KEGG   ENZYME: 4.2.2.2Help
Entry
EC 4.2.2.2                  Enzyme                                 

Name
pectate lyase;
polygalacturonic transeliminase;
pectic acid transeliminase;
polygalacturonate lyase;
endopectin methyltranseliminase;
pectate transeliminase;
endogalacturonate transeliminase;
pectic acid lyase;
pectic lyase;
alpha-1,4-D-endopolygalacturonic acid lyase;
PGA lyase;
PPase-N;
endo-alpha-1,4-polygalacturonic acid lyase;
polygalacturonic acid lyase;
pectin trans-eliminase;
Polygalacturonic acid trans-eliminase
Class
Lyases;
Carbon-oxygen lyases;
Acting on polysaccharides
BRITE hierarchy
Sysname
(1->4)-alpha-D-galacturonan lyase
Reaction(IUBMB)
Eliminative cleavage of (1->4)-alpha-D-galacturonan to give oligosaccharides with 4-deoxy-alpha-D-galact-4-enuronosyl groups at their non-reducing ends [RN:R08694]
Reaction(KEGG)
Comment
Favours pectate, the anion, over pectin, the methyl ester (which is the preferred substrate of EC 4.2.2.10, pectin lyase).
History
EC 4.2.2.2 created 1965 as EC 4.2.99.3, transferred 1972 to EC 4.2.2.2, modified 2002
Pathway
Pentose and glucuronate interconversions
Orthology
K01728  
pectate lyase
K19551  
pectate lyase C
Genes
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
BRP: 
BNA: 
106345454 106347564 106347875 106351296 106352403 106352880 106353973 106356689 106359728 106360208 106361318 106363861 106364615 106364980 106365441 106365801 106366185 106367044 106367682 106367786 106368660 106369157 106369886 106370559 106370994 106372536 106372688 106373282 106374536 106374537 106375499 106375788 106375976 106378857 106379411 106379656 106379864 106379906 106380922 106380924 106381139 106382022 106382476 106382584 106386392 106386806 106388660 106391282 106394864 106399678 106399968 106402512 106403184 106409219 106409464 106409544 106410328 106410439 106415745 106416640 106417790 106418398 106419261 106419263 106419852 106421771 106422643 106424219 106426949 106427406 106428402 106428627 106428855 106430092 106430295 106430312 106433413 106436935 106437359 106438903 106439158 106439876(BPL1) 106440777 106440778 106442074 106442321 106443116 106443426 106443623 106445342 106445845 106449446 106450598 106450745 106452444 106452749 106452978 106454552
THJ: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GRA: 
EGR: 
GMX: 
PVU: 
VRA: 
VAR: 
MTR: 
CAM: 
ADU: 
AIP: 
LJA: 
Lj0g3v0016749.1(Lj0g3v0016749.1) Lj0g3v0016749.2(Lj0g3v0016749.2) Lj0g3v0081679.1(Lj0g3v0081679.1) Lj0g3v0146639.1(Lj0g3v0146639.1) Lj0g3v0207779.1(Lj0g3v0207779.1) Lj0g3v0293729.1(Lj0g3v0293729.1) Lj1g3v3476140.1(Lj1g3v3476140.1) Lj1g3v4616550.1(Lj1g3v4616550.1) Lj4g3v0134630.1(Lj4g3v0134630.1) Lj4g3v1389340.1(Lj4g3v1389340.1) Lj4g3v1614780.1(Lj4g3v1614780.1) Lj5g3v0615090.1(Lj5g3v0615090.1) Lj5g3v0670070.1(Lj5g3v0670070.1) Lj5g3v0670070.2(Lj5g3v0670070.2) Lj5g3v2220310.1(Lj5g3v2220310.1) Lj5g3v2288630.1(Lj5g3v2288630.1) Lj6g3v0108680.1(Lj6g3v0108680.1) Lj6g3v0108680.2(Lj6g3v0108680.2)
LANG: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
PXB: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
JCU: 
POP: 
POPTR_0001s04460g(POPTRDRAFT_750465) POPTR_0001s14240g(POPTRDRAFT_547984) POPTR_0001s35960g(POPTRDRAFT_815540) POPTR_0001s37640g POPTR_0002s23990g(POPTRDRAFT_409041) POPTR_0003s17450g(POPTRDRAFT_712008) POPTR_0003s21280g(POPTRDRAFT_758314) POPTR_0004s00870g POPTR_0004s12300g(POPTRDRAFT_759513) POPTR_0005s06550g POPTR_0006s12390g POPTR_0006s23090g(POPTRDRAFT_832050) POPTR_0008s032602(POPTRDRAFT_1084235) POPTR_0008s04850g(POPTRDRAFT_720641) POPTR_0008s14810g(POPTRDRAFT_421334) POPTR_0008s18250g(POPTRDRAFT_565107) POPTR_0010s06170g(POPTRDRAFT_565960) POPTR_0010s23570g(POPTRDRAFT_883326) POPTR_0011s00240g(POPTRDRAFT_1093113) POPTR_0011s002501 POPTR_0011s09580g(POPTRDRAFT_234938) POPTR_0012s09310g(POPTRDRAFT_570188) POPTR_0014s17620g(POPTRDRAFT_247369) POPTR_0015s07590g POPTR_0015s09930g(POPTRDRAFT_575272) POPTR_0016s08140g(POPTRDRAFT_777442) POPTR_0017s11450g(POPTRDRAFT_908365) POPTR_0021s00250g POPTR_0021s00260g
VVI: 
SLY: 
SPEN: 
SOT: 
INI: 
SIND: 
BVG: 
NNU: 
OSA: 
DOSA: 
Os01t0546800-01(Os01g0546800) Os01t0837100-00(Os01g0837100) Os02t0214400-01(Os02g0214400) Os05t0293500-01(Os05g0293500) Os06t0144200-01(Os06g0144200) Os06t0144900-01(Os06g0144900) Os06t0583900-01(Os06g0583900) Os06t0584000-00(Os06g0584000) Os08t0286100-00(Os08g0286100) Os10t0457200-00(Os10g0457200)
OBR: 
BDI: 
ATS: 
SBI: 
SORBI_01g020180(SORBIDRAFT_01g020180) SORBI_03g036930(SORBIDRAFT_03g036930) SORBI_03g039150(SORBIDRAFT_03g039150) SORBI_04g007450(SORBIDRAFT_04g007450) SORBI_06g001410(SORBIDRAFT_06g001410) SORBI_08g002030(SORBIDRAFT_08g002030) SORBI_08g004905(SORBIDRAFT_08g004905) SORBI_10g003080(SORBIDRAFT_10g003080) SORBI_10g003090(SORBIDRAFT_10g003090) SORBI_10g022830(SORBIDRAFT_10g022830)
ZMA: 
100273705 100281162(GRMZM2G131912) 100281581(GRMZM2G472060) 100283618(pco073276b) 100284055(gpm506) 100284356(GRMZM2G129635) 100502180 103636583(GRMZM2G139396) 103652411 107275230 542245(GRMZM2G080056)
SITA: 
PDA: 
EGU: 
MUS: 
ATR: 
SMO: 
PPP: 
NCR: 
PAN: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
FPU: 
NHE: 
VAL: 
VDA: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_1156054(AO090011000673) AOR_1_590114(AO090701000321)
ANG: 
ANI_1_102174(An10g00870)
AFV: 
NFI: 
PCS: 
PNO: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
NPA: 
TML: 
SHS: 
HIR: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT87431(AGABI1DRAFT_87431)
ABV: 
AGABI2DRAFT139877(AGABI2DRAFT_139877)
ENT: 
ENR: 
ENF: 
CCON: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOC: 
KOM: 
CED: 
KSA: 
KOR: 
KRD: 
YPE: 
YPO3994(pelY)
YPK: 
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_3357(pelY)
YPG: 
YPZ: 
YPZ3_2172(pelY)
YPT: 
YPD: 
YPD4_3514(pelY)
YPX: 
YPD8_3520(pelY)
YPH: 
YPC_4503(pelY)
YPW: 
CH59_1943(pelY)
YPJ: 
CH55_2674(pelY)
YPV: 
BZ15_3710(pelY)
YPL: 
CH46_1062(pelY)
YPS: 
YPTB3834(pelY)
YPO: 
BZ17_2750(pelY)
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
DJ40_2560(pelY)
YPU: 
BZ21_3188(pelY)
YPR: 
BZ20_2257(pelY)
YPC: 
BZ23_3463(pelY)
YPF: 
BZ19_3322(pelY)
YEN: 
YE4069(pelY)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YEW: 
CH47_3664(pelY)
YET: 
CH48_1520(pelY)
YEF: 
YEE: 
YSI: 
YFR: 
AW19_3388(pelY)
YIN: 
CH53_1625(pelY)
YKR: 
YRO: 
CH64_2472(pelY)
YAK: 
SFO: 
ECA: 
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PCV: 
PWA: 
PPAR: 
PEC: 
PWS: 
DDA: 
DDD: 
DZE: 
DDC: 
DZC: 
DSO: 
XCC: 
XCC0644(pel) XCC0645(pel) XCC2815(pelB)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XAC: 
XAC2373(pel) XAC2986(pelB) XAC3562(pel)
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAO: 
XOO: 
XOM: 
XOO0747(XOO0747) XOO2130(XOO2130)
XOP: 
XOY: 
XOR: 
XOZ: 
XSA: 
XFR: 
XGA: 
LCP: 
LGU: 
PFS: 
PSES: 
CJA: 
CJA_0533(pel1B) CJA_1277(pelC)
SDE: 
Sde_3448(pel1D)
SAGA: 
HCH: 
MMW: 
MPC: 
GSN: 
GAP: 
BGE: 
BUO: 
BPH: 
BPX: 
BPT: 
BBRO: 
BFZ: 
AXY: 
AXO: 
AXN: 
AXS: 
AXX: 
ADT: 
AIS: 
AAV: 
AAA: 
RDP: 
MIU: 
SCL: 
sce4938(yvpA)
SCU: 
SME: 
SMX: 
SMD: 
BSU: 
BSU07560(pel) BSU34950(pelC)
BSR: 
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSUT: 
BSUL: 
BSUS: 
BSS: 
BST: 
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSX: 
C663_0779(pel) C663_3384(pelC)
BSP: 
BLI: 
BL03597(yvpA) BL03760(pel)
BLD: 
BLi01404(pel) BLi03741(pelC)
BLH: 
BAY: 
BAQ: 
BYA: 
BAMP: 
BAML: 
BAMA: 
BAMN: 
BAMB: 
BAMT: 
BAMY: 
BMP: 
BAO: 
BAZ: 
BQL: 
BXH: 
BQY: 
BAMI: 
BAMC: 
BAMF: 
BAE: 
BATR: 
BHA: 
BCL: 
BPU: 
BPUM_3515(pelB)
BPUM: 
BJS: 
BACW: 
BACP: 
BACB: 
BACY: 
BACL: 
BALM: 
BEO: 
BGY: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPM_0875(yvpA) PPM_3731(pel1)
PPOL: 
PPQ: 
PPOY: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PBD: 
PAEN: 
PAEQ: 
PAEA: 
PPEO: 
PBV: 
PXL: 
MPS: 
LCI: 
LKI: 
LEC: 
LLF: 
CCB: 
CSB: 
CLT: 
CCE: 
BPB: 
bpr_I2372(pel1A)
SELE: 
ABRA: 
SCO: 
SCO1880(SCI39.27c)
SMA: 
SGR: 
SCB: 
SSX: 
SFA: 
SBH: 
SVE: 
SDV: 
STRP: 
SFI: 
SLV: 
SGU: 
SCW: 
SXI: 
STRC: 
SAMB: 
SPRI: 
SCX: 
SRW: 
TUE45_01468(pel_1) TUE45_02368(pel_2) TUE45_03929(pel_3)
STRF: 
SLE: 
sle_02110(sle_02110) sle_13560(sle_13560) sle_13570(sle_13570) sle_13580(sle_13580) sle_13590(sle_13590) sle_52470(sle_52470) sle_52540(sle_52540)
SRN: 
A4G23_01105(pel_2) A4G23_02893(pel_3)
SPAV: 
CMC: 
RTX: 
RTC: 
ARR: 
AAU: 
ACH: 
APN: 
GAR: 
IVA: 
IDO: 
I598_2089(pelA_1) I598_2471(pel_2)
CFI: 
TFU: 
NDA: 
TCU: 
SRO: 
AMD: 
AMN: 
AMM: 
AMZ: 
AMI: 
LED: 
AHM: 
ACTI: 
ACAD: 
MAU: 
MIL: 
VMA: 
AMS: 
ASE: 
ACTN: 
AFS: 
TBI: 
RBA: 
TBE: 
SCD: 
ABAC: 
FSU: 
FSC: 
NKO: 
PEP: 
PCM: 
HSW: 
FJO: 
CHH: 
FBA: 
MRO: 
TMA: 
TMM: 
TMI: 
TMW: 
TMQ: 
TMX: 
TRQ: 
THQ: 
THR: 
TLE: 
DTH: 
DTU: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:13860094]
  Authors
ALBERSHEIM P, KILLIAS U.
  Title
Studies relating to the purification and properties of pectin transeliminase.
  Journal
Arch. Biochem. Biophys. 97 (1962) 107-15.
Reference
2  [PMID:14235514]
  Authors
EDSTROM RD, PHAFF HJ.
  Title
PURIFICATION AND CERTAIN PROPERTIES OF PECTIN TRANS-ELIMINASE FROM ASPERGILLUS FONSECAEUS.
  Journal
J. Biol. Chem. 239 (1964) 2403-8.
Reference
3  [PMID:14235515]
  Authors
EDSTROM RD, PHAFF HJ.
  Title
ELIMINATIVE CLEAVAGE OF PECTIN AND OF OLIGOGALACTURONIDE METHYL ESTERS BY PECTIN TRANS-ELIMINASE.
  Journal
J. Biol. Chem. 239 (1964) 2409-15.
Reference
4  [PMID:13727438]
  Authors
NAGEL CW, VAUGHN RH.
  Title
The degradation of oligogalacturonides by the polygalacturonase of Bacillus polymyxa.
  Journal
Arch. Biochem. Biophys. 94 (1961) 328-32.
Reference
5  [PMID:6035509]
  Authors
Nasuno S, Starr MP.
  Title
Polygalacturonic acid trans-eliminase of Xanthomonas campestris.
  Journal
Biochem. J. 104 (1967) 178-85.
Reference
6  [PMID:9195887]
  Authors
Mayans O, Scott M, Connerton I, Gravesen T, Benen J, Visser J, Pickersgill R, Jenkins J.
  Title
Two crystal structures of pectin lyase A from Aspergillus reveal a pH driven conformational change and striking divergence in the substrate-binding clefts of pectin and pectate lyases.
  Journal
Structure. 5 (1997) 677-89.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9015-75-2

DBGET integrated database retrieval system