: 
PIT: 
PDT: 
PRO: 
DOI: 
RMG: 
CPI: 
NKO: 
PHE: 
PSN: 
SHG: 
SCN: 
HHY: 
SGN: 
CMR: 
BBD: 
EVI: 
CHU: 
DFE: 
SLI: 
LBY: 
RSI: 
FLI: 
EOL: 
FAE: 
HSW: 
GFO: 
FJO: 
FPS: 
FP1640(gmd)
FBR: 
FIN: 
RBI: 
ZPR: 
CAT: 
FBC: 
CAO: 
CLY: 
KDI: 
ZGA: 
NDO: 
POM: 
CCH: 
CPH: 
CPB: 
PVI: 
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:14299611]
  Authors
ELBEIN AD, HEATH EC.
  Title
THE BIOSYNTHESIS OF CELL WALL LIPOPOLYSACCHARIDE IN ESCHERICHIA COLI. II. GUANOSINE DIPHOSPHATE 4-KETO-6-DEOXY-D-MANNOSE, AN INTERMEDIATE IN THE BIOSYNTHESIS OF GUANOSINE DIPHOSPHATE COLITOSE.
  Journal
J. Biol. Chem. 240 (1965) 1926-31.
  Organism
Escherichia coli
Reference
2  [PMID:5047712]
  Authors
Liao TH, Barber GA.
  Title
Purification of guanosine 5'-diphosphate D-mannose oxidoreductase from Phaseolus vulgaris.
  Journal
Biochim. Biophys. Acta. 276 (1972) 85-93.
  Organism
Phaseolus vulgaris
Reference
3  [PMID:4869560]
  Authors
Melo A, Elliott WH, Glaser L.
  Title
The mechanism of 6-deoxyhexose synthesis. I. Intramolecular hydrogen transfer catalyzed by deoxythymidine diphosphate D-glucose oxidoreductase.
  Journal
J. Biol. Chem. 243 (1968) 1467-74.
Reference
4  [PMID:9525924]
  Authors
Sullivan FX, Kumar R, Kriz R, Stahl M, Xu GY, Rouse J, Chang XJ, Boodhoo A, Potvin B, Cumming DA.
  Title
Molecular cloning of human GDP-mannose 4,6-dehydratase and reconstitution of GDP-fucose biosynthesis in vitro.
  Journal
J. Biol. Chem. 273 (1998) 8193-202.
  Organism
Homo sapiens
  Sequence
[hsa:2762]
Reference
5  [PMID:11096116]
  Authors
Kneidinger B, Graninger M, Adam G, Puchberger M, Kosma P, Zayni S, Messner P.
  Title
Identification of two GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductases synthesizing GDP-D-rhamnose in Aneurinibacillus thermoaerophilus L420-91T.
  Journal
J. Biol. Chem. 276 (2001) 5577-83.
  Organism
Aneurinibacillus thermoaerophilus
Reference
6  [PMID:12501186]
  Authors
Mulichak AM, Bonin CP, Reiter WD, Garavito RM.
  Title
Structure of the MUR1 GDP-mannose 4,6-dehydratase from Arabidopsis thaliana: implications for ligand binding and specificity.
  Journal
Biochemistry. 41 (2002) 15578-89.
  Organism
Arabidopsis thaliana
Other DBs
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CAS: 
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