KEGG   ENZYME: 5.1.1.13Help
Entry
EC 5.1.1.13                 Enzyme                                 

Name
aspartate racemase;
D-aspartate racemase;
McyF
Class
Isomerases;
Racemases and epimerases;
Acting on amino acids and derivatives
BRITE hierarchy
Sysname
aspartate racemase
Reaction(IUBMB)
L-aspartate = D-aspartate [RN:R00491]
Reaction(KEGG)
Substrate
L-aspartate [CPD:C00049]
Product
D-aspartate [CPD:C00402]
Comment
Also acts, at half the rate, on L-alanine.
History
EC 5.1.1.13 created 1976
Pathway
Alanine, aspartate and glutamate metabolism
Orthology
K01779  
aspartate racemase
Genes
ECP: 
ECM: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
STY: 
STT: 
SEX: 
SENT: 
STM: 
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
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SPT: 
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SPQ: 
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SEC: 
SC4365(pnl)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
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SET: 
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BN855_45820(SBOV46001)
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YP_2405(racX)
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MHAO: 
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XCC1785(ygeA)
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XAC1802(ygeA)
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PSD: 
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HELO_3136(racD)
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H16_B2421(racX)
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HH0075(ygeA)
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HRM2_03110(racD1) HRM2_07710(racD2)
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BABL1_779(racX)
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RL3216(asr)
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C663_3323(racX)
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LL3_00490(racX)
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MUS_0503(racX)
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L92665(racD)
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lp_1523(racD)
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Ldb2043(racD)
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CTC: 
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TTE1724(RacX)
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CHN: 
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MAE_38620(mcyF)
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trd_1098(murI)
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HFX_5011(racX)
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PAB0912(racD-1)
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TGAM_1341(racD-1) TGAM_1356(racD-2)
TSI: 
TBA: 
THE: 
THA: 
THM: 
TLT: 
THS: 
ABI: 
ACF: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:4626916]
  Authors
Lamont HC, Staudenbauer WL, Strominger JL.
  Title
Partial purification and characterization of an aspartate racemase from Streptococcus faecalis.
  Journal
J. Biol. Chem. 247 (1972) 5103-6.
  Organism
Streptococcus faecalis
Reference
2  [PMID:1526977]
  Authors
Yamauchi T, Choi SY, Okada H, Yohda M, Kumagai H, Esaki N, Soda K.
  Title
Properties of aspartate racemase, a pyridoxal 5'-phosphate-independent amino acid racemase.
  Journal
J. Biol. Chem. 267 (1992) 18361-4.
  Organism
Streptococcus thermophilus
Reference
3  [PMID:12051922]
  Authors
Liu L, Iwata K, Kita A, Kawarabayasi Y, Yohda M, Miki K.
  Title
Crystal structure of aspartate racemase from Pyrococcus horikoshii OT3 and its implications for molecular mechanism of PLP-independent racemization.
  Journal
J. Mol. Biol. 319 (2002) 479-89.
  Organism
Pyrococcus horikoshii [GN:pho]
Reference
4  [PMID:12713441]
  Authors
Sielaff H, Dittmann E, Tandeau De Marsac N, Bouchier C, Von Dohren H, Borner T, Schwecke T.
  Title
The mcyF gene of the microcystin biosynthetic gene cluster from Microcystis aeruginosa encodes an aspartate racemase.
  Journal
Biochem. J. 373 (2003) 909-16.
  Organism
Microcystis aeruginosa [GN:mar]
Reference
5  [PMID:15606767]
  Authors
Yamashita T, Ashiuchi M, Ohnishi K, Kato S, Nagata S, Misono H.
  Title
Molecular identification of monomeric aspartate racemase from Bifidobacterium bifidum.
  Journal
Eur. J. Biochem. 271 (2004) 4798-803.
  Organism
Bifidobacterium bifidum
  Sequence
[ncbi-gi:56790013]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
37237-56-2

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