KEGG   ENZYME: 5.4.99.21Help
Entry
EC 5.4.99.21                Enzyme                                 

Name
23S rRNA pseudouridine2604 synthase;
RluF;
YjbC
Class
Isomerases;
Intramolecular transferases;
Transferring other groups
BRITE hierarchy
Sysname
23S rRNA-uridine2604 uracil mutase
Reaction(IUBMB)
23S rRNA uridine2604 = 23S rRNA pseudouridine2604
Substrate
23S rRNA uridine2604
Product
23S rRNA pseudouridine2604
Comment
The enzyme is not completely specific for uridine2604 and can, to a small extent, also react with uridine2605 [1].
History
EC 5.4.99.21 created 2011
Orthology
K06182  
23S rRNA pseudouridine2604 synthase
Genes
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
PTI: 
EHX: 
GTT: 
ECO: 
b4022(rluF)
ECJ: 
Y75_p3909(yjbC)
ECD: 
EBW: 
BWG_3678(rluF)
ECOK: 
ECE: 
Z5620(yjbC)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_5098(rluF)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c4988(yjbC)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_4711(rluF)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_03894(yjbC)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m4381(rluF)
ELL: 
WFL_21300(rluF)
ELC: 
i14_4577(yjbC)
ELD: 
i02_4577(yjbC)
ELP: 
EBL: 
ECD_03894(yjbC)
EBE: 
B21_03854(rluF)
ELF: 
LF82_1902(rluF)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
EFER_4084(yjbC)
STY: 
STY4410(yjbC)
STT: 
t4120(yjbC)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM4193(rluF)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA4031(yjbC)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_4252(yjbC)
SEC: 
SC4072(yjbC)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG4053(yjbC)
SEL: 
SPUL_4199(yjbC)
SEGA: 
SET: 
SEN3976(yjbC)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_42550(SBOV42671)
SENE: 
SES: 
SBG: 
SBG_3662(yjbC)
SBZ: 
SBV: 
YPS: 
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
DJ40_1217(rluF)
YEN: 
YEP: 
YEL: 
YSI: 
SFL: 
SF4095(yjbC)
SFX: 
S3635(yjbC)
SFV: 
SFV_4100(yjbC)
SFE: 
SFS: 
SSN: 
SSON_4200(yjbC)
SSJ: 
SBO: 
SBO_4050(yjbC)
SBC: 
SDY: 
SDY_4310(yjbC)
SDZ: 
ETA: 
ETA_00360(rluF)
EPY: 
EpC_00370(rluF)
EPR: 
EAM: 
EAMY_0042(yjbC)
EAY: 
EAM_0038(rluF)
EBI: 
ERJ: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLA: 
ECLC: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
KPN: 
KPN_04409(yjbC)
KPU: 
KP1_0260(yjbC)
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPQ: 
KPE: 
KPK_5264(rluF)
KPO: 
KPR: 
KPR_0392(rluF)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
CKO: 
CRO: 
ROD_37321(rluF)
CFD: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SOD_c35160(rluF1) SOD_c39260(rluF)
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SFO: 
SERF: 
SERS: 
PMR: 
PMI2872(rluF)
PMIB: 
XBO: 
PAM: 
PANA_4213(rluF)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_p0074(rluF)
PAQ: 
PVA: 
PAO: 
KLN: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
PSX: 
DR96_3754(rluF)
EBT: 
MMK: 
ROR: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
PGE: 
EBF: 
XCC: 
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XCV2972(rluF) XCV3259(rsuA1)
XAC: 
XCI: 
XAX: 
XACM_2755(rluF) XACM_3049(rsuA1)
XAO: 
XOO: 
XOM: 
XOP: 
XOR: 
XAL: 
XFU: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SMD_1299(rluF) SMD_3101(rluF2)
PSU: 
PSD: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VFI: 
VF_1568(rluF)
VFM: 
VSA: 
PPR: 
PAE: 
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
PPU: 
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PMOS: 
PPUU: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PPZ: 
PEN: 
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PBA: 
PBC: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
PKC: 
PCH: 
PCP: 
PALK: 
PRH: 
PSW: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PAR: 
PCR: 
PSO: 
SDN: 
SFR: 
CPS: 
PHA: 
PSHAb0436(rluC)
PSM: 
SDE: 
MAQ: 
MHC: 
MARHY3745(rluF)
MAD: 
MBS: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
AAL: 
GAG: 
GNI: 
GNIT_1903(rluF)
GPS: 
PIN: 
PSY: 
TCY: 
HCS: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
AHA: 
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
ASA: 
ASA_2730(rluF)
AVR: 
AMED: 
OCE: 
NMA: 
NME: 
NMP: 
NMH: 
NMC: 
NMN: 
NMT: 
NMV_1591(rluF)
NMI: 
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMAA_0635(rluF)
NMZ: 
NGO: 
NGK: 
NGT: 
NLA: 
SALV: 
CVI: 
LHK: 
PSE: 
NH8B_2784(rluF)
RSO: 
RSC: 
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
REU: 
REH: 
H16_A2058(rsuA1)
CNC: 
RME: 
Rmet_1432(rsuA1)
CTI: 
BMA: 
BMV: 
BML: 
BMN: 
BMAL: 
BPS: 
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
BPSE: 
BPSM: 
BPSU: 
BPSD: 
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BTE: 
BTQ: 
BTJ: 
BTZ: 
BTD: 
BTHE: 
BOK: 
BVI: 
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCEN: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BMK: 
BCT: 
BCED: 
BXE: 
BXB: 
BPH: 
BPY: 
BGL: 
BUG: 
BRH: 
BGD: 
BYI: 
BUK: 
BPX: 
BUO: 
PNU: 
PNE: 
PPK: 
PPNO: 
PRB: 
BPE: 
BPC: 
BPER: 
BPA: 
BPAR: 
BBR: 
BBM: 
BBH: 
BPT: 
BAV: 
BAV1651(rluF)
BHO: 
BHM: 
AXY: 
AXO: 
AXN: 
AXS: 
TEQ: 
TEA: 
KUI_0847(rluF)
TEG: 
KUK_0685(rluF)
TAS: 
TAT: 
KUM_0053(rluF)
PUT: 
AKA: 
AMIM: 
CDN: 
BPSI: 
RFR: 
POL: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
CTES: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
MPT: 
HAR: 
MMS: 
JAG: 
HSE: 
CFU: 
LCH: 
TIN: 
THI: 
RGE: 
RGE_14590(rluF)
NEU: 
NET: 
NIT: 
NII: 
NMU: 
EBA: 
ebA4056(rsuA)
AZO: 
AZA: 
AZKH_0639(rluF)
DAR: 
TMZ: 
DSU: 
TBD: 
SDR: 
MFA: 
MMB: 
MEH: 
MEI: 
MEP: 
APP: 
SLT: 
GCA: 
BPRC: 
BBA: 
Bd1967(rsuA2)
BBAT: 
Bdt_1938(rsuA2)
BBW: 
BBAC: 
BEX: 
DOL: 
CCR: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
PZU: 
BSB: 
AEX: 
HNE: 
HBA: 
BAT: 
BAH: 
BAI: 
BAX: 
BANT: 
BANR: 
BANS: 
BAL: 
BCE: 
BCA: 
BCZ: 
BCR: 
BCB: 
BCU: 
BCG: 
BCQ: 
BCX: 
BNC: 
BCF: 
BCER: 
BCY: 
BTK: 
BTL: 
BTB: 
BTT: 
BTC: 
BTF: 
BTM: 
BTG: 
BTB_c24010(rluF1) BTB_c47010(rluF2)
BTI: 
BTN: 
BTHT: 
BTHU: 
BWE: 
BTY: 
BMYC: 
BPF: 
BMQ: 
BMQ_0504(rluF)
BMD: 
BMD_0507(rluF)
BMH: 
BACI: 
LSP: 
LGY: 
BSE: 
MCL: 
ESI: 
EAT: 
EAN: 
Eab7_0759(rluB)
EXM: 
BBE: 
PJD: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPM_0092(rsuA1) PPM_2236(truA1)
PPOL: 
PPQ: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PLV: 
PSAB: 
PDU: 
PBD: 
PGM: 
POD: 
PAEN: 
PAEF: 
PAEQ: 
PSTE: 
PAEA: 
PAEE: 
PAEH: 
PAEJ: 
SIV: 
CPE: 
CPF: 
CPR: 
CTC: 
CTET: 
CNO: 
CBK: 
CBN: 
CBT: 
CBE: 
CCB: 
CLS: 
CSR: 
CPAS: 
CSB: 
CLT: 
AMT: 
AOE: 
ASF: 
ASM: 
ASO: 
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BFI: 
CLE: 
RHO: 
RIX: 
RIM: 
COO: 
CCT: 
ROB: 
CPY: 
CSH: 
CSO: 
CST: 
EEL: 
ERE: 
ERT: 
ERA: 
CLO: 
BPRL: 
ERH: 
ERH_0302(rluF)
ERS: 
ABRA: 
APAL: 
MBJ: 
STP: 
WCH: 
SNG: 
BHY: 
BRM: 
BPO: 
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BPIP: 
BPW: 
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PMN: 
PMI: 
PMB: 
PMG: 
PMH: 
PRC: 
PPN: 
BVS: 
RBC: 
DOI: 
CPI: 
NKO: 
PHE: 
PSN: 
HHY: 
SGN: 
SGRA_0912(rluF)
CMR: 
BBD: 
EVI: 
CHU: 
DFE: 
EOL: 
HSW: 
HYM: 
MTT: 
GFO: 
GFO_2790(rluF)
FJO: 
FPS: 
FPC: 
FPY: 
FPO: 
FBR: 
FCO: 
FIN: 
ZPR: 
CAT: 
RAN: 
RAR: 
RAG: 
RAE: 
RAT: 
FBC: 
CAO: 
CLY: 
CLH: 
WVI: 
KDI: 
DOK: 
LAN: 
ZGA: 
ASL: 
PTQ: 
NDO: 
DDD_0038(rluF)
POM: 
EAO: 
FBA: 
FTE: 
CNI: 
NDE: 
MER: 
MAX: 
TAR: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:11720289]
  Authors
Del Campo M, Kaya Y, Ofengand J
  Title
Identification and site of action of the remaining four putative pseudouridine synthases in Escherichia coli.
  Journal
RNA. 7 (2001) 1603-15.
  Sequence
[eco:b4022]
Reference
2  [PMID:19298824]
  Authors
Alian A, DeGiovanni A, Griner SL, Finer-Moore JS, Stroud RM
  Title
Crystal structure of an RluF-RNA complex: a base-pair rearrangement is the key to selectivity of RluF for U2604 of the ribosome.
  Journal
J. Mol. Biol. 388 (2009) 785-800.
  Sequence
[eco:b4022]
Reference
3  [PMID:16712869]
  Authors
Sunita S, Zhenxing H, Swaathi J, Cygler M, Matte A, Sivaraman J
  Title
Domain organization and crystal structure of the catalytic domain of E.coli RluF, a pseudouridine synthase that acts on 23S rRNA.
  Journal
J. Mol. Biol. 359 (2006) 998-1009.
  Sequence
[eco:b4022]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
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