KEGG   ENZYME: 5.4.99.21Help
Entry
EC 5.4.99.21                Enzyme                                 

Name
23S rRNA pseudouridine2604 synthase;
RluF;
YjbC
Class
Isomerases;
Intramolecular transferases;
Transferring other groups
BRITE hierarchy
Sysname
23S rRNA-uridine2604 uracil mutase
Reaction(IUBMB)
23S rRNA uridine2604 = 23S rRNA pseudouridine2604
Substrate
23S rRNA uridine2604
Product
23S rRNA pseudouridine2604
Comment
The enzyme is not completely specific for uridine2604 and can, to a small extent, also react with uridine2605 [1].
History
EC 5.4.99.21 created 2011
Orthology
K06182  
23S rRNA pseudouridine2604 synthase
Genes
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
PTI: 
EHX: 
GTT: 
ECO: 
b4022(rluF)
ECJ: 
JW3982(yjbC)
ECD: 
EBW: 
BWG_3678(rluF)
ECOK: 
ECE: 
Z5620(yjbC)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_5098(rluF)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c4988(yjbC)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_4711(rluF)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_03894(yjbC)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m4381(rluF)
ELL: 
WFL_21300(rluF)
ELC: 
i14_4577(yjbC)
ELD: 
i02_4577(yjbC)
ELP: 
EBL: 
ECD_03894(yjbC)
EBE: 
B21_03854(rluF)
ELF: 
LF82_1902(rluF)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
EFER_4084(yjbC)
EAL: 
STY: 
STY4410(yjbC)
STT: 
t4120(yjbC)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM4193(rluF)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SENR: 
SEND: 
SENI: 
SEEN: 
SPT: 
SPA4031(yjbC)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_4252(yjbC)
SEC: 
SCH_4072(yjbC)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG4053(yjbC)
SEL: 
SPUL_4199(yjbC)
SEGA: 
SET: 
SEN3976(yjbC)
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
SENE: 
SENC: 
SES: 
SBG: 
SBG_3662(yjbC)
SBZ: 
SBV: 
YPS: 
YPO: 
BZ17_1489(rluF)
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
DJ40_1217(rluF)
YPU: 
BZ21_305(rluF)
YPR: 
BZ20_970(rluF)
YPC: 
BZ23_582(rluF)
YPF: 
BZ19_414(rluF)
YEN: 
YEP: 
YEL: 
YEW: 
CH47_1277(rluF)
YET: 
YEF: 
YEE: 
YSI: 
YAL: 
YFR: 
AW19_1473(rluF)
YIN: 
YKR: 
YRO: 
YRU: 
BD65_613(rluF)
YRB: 
YAK: 
SFL: 
SF4095(yjbC)
SFX: 
S3635(yjbC)
SFV: 
SFV_4100(yjbC)
SFE: 
SFS: 
SFT: 
SSN: 
SSON_4200(yjbC)
SSJ: 
SBO: 
SBO_4050(yjbC)
SBC: 
SDY: 
SDY_4310(yjbC)
SDZ: 
ETA: 
ETA_00360(rluF)
EPY: 
EpC_00370(rluF)
EPR: 
EAM: 
EAMY_0042(yjbC)
EAY: 
EAM_0038(rluF)
EBI: 
ERJ: 
EGE: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ECLA: 
ECLC: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
ENR: 
ENX: 
KPN: 
KPN_04409(yjbC)
KPU: 
KP1_0260(yjbC)
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPV: 
KPW: 
KPY: 
KPG: 
KPC: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPK_5264(rluF)
KPO: 
KPR: 
KPR_0392(rluF)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KPB: 
KPNE: 
KPNU: 
KVA: 
KVD: 
KVQ: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KMI: 
KLE: 
EAE: 
EAR: 
CKO: 
CRO: 
ROD_37321(rluF)
CFD: 
CAMA: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SOD_c35160(rluF1) SOD_c39260(rluF)
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
SMAR: 
SM39_3191(rluF)
SMAC: 
SLQ: 
SERF: 
SERS: 
SFW: 
SFO: 
PMR: 
PMI2872(rluF)
PMIB: 
PVL: 
XBO: 
XBV: 
XBW1_2790(rluF)
PAM: 
PANA_4213(rluF)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_p0074(rluF)
PAQ: 
PVA: 
PAO: 
KLN: 
PANT: 
PAGG: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
PSX: 
DR96_3754(rluF)
EBT: 
MMK: 
ROR: 
RON: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
PGE: 
HAV: 
KSA: 
KIN: 
LAX: 
OPO: 
EBF: 
XCC: 
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XCV2972(rluF) XCV3259(rsuA1)
XAC: 
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAX: 
XACM_2755(rluF) XACM_3049(rsuA1)
XAO: 
XOO: 
XOO1552(RsuA)
XOM: 
XOO1440(XOO1440) XOO1558(XOO1558)
XOP: 
XOY: 
XOR: 
XOZ: 
XAL: 
XSA: 
XTN: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SMD_1299(rluF) SMD_3101(rluF2)
SACZ: 
PSU: 
PSUW: 
PSD: 
LAB: 
LCP: 
LGU: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
DTX: 
VCH: 
VCF: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VCQ: 
VCS: 
VCX: 
VCZ: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VAU: 
VCY: 
VCT: 
VTU: 
VFI: 
VF_1568(rluF)
VFM: 
VSA: 
AWD: 
PPR: 
PBPRA2720(VP0750)
PGB: 
PAE: 
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PAEB: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
PMY: 
PMK: 
PRE: 
PPSE: 
BN5_1542(rsuA1)
PPU: 
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PPUD: 
PFV: 
PMON: 
PMOT: 
PMOS: 
PPJ: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PPRC: 
PPRO: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PFW: 
PFB: 
PFF: 
PPZ: 
PMAN: 
PTV: 
PEN: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
PBM: 
PBA: 
PBC: 
PPUU: 
PDR: 
PSV: 
PSK: 
PKC: 
PCH: 
PCZ: 
PCP: 
PFZ: 
PALK: 
PRH: 
PSW: 
PPV: 
PSES: 
PSEM: 
PSEC: 
PPSY: 
PSOS: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
ACX: 
PAR: 
PCR: 
PSO: 
PUR: 
SDN: 
SFR: 
CPS: 
COM: 
PHA: 
PSHAb0436(rluC)
PSM: 
PSEO: 
PIA: 
PPHE: 
PBW: 
PRR: 
PTN: 
MAQ: 
MHC: 
MARHY3745(rluF)
MAD: 
MBS: 
MSR: 
MSX: 
MPQ: 
MARI: 
AMC: 
AMH: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMK: 
ALT: 
AAL: 
AAUS: 
ASP: 
GAG: 
GNI: 
GNIT_1903(rluF)
GPS: 
LAL: 
PIN: 
PSY: 
MVS: 
MVIS_2060(rluF)
SDE: 
TCY: 
HCS: 
HAK: 
HAM: 
HCO: 
LOKO_01346(rluF_1) LOKO_01574(rluF_2)
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
AHA: 
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
AHJ: 
AHH: 
AHI: 
ASA: 
ASA_2730(rluF)
AVR: 
AMED: 
OCE: 
SDF: 
NMA: 
NME: 
NMP: 
NMH: 
NMC: 
NMN: 
NMT: 
NMV_1591(rluF)
NMI: 
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMAA_0635(rluF)
NMZ: 
NMX: 
NGO: 
NGK: 
NLA: 
NEL: 
SALV: 
KKI: 
CVI: 
LHK: 
PSE: 
NH8B_2784(rluF)
RSO: 
RSC: 
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
RMN: 
REU: 
REH: 
H16_A2058(rsuA1)
CNC: 
RME: 
Rmet_1432(rsuA1)
CTI: 
CBW: 
CGD: 
BMA: 
BMV: 
BML: 
BMN: 
BMAL: 
BMAE: 
BMAQ: 
BMAI: 
BMAF: 
BMAZ: 
BMAB: 
BPS: 
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
BPSE: 
BPSM: 
BPSU: 
BPSD: 
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BPSH: 
BPSA: 
BPSO: 
BUT: 
BTE: 
BTQ: 
BTJ: 
BTZ: 
BTD: 
BTV: 
BTHE: 
BTHM: 
BTHA: 
BTHL: 
BOK: 
BOC: 
BVI: 
BVE: 
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCEN: 
BCEW: 
BCEO: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BMK: 
BMUL: 
BCT: 
BCED: 
BDL: 
BPYR: 
BCON: 
BGL: 
BGP: 
BGU: 
BUG: 
BGD: 
BGO: 
BYI: 
BUK: 
BUO: 
BUE: 
BUL: 
BUB: 
BUQ: 
BPLA: 
BUD: 
BXE: 
BXB: 
BPH: 
BRH: 
BPX: 
BPY: 
BFN: 
BCAI: 
PNU: 
PNE: 
PDQ: 
PPK: 
PPNO: 
PPNM: 
PRB: 
PPUL: 
PSPU: 
PAPI: 
PVE: 
POX: 
PTX: 
PFG: 
PNR: 
BPE: 
BPC: 
BPER: 
BPET: 
BPEU: 
BPA: 
BPAR: 
BBR: 
BBM: 
BBH: 
BBX: 
BPT: 
BAV: 
BAV1651(rluF)
BHO: 
BHM: 
BHZ: 
AXY: 
AXO: 
AXN: 
AXS: 
ADT: 
TEQ: 
TEA: 
KUI_0847(rluF)
TEG: 
KUK_0685(rluF)
TAS: 
TAT: 
KUM_0053(rluF)
PUT: 
AKA: 
AMIM: 
CDN: 
BPSI: 
AFA: 
RFR: 
POL: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
CTES: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
OTO: 
LIM: 
LIH: 
CBAA: 
CBAB: 
MPT: 
HAR: 
MMS: 
JAG: 
JAB: 
HSE: 
HHT: 
HRB: 
CFU: 
CARE: 
CPRA: 
MNR: 
MASW: 
LCH: 
TIN: 
THI: 
RGE: 
RGE_14590(rluF)
RBN: 
RDP: 
PKT: 
PBH: 
NEU: 
NET: 
NIT: 
NII: 
NUR: 
NMU: 
EBA: 
ebA4056(rsuA)
AZO: 
AZA: 
AZKH_0639(rluF)
AZI: 
DAR: 
TMZ: 
THU: 
DSU: 
SHD: 
RBU: 
TBD: 
SDR: 
MFA: 
MMB: 
MEH: 
MEI: 
MEP: 
MBAC: 
MBAT: 
MEU: 
APP: 
SLT: 
GCA: 
BPRC: 
BBA: 
Bd1967(rsuA2)
BBAT: 
Bdt_1938(rsuA2)
BBW: 
BBAC: 
BEX: 
DOL: 
CCR: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
CHQ: 
PZU: 
BSB: 
BRD: 
AEX: 
HNE: 
HBA: 
BAT: 
BAH: 
BAI: 
BAX: 
BANT: 
BANR: 
BANS: 
BANH: 
BANV: 
BAL: 
BCE: 
BCA: 
BCZ: 
BCR: 
BCB: 
BCU: 
BCG: 
BCQ: 
BCX: 
BNC: 
BCF: 
BCER: 
BCEF: 
BCY: 
BTK: 
BTL: 
BTB: 
BTT: 
BTHR: 
BTHI: 
BTC: 
BTF: 
BTM: 
BTG: 
BTB_c24010(rluF1) BTB_c47010(rluF2)
BTI: 
BTN: 
BTHT: 
BTHU: 
BTW: 
BWE: 
BWW: 
BTY: 
BMYC: 
BMYO: 
BPF: 
BMQ: 
BMQ_0504(rluF)
BMD: 
BMD_0507(rluF)
BMH: 
BMEG: 
BACI: 
BBY: 
BACO: 
BSJ: 
LSP: 
LGY: 
LFU: 
FPN: 
BSE: 
MCL: 
ESI: 
EAT: 
EAN: 
Eab7_0759(rluB)
EXM: 
BBE: 
BLR: 
PJD: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPSC2_00510(rsuA1) PPSC2_11665(truA1)
PPO: 
PPM_0092(rsuA1) PPM_2236(truA1)
PPOL: 
PPQ: 
PPOY: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PLV: 
PSAB: 
PDU: 
PBD: 
PGM: 
POD: 
PAEN: 
PAEF: 
PAEQ: 
PSTE: 
PAEA: 
PAEE: 
PAEH: 
PAEJ: 
PBJ: 
PIH: 
PRI: 
PRIO_0093(rluF1) PRIO_3048(rluF3)
PPEO: 
PNP: 
SIV: 
PLN: 
PKU: 
PRT: 
JEO: 
KUR: 
CPE: 
CPF: 
CPR: 
CTC: 
CTET: 
CNO: 
CBK: 
CBN: 
CBT: 
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CBZ: 
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CLS: 
CSR: 
CPAS: 
CPAT: 
CPAE: 
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CLT: 
CBV: 
CSQ: 
CACE: 
CCK: 
CBUT: 
AMT: 
AOE: 
ASF: 
ASM: 
ASO: 
ASB: 
CLO: 
BPB: 
BFI: 
CLE: 
RHO: 
RIX: 
RIM: 
COO: 
CCT: 
ROB: 
CPY: 
CSH: 
CSO: 
BPRL: 
HSD: 
SD1D_1790(rluF)
ERE: 
ERT: 
ERA: 
CST: 
EEL: 
ERH: 
ERH_0302(rluF)
ERS: 
ABRA: 
APAL: 
AOC: 
MBJ: 
STP: 
PMN: 
PMI: 
PMB: 
PMG: 
PMH: 
PRC: 
WCH: 
SNG: 
VBL: 
BHY: 
BRM: 
BPO: 
BPJ: 
BPIP: 
BPW: 
BIP: 
PPN: 
BVS: 
PBT: 
RBC: 
DOI: 
CPI: 
NKO: 
HHY: 
SGN: 
SGRA_0912(rluF)
PHE: 
PEP: 
PSN: 
CMR: 
CAMU: 
BBD: 
EVI: 
CHU: 
DFE: 
EOL: 
HSW: 
HYM: 
HYD: 
HYE: 
HYG: 
PKO: 
RUF: 
RTI: 
MTT: 
FBT: 
GFO: 
GFO_2790(rluF)
FJO: 
FPS: 
FPC: 
FPY: 
FPO: 
FPQ: 
FPV: 
FPW: 
FPK: 
FBR: 
FCO: 
FIN: 
ZPR: 
CAT: 
RAN: 
RAR: 
RAG: 
RAE: 
RAT: 
FBC: 
CAO: 
CLY: 
CLH: 
CBAL: 
CBAT: 
WVI: 
KDI: 
DOK: 
DDO: 
I597_2215(rluF_2)
LAN: 
ZGA: 
ASL: 
PTQ: 
NDO: 
DDD_0038(rluF)
NOM: 
POM: 
EAO: 
EMN: 
ELB: 
MYR: 
MPW: 
MOD: 
CHZ: 
CGN: 
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TDI: 
LUT: 
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FTE: 
CNI: 
NDE: 
NMV: 
NIO: 
BBGW: 
PWO: 
BLQ: 
TAR: 
MAX: 
MER: 
MEAR: 
MARC: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:11720289]
  Authors
Del Campo M, Kaya Y, Ofengand J
  Title
Identification and site of action of the remaining four putative pseudouridine synthases in Escherichia coli.
  Journal
RNA. 7 (2001) 1603-15.
  Sequence
[eco:b4022]
Reference
2  [PMID:19298824]
  Authors
Alian A, DeGiovanni A, Griner SL, Finer-Moore JS, Stroud RM
  Title
Crystal structure of an RluF-RNA complex: a base-pair rearrangement is the key to selectivity of RluF for U2604 of the ribosome.
  Journal
J. Mol. Biol. 388 (2009) 785-800.
  Sequence
[eco:b4022]
Reference
3  [PMID:16712869]
  Authors
Sunita S, Zhenxing H, Swaathi J, Cygler M, Matte A, Sivaraman J
  Title
Domain organization and crystal structure of the catalytic domain of E.coli RluF, a pseudouridine synthase that acts on 23S rRNA.
  Journal
J. Mol. Biol. 359 (2006) 998-1009.
  Sequence
[eco:b4022]
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